基因總覽
SNORD56 的正式名稱為 small nucleolar RNA, C/D box 56，屬於非編碼 RNA。這表示此基因按 RNA 分子描述，而非蛋白質編碼基因；目前提供的資料未說明其 RNA 長度、序列或結構細節，也未列出特定異構型。其名稱指出它屬於 C/D box small nucleolar RNA 類別。現有基本資料未提供更多家族特徵或分子組成資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000413522 ★ | 2,656,624–2,656,694 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SNORD56 被預測可能參與 RNA processing。不過，現有資料沒有進一步說明它在此過程中的具體作用、作用對象或分子機制，因此不能據此推定更細的功能步驟。
Promoter 與基因調控
>SNORD56 ENST00000413522 GRCh38 chr20:2655624-2656724 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AACATCGAGAGCTTCTCCAGTCGTGTGGTGTCTTTATCTGAATACCGCCAGAGCCTACACACTTACCTGC GCTCCAAGATGAGCCAAGTAGCCCCCAGCCTGTCAGCCCTAATTGGGGAAGCGGTGCGTCACAGGGGACT CAAAAATGGGAGAATAAGGACTGTTGCCATGTGCACCTGCACTGCTGTATTTCGTGACCCACCATGTCTT CCCTAGTTGTGCTTGATGGGGAGGTGGGGAGCAGGGCTGTCGTGCAACTGGGCAGGTCAGCAGTTCATTT CTCTGACTGCTTCCTTGACTCTCTCTCCAGGTAGGTGCACGTCTCATCGCACATGCTGGCAGCCTCACCA ACCTGGCCAAGTATCCAGCATCCACAGTGCAGATCCTTGGGGCTGAAAAGGCCCTGTTCAGGTACCAGTG AGGGCACCTGCCCACAATCAGGTGCCACTTCTGGTGCCCACTGCTTGTTGGGGGATCACGGTGATGGCTG ACCAGGGCTCCCTGACCTATACAGGCCTCTGCTATGGGGGTGATGGCCAGTCCTGGTGTCTGAGTGATTC CCAGGGCCCAGCAAAGGGACCAAGTTTCCAGGTCAGCGACATTGGATGCCTTCCCTCTGCCTCTGGGAGC TATGGGTTGGCATGCATTGGGGTAGAGATCCAATCTGGCCTGAGGCTCACTCAGGACTTCGGGGTGAGAG GAGGGGAGGAGCTGAGCTGCCTTGGCTAATGGGGTTGAAATTTCTGATCTTAAACTCTCCACTGAATATT CTCTCAGAGCCCTGAAGACAAGGGGTAACACTCCAAAATATGGACTCATTTTCCACTCCACCTTCATTGG CCGAGCAGCTGCCAAGAACAAAGGCCGCATCTCCCGATACCTGGCAAACAAATGCAGTATTGCCTCACGA ATCGATTGCTTCTCTGGTATGGGTGGGGGGGCGTTGGCAGGTGTGAGAAGGGGCTGGGTGGCTGGGTGGG GAGGCTTGCAACCATAGCTTCCACAATGATGGCAATATTTTTCGTCAACAGCAGTTCACCTAGTGAGTGT TGAGACTCTGGGTCTGAGTGAAGCTGAGGGTAGAGGGAACACAGGGTTGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_BJ7N · enhancer · 2651510–2652411 · regulatory
ENSR20_844T2 · promoter · 2652412–2652642 · regulatory
· motif · 2651874–2651883 · motif
· motif · 2651874–2651883 · motif
· motif · 2651955–2651967 · motif
· motif · 2652098–2652114 · motif
· motif · 2652428–2652438 · motif
· motif · 2652570–2652583 · motif
· motif · 2652575–2652585 · motif
· motif · 2652576–2652589 · motif
· motif · 2652581–2652591 · motif
· motif · 2652616–2652633 · motif
· motif · 2652750–2652761 · motif
· motif · 2652756–2652767 · motif
· motif · 2652756–2652767 · motif
· motif · 2652762–2652773 · motif
· motif · 2652762–2652773 · motif
· motif · 2652768–2652779 · motif
· motif · 2652837–2652846 · motif
· motif · 2652849–2652858 · motif
· motif · 2652849–2652858 · motif
· motif · 2652849–2652858 · motif
· motif · 2652849–2652858 · motif
· motif · 2652927–2652936 · motif
· motif · 2658341–2658356 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD56 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000413522 ★ | snoRNA | 71 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORD56 被預測位於核仁；此定位屬推測性資訊，來源未提供定位變化條件或不同 RNA 形式之間的差異。
深綠色圓點：來源記載的RNA定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNORD56 預測可能參與 RNA processing，並預測位於核仁；此處提供的資料未說明參與方式或定位證據細節。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in RNA processing. Predicted to be located in nucleolus. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | SNORD56 預測位於核仁；這是預測性定位資訊，並未提供定位變化條件或實驗細節。 | 推論支持 |
DNA 與 RNA 序列
CCACAATGATGGCAATATTTTTCGTCAACAGCAGTTCACC40TAGTGAGTGTTGAGACTCTGGGTCTGAGTGA71cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。