基因總覽
SNAPC2（small nuclear RNA activating complex polypeptide 2）是由 SNAPC2 基因編碼的蛋白質，屬於 SNAPc 複合體。此複合體由 SNAPC1、SNAPC2、SNAPC3、SNAPC4 與 SNAPC5 五個次單元組成。SNAPC2 是參與小核 RNA 基因轉錄的蛋白質複合體成員；其特徵與角色，主要由它在 SNAPc 中的位置及其與轉錄相關分子的互作所界定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000221573 ★ | 7,920,338–7,923,250 | 5 |
| ENST00000853925 | 7,920,314–7,923,249 | 5 |
| ENST00000971261 | 7,920,314–7,923,249 | 4 |
| ENST00001117224 | 7,920,314–7,923,250 | 5 |
| ENST00001136067 | 7,920,314–7,923,250 | 5 |
| ENST00000595637 | 7,920,387–7,922,657 | 4 |
| ENST00000597584 | 7,921,015–7,923,250 | 5 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SNAPC2 是 SNAPc 複合體的一員，而 SNAPc 對 RNA polymerase II 與 RNA polymerase III 所轉錄的小核 RNA 基因都屬必要。這表示該複合體參與兩類聚合酶所負責的基因轉錄；現有資料將 SNAPC2 的功能置於複合體層級，未分別說明它對兩類基因轉錄的獨立貢獻。
在啟動子辨識方面，SNAPc 會結合近端序列元件（proximal sequence element，PSE）。PSE 是一種基礎啟動子元件，不含 TATA box，且為上述兩類小核 RNA 基因共同具有。藉由結合此序列元件，SNAPc 參與辨識相關啟動子；來源未進一步描述結合過程的調控條件或 SNAPC2 本身的直接辨識方式。
對 U6 snRNA 基因而言，SNAPc 還會將 TBP 與 BRF2 招募至 TATA box。這項作用將啟動子上的序列辨識與轉錄相關因子的配置連結起來，並補充 SNAPc 在小核 RNA 基因轉錄中的角色。來源指出這項招募發生於 U6 snRNA TATA box，但未提供招募的先後順序、條件或其對轉錄量的具體影響，因此不宜延伸為更廣泛的調控機制。
Promoter 與基因調控
>SNAPC2 ENST00000221573 GRCh38 chr19:7919338-7920438 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCCAGACCAGCGTGG CCGACATGGTGAAACCCCGTCCCTACTAAAAAAAGTAACAAAAAAAGAATTAGCAGGGCGTAGTGGCGCG TGCTTATAATCCCAGCTGCTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCA GTGAGCCGAGATCGCGCCATTGCACTGCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAAATCTGTCTAAAAAAAAAAAA AAAGCGGCACCCAACCCCACAAGCGTAAGTTTAAAATAAACCTTCCCCCTCCCTCCTCTCCTTACCCGGA CACCTGCCCATCTGCCTCCTGCGATCTTTCTCAAGCCAGGCCTTCTCCGCTCTCCATTACCCCCGCCCGG ACCCTGCCCTAGCTCCGCTTCGACCTTCTGCCTCTGCTCCAGTTCCCTCCTGGTCTGGACTTCGCCCTCC TCTTAGATTGTCAGTCTAGTCTAGAGCTCCTTAAATCCCTCCTGCCCGAGCTCCACTCTACCTTACACAG ACAAGAGTGGGACTATCAGCCCCAGTCTACAGAGGAGGAAACTGAGGCTCGGCAAGGCTAAATCACTTGC CCAAAGTCCCCAGGCCTGTCTGACCCCAGAGCCCAGGCTCTTGACCGACTGGATCTTCGGACTTGACCTT TCGGCCAGAACCCACCCCTCTGCGAGAAGCAAAGCACACAGTAGTAGCTTCATGAGTTAGTCCAGCAACA GAGGGAGGGCATGGGATCCAAGGTGTCGTCTCCACTTCATGAATGAGATAAAGTGCAGGCTGAGGGTCTC CTTCGCCCCGCCCCAGTTCCGGTGCCGATCTCCCCTTCACTTCCATTGGGGCGGTTCCCCGGGCCTCCAA ACGCGAAGCCACGCCCCCACGCGCGTCCGCCTCCGCGCGGTTCTTTCTGACCTCGGCGGCCCCCGTAGCT CCGCCCATCGGAGAAGCGACCTTACAGCGCCTGCCTCTTTCTGAGCGGCATGAAGCCACCTCCCAGGCGG CGAGCGGCCCCGGCGCGCTATCTGGGCGAGGTGACCGGTCCCGCGACCTGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SNAPC2_3 ↗ | 19:7,916,451 | 正股 | 7,916,402–7,916,461 |
