基因總覽
SNORD45B(small nucleolar RNA, C/D box 45B)屬於非編碼 RNA,正式名稱指出它是 C/D box 類的小核仁 RNA。現有資料未提供其序列、長度或更細部的結構描述,因此不進一步推定這些特性。資料庫將其列為可能參與 RNA 加工,並預測其位於核仁;這些內容屬預測,不能視為已確認的功能或定位。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000364617 ★ | 75,789,477–75,789,548 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料預測 SNORD45B 可能參與 RNA 加工,但未說明涉及哪一類 RNA、加工的具體步驟,或其分子作用方式。因此,目前只能概述其預測中的功能範圍,不能據此判定它直接催化反應、辨識特定 RNA,或影響特定加工產物。
這項功能資訊屬於預測,並非已確認的實驗結論。來源沒有提供相關生物系統、實驗處理或觀察結果,也沒有描述 SNORD45B 對 RNA 加工效率或細胞生物學過程的影響。其作為 C/D box 小核仁 RNA 的分類,亦不足以單獨支持更具體的機制或功能推論。
Promoter 與基因調控
>SNORD45B ENST00000364617 GRCh38 chr1:75788477-75789577 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GACTGAGTTTTGCTATGTTGGCCAGAGTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCTGCCCCAGCT TTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGGAGCCACCACCCAGCCACAAAACTTCTTAAAATATAATGCATTG TTGAGTGTGGGAAAAATTTGTTTCTGGAATCCTAATACTAATTTTCATGTATCATTGATTAGCCACTGTT TTATCTGGGCTTAAACATCTTTGGCATGTTTAGGGCATTTTGATTTTTCATGTAGTTATATAATTTACTA ATAGATAATAGGTTTTGTACAGAGTCCACATTAAAATAGATGTCTGATAAATATGGTATAGGTACTCGGA AAGAAATACTCTCCCTGAACTTCACTGATGAAAAAGGTAGATGTTTTTCTGTCTCTGGCTCATGGGAGAA ACTAAAGCACTGTTTGTATTGTCAGCCATAGATTAACTAATCCTGTGCTTCTCAGATAATTGTTTTTTTC TGATAATAGTTGTGTCTGAAGATGGCTTCTAACATTGAGCAGCACAGATTTTAAACTCACTACTGATCAG TGCTGTTAAGGTCAGGAGAGGTAAAAATAGCAGCATGGCTAATGAGTTACCTTTGTGTTTAATCTCTTTA TAACTTGTTACCAGTTCAAATGACAGATTTAAGAAATTGTGTATTATTTTAGGAATACTGTATGTCTGAG TATTTGAGAATGAGTGGCATCTATTGGGGTCTGACAGTAATGGATCTCATGGGACAACTTCATCGCATGA ATAGAGAAGAGATTCTGGCATTTATTAAGTCTTGCCAACATGAATGTGGTGGAATAAGTGCTAGTATCGG ACATGATCCTCATCTTTTATACACTCTTAGTGCTGTCCAGGTAAATACTAATCAAAATTGCAACGATCTT GATAGTATGTTCTCTTACTTCAGAGTTGGAAATTGAAACTGTATCAGGATTTGGTCAAAAAGTTTTGTTA CAAGTGAAGCTGTCCTACAAGGTCAATGATGTAATGGCATGTATTAGCTGAATCTAAAGTTGATGTGAGT TCTAAAATTACACTGAGACCTTGGAGGGTAAAATTTTTATCTTCAGTATGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_93546D · enhancer · 75784411–75784740 · regulatory
ENSR1_BK34F · promoter · 75785741–75786266 · regulatory
ENSR1_BK34H · enhancer · 75786267–75786935 · regulatory
ENSR1_8486DD · enhancer · 75787222–75787376 · regulatory
ENSR1_93547B · enhancer · 75787584–75787937 · regulatory
ENSR1_BK355 · enhancer · 75790650–75791385 · regulatory
ENSR1_BK35G · enhancer · 75792902–75793872 · regulatory
· motif · 75784484–75784501 · motif
· motif · 75784490–75784507 · motif
· motif · 75784568–75784574 · motif
· motif · 75784850–75784858 · motif
· motif · 75786068–75786083 · motif
· motif · 75786068–75786083 · motif
· motif · 75786206–75786217 · motif
· motif · 75786206–75786217 · motif
· motif · 75786411–75786423 · motif
· motif · 75786413–75786428 · motif
· motif · 75786427–75786438 · motif
· motif · 75786669–75786678 · motif
· motif · 75786669–75786680 · motif
· motif · 75786669–75786680 · motif
· motif · 75789480–75789493 · motif
· motif · 75789480–75789493 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD45B 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000364617 ★ | snoRNA | 72 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORD45B 被預測位於核仁;現有資料未提供定位是否會隨條件改變,也未描述異構型差異或動態變化。 此處為預測性資訊,並非已確認的定位結果。
深綠色圓點:來源記載的RNA定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNORD45B 預測可能參與 RNA 加工,並預測位於核仁;這些資訊由 Alliance of Genome Resources 提供,時間為 2025 年 7 月。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in RNA processing. Predicted to be located in nucleolus. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | SNORD45B 預測位於核仁;此定位屬預測,並非已確認的結果。 | 推論支持 |
DNA 與 RNA 序列
GGTCAATGATGTAATGGCATGTATTAGCTGAATCTAAAGT40TGATGTGAGTTCTAAAATTACACTGAGACCTT72cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。