基因總覽
SNORA63 是人類非蛋白質編碼 RNA 基因,正式名稱為 small nucleolar RNA, H/ACA box 63。來源記錄的類型為 RNA, small nucleolar。此基因座位於 3q27.3。目前可用來源提供名稱、分類與基因座資料,尚未提供可採用的功能敘述;功能與產物資訊依後續取得的來源註解補充。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000363450 ★ | 186,787,300–186,787,431 | 1 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SNORA63 ENST00000363450 GRCh38 chr3:186786300-186787400 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAGGTAGAGATGGGGTTTATTTAATGCAGGTACTGTTACAATACAACTGATGTGTTTTGTTGTCGTTCCC CCTGCTTAAAGCACTTGATGCATAACTCTGTCTACCTTCATTCCGTAGTAAGACAGAGACGCTTGGCTTC AGACATTTTCCTTTGGGTATTAATGTGTAAGTTGTGCTACAACATAATTTTCTCTTTTTAAGGTTGTGTT GCTTTCTGCCACAATGCCAACTGATGTGTTGGAAGTGACCAAAAAATTCATGAGAGATCCAATTCGAATT CTGGTGAAAAAGGAAGAATTGACCCTTGAAGGAATCAAACAGTTTTATATTAATGTTGAGAGAGAGGTAA CTGTCTGATTGTTAGACATTATTTTACCTTCTTGTATAAGCACTGTGCTAAAATTGCAGACACTAGGACC ATGTCTTGGTTTTTGCAATAATGCTAGCAGAGTACACACAAGAAGAAAAGTAACAGCACTAGATTGTAAA GACTGGGGTGGACCTCTTTCTTAATGTCCAATGTCCTTTGTCTTAAGATTTGGTGCAATATCTCATTAGA CCTAACAGAATGAAGTTAATTTTTATAATTTCTACGTTTTGAGACTGGGTTATGAGACTGGCTAAGACTG GCCAATTTTGGTATTTTGGGTAGAGACAGTTTCACTTTCTTGAAACCCTGGTCTGGTTGGAACTCTGGGC TCTAAGTGCTAGGATCCCAAAGGGCTGGGATTACAGGCATTAGCACTGTGGCTGGCCCAGAATGAATTTT TAACTGAAGAGTTGGAAAAACTAAATGACTGTTAACTTTAACTTCTAAACATTACAGGAATGGAAGTTGG ATACACTTTGTGACTTGTACGAGACACTGACCATTACACAGGCTGTTATTTTTCTCAATACGAGGCGCAA GGTGGACTGGCTGACTGAGAAGATGCATGCCAGAGACTTCACAGTTTCTGCTCTGGTAAGAGGTGTTCTA AAATGTCTGGATTTCCACTAAAGCAGGATTCAGACTACAATATAGCTGCTAAGTGCTGTGTTGTCGTTCC CCCTGCTTAAAATAAAGTTGTTTCTTAACTATACCTGTCTGCTATTCTCCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_94Q5P4 · promoter · 186783087–186783587 · regulatory
ENSR3_B3D3T5 · enhancer · 186783588–186784168 · regulatory
ENSR3_94Q5PF · promoter · 186784169–186784669 · regulatory
ENSR3_87H9GL · enhancer · 186785670–186785884 · regulatory
· motif · 186782825–186782837 · motif
· motif · 186782827–186782849 · motif
· motif · 186782827–186782849 · motif
· motif · 186782830–186782839 · motif
· motif · 186782877–186782888 · motif
· motif · 186782879–186782888 · motif
· motif · 186783295–186783305 · motif
· motif · 186783659–186783674 · motif
· motif · 186783672–186783684 · motif
· motif · 186783674–186783687 · motif
· motif · 186783867–186783876 · motif
· motif · 186784254–186784269 · motif
· motif · 186784435–186784445 · motif
· motif · 186784898–186784910 · motif
· motif · 186785367–186785376 · motif
· motif · 186785367–186785376 · motif
· motif · 186785541–186785552 · motif
· motif · 186785829–186785837 · motif
· motif · 186787629–186787640 · motif
· motif · 186788001–186788014 · motif
· motif · 186788001–186788014 · motif
· motif · 186788354–186788367 · motif
· motif · 186788354–186788367 · motif
· motif · 186788603–186788615 · motif
· motif · 186789144–186789155 · motif
· motif · 186789765–186789777 · motif
· motif · 186790584–186790596 · motif
· motif · 186790757–186790770 · motif
· motif · 186790966–186790981 · motif
· motif · 186791422–186791431 · motif
RNA 轉錄本與序列
SNORA63 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000363450 ★ | snoRNA | 132 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
DNA 與 RNA 序列
AAGCAGGATTCAGACTACAATATAGCTGCTAAGTGCTGTG40TTGTCGTTCCCCCTGCTTAAAATAAAGTTGTTTCTTAACT80ATACCTGTCTGCTATTCTCCTGTAGCAGCCAGGGACGCTT120GGTCTCATACAT132cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。