基因總覽
SNAP23（synaptosome associated protein 23）是人類的蛋白質編碼基因，產物屬於 SNAP-25 family，並歸類為 t-SNARE，也就是定位於目標膜一側的 SNARE。SNARE 蛋白參與細胞內膜融合；SNAP23 的主要角色，是在特定細胞中協助運輸囊泡與細胞膜融合。其蛋白質含有兩段 t-SNARE coiled-coil homology 區域，分別位於胺基酸 14–76 與 146–208。這些特徵構成 SNAP23 作為 SNARE 蛋白的基本分子背景。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000249647 ★ | 42,495,634–42,533,058 | 8 |
| ENST00000873737 | 42,491,242–42,533,057 | 9 |
| ENST00000561526 | 42,491,244–42,528,370 | 7 |
| ENST00001103742 | 42,492,802–42,531,479 | 8 |
| ENST00000349777 | 42,495,255–42,533,059 | 7 |
| ENST00000564153 | 42,495,255–42,531,827 | 6 |
| ENST00000567094 | 42,495,255–42,522,095 | 6 |
| ENST00000873738 | 42,495,255–42,533,061 | 9 |
| ENST00000873739 | 42,495,255–42,533,055 | 9 |
| ENST00000873740 | 42,495,255–42,533,058 | 9 |
| ENST00000873741 | 42,495,255–42,533,058 | 8 |
| ENST00000873742 | 42,495,255–42,533,058 | 8 |
顯示 12/35 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SNAP23 是目標膜上的 t-SNARE，參與運輸囊泡與細胞膜融合。一般而言，SNARE 分別位於相對的膜面，組裝成延伸、平行排列的四股螺旋 trans-SNARE 複合體；複合體形成所釋出的能量可推動膜融合。核心 SNARE 複合體通常由四個 α 螺旋區域構成，其中三個來自目標膜 SNARE，另一個來自囊泡 SNARE。這是 SNARE 介導膜融合的分子原理，並提供理解 SNAP23 作用的背景。
在免疫細胞中，SNAP23 參與運輸囊泡與細胞膜的融合。於巨噬細胞，SNAP23 與 STX11 協同，調節受刺激條件下 TLR4 從回收內體運送至細胞膜。這項運輸有助於細胞辨識微生物成分，並參與先天性與適應性免疫的誘導；來源指出此過程對相關免疫反應具有重要作用。
在骨骼肌衛星細胞中，SNAP23 與其相應的 SNARE 蛋白 VAMP4、STX11 協同，促進 CD36 囊泡由內體運送至細胞膜。來源將此運輸步驟描述為肌肉再生的重要環節；此項功能證據標示為相似性推論，因此不應視為已在此處直接確立的結果。
Promoter 與基因調控
>SNAP23 ENST00000249647 GRCh38 chr15:42494634-42495734 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCTCCCGACTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAG ATGGGGTTTCTCTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCTTCAGCCTCC CAAAGTGCTGGGATTGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGTGAAGCACTTTCTTTTCTTGATTTCCA GCAGTTTATTTTATTCTTAGAGGTGCATGGAGGGGTTCCTGCAGCAAATAGTTTACAATAATCCTCCATC TGCTTAAAACTCTTCAATAGCTTTCAGTGCCCCTAGTACAAAGTGGTCTAAAATTCCAAGGCCTTCCAAG ATCTAGCGATTGTTGGCCTTCTAAAGCTTTCTTTCCTCTACACTCGGGGATGTACGATTAGCACTAAGCC TCTAACAAGGATGAACTACTAGAAATTTCCAGAAGGCGTTATGCTGTTCTCGACATAAGCTGTTCCCCAG AGCCTGGAAAACTCTAGCTCTTTCTCTGCCGGATTTCCGGGGGAACTCCTACTTATCCTTCATGACTCAA GTCACTTCCTCCGGGAACCCTTCCAGACACCCCTAAGAATAAAACGCTTTGTTCATTATCAGCCAAAGGC GCCTCAAATTTTCTATGTGCTATGCACTGTATTCTATCCACTATAATTTGTTTACATATCTATATCTTAG TCTAGACATATTGAAAGGCGATGAAGAGCAGGGAAAGCACTGTATTCGCTTTCTTTTCTTCAGCGTTCAT CCAGCACAGTGCCTGGCATACGGTTTGCCCTCAGTAAATGTTTATTGCATGAACACCTCCCAGCTTCGGG CAGGACTGAAATCTATCCGGTTAACTAGTGAATTCCCAGACTCTCCGTCTGCGTGGCAGGGACATTTAAA CCCCCAGCACCGTGATTGGCTCCAGCTGCAGGGGTGTGTCTGTGTCCGCGGCGAACGGGAAGTGAGCAGG CGCGCGGGCTCGGCGCGCGCAGGCGCGACTAGGGTGCAGCGCCAGGTCCGGTGTTGGGGTGTCCGAGTTG CCGCCGGAGAGGAGTGGCCTCGCCCGCTTGGTGAGTCTCCAGGAGTGGGAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SNAP23_2 ↗ | 15:42,491,251 | 正股 | 42,491,202–42,491,261 |
| SNAP23_3 ↗ | 15:42,495,260 | 正股 | 42,495,211–42,495,270 |
| SNAP23_1 ↗ | 15:42,495,678 | 正股 | 42,495,629–42,495,688 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_BBFND · enhancer · 42490211–42491094 · regulatory
ENSR15_5CZSST · CTCF_binding_site · 42491047–42491068 · regulatory
