基因總覽
SNORD54 的正式名稱為 small nucleolar RNA, C/D box 54，屬於非編碼 RNA。現有資料未提供其序列、結構特徵或更詳細的家族資訊，因此不進一步推述其分子組成或特性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000459159 ★ | 56,073,835–56,073,901 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SNORD54 被預測可能參與 RNA processing。這是預測性功能註記，資料未說明其作用方式、參與的具體步驟或相關 RNA 類型，因此不能據此推定更細緻的分子機制。
Promoter 與基因調控
>SNORD54 ENST00000459159 GRCh38 chr8:56073801-56074901 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGCTAAGCTCAGAGAAGTTACCTCATCCTCAGAGAGCAACGAATGGTATGGTCTATGTAGAAAGCAAAAT TTGCAACGGAAAAACCAGAGTTCGTGTGCACTTTATGAGGAAGAGGGTTAGGTGCACCAGACAGAGGAGT TTCTCAGGTTTCCGTGTCGCCTGTTCTCTCGACCAGGTGGCCCTCTCGGCGCAGGCGGGGACCCCACCCT GCGGGACTTCGGCTCCTCCGTGCGGACAGGGGGCGCCCGCAGCCGTGCCTTTCCCGCCAACTCCACTAGT GCTCCAGCTCGCCCTTGTGCGACCGCCTCTAGGGCCCGGGATATTTCCTGTTCCGGGGCGTGTGGGACCC GGATGCAAGCGTGCTATATAAGCGTTGCTCAAGTCCCACCCCTTTCTTTTTGAGGAAGACGCGGTCGTAA GGGCTGAGGATTTTTGGTCCGCACGCTCCTGCTCCTGACTCACCGCTGTTCGCTCTCGCCGAGGAACAAG TCGGTCAGGAAGCCCGCGCGCAACAGCCATGGTGAGGCGGCAGTCGGCGGCGGGCGGCGCAACGCAGGGC TCGGGCGCCGGGGGGACCCCGGTTTCGAGTTCGTGCTCCTGAGGGCAGATGCCGGGGCGTGTAGGGGCGG AAAGGCGCTCCTGAAATGGTGGGGAAACGCGGGAAGCTTCCGGAAGCTGCCTTTCTCCAGAAGTGGCAGA CCATTTTTGGCTTATTGTTCTTTTTCATGTATCTAATAATAGGCTTTTAAGGATACCGGAAAAACACCCG TGGAGCCGGAGGTGGCAATTCACCGAATTCGAATCACCCTAACAAGCCGCAACGTAAAATCCTTGGAAAA GGGTCAGTGCATTCGTTATGCGGGGGGGAGGGGGAATTGGGCGAAAAGCGACGAGCTTTACTCGTTAATG TTAGTGTAGAAGGTGGACTGCAAGAACTAAAGTGACAAGTTACTTAAAAAAGTAAAGCGTGGCTTAAAAT TGCTTTTACTGTCATACAGCTGGCGATGAGGAGGTACCTATTGTGTTGAGTAACGGTGATAATTTTATAC GCTATTCTGAGCCAGCAGAAGTGAAGGCCTTAAGCCGATTTTAATTGTTTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_C7K82 · enhancer · 56069892–56070987 · regulatory
ENSR8_83MHRR · enhancer · 56071483–56071621 · regulatory
ENSR8_9S8X9 · promoter · 56074346–56074703 · regulatory
ENSR8_BF5GP · enhancer · 56074704–56075483 · regulatory
· motif · 56069517–56069532 · motif
· motif · 56069522–56069534 · motif
· motif · 56069525–56069532 · motif
· motif · 56073648–56073657 · motif
· motif · 56073650–56073661 · motif
· motif · 56073650–56073661 · motif
· motif · 56073652–56073661 · motif
· motif · 56073667–56073676 · motif
· motif · 56073771–56073780 · motif
· motif · 56074015–56074026 · motif
· motif · 56074118–56074127 · motif
· motif · 56074509–56074519 · motif
· motif · 56074545–56074554 · motif
· motif · 56074558–56074568 · motif
· motif · 56074569–56074580 · motif
· motif · 56074571–56074580 · motif
· motif · 56074631–56074642 · motif
· motif · 56074992–56075007 · motif
· motif · 56074992–56075007 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD54 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000459159 ★ | snoRNA | 67 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORD54 被預測可能位於核仁；此定位屬預測，來源未提供實驗確認或其他條件下的位置變化資訊。
深綠色圓點：來源記載的RNA定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNORD54 被預測可能參與 RNA processing，並被預測可能位於核仁。來源未提供參與 RNA processing 的具體步驟、作用機制或定位的實驗確認，因此這些資訊應保留為預測，而非已證實的功能或位置。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in RNA processing. Predicted to be located in nucleolus. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | SNORD54 被預測可能位於核仁。這項定位資訊屬預測，來源未提供實驗確認，也未說明其他條件下的定位變化；不應將其描述為已確定的位置。 | 推論支持 |
DNA 與 RNA 序列
TGGCGATGAGGAGGTACCTATTGTGTTGAGTAACGGTGAT40AATTTTATACGCTATTCTGAGCCAGCA67cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。