基因總覽
SNORD62A 的正式名稱為 small nucleolar RNA, C/D box 62A,屬於非編碼 RNA,而非蛋白質編碼基因。其名稱將它歸入 C/D box 小核仁 RNA 類別。現有資料未提供其序列、長度或更詳細的結構特徵,因此無法據此描述其他分子性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000428514 ★ | 131,485,665–131,485,750 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料將 SNORD62A 的功能描述為預測可能參與 RNA 加工。這是預測性註記,並未提供可據以確認其作用方式或影響範圍的細節,因此不能進一步指定它參與哪一類 RNA 加工步驟,也不能推定其分子作用機制。
RNA 加工是此註記所指向的生物學範疇;然而,現有來源沒有說明 SNORD62A 的具體作用對象、相關反應或功能後果。基於這些限制,目前僅能將其功能概述為可能參與 RNA 加工,不能將此預測表述為已確立的作用。
Promoter 與基因調控
>SNORD62A ENST00000428514 GRCh38 chr9:131484665-131485765 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTCCTTTTCCTCCTCTCCAGGCAGGGTTAACACAGAGTATCCCCATCCTGCGGCGGGACCATCACATCC AGAGGGCCATCGGTCTCTCCCCAATGTCCTTCCCCACCGCCGACCTTACTCTGAAGGTAACACCAGCCCT GAGCTGGGTGAGGGCCCACCCAGTACCTTAGCTTACAAAGAGGCAGAAGGGAGGAGTCCCCGAACCCCTA AAGCTTAGATTGGCTCTGTCCACTGCCAGCGTGATAGTAATTTTCATCCCTCCCCCTCCCCTTGCTTCTG AAGATGGAGTCTGCGCGCAAGGCTTGGGAAAACTCCCCCAGTTTGCCGGAGCAGAGCTCTCCAGGCGGCG CTGGCTCAGGCATCCAGCCTCCATCCTCTGTGGGTGCCTCCAGCGGGGTCAACTACAGCTCCTTCGGTGG AGTGTCCATGCCACCCATGCCTGTGGCCTCTGTAGCACCTTCTGCTTCTATGCCAGGTATCTCATCCCCT GAGCAAGGCCTTGGGGTCCTTCTCCATTTATTATCAAGAAAAACGGATTAACAGCCCCGAATGTCACCTC CTGGCCTTGTCTTAAGTAGCATGTAGAAGTAGCAACTTGTTTTTAGGCCCAGTGGTCGTAGCTCCCATGT GCTGCAGGTAATGTGCACGTCCTGCTTCCCCACGCTGGGAAACAGAACTGGGGGATAACAGCGAGGCACT CCTGCCTACTGGTGACAGGAGCGAGCAAAGGCTTGACTTTGAGTCAGACCTGGGTCATGTGCTGGAGCCG TGTCGCCTCGGCTGGTGAGCAGCTCTTGCCGAGCCACAGTGTCCTCTCCTCTCTTACATGAAACTCCGTG GGGTGGCCACACCCGTGAGGCCAGGTCTTACCTGGAAAGGGCTTTGTATCAACAGAGCCCTCAGTCACTG GCAGCTACTTTTGTCCTGATTGCTGCCATCCTTATCGTGTGCCAGTGTCCCCAAGGGGAAGCGTGGGGGT TTTGAGGGCCCAGCTGCCAGTCTCAGTGATGTAATTCCAATAGATCCTTCTGACCCTCCACTGTGGACTC AATAGCAGGGAGATGAAGAGGACAGTGACTGAGAGACCAAGGCAGCCCTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_535X365 · CTCF_binding_site · 131489152–131489173 · regulatory
· motif · 131489154–131489170 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD62A 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000428514 ★ | snoRNA | 86 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
資料預測 SNORD62A 位於核仁,但未提供定位實驗、條件或動態變化的資訊。
深綠色圓點:來源記載的RNA定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNORD62A 預測可能參與 RNA 加工,並預測位於核仁;此項註記由 Alliance of Genome Resources 提供,日期為 2025 年 7 月。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in RNA processing. Predicted to be located in nucleolus. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | SNORD62A 預測位於核仁;此項定位資訊屬於預測,來源未提供其他條件或實驗細節。 | 推論支持 |
DNA 與 RNA 序列
TCTCAGTGATGTAATTCCAATAGATCCTTCTGACCCTCCA40CTGTGGACTCAATAGCAGGGAGATGAAGAGGACAGTGACT80GAGAGA86cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。