基因總覽
SMIM29 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 small integral membrane protein 29。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p21.31。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000476320 ★ | 34,246,395–34,249,006 | 5 |
| ENST00000636500 | 34,245,865–34,249,108 | 5 |
| ENST00000481533 | 34,245,865–34,249,113 | 5 |
| ENST00000394990 | 34,245,865–34,249,113 | 5 |
| ENST00000468145 | 34,245,865–34,249,113 | 5 |
| ENST00000858098 | 34,245,865–34,249,050 | 4 |
| ENST00000858099 | 34,245,865–34,249,053 | 5 |
| ENST00000858100 | 34,245,865–34,249,113 | 5 |
| ENST00000858101 | 34,245,865–34,249,000 | 5 |
| ENST00000928385 | 34,245,865–34,249,113 | 5 |
| ENST00000928386 | 34,245,865–34,249,050 | 4 |
| ENST00000928387 | 34,245,865–34,249,113 | 5 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SMIM29 ENST00000476320 GRCh38 chr6:34248906-34250006 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCATTGCTTGAGCATCAATTAACTCATCTGCAAATTGCGATTGCTCCACTTGCCCTGCCTAGCTCACAA GGGTGTTCTCTCTTAGGAGAAAAGAAAGTAAAATCCGGCCAGGCCCAGTGGCTCACGCCTCTAATCCCAG CACTTTAGGAGGCTGAGACAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGTGTTAAGAGACCATCCTGGCGAACATGTT GAAACCCCCTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTAC TCGGGAGGCTGAGGCAAGAGAATAGCTTGAACCAGGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCA CTGCACTCCAGCCTGGACGACAGAGACAGACTCCATCTCAAAAAAAAAGTAATAATAATAATCCTCACAC AGCTTGTTTTACAGACGTTAAGACAGGCGCAGAGAGGGTGGGCGTGCCAGGGCCCTCGGTAGCCCAGACC TGCCGTACTCTACCAGCCGAGCACAGCCCGAAGGCCAGGGAACAAACACAGACGGAGGCCGAGTGGGCCC GGAGCAGGGTCTTGCCGCGAAGGGCCTGGGCTCAACGTTAGAGCGTGGCGCGACCCTATTCTGGCTGCAA CGAGAGGGGTGAATGAAGTGGGCGCCGGGGACCTCCCAGAATCGGAGCTCCAGACGCGGGCGGGCCAGGG GCCGCCGGAAAACTGCGCGCGCCCCGCCCTACCCCGTCCGGCCCCGCGTCGCGTTCTCCTCCCCCACTGC GCAGCCCTCGGCTGCCCCCTGCCGCCGCCGGGCGGACCCTGCAAGCCCCGCTGTCCCCGCCTTCGCACCG CCCACCCCCGCCTCCGGATTGGCGGCTCCAGAAATCTCCAGGCCACCGGCTTTCCGCTACCGGATTGGCT GCGTCCGGGTGCTGAGGCCCGGCCCATTTCCCCGGGTCCTTTGATCACGCGCCTGACGGCTTTTCCGGGG CCCGGGAGCCAACCGAGGGCGTTCCTGTCGGGGCTGCAGCGGCGGGAGGTAAGGCATGGCCAGGCCGGCT GGGCTGCAGAGCGCCGGCACGGGTCCACGCCTCGGGTGACGGGCTTCCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| C6orf1_1 ↗ | 6:34,249,006 | 負股 | 34,248,996–34,249,055 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_D3NTJ · enhancer · 34242480–34244612 · regulatory
ENSR6_9HKZR · promoter · 34244613–34245113 · regulatory
ENSR6_662Q4S · CTCF_binding_site · 34246702–34246743 · regulatory
ENSR6_5B3H9J · CTCF_binding_site · 34247120–34247141 · regulatory
ENSR6_B8RHW · promoter · 34248030–34248578 · regulatory
ENSR6_9HL2X · enhancer · 34248579–34248978 · regulatory
ENSR6_B8RJ3 · promoter · 34248979–34249598 · regulatory
ENSR6_5B3HL8 · CTCF_binding_site · 34