基因總覽
SNORD42B 的正式名稱為 small nucleolar RNA, C/D box 42B，屬於非編碼 RNA，並歸於 C/D box 小核仁 RNA 類別。它是 RNA 分子，而非蛋白質；現有資料未提供其序列或更詳細的結構特色。資料庫將其功能與細胞位置標示為預測，因此其基本認識應限於此類別與預測資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000458893 ★ | 28,720,550–28,720,616 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料預測 SNORD42B 可能參與 RNA processing（RNA 加工）。這項註記指出可能涉及 RNA 的處理過程，但未說明作用步驟、分子機制或具體底物，也未提供能將其功能描述得更細緻的證據。因此，SNORD42B 的功能目前只能概括為可能與 RNA 加工有關；不能據此推定特定加工反應或其他功能。
Promoter 與基因調控
>SNORD42B ENST00000458893 GRCh38 chr17:28719550-28720650 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CGGGACCAGACCCGAGCGCCAGCCGGCTACGCCGTCCGCTGGCCTGAGCAAATAAACGCGTGTCTTCAAA AAACTACAATCCCCATGGTGGCACGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCTGGTGGCTGAGGCAGGAGAATGGC GTAAACCCGGGAGGCGGAGCTTACAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGC GCTCAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAAACTACAACCCCCATGAAGCTTTAGTGCCTTTGAGGG GAGGAGTGGCGCATGTTTGTTCACGCACGAAAAAGAAATTAAACCTAACTACCGTTCCCAGAGGGCGCCG CTCTGCAAATTACCCAATCAGCTCTAAGTACAAAGCATCGCGAGTCTTTAGTGCTCTTTGGCGCTATAAG CCCGTGGGAACGAGCATTGGAGACCCTTTTCACAAGATGGCGCCGAAAGCGAAGAAGGAAGGTGTGTGTT GGTGATGGGGCCGCAGCTGGTTTACCGGGGATTGCCGCGCCGCAGAGCGAACGAATTGGGAACACGGCTG CTGGGCTAAGCCCTGAGGGCTCTGCTCCGGGGCTGCTCCCTGCGTTTCGGACACGCTGCAGTATACGTGG GCCGCGTGGGCCCAGCCTCGTGGGCTGAGTTCCGGTAGAGGGAGTTGGGGGGGGGCAACGCGGCAGGCAT CATCCGCCAGGGAGGGCCAGACATTCGGTTCTGGGAAGCTACATGCATCCACTGGTTGGAGCTCCATGTC CCCGGGCCTGTAAGGAATTAGTGCCCTCAGCTTTAACCATTTTCCTTCTGGTTCATGTTCAACCGGGCTA CATTACCCGCCCCTCTCTCCGCAGCGTGGTTTTGCGATGGGGTATGTGTAAAATTCGTAGGACATTTTCT GGAAAGTATCAAGCGTTCATTCAGTGCTACTTTGTTTCATAGTCGTATCCCTGGAGTTACTTAGAGTTGG TCGCTTTCGCCTCTGGTATCGTGCATATGATGGAAAAGTTTTAATCTCCTGACACTTGTGATGTCTTCAA AGGAACCACTGATGCACCTGTGGCCAGGGTGGCCCACTGCAGTTCTTGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_58QD5L · CTCF_binding_site · 28717539–28717560 · regulatory
ENSR17_9FDQK · promoter · 28717698–28718023 · regulatory
ENSR17_58QD7N · CTCF_binding_site · 28717987–28718008 · regulatory
ENSR17_B7NTT · promoter · 28718151–28718905 · regulatory
ENSR17_C4SXJ · promoter · 28719495–28720579 · regulatory
ENSR17_58QDH3 · CTCF_binding_site · 28719575–28719596 · regulatory
ENSR17_58QDJZ · CTCF_binding_site · 28719995–28720016 · regulatory
ENSR17_58QDKZ · CTCF_binding_site · 28720207–28720228 · regulatory
ENSR17_9FDS4 · promoter · 28722867–28723367 · regulatory
· motif · 28717541–28717557 · motif
· motif · 28717643–28717658 · motif
· motif · 28717643–28717658 · motif
· motif · 28717722–28717732 · motif
· motif · 28717748–28717755 · motif
· motif · 28717904–28717914 · motif
· motif · 28717949–28717959 · motif
· motif · 28717989–28718005 · motif
· motif · 28718582–28718595 · motif
· motif · 28718582–28718595 · motif
· motif · 28719577–28719593 · motif
· motif · 28719822–28719833 · motif
· motif · 28719829–28719839 · motif
· motif · 28719908–28719917 · motif
· motif · 28719997–28720013 · motif
· motif · 28720209–28720225 · motif
· motif · 28720577–28720599 · motif
· motif · 28720577–28720599 · motif
· motif · 28720612–28720621 · motif
· motif · 28720648–28720659 · motif
· motif · 28720648–28720659 · motif
· motif · 28720650–28720659 · motif
· motif · 28722161–28722173 · motif
· motif · 28723728–28723736 · motif
· motif · 28724702–28724713 · motif
· motif · 28724829–28724844 · motif
· motif · 28725303–28725316 · motif
· motif · 28725303–28725316 · motif
· motif · 28725324–28725337 · motif
· motif · 28725324–28725337 · motif
· motif · 28725344–28725359 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD42B 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000458893 ★ | snoRNA | 67 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
資料預測 SNORD42B 位於核仁；這是預測性定位，並非已確認的定位結果。 來源沒有提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的RNA定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNORD42B 預測可能參與 RNA 加工，且預測位於核仁；這些內容屬於預測性註記，來源未提供更具體的作用機制或定位條件。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in RNA processing. Predicted to be located in nucleolus. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | SNORD42B 預測位於核仁。此定位資訊具有預測性，來源未說明定位變化的條件或異構型差異。 | 推論支持 |
DNA 與 RNA 序列
GTGCATATGATGGAAAAGTTTTAATCTCCTGACACTTGTG40ATGTCTTCAAAGGAACCACTGATGCAC67cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。