基因總覽
SNORA71B 的正式名稱為 small nucleolar RNA, H/ACA box 71B，屬於非編碼 RNA。名稱指出它歸於 H/ACA box 小核仁 RNA 類別；現有資料未提供其序列、長度或更具體的結構資訊。其基本特性是 RNA 分子，而非蛋白質；資料並未描述其產物形式或其他分子特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000439232 ★ | 38,425,083–38,425,354 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前的資料將 SNORA71B 與 RNA 處理關聯起來，但這項功能屬於預測，尚不能視為已確立的作用。來源沒有提供它參與哪一種 RNA 處理步驟、作用對象或分子機制，因此不宜進一步推定其具體功能。
Promoter 與基因調控
>SNORA71B ENST00000439232 GRCh38 chr20:38425254-38426354 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAGGTCACTAGAGGGGAGGCAGAGGCTGCTTCCCATTGCTTGCTCTTCCACTGAGGCCCACAGGGACATG TGACACCCTCTTTTCCTCGAACTCTGCGACTCCACTGTGTGAATCACGGTGGGGCTTACAGAGCTCCCCT TGGGCTCTGAGTCATCCTAGTGTGGATTGGCATAGTTTGTTGAAGTGGGAGGAGTACTGCATTTTGGAGG CAGGCAATTAGCTAGTGGTTTTCTCTGGACTTGGTGGCGATCCTTGTTATGAAGTGATTTATGGATTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGCAGGGTCTCATTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATGAT GGCTCACTGCAGCCTCGACCTGGGCTCAAGTGATCCTCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGACCACAG GTACGTGCTGCTGCACCCAGCTAATTTTTAGAAATTTTTTGTAGAGGCGGAGTCTCACCATGTTGCTTGG GCTCGTTTTGAATTCCTGGGCTCAAGCAATCCTTCCACCTTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTATGGATA GTAAGTCCAGGCCTGGCCGACGTGTGGATAGTATCACACAATCCCTGACTTCCTAATCCAGTGAATTCTC AACATTTCACCCAGAGTTGATCTTCCATCTCATTCTCTTATGAGGGAAGCATTTGAGTAGTGGTTCTCAA ACTGTGGTCCCAGAACCAGGTACCATCAGTATTACTTGGGAACTTGTAAGAAGTGCAAGTTCTTAGCCCT GTCCCAACCTACTACATCAGAAGTTTTGGATCTGGAGCCAGCAATCTGGCTTAACATGGTCTCCAGGTGA TTCGTATTCATGCTAAAGTTTGGGAAATCAAACCATGTTAGAAATCTTTGGGAATCAGAAGCAGCTGCTG CAATTCTAGGCTGCAAATCTGGTCACTGACTTGTTTCCAGGTCTCTTAGTTTGGGCCCTTCCTAAGCTGC TGTCAGTGCCTCCCCTCTCAACTCACTCACTGCCCTATTTTGTCCCTGTATTCGAAAGTGATCGTGGGCT GCCTTTGCCCTGGTCATTGATAGTGCAGGGAGAGGAATCAATGAAAGCGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_B9LWD · enhancer · 38426051–38426882 · regulatory
ENSR20_9K8RZ · enhancer · 38426991–38427360 · regulatory
· motif · 38423154–38423168 · motif
· motif · 38427130–38427138 · motif
· motif · 38428522–38428533 · motif
· motif · 38428526–38428540 · motif
· motif · 38428994–38429008 · motif
· motif · 38428994–38429008 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORA71B 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000439232 ★ | snoRNA | 272 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
SNORA71B 被預測位於核仁；此定位屬推論性資訊，來源未提供實驗驗證、定位改變條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的RNA定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
DNA 與 RNA 序列
ACTCACTCACTGCCCTATTTTGTCCCTGTATTCGAAAGTG40ATCGTGGGCTGCCTTTGCCCTGGTCATTGATAGTGCAGGG80AGAGGAATCAATGAAAGCGCTTCCCCGTGTTTGAAGGGTC120CACTCCTATCCCTTCCAAACTCTGGAGCTTTCGTACATGC160CTTTATTCTCACCAGTGATGTTACCTCCTGGTACCTGGTT200GTCGTGCCAGACCCCTGTTTACCTCATTAGGGATGGCACC240AGGTTCAACAGGCCGGAGAAGAGACCTGGAGC272cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。