基因總覽
SNORD33 的正式名稱為 small nucleolar RNA, C/D box 33，屬於非編碼 RNA。現有資料未提供其序列、結構或其他分子特徵；資料庫摘要所列的功能與細胞定位均屬預測。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000362761 ★ | 49,490,615–49,490,699 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SNORD33 預測參與 RNA processing，但現有資料未說明其具體作用方式或影響的 RNA 類型，因此不宜據此推定特定加工機制。
此外，SNORD33 預測可能作用於 glucose metabolic process、insulin secretion，以及 reactive oxygen species metabolic process 的上游或過程之中。這些關聯是功能預測，資料未指出其直接作用對象、調控方向或彼此間的因果關係；因此目前只能將它們視為可能涉及的生物學過程，不能據此認定 SNORD33 已被證實會改變葡萄糖代謝、胰島素分泌或活性氧代謝。
Promoter 與基因調控
>SNORD33 ENST00000362761 GRCh38 chr19:49489615-49490715 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATATGAGGGGAGTTTGGGCCTCTTAAACTGCTCACTCACTGATCCTGAGGCAGCCTTGCTTTCTCAGTCC CTGTTCCTCATCTGTAGAACGGGGCTCCGTGCATAGTTCCCAGCTCTGATGGCTGGGTGCAAGGCACGCT GTTGGCACGGTAGGACAAAAGAAGGGAATGCTTGCTTGTGAGGACAATCAAAGGCTGTCCTTGTCTCTGA GTCCTTTTGCCCTTGTCTCCCACAGGTCCTGGTGCTTGATGGTCGAGGCCATCTCCTGGGCCGCCTGGCG GCCATCGTGGCTAAACAGGTACTGCTGGGTAAGTCGCTGCTCGTGGCCCCTCTGTCATGGGCCCCCGCTG GAGGTCAGTGATGAGCAACATTCACCATCTTTCGTTTGAGTCTCACGGCCATGAGATCAACCCCATGCAC CGCTCTGAGACCTGCCAGCCACTCTTCCCCAGGGTTGGGGACTCCAGGCTCAAGAAGTAATTATGTATTA GGCTAGTTTTTCATTTAAACAGGAACTTAGCTCTGGCAAGTACTGCGCTGTGTCTGGAGGGTGACTGCAT AGGCAGTGGTGGGACCCTCAGGCGGCTCGGCCCTGCTAAGCCTTTCCCTCCCTCTAGGCCGGAAGGTGGT GGTCGTACGCTGTGAAGGCATCAACATTTCTGGCAATTTCTACAGAAACAAGTGTAAGTTAGGACCTGGG AGGAGCACTGGAGAGGGTCTCCCTGTGGGGTGTTGAGGCTCTGAAAGCAATTGCAGCCGTGTTGGGAGAG GCTACTTGGGGTTTCTGAGAAGGCCCTTGGAAGTGGGGTTTTGGGGGTGCTGGTAGACTGGGCAGGCCTC ACACTCTCCCCTCTCCCTAGTGAAGTACCTGGCTTTCCTCCGCAAGCGGATGAACACCAACCCTTCCCGA GGCCCCTACCACTTCCGGGCCCCCAGCCGCATCTTCTGGCGGACCGTGCGAGGTGAGCAGAGCGTGGGGA CTGCAGGTGGTGACGGGCAGGCGGCCGGTGATGAGAACTTCTCCCACTCACATTCGAGTTTCCCGACCAT GAGATGACTCCACATGCACTACCATCTGAGGCCACCCCATGGGCCCACCTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_BCS6L · promoter · 49487020–49487618 · regulatory
ENSR19_5FM9ZG · CTCF_binding_site · 49490229–49490250 · regulatory
· motif · 49487083–49487094 · motif
· motif · 49487268–49487278 · motif
· motif · 49487289–49487299 · motif
· motif · 49487407–49487422 · motif
· motif · 49487428–49487439 · motif
· motif · 49487430–49487439 · motif
· motif · 49487472–49487485 · motif
· motif · 49487472–49487485 · motif
· motif · 49487489–49487500 · motif
· motif · 49487489–49487500 · motif
· motif · 49487547–49487556 · motif
· motif · 49487628–49487638 · motif
· motif · 49487994–49488005 · motif
· motif · 49487994–49488005 · motif
· motif · 49488103–49488115 · motif
· motif · 49489320–49489334 · motif
· motif · 49489320–49489334 · motif
· motif · 49489890–49489907 · motif
· motif · 49490231–49490247 · motif
· motif · 49492570–49492587 · motif
· motif · 49492600–49492613 · motif
· motif · 49492889–49492906 · motif
· motif · 49492898–49492906 · motif
· motif · 49493746–49493768 · motif
· motif · 49493746–49493768 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD33 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000362761 ★ | snoRNA | 85 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORD33 預測位於核仁；此定位屬預測，來源未提供實驗驗證或其他條件下的定位變化資訊。
深綠色圓點：來源記載的RNA定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNORD33 預測參與 RNA processing，並可能作用於 glucose metabolic process、insulin secretion 及 reactive oxygen species metabolic process 的上游或過程之中；其定位亦預測在核仁。這些均屬預測。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in RNA processing. Predicted to act upstream of or within glucose metabolic process; insulin secretion; and reactive oxygen species metabolic process. Predicted to be located in nucleolus. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | SNORD33 預測位於核仁；此定位為預測，並非來源所述的已確認結果。 | 推論支持 |
DNA 與 RNA 序列
GCGGCCGGTGATGAGAACTTCTCCCACTCACATTCGAGTT40TCCCGACCATGAGATGACTCCACATGCACTACCATCTGAG80GCCAC85cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。