基因總覽
SNORD51(small nucleolar RNA, C/D box 51)屬於非編碼 RNA,不是蛋白質編碼基因。其名稱指出它是 C/D box 類的小核仁 RNA;現有資料未提供其 RNA 長度、序列結構或其他分子特徵。關於其生物學角色,資料僅將 RNA 處理列為預測可能參與的過程,並未提供已確認的具體功能或作用機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000384320 ★ | 206,161,878–206,161,957 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料將 SNORD51 與 RNA 處理的關聯標示為預測可能參與,並未說明它在此過程中的具體作用,也未提供可據以描述分子機制或生物學後果的資訊。因此,現有內容不足以進一步判定 SNORD51 如何參與 RNA 處理,或其功能在何種條件下發生。
Promoter 與基因調控
>SNORD51 ENST00000384320 GRCh38 chr2:206160878-206161978 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACAGAACAGGTAGAACATGGACAGCAGCAATTCAACTTTTCCCCACACTGCCCTGCCAATGTGCCTCGAC CTTGACCTGGGGGGCCCACCTCTGGGGTGAGAGGGTGGCTCATTCATTCAGTCCTTGGCCATTCTTCTGA AACTGCCAACAAGGGTGGAAGTTTGGGGAAGTGGACTCCAGTTCACTAAGAATGGAACTGAGCATACTTA ATGAAATCTCAAACAGAAATGTTCATACTGAAAGAGTAAATCATAGTGAGTATTGAAAATAATGTCTCAC ATGGTACTAATGCTTGTCGGGTGAGGAGTTGAACATATGACAGTGTTTACCTGGGCGCATGTGAAAGGGT AAATTATGATTGCAAAAGGGATCTAGTGATAAGTAGTGATTAAAACAAGTTATTTTGTATTTTCTGGAAA AGGATGTTATACTAGCTCAATAGTGGTTGAATTTAAATGTTTTTCAAGCCTGCCAGGAGTGAAGAAAGCT TTGGGCAAATATGGTCCTGCCGATGTGGAAGACACTACAGGAAGTGGAGCTACAGATAGTAAAGATGATG ATGACATTGACCTCTTTGGATCTGATGATGAGGAGGTATGGCGTCTTCTATAAAGAACATATCGGCCAGG CGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATGTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTT GAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAAAAATGTGGCAGGCATCT GTAATCCCAGCTACTCAGGCGGCTAAGGCAGAGAATTGCTTGAACCTAGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGC CAAGATCGTGCCACTGCATCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCCCAAAAAAAAAAAAAAAGAAT ACATCGATCAGCAATTGTATCAATGTGGTTAAGCCAAATTGCCTGGATTTGAATCCTGGCTTTAATTTAT ATGCCTTTTTCAAATTCTGACTGGTTGCATGATGAATAAAATCAAATCACCATCTTTCGGCTGAGTTCGT GATGGATTTGCTTTTTTCTGATTAAGCCAGTCTTTTTTGTGATGACCCCAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_B3HWN7 · enhancer · 206158207–206159183 · regulatory
ENSR2_B3HWNB · promoter · 206159184–206159905 · regulatory
ENSR2_53RH8MS · CTCF_binding_site · 206159212–206159233 · regulatory
ENSR2_883MQ4 · enhancer · 206160839–206161033 · regulatory
ENSR2_B3HWNW · enhancer · 206163244–206163809 · regulatory
ENSR2_B3HWP2 · enhancer · 206163939–206164548 · regulatory
ENSR2_53RH9K3 · CTCF_binding_site · 206164443–206164464 · regulatory
· motif · 206158960–206158971 · motif
· motif · 206159214–206159230 · motif
· motif · 206159422–206159432 · motif
· motif · 206159590–206159601 · motif
· motif · 206159592–206159603 · motif
· motif · 206159594–206159603 · motif
· motif · 206159807–206159822 · motif
· motif · 206159807–206159822 · motif
· motif · 206159812–206159824 · motif
· motif · 206159814–206159829 · motif
· motif · 206159815–206159822 · motif
· motif · 206159815–206159829 · motif
· motif · 206159816–206159829 · motif
· motif · 206159849–206159859 · motif
· motif · 206159861–206159876 · motif
· motif · 206160115–206160124 · motif
· motif · 206160115–206160124 · motif
· motif · 206160306–206160317 · motif
· motif · 206160307–206160323 · motif
· motif · 206160366–206160383 · motif
· motif · 206160971–206160984 · motif
· motif · 206161369–206161384 · motif
· motif · 206162074–206162083 · motif
· motif · 206163550–206163558 · motif
· motif · 206164445–206164461 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD51 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000384320 ★ | snoRNA | 80 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORD51 被預測位於核仁;此定位屬於預測,資料未提供實驗驗證、條件變化或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的RNA定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
DNA 與 RNA 序列
CTGGTTGCATGATGAATAAAATCAAATCACCATCTTTCGG40CTGAGTTCGTGATGGATTTGCTTTTTTCTGATTAAGCCAG80cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。