演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN NON-CODING RNA GENE

SNORD102U102

small nucleolar RNA, C/D box 102

SNORD102 為人類非蛋白質編碼 RNA 基因,此頁收錄已核對的名稱、分類與基因座資訊。

Homo sapiens13q12.2
OFFICIAL SYMBOL
SNORD102
CHROMOSOME
13
RNA TYPE
snoRNA
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SNORD102 是人類非蛋白質編碼 RNA 基因,正式名稱為 small nucleolar RNA, C/D box 102。來源記錄的類型為 RNA, small nucleolar。此基因座位於 13q12.2。目前可用來源提供名稱、分類與基因座資料,尚未提供可採用的功能敘述;功能與產物資訊依後續取得的來源註解補充。

Official symbol
SNORD102
Gene name
small nucleolar RNA, C/D box 102
Organism
Homo sapiens
Gene type
Non-coding RNA
HGNC ID
HGNC:10099
RNA type
RNA, small nucleolar
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
U102RNU102

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1313q12.2
chr13 · 114,364,328 bp · GRCh38chr13p13 · 1–4600000 · gvarchr13p12 · 4600001–10100000 · stalkchr13p11.2 · 10100001–16500000 · gvarchr13p11.1 · 16500001–17700000 · acenchr13q11 · 17700001–18900000 · acenchr13q12.11 · 18900001–22600000 · gnegchr13q12.12 · 22600001–24900000 · gpos25chr13q12.13 · 24900001–27200000 · gnegchr13q12.2 · 27200001–28300000 · gpos25chr13q12.3 · 28300001–31600000 · gnegchr13q13.1 · 31600001–33400000 · gpos50chr13q13.2 · 33400001–34900000 · gnegchr13q13.3 · 34900001–39500000 · gpos75chr13q14.11 · 39500001–44600000 · gnegchr13q14.12 · 44600001–45200000 · gpos25chr13q14.13 · 45200001–46700000 · gnegchr13q14.2 · 46700001–50300000 · gpos50chr13q14.3 · 50300001–54700000 · gnegchr13q21.1 · 54700001–59000000 · gpos100chr13q21.2 · 59000001–61800000 · gnegchr13q21.31 · 61800001–65200000 · gpos75chr13q21.32 · 65200001–68100000 · gnegchr13q21.33 · 68100001–72800000 · gpos100chr13q22.1 · 72800001–74900000 · gnegchr13q22.2 · 74900001–76700000 · gpos50chr13q22.3 · 76700001–78500000 · gnegchr13q31.1 · 78500001–87100000 · gpos100chr13q31.2 · 87100001–89400000 · gnegchr13q31.3 · 89400001–94400000 · gpos100chr13q32.1 · 94400001–97500000 · gnegchr13q32.2 · 97500001–98700000 · gpos25chr13q32.3 · 98700001–101100000 · gnegchr13q33.1 · 101100001–104200000 · gpos100chr13q33.2 · 104200001–106400000 · gnegchr13q33.3 · 106400001–109600000 · gpos100chr13q34 · 109600001–114364328 · gnegSNORD102pq1 bp114,364,328 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr13:27,255,064–27,255,135
Gene span
72 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000384769 ★27,255,064–27,255,1351

顯示 1/1 個RNA轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前可用來源未提供可採用的功能註解。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 27255064 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SNORD102 ENST00000384769 GRCh38 chr13:27254064-27255164 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAGGCTGATTGTGCTGTCAGGAGAAATTGTCCATTGGGAAGATAATAAGCATGTAACCATCAAAAATGAT
ATATGTGTTAAAAGCTAGTAAAATTGCATTTCTTTTACTCTAGATTTTTAGCCTTAATACTCACTATACC
AAATTTATTTTTGTAGGAGTTGTTCCTTTGGCCACATATATGCGAATCTATAAGAAAGGTGATATTGTAG
ACATCAAGGTAAACATAAAATTGGGAAAATAACACTACAGAAGATAGAAAAGTTGGATTTAATCTAGTGT
AGGAATTCAAATACTAGTGTATGTTGCATCTGTAAGAGTATAGAATGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGG
AGACGGAGTTTCACTCTTGTTGCTCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTCACCTCAACCTCCGCCTCCC
TCCCGGATTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGATTACAGGCGTGCACCATGATAC
CTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGTGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACACCTCG
GGTGATCTGCTGGACTCAGCCTCCCAATGTGCTGGGATTACAGGCATGCACCATGATTCCTGGCTAATTT
TGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACACCTCGGGTGATCCGCC
GGACTCAGCCTCCCAATGTGCTGGGATTATTACAGGTGTGAACCACCGTGCCCGGCCTAGAATGGATTTT
TTAAAGTGCTATTCTTAGCAGAATTTAAATTTTCCTCATTACCCGCTTGGAGTTAACAGCTAGTGGAAAT
TGGGTGGTAGGGTGGGAAATTATGAGTTTATCAAGTTGGAAAGGAACGCCTTAGTGCAAAGTTTAATTAT
TGATGAAGATTACTATTACTATGATTAAAAACCCTCCTAGTGAAAGCTGTGTTCTTCTGTGACCTGGATT
TAAATGTATCTTGGCACTCGAGCTTAATGATGACTGTTTTTTTTGATTGCTTGAAGCAATGTGAAAAACA
CATTTCACCGGCTCTGAAAGCTCTTGAGTTGCCATTTGAAAGAAATCTTAG
SNORD102 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnewNC human v001 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR13_9DS35 · promoter · 27250701–27251201 · regulatory

ENSR13_9DS38 · promoter · 27251250–27251607 · regulatory

ENSR13_C4P2C · enhancer · 27251608–27252686 · regulatory

ENSR13_B7F3J · enhancer · 27257529–27258051 · regulatory

ENSR13_B7F3T · enhancer · 27259749–27260282 · regulatory

· motif · 27251216–27251231 · motif

· motif · 27251261–27251270 · motif

· motif · 27251264–27251281 · motif

· motif · 27251356–27251378 · motif

· motif · 27251356–27251378 · motif

· motif · 27251570–27251580 · motif

· motif · 27251637–27251652 · motif

· motif · 27251643–27251660 · motif

· motif · 27251818–27251829 · motif

· motif · 27251905–27251914 · motif

· motif · 27251928–27251950 · motif

· motif · 27251928–27251950 · motif

· motif · 27252092–27252104 · motif

· motif · 27252237–27252252 · motif

· motif · 27253054–27253076 · motif

· motif · 27253054–27253076 · motif

· motif · 27256602–27256613 · motif

· motif · 27256713–27256722 · motif

· motif · 27256713–27256722 · motif

· motif · 27257075–27257087 · motif

· motif · 27257135–27257144 · motif

· motif · 27257135–27257144 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / RNA TRANSCRIPTS

RNA 轉錄本與序列

Non-coding RNA

SNORD102 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000384769 ★snoRNA72 nt1

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

RNA 細胞內定位

動物細胞結構與RNA定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

0 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 0 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000384769 · 72 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCTTAATGATGACTGTTTTTTTTGATTGCTTGAAGCAAT40
41GTGAAAAACACATTTCACCGGCTCTGAAAGCT72

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。