基因總覽
SNORA66（small nucleolar RNA, H/ACA box 66）屬於非編碼 RNA，並非蛋白質編碼基因。其名稱標示它屬於 H/ACA box 小核仁 RNA；來源指出，這種 RNA 位於核仁，且與 GAR1 蛋白相關。現有資料未提供其 RNA 長度或更細部的結構資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000384792 ★ | 92,840,719–92,840,851 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SNORA66 被描述為參與其他小核 RNA 生合成的非編碼 RNA。來源未進一步說明它在這項生合成過程中的具體作用步驟，因此無法據此界定其分子機制。
此 RNA 位於核仁，並可能參與 18S 核糖體 RNA 的假尿苷化；這項功能以「可能參與」描述，並非確定的作用結論。來源也指出 SNORA66 與 GAR1 蛋白相關，但未交代此關聯的性質或其對 RNA 修飾的影響。
Promoter 與基因調控
>SNORA66 ENST00000384792 GRCh38 chr1:92839719-92840819 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGTCAGACAGTATTTAAAATGAGAAGCGCAATATTTGTTTCTGCAGACAAAAATTTGATTTAGAGTGACT CAAGAAGTGTGGCTGAATTTCTCAGAAGTACATGCAGATTTTTCTTTTTGTTTTCTTACTTTTTTTTTTT GAGGCAGGATCTTGTTCTGTTTCCTGGGCTGGGGTGCAATGGCACAATTATAGCTCATTGCAACTTCAGA CTTCTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTCTCGAGGTAGCTGGGGTTATAGGTGTGCACCACCAT GCCCTGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTTGGTAGAGATGAGGTCTCATTCTGTCATCTAGGCTG GGGTCCAGTGAGCTGTGATTGTGCCACTGCAGCCTTGACCTCCTGGACTCACGTGTAGTCCTGTAGCTGG GACTACAGGTGCATGCCACCATTAATAATTGCCACCTGGCTAATTAGTTTTTTTATGGAGACAGGTCTCA CTGTGTTGCCTTAGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTGAAGTGATCCTCCCACTTCAGACTCCCAAAGTGCT TGAGATTACAGGCATGAACCACCACACCTGGCCTGATTTTTTTCTTGAGTAAGATGGAGTTCTGTAGTGA TAATTCACATTGCATAAGGTGAAAATTGGGAATTTGTTAGGAAAAGGTGAGTTACATTTAGAAGTTAAAG TGTTTACCAACATTGATTTAGTTTAGTTCCTTTTGAGAATCTGGCTTAGAAGGACAAGATAAGTTATGGT TGCATTAATATAGTAGGGCACATGAAATGAAACCAAGTACTGTTTGCTTTCCTTTGTTTCAGATGGAGGA GATGTATAAGAAAGCTCATGCTGCTATACGAGAGAATCCAGTCTATGAAAAGAAGCCCAAGAAAGAAGTT AAAAAGAAGAGGTATGTCGTCTTTTTTTTTGTCTTTTCAAGAAAACAGGTTGGGAATGGTTCCCACGTGG GGCAGACTGTTGGTGTAATTGTGCAAACTCGATCACTAGCTCTGCGTGATGTGGCAGAAGCGAAGGGAAC CAGGTTTGCAAAAGTAACTGTGGTGATGGAAATGTGTTAGCCTCAGACACT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
· motif · 92837695–92837706 · motif
· motif · 92842415–92842427 · motif
· motif · 92842810–92842825 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORA66 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000384792 ★ | snoRNA | 133 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNORA66 是參與其他小核 RNA 生合成的非編碼 RNA，位於核仁，可能參與 18S 核糖體 RNA 的假尿苷化，並與 GAR1 蛋白相關；來源未詳述其具體機制。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源This gene encodes a non-coding RNA that functions in the biogenesis of other small nuclear RNAs. This RNA is found in the nucleolus, where it may be involved in the pseudouridylation of 18S ribosomal RNA. This RNA is found associated with the GAR1 protein. |
DNA 與 RNA 序列
GTGCAAACTCGATCACTAGCTCTGCGTGATGTGGCAGAAG40CGAAGGGAACCAGGTTTGCAAAAGTAACTGTGGTGATGGA80AATGTGTTAGCCTCAGACACTACTGAGGTGGTTCTTTCTA120TCCTAGTACAGTC133cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。