基因總覽
SNORD42A（small nucleolar RNA, C/D box 42A）屬於非編碼 RNA，名稱指出它是 C/D box 類小核仁 RNA。它不是蛋白質編碼基因，因此此處描述的是 RNA 產物，而非蛋白質結構或胺基酸序列。其基本特性與分類由基因名稱及非編碼 RNA 類別界定；目前提供的資料未進一步說明 RNA 的序列、長度或結構細節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000459584 ★ | 28,723,429–28,723,492 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SNORD42A 的功能目前帶有預測性：資料指出它可能參與 RNA 加工，但未提供直接實驗證據、具體作用步驟或相關分子，因此不宜將此功能視為已確立的機制。
Promoter 與基因調控
>SNORD42A ENST00000459584 GRCh38 chr17:28722429-28723529 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGCCTCCCAAAGTGCTGGGAATACAGCCATGAGCCAGCACACCTGGCCCAGAGATGATTCTTTAATCACT TGAGGTTGTAAGAGCCCTTCAAGAGAAAGAAAATGCACAACGTTCTGCCCCTGGGATTGGGGCTTCAGGC CCTTAGATTTCAGGGTGCAGATGATGACACTGTAAAGCGACCAAAGTCTGAACAAAGTGATTGGTACCTC GTTGTCTGATGCACCTAGGCTCTCCTGGCTCTGGGCTCCAAAAGAATGGGCCCAGGCCAGGTGACCCCAT TTTGCCTCTCCCAGGCTTGACCACTATGCTATCATCAAGTTTCCGCTGACCACTGAGTCTGCCATGAAGA AGATAGAAGACAACAACACACTTGTGTTCATTGTGGATGTTAAAGCCAACAAGCACCAGATTAAACAGGC TGTGAAGAAGCTGTATGACATTGATGTGGCCAAGGTCAACACCCTGATTCGGTGAGTTGGGCCTCAAGGG ATGGGGAGCAGGCTGGACCAGCAGTCTGGAGCCAAAAAAACCTGCATTCCATGAAGCTTTTTGATGTTTA GGTAGTCCTGGTAATGCAGGACTACACGTGTAGTCCGAGCTATGCAGGAGGATCTCTTGAGGCCAGGAAT CACCCATGATTGCCCCATTGTACTCCAGCCTGAGCAACCAAGCAAGGCCCTTTTTAAAAAAAAAAAAAAA AAAAATCCCCTGGACCTTTCAGCAGGGGAAAAAGGTTCCTTGACTTAAACTTGGTGTAGGTTTAGCAGTG TGTGTGAGCCTTGAGGCAGGAATTACAGGCTGCTTTAGTTACAGACCTTTGTGTGGACCTGAGGCTTTCT AGGACTTGATTGGGGGTTGGTCCTCATTTTCTGGGTCCCTACTTCTATTGGGAAAGGCAACTAGAGTGCG ACACGTGGCAGATTACCTTGGTTTAAGTCTTAATGTGGCCTGTGGTGTTTCCCATAAGAGAATTGGCTTT GTGGCTTCATGGTGTCCTCTGGGCTAATGATGGAAAAATCATTATTGGAAAAGAATGACATGAACAAAGG AACCACTGAAGTGCCGGAGGACTGGAGGAGGAAGGGGGAGGGTGTGGGGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_B7NTT · promoter · 28718151–28718905 · regulatory
ENSR17_C4SXJ · promoter · 28719495–28720579 · regulatory
ENSR17_58QDH3 · CTCF_binding_site · 28719575–28719596 · regulatory
ENSR17_58QDJZ · CTCF_binding_site · 28719995–28720016 · regulatory
ENSR17_58QDKZ · CTCF_binding_site · 28720207–28720228 · regulatory
ENSR17_9FDS4 · promoter · 28722867–28723367 · regulatory
ENSR17_9FDT3 · promoter · 28726223–28726723 · regulatory
ENSR17_58QFNH · CTCF_binding_site · 28726585–28726606 · regulatory
ENSR17_9FDT8 · promoter · 28726922–28727268 · regulatory
ENSR17_58QFQD · CTCF_binding_site · 28726990–28727011 · regulatory
ENSR17_9FDTM · promoter · 28728298–28728798 · regulatory
· motif · 28718582–28718595 · motif
· motif · 28718582–28718595 · motif
· motif · 28719577–28719593 · motif
· motif · 28719822–28719833 · motif
· motif · 28719829–28719839 · motif
· motif · 28719908–28719917 · motif
· motif · 28719997–28720013 · motif
· motif · 28720209–28720225 · motif
· motif · 28720577–28720599 · motif
· motif · 28720577–28720599 · motif
· motif · 28720612–28720621 · motif
· motif · 28720648–28720659 · motif
· motif · 28720648–28720659 · motif
· motif · 28720650–28720659 · motif
· motif · 28722161–28722173 · motif
· motif · 28723728–28723736 · motif
· motif · 28724702–28724713 · motif
· motif · 28724829–28724844 · motif
· motif · 28725303–28725316 · motif
· motif · 28725303–28725316 · motif
· motif · 28725324–28725337 · motif
· motif · 28725324–28725337 · motif
· motif · 28725344–28725359 · motif
· motif · 28725637–28725650 · motif
· motif · 28725637–28725650 · motif
· motif · 28725734–28725747 · motif
· motif · 28725734–28725747 · motif
· motif · 28725740–28725757 · motif
· motif · 28725749–28725764 · motif
· motif · 28725968–28725977 · motif
· motif · 28726269–28726282 · motif
· motif · 28726291–28726304 · motif
· motif · 28726310–28726323 · motif
· motif · 28726329–28726342 · motif
· motif · 28726587–28726603 · motif
· motif · 28726712–28726729 · motif
· motif · 28726772–28726788 · motif
· motif · 28726992–28727008 · motif
· motif · 28727191–28727201 · motif
· motif · 28727353–28727365 · motif
· motif · 28727791–28727802 · motif
· motif · 28727838–28727853 · motif
· motif · 28727843–28727855 · motif
· motif · 28727846–28727853 · motif
· motif · 28727983–28727992 · motif
· motif · 28727983–28727994 · motif
· motif · 28727983–28727994 · motif
· motif · 28728124–28728137 · motif
· motif · 28728124–28728137 · motif
· motif · 28728396–28728407 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD42A 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000459584 ★ | snoRNA | 64 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORD42A 預測位於核仁；此定位屬預測資訊，來源未提供實驗驗證、條件變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的RNA定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
DNA 與 RNA 序列
GGGCTAATGATGGAAAAATCATTATTGGAAAAGAATGACA40TGAACAAAGGAACCACTGAAGTGC64cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。