| SNAPC2_1 ↗ | 19:7,920,341 | 正股 | 7,920,292–7,920,351 |
| SNAPC2_2 ↗ | 19:7,921,017 | 正股 | 7,920,968–7,921,027 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：334 aa
SNAPC2 蛋白質長 334 個胺基酸。序列註解預測第 137–200 位與第 271–306 位各有一段無序區域；此註解屬預測性質，來源未提供其他結構域或功能區域的說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供其在不同條件下的定位變化或異構型差異，也未描述定位動態。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
SNAPC2 是由 SNAPC1、SNAPC2、SNAPC3、SNAPC4 與 SNAPC5 組成的 SNAPc 複合體次單元。另有資料指出，SNAPC2 與 TBP 及 SNAPC4 互作；來源未進一步界定這些互作的條件或分子細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNAPC2 是 SNAPc 複合體的一部分；該複合體對 RNA polymerase II 與 RNA polymerase III 所轉錄的小核 RNA 基因皆屬必要。SNAPc 結合兩類基因共同具有、不含 TATA box 的基礎啟動子元件 PSE，並將 TBP 與 BRF2 招募至 U6 snRNA 的 TATA box。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Part of the SNAPc complex required for the transcription of both RNA polymerase II and III small-nuclear RNA genes. Binds to the proximal sequence element (PSE), a non-TATA-box basal promoter element common to these 2 types of genes. Recruits TBP and BRF2 to the U6 snRNA TATA box |
| 交互作用 | SNAPc 複合體由 SNAPC1、SNAPC2、SNAPC3、SNAPC4 與 SNAPC5 五個次單元組成。SNAPC2 另與 TBP 及 SNAPC4 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of the SNAPc complex composed of 5 subunits: SNAPC1, SNAPC2, SNAPC3, SNAPC4 and SNAPC5. SNAPC2 interacts with TBP and SNAPC4 PMID 12621023 ↗ · PMID 9418884 ↗ |
| 細胞定位 | SNAPC2 位於細胞核。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CTTACAGCGCCTGCCTCTTTCTGAGCGGCATGAAGCCACC40TCCCAGGCGGCGAGCGGCCCCGGCGCGCTATCTGGGCGAG80GTGACCGGTCCCGCGACCTGGAGCGCTCGCGAGAAGCGGC120AGCTAGTGCGACTCCTGCAGGCGCGGCAGGGCCAGCCGGA160GCCGGACGCCACCGAGCTGGCCCGGGAGCTGCGGGGCCGG200AGCGAGGCTGAGATCCGGGTCTTCCTCCAGCAGCTCAAGG240GCCGCGTAGCCCGGGAGGCCATTCAGAAAGTGCATCCGGG280TGGCCTTCAGGGACCAAGGCGCCGGGAGGCACAGCCCCCA320GCCCCCATAGAGGTCTGGACGGATCTGGCTGAGAAGATAA360CAGGGCCACTGGAAGAAGCCCTGGCAGTGGCTTTCTCGCA400GGTGCTCACCATCGCGGCCACGGAACCGGTCACCCTCCTG440CACTCCAAGCCCCCCAAGCCCACGCAGGCCCGTGGAAAGC480CTTTGCTCCTGAGCGCCCCTGGAGGACAGGAAGACCCCGC520CCCTGAAATACCTAGCTCTGCCCCTGCTGCACCTAGCTCC560GCACCCAGGACTCCTGACCCTGCCCCTGAGAAACCTTCTG600AGTCGTCGGCTGGTCCCTCCACTGAAGAAGACTTTGCTGT640GGACTTTGAGAAGATCTACAAGTACTTGTCCTCTGTCTCC680CGAAGTGGCCGCAGCCCCGAGCTCTCAGCAGCTGAGTCCG720CTGTGGTCCTCGACCTGCTCATGTCACTTCCAGAGGAGCT760GCCACTCCTGCCCTGCACAGCCCTGGTTGAGCATATGACG800GAGACGTACCTACGCCTGACAGCCCCCCAGCCCATTCCCG840CTGGAGGGAGCCTGGGGCCTGCAGCAGAAGGGGATGGGGC880TGGCTCCAAGGCACCAGAGGAGACCCCCCCAGCCACCGAG920AAGGCCGAGCACAGCGAACTGAAATCGCCTTGGCAAGCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。