基因總覽
SNORD3B-1（small nucleolar RNA, C/D box 3B-1）屬於非編碼 RNA，名稱指出它是 C/D box 小核仁 RNA。現有資料未提供其 RNA 長度、序列特徵或具體分子作用方式，因此不宜據此描述更細的結構與機制。資料將其基本角色概述為可能參與 RNA 加工；其定位及功能均為預測，應視為推論而非已證實的特性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000577988 ★ | 19,061,912–19,062,669 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料僅指出，SNORD3B-1 預測可能參與 RNA 加工，未提供其具體作用方式、涉及的 RNA 種類或加工步驟，也未說明相關生物學過程。因此，無法據此進一步描述其分子機制或功能意義；這項功能描述應保留為預測，而非已確認的作用。
Promoter 與基因調控
>SNORD3B-1 ENST00000577988 GRCh38 chr17:19060912-19062012 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCATTGCACTCCAGCCTGAAAAAGGAGTGAAATTCTGCAACATGTTACAACGTGAATGAACCTTGAAAAC GTCATTCTAAGTGAAATAAGCCAGATACAAAAGGACAATATTGCATGTTTCCACTTATAGAGATACCTAC AAGAATCAAATTCATAGAGACGGAAAGTAGAATAGTGGTTAAAGGGGTCTGGGCGGAGGGAGGAAAGGGA AGTTTGTTTTACGGGTAGAGTTTCAGTTTGGGATGTCGAAAAAGTTCTGGAGATAAATAATGGTGATGGT TACATGCCAATGGCTACACGAATGTACTTAATGCCACTGAATTGTATATGTGAAAAATGGTTAAAATGGT AAATTTTGTATCTATTTAATACCATCCCCCCTAAAAAAAAAATTGTTTTTAAGAGTCAAGATCTCACTCT GTCTCCCAGGCTGGGGTGCAGTGGGGTAACTGATCAGAGCTCACTGCAGCTTTGAACTCAGCCAGCTTCC CTGACTCAAACGATCATCCCGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGACGGTGCCATCACGCCCAG CTCATTGTTGATTCCCGCCCCCTTGGTAGAGACGGGATTCCGCTATATTGCCTGGGCTGGTGTCGAACTC ATAGAACAAAGGATCCTCCCTCCTGGGCCTGGGCGTGGGCTCGCAAAACGCTGGGATTCCCGGATTACAG GCGGGCGCACCACACCAGGAGCAAACACTTCCGGTTTTAAAAATTCAGTTTGTGATTGGCTGTCATTCAG TATTATGCTAATTAAGCATGCCCGGTTTTAAACCTCTTAAAACAATTTTTAAAATTACCTTTCCACCTAA AACGTTAAAATTTGTCAAGTGATAATATTCGACAAGCTGTTATTGCCAAACTATTTTCCTATTTGTTTCC TAATGGCATCGGAACTAGCGAAAGTTTCTCGCCATCAGTTAAAAGTTTGCGGCAGATGTAGACCTAGCAG AGGTGTGCGAGGAGGCCATTAAGACTATACTTTCAGGGATCATTTCTATAGTGTGTTACTAGAGAAGTTT CTCTGAACGTGTAGAGCACCGAAAACCCCGAGGAAGAGAGGTAGCGTTTTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_56H3KH · CTCF_binding_site · 19062315–19062336 · regulatory
ENSR17_56H3KN · CTCF_binding_site · 19062355–19062376 · regulatory
ENSR17_56H3RR · CTCF_binding_site · 19063674–19063695 · regulatory
ENSR17_56H3RZ · CTCF_binding_site · 19063714–19063735 · regulatory
· motif · 19060532–19060547 · motif
· motif · 19060540–19060555 · motif
· motif · 19060877–19060884 · motif
· motif · 19060891–19060906 · motif
· motif · 19060903–19060919 · motif
· motif · 19061637–19061646 · motif
· motif · 19061637–19061648 · motif
· motif · 19061637–19061648 · motif
· motif · 19061683–19061696 · motif
· motif · 19061686–19061700 · motif
· motif · 19061686–19061700 · motif
· motif · 19061889–19061898 · motif
· motif · 19062113–19062130 · motif
· motif · 19062231–19062245 · motif
· motif · 19062231–19062248 · motif
· motif · 19062278–19062289 · motif
· motif · 19062317–19062333 · motif
· motif · 19062357–19062373 · motif
· motif · 19062504–19062515 · motif
· motif · 19062605–19062616 · motif
· motif · 19063014–19063023 · motif
· motif · 19063443–19063454 · motif
· motif · 19063535–19063546 · motif
· motif · 19063648–19063658 · motif
· motif · 19063652–19063662 · motif
· motif · 19063676–19063692 · motif
· motif · 19063716–19063732 · motif
· motif · 19063760–19063771 · motif
· motif · 19063800–19063817 · motif
· motif · 19063803–19063817 · motif
· motif · 19063918–19063935 · motif
· motif · 19064150–19064159 · motif
· motif · 19064348–19064362 · motif
· motif · 19064348–19064362 · motif
· motif · 19064352–19064365 · motif
· motif · 19064400–19064411 · motif
· motif · 19064400–19064411 · motif
· motif · 19064402–19064411 · motif
· motif · 19065143–19065159 · motif
· motif · 19065156–19065171 · motif
· motif · 19065178–19065185 · motif
· motif · 19065507–19065522 · motif
· motif · 19065515–19065530 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD3B-1 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000577988 ★ | snoRNA | 758 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORD3B-1 預測可能位於核仁；此定位屬推論，資料未提供其在不同條件下的變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的RNA定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
DNA 與 RNA 序列
AAGACTATACTTTCAGGGATCATTTCTATAGTGTGTTACT40AGAGAAGTTTCTCTGAACGTGTAGAGCACCGAAAACCCCG80AGGAAGAGAGGTAGCGTTTTCTCCTGAGCGTGAAGCCGGC120TTTCTGGCGTTGCTTGGCTGCAACTGCCGTCAGCCATTGA160TGATCGTTCTTCTCTCCGTATTGGGGAGTGAGAGGGAGAG200AACGCGGTCTGAGTGGTTTTTCCTTCTTGATGGCTCAATG240ACAGAGACTAGCTCGTAAACTCCGGGCCGTTTCCGGGCTG280TTCGCTCCTGCTTGGCAATGTCGCGAGAAAGGTTTTCGCC320TCCTGTTTCAGCGGTGACGGCTTTTGGGTTTTCCTCGGGG360TGGCTTTTTAATTTTAGTCTTGGCGCGAGGCGGGGGATGC400TGTGTGGCACCTCCTATTGTCTCTTTTTGCGTTTTCTCCC440ATTCTCGCTCCCTCTTTTGTCGCCGTTTCCCGCCCGCCAC480TCCCACCCCCAGACGGGGTCTCCGGGTCTCTTGTTCTGTC520TGCCGGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTC560CTAGCAACATCTGCCTCCCGGGCTCAAGCGAGTCTCCCGC600CTAAGCCCTCCCGAGTAGCCGGGGCTTAAAGGCGCACACG640CCACTCCAGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG680GCAGAAACGGGGTGTCAGCATGTTAGCCAGGCTGGTCTCC720AACGCGTGATCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC758cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。