基因總覽
SNORD28 的正式名稱為 small nucleolar RNA, C/D box 28，屬於非編碼 RNA。名稱將它歸為 C/D box 類小核仁 RNA；現有資料未提供其序列、結構細節或其他分子特性，因此不進一步推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000384706 ★ | 62,854,621–62,854,695 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料將 SNORD28 與 RNA 加工相連，但此功能屬預測，並非已確立的作用描述。來源未提供其參與的 RNA 加工步驟、作用方式或相關生物學過程，因此無法據此說明更具體的分子機制。
Promoter 與基因調控
>SNORD28 ENST00000384706 GRCh38 chr11:62854595-62855695 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTTAAAAGTAGCAGTGGGGCTTTGTGAAGGACAAAATGGCGATGGCGGGCCGTGTAGGTCCCCCTTCCTA TGATGAGGACCTTTTCACAGACCTGTACTGAGCTCCGTGAGGATAAATAACTCTGAGGAGATGGGCCCTG CAAGCCTCTTGCTTAGCCGTCTGTTCAGAAAATAGCGTTTTCGAAATGCCCTGAGTTGACCTAATGTCTT ATTGGGCTCCTGTCTGCAGGATTTACGCGCACGTTGGAACCGAAGAGAGCTCTGTTGTTGCAGTAAGTTC TTACGGCCATTTCTTAATCTCTGCTCTTTCGTTGAGTGTGTGGAAGTTGCTACGGGGATGATTTTACGAA CTGAACTCTCTCTTTCTGATGGATTAGTGGAGAAAACAGAAAATTCTGAGTAGCACTGTACTGTACGCAA CAAATGTCAGGGCCCTATTGATTTGTCTGAGGTGTTAGTGAAGGGTGTTATTTTTTCAGATGTTCAGCCC ACAAGAGCTTACTGGTGAAGGAATGGGACAAGACCCATCTTTATGCAAAGCCAGCGTTACAGTAATGTTC CAGGTAGGTGTACATGGTTTATGCTCTTACAGAGGAGACCTTGTAGATAACCACTCCATGATGAACACAA AATGACAAGCATATGGCTGAACTTTCAAGTGATGTCATCTTACTACTGAGAAGTGAGAGAGAGGTCTTAA GGGGTCTTTGAATGACTATTTTTAGGTACATAAAATGCTTTCCTCTGTTGTCTACAGCATCTCATAATCT ATCCTGGGGAATTCAGCTGCCTCCCAGGGTGAATACAGGTAATTATCCAAATTGGTGTATGTCATCTTTG TAAATGTTCAAGAAAACAAGTGGCCGGCGGAACAATGTTTTTTGGCGCCTTCCATCTTGTTCCTCTTGAA ATGATTTTCTGGGGAGGGAGATCGCAACCCGGTACTACAGTTCTTGTAAGGGTGTGCTGTTACCCTCATC CATATATCGATCACGTTACTGTCAGATGATTTGAATTGATAAGCTGATGTTCTGTGAGGTACAAAAGTTA ATAGCATGTTAGAGTTCTGATGGCAGTTGTTGTTTATGAATAAGCTTCATT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_83SW68 · enhancer · 62852871–62853105 · regulatory
ENSR11_BGGRD · enhancer · 62853220–62854027 · regulatory
ENSR11_83SW72 · enhancer · 62854204–62854418 · regulatory
ENSR11_BGGRL · enhancer · 62854566–62855553 · regulatory
ENSR11_BGGRP · promoter · 62855554–62856178 · regulatory
ENSR11_C88DX · enhancer · 62856179–62857960 · regulatory
ENSR11_9WXM7 · enhancer · 62858205–62858577 · regulatory
ENSR11_9WXMD · enhancer · 62858878–62859286 · regulatory
· motif · 62851924–62851935 · motif
· motif · 62852125–62852138 · motif
· motif · 62853477–62853492 · motif
· motif · 62855026–62855039 · motif
· motif · 62855026–62855039 · motif
· motif · 62855646–62855656 · motif
· motif · 62855652–62855662 · motif
· motif · 62855892–62855905 · motif
· motif · 62855892–62855905 · motif
· motif · 62855927–62855940 · motif
· motif · 62855942–62855952 · motif
· motif · 62855960–62855971 · motif
· motif · 62855960–62855971 · motif
· motif · 62855970–62855986 · motif
· motif · 62855970–62855986 · motif
· motif · 62855987–62856000 · motif
· motif · 62855987–62856000 · motif
· motif · 62856070–62856081 · motif
· motif · 62856070–62856081 · motif
· motif · 62856126–62856148 · motif
· motif · 62856126–62856148 · motif
· motif · 62856139–62856156 · motif
· motif · 62856231–62856246 · motif
· motif · 62856768–62856783 · motif
· motif · 62857041–62857056 · motif
· motif · 62857046–62857058 · motif
· motif · 62857049–62857056 · motif
· motif · 62857343–62857358 · motif
· motif · 62857348–62857360 · motif
· motif · 62857351–62857358 · motif
· motif · 62857358–62857370 · motif
· motif · 62857361–62857376 · motif
· motif · 62857403–62857418 · motif
· motif · 62857683–62857690 · motif
· motif · 62857905–62857918 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORD28 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000384706 ★ | snoRNA | 75 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORD28 被預測位於核仁；這是預測性定位資訊，資料未提供定位變化的條件或其他細胞區室的資訊。
深綠色圓點：來源記載的RNA定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNORD28 被預測可能參與 RNA 加工，也被預測位於核仁。這兩項資訊均屬預測，來源未說明具體的加工步驟、作用機制或定位條件，因此不宜視為已證實的功能或定位。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in RNA processing. Predicted to be located in nucleolus. · CC BY 4.0 |
| 細胞定位 | SNORD28 被預測位於核仁；此定位資訊屬預測，並非來源已確認的結果。該筆資料沒有提供定位變化的條件、其他區室資訊或相關實驗細節。 | 推論支持 |
DNA 與 RNA 序列
GTCAGATGATTTGAATTGATAAGCTGATGTTCTGTGAGGT40ACAAAAGTTAATAGCATGTTAGAGTTCTGATGGCA75cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。