ENSR15_BBFNG · promoter · 42491095–42491631 · regulatory
ENSR15_BBFP3 · promoter · 42494879–42495663 · regulatory
ENSR15_BBFP6 · enhancer · 42495664–42496417 · regulatory
ENSR15_BBFPN · enhancer · 42499290–42499954 · regulatory
· motif · 42490686–42490698 · motif
· motif · 42490688–42490695 · motif
· motif · 42490706–42490718 · motif
· motif · 42490855–42490870 · motif
· motif · 42491049–42491065 · motif
· motif · 42491126–42491137 · motif
· motif · 42491126–42491137 · motif
· motif · 42491409–42491419 · motif
· motif · 42495421–42495436 · motif
· motif · 42495573–42495583 · motif
· motif · 42495606–42495617 · motif
· motif · 42495606–42495617 · motif
· motif · 42495629–42495640 · motif
· motif · 42495629–42495640 · motif
· motif · 42495691–42495701 · motif
· motif · 42496032–42496049 · motif
· motif · 42496400–42496415 · motif
· motif · 42496400–42496415 · motif
· motif · 42498525–42498536 · motif
· motif · 42498809–42498822 · motif
· motif · 42498811–42498823 · motif
· motif · 42499060–42499072 · motif
· motif · 42499231–42499242 · motif
· motif · 42499239–42499250 · motif
· motif · 42499290–42499305 · motif
· motif · 42499371–42499383 · motif
· motif · 42499451–42499464 · motif
· motif · 42499451–42499464 · motif
· motif · 42500285–42500291 · motif
· motif · 42500445–42500457 · motif
· motif · 42500566–42500577 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：211 aa
SNAP23 蛋白長 211 個胺基酸，屬於 SNAP-25 family。其序列包含兩段 t-SNARE coiled-coil homology：第一段位於第 14–76 個胺基酸，第二段位於第 146–208 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SNAP23 位於細胞膜，並以脂質錨定方式關聯於膜。 此定位資料未進一步描述定位改變的條件或不同異構型之差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- NAPAP54920 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- NAPBQ9H115 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCGNO76038 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STX11O75558 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- STX3Q13277 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VAMP3Q15836 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZDHHC17Q8IUH5 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
SNAP23 可經 coiled-coil domain 形成同源四聚體，也可與 STX4、VAMP3 形成異源四聚體。它與 STX4、VAMP7 組成參與溶小體胞吐作用的 SNARE 複合體；另與 VAMP4、STX11 組成的複合體參與內體至細胞膜的囊泡運輸。來源亦記載 SNAP23 出現在含 VAMP8、STX1A 的複合體，以及胰臟中含 VAMP8、STX4 的複合體；此外，它與 STX12、ZDHHC13、ZDHHC17 有互作，其中與 ZDHHC13、ZDHHC17 的互作涉及 ANK repeats。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SNARE 蛋白在相對膜面組成平行四股螺旋 trans-SNARE 複合體，組裝釋出的能量推動膜融合；核心複合體通常由三個目標膜 SNARE 的 α 螺旋區域與一個囊泡 SNARE 區域構成。SNAP23 是位於目標膜的 t-SNARE，參與免疫細胞運輸囊泡與細胞膜融合。在巨噬細胞中，它與 STX11 協同，調節刺激依賴的 TLR4 由回收內體至細胞膜的運輸，並參與微生物成分辨識及先天性、適應性免疫誘導；在骨骼肌衛星細胞中，它與 VAMP4、STX11 協助 CD36 囊泡由內體運至細胞膜，此步驟依相似性推論為肌肉再生的重要環節。 | 含實驗來源 | 證據與來源SNAREs (soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor-attachment protein receptors) are essential proteins for intracellular membrane fusion. SNAREs localized on opposing membranes assemble to form a trans-SNARE complex, an extended, parallel four-helix bundle whose assembly releases energy that drives membrane fusion. The core SNARE complex typically consists of four alpha-helical domains, three from target membrane SNAREs (t-SNAREs) and one from a vesicle SNARE (v-SNARE). SNAP23 is a t-SNARE (target-SNARE) that resides on target membrane and functions in the fusion of transport vesicles with the plasma membrane in immune cells. In macrophages, regulates the stimulus-dependent vesicular transport of TLR4 from recycling endosomes to the plasma membrane by cooperating with STX11 and thereby plays a critical role in the recognition of microbial components and the induction of innate and adaptive immunity. In skeletal muscle satellite cells, SNAP23 cooperates with its cognate SNAREs VAMP4 and STX11 to facilitate CD36 vesicular transport from endosomes to the plasma membrane, an essential step in muscle regeneration (By similarity) PMID 10036234 ↗ · PMID 11354632 ↗ · PMID 30811271 ↗ · PMID 8663154 ↗ · PMID 9070898 ↗ |
| 交互作用 | SNAP23 可透過 coiled-coil domain 形成同源四聚體，也能與 STX4、VAMP3 形成異源四聚體。它與 STX4、VAMP7 組成參與溶小體胞吐作用的 SNARE 複合體，並與 VAMP4、STX11 組成涉及內體至細胞膜囊泡運輸的複合體。SNAP23 也被發現在含 VAMP8、STX1A 的複合體，以及胰臟中含 VAMP8、STX4 的複合體；另與 STX12、ZDHHC13、ZDHHC17 互作，後兩者的互作涉及 ANK repeats。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotetramer (via coiled-coil domain), also forms heterotetramers with STX4 and VAMP3. Forms a SNARE complex composed of STX4, SNAP23 and VAMP7 that functions in lysosomal exocytosis (By similarity). Forms a SNARE complex with VAMP4 and STX11; involved in vesicular transport from endosomes to the plasma membrane. Found in a complex with VAMP8 and STX1A. Found in a complex with VAMP8 and STX4 in pancreas (By similarity). Interacts with STX12 (By similarity). Interacts with ZDHHC13 (via ANK repeats) (By similarity). Interacts with ZDHHC17 (via ANK repeats) PMID 10036234 ↗ · PMID 12130530 ↗ · PMID 12556468 ↗ · PMID 24910990 ↗ · PMID 28882895 ↗ · PMID 30811271 ↗ |
| 細胞定位 | SNAP23 位於細胞膜，並以脂質錨定方式關聯於膜。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGGCGCGACTAGGGTGCAGCGCCAGGTCCGGTGTTGGGGT40GTCCGAGTTGCCGCCGGAGAGGAGTGGCCTCGCCCGCTTG80AGTTTTGATTCATCATGGATAATCTGTCATCAGAAGAAAT120TCAACAGAGAGCTCACCAGATTACTGATGAGTCTCTGGAA160AGTACGAGGAGAATCCTGGGTTTAGCCATTGAGTCTCAGG200ATGCAGGAATCAAGACCATCACTATGCTGGATGAACAAAA240GGAACAACTAAACCGCATAGAAGAAGGCTTGGACCAAATA280AATAAGGACATGAGAGAGACAGAGAAGACTTTAACAGAAC320TCAACAAATGCTGTGGCCTTTGTGTCTGCCCATGTAATAG360AACAAAGAACTTTGAGTCTGGCAAGGCTTATAAGACAACA400TGGGGAGATGGTGGAGAAAACTCACCTTGCAATGTAGTAT440CTAAACAGCCAGGCCCGGTGACAAATGGTCAGCTTCAGCA480ACCAACAACGGGAGCAGCCAGTGGTGGATACATTAAACGC520ATAACTAATGATGCCAGAGAAGATGAAATGGAAGAGAACC560TGACTCAAGTGGGCAGTATCCTGGGAAATCTAAAAGACAT600GGCCCTGAACATAGGCAATGAGATTGATGCTCAAAATCCA640CAAATAAAACGAATCACAGACAAGGCTGACACCAACAGAG680ATCGTATTGATATTGCCAATGCCAGAGCAAAGAAACTCAT720TGACAGCTAAAGCTACTGCTGTTCTTCTTTATCATTTATT760CACTTCCGTAGCTCCTCCTTGAAAGTTATTACCTTTTCAG800AGTTTAAGTTTTCGGTTCCACGCTCTTCTAATTGGGAGAT840AATATGGAAGAAGGGCCAGAGCAGTTACAGCCCTCCTTCT880TTTTTGTTTTCTGTTGAGGGCCGACTGCTGCTCTGCCTTC920CTTCTAGTATTTTCTTTCTCAATTCATACGCTTAGATTGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。