基因總覽
SNORD13P1 是人類假基因（pseudogene），正式名稱為 small nucleolar RNA, C/D box 13 pseudogene 1。來源記錄的類型為 pseudogene。此基因座位於 22q13.2。目前可用來源提供名稱、分類與基因座資料，尚未提供可採用的功能敘述；功能與產物資訊依後續取得的來源註解補充。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000458891 ★ | 42,076,058–42,076,161 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
Promoter 與基因調控
>SNORD13P1 ENST00000458891 GRCh38 chr22:42076061-42077161 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGTGTCCCTAAGGTCCCTAAAGTCTCCTGAGAAGTGGGCTCGTCTTTCCTTCCTTTTCTCTCAAAGGGA TGTCGTGAGGATCATGCAAAAAAAACTGGACACTGGCGGACTTCGAGAAAAGAATAACGAGATTGCATCA GACAGGAGGCATGGCAGGACCTGGGCACGGCTTTCTAAAATCCAAAGAAACAGGCCCCAGCTGAGCTGAA ATGGACCCCAGACCCATCGAAACCACTGTGCTTAAACTATCCCCTCATCTGGGGTCCTCTCAACTCCAAC TCTGAGGCCAAGCTTCCAGGGTTTCCATGACCCTCCTGGGCCTCTACTGGCCTCTTATTTGCATATAGCT GTTGAATCTTATTGACCTACAGGCAGAAGCTGAGGCACAAATATAACTTTAAAGAGTTTACTTGAGCGAG AGTAAGGATAACTGCCCAGAACAAACTTCTAAGTTGCCGTGGGGTGTGCTGCGTTGGGCCTTTCCTACAG GTTTTTATAGGCAGAAGGGGGCAAGGATGACAAAGTTGTTTGGCAGGAATTCTCCTTGGTTTATAGAAAT AACATTGATTGGTGGGGTGCGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGA TCACCTGAGCTCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTAAATACAAAAATT AGCCAGGCACGGTGGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGATC CCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCACCTGGGTGACAAGAGAGAAACT CCATCTCAAAAAAAAAAAAAGAAATAACATTGATTAGTGATTGGCTATACATTGTTGAACTATAGGGTAT GAACTATAGGGTGTCCAGTGTACAGCATTTTATGGCTACTTGGTGTCACTCTAGAGCCACATAGCAAGTG GCTTCAAGAGGTAATTCTTGATCCTTTTGTAGTTCATGAGCGTGATGATTGGGTGTTCACATGCATGTGT GAGCTGTGCCACCCTCGAACCTTGTTACCATGTAGGCACATTACCGATCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_BBCFN · enhancer · 42070960–42071561 · regulatory
ENSR22_9LNTS · enhancer · 42072613–42072874 · regulatory
ENSR22_9LNW7 · promoter · 42073869–42074258 · regulatory
ENSR22_BBCG7 · enhancer · 42074259–42075268 · regulatory
ENSR22_9LNXQ · promoter · 42079210–42079710 · regulatory
ENSR22_9LNXZ · promoter · 42079940–42080440 · regulatory
· motif · 42071223–42071236 · motif
· motif · 42071250–42071263 · motif
· motif · 42071323–42071334 · motif
· motif · 42071323–42071334 · motif
· motif · 42071408–42071420 · motif
· motif · 42071410–42071425 · motif
· motif · 42071436–42071448 · motif
· motif · 42074470–42074482 · motif
· motif · 42074508–42074525 · motif
· motif · 42074601–42074616 · motif
· motif · 42074660–42074673 · motif
· motif · 42074669–42074682 · motif
· motif · 42074676–42074683 · motif
· motif · 42074768–42074783 · motif
· motif · 42078732–42078747 · motif
· motif · 42078732–42078747 · motif
· motif · 42079703–42079719 · motif
· motif · 42079763–42079773 · motif
· motif · 42079849–42079859 · motif
· motif · 42080085–42080098 · motif
基因座與轉錄註解
SNORD13P1 依 HGNC／Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000458891 ★ | snoRNA | 104 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
DNA 與 RNA 序列
ATCCTTTTGTAGTTCATGAGCGTGATGATTGGGTGTTCAC40ATGCATGTGTGAGCTGTGCCACCCTCGAACCTTGTTACCA80TGTAGGCACATTACCGATCTGACA104cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。