基因總覽
SNORD61 的正式名稱為 small nucleolar RNA, C/D box 61，屬於非編碼 RNA，而非蛋白質編碼基因。它歸於 C/D box 小核仁 RNA 類別；此類 RNA 參與 RNA 加工。SNORD61 位於 RNA binding motif protein, X-linked gene（RBMX）的一個內含子中。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000384252 ★ | 136,879,199–136,879,271 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SNORD61 屬於小核仁 RNA（snoRNA）。小核仁 RNA 是參與 RNA 加工的小型非編碼 RNA；其中 C/D box 類 snoRNA 與前核糖體 RNA 前驅物的位點特異性 2′-O-核糖甲基化有關。
這項修飾的作用位置具有特異性，底物是尚未成熟的前核糖體 RNA 前驅物。來源將 SNORD61 歸入參與此類甲基化的 C/D box snoRNA，但未提供其作用位點、分子互作方式或實驗條件，因此不能據此補述更細的作用機制或下游效應。
Promoter 與基因調控
>SNORD61 ENST00000384252 GRCh38 chrX:136879171-136880271 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCATGCGGGCTGCGGGCTTCGTATTCATTGGCGGCCCCGGAGAAGAAGCCCTCTGAATGTTCCCAGCCA ATGTTGGTGGTAAAAGTTAGTCCCCTGACCAGTGTCGGTGGTTCTGGGTTGAATCCAAGTGTCGCCATTT TGTCTTTTACACGCGGTTTTTAATGACGAGTTTTAATTAGGTTCCGCTGCAGTCACGGAGTGTCGAGTGT TAGTGTGTGCGTCCGCGTTCCGTTACTTAATAGCAAACGATGTTGACGATTTGTTTTTATCTTTTTGGCC GGATAGTAGAATTTTCGGTAGGGCGGGGGCCGGTGAAGAAGAGGGGCGGCATAACTTGGCTTAAACTTCA CATTTCTCCTTGGATTTAGTAGGGAATCCTAATGAGGAAAAGAGGAGTCGTTGGAAGAGGGCTTGGTGTT AAGGTCCTGTGTCTAGCCTGTGACCTTGGGAGTCTTTTAAAACCATCGTTAGGAAGGGTGTGATGAGTAA TTGAATCTTTCAAAGGCAAGAGGACTGGAACTAAAAGTTGCTTTTTCAAATGTTAAGCAGCTGTTGCTTA AGAACAGCTAAGGGTGATCAAGGGTAGTGGTAAAAGTTAAGTTGGCCCTTTTAACCAGTTTTATGTAAAT TGCAGTGTTACTAAACTACTTAGTTCAAATTGCTTCCTACTGTGGCTGAGGCTTAGCTCGTTATCGTTTT CTTTAGTTATTAAGGAACAATGGTTTTAGTGGAAAATATGAGAAATGTGCGAAAGTAAAAGTGTCCAATA AACTTGAGGAACTTTTTGCAGTGAGGTAATACTATTCCTTTTCAACAGACTCACCGGCCCAAAAAAAAAA AAACATGGTTGAAGCAGATCGCCCAGGAAAGCTCTTCATTGGTGGGCTTAATACGGAAACAAATGAGAAA GCTCTTGAAGCAGTATTTGGCAAATATGGACGAATAGTGGAAGGTGAGTTGTCTGGCAGTACAGGCTGGG CTATTATAATTAAAATATAAGCTATGATGAATTTGATTGCATTGATCGTCTGACATGATAATGTATTTTT GTCCTCTAAGAAGTTCTGAGCTTTCTGTTTACACATTTACTTTGGTTATTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_CHKPL · enhancer · 136879255–136880714 · regulatory
ENSRX_B326GD · promoter · 136880715–136881254 · regulatory
· motif · 136874832–136874843 · motif
· motif · 136879516–136879528 · motif
· motif · 136879987–136879998 · motif
· motif · 136880132–136880142 · motif
· motif · 136880253–136880268 · motif
· motif · 136880498–136880508 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD61 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000384252 ★ | snoRNA | 73 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 小核仁 RNA（snoRNA）是參與 RNA 加工的小型非編碼 RNA。C/D box 類 snoRNA 參與前核糖體 RNA 前驅物的位點特異性 2′-O-核糖甲基化；SNORD61 位於 RNA binding motif protein, X-linked gene（RBMX）的一個內含子中。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Small nucleolar RNAs (snoRNAs) are small noncoding RNAs involved in RNA processing. Box C/D class snoRNAs are involved in site-specific 2-prime-O-ribose methylation of preribosomal RNA precursors. This snoRNA is located in an intron of the RNA binding motif protein, X-linked gene (RBMX). |
DNA 與 RNA 序列
GCTATGATGAATTTGATTGCATTGATCGTCTGACATGATA40ATGTATTTTTGTCCTCTAAGAAGTTCTGAGCTT73cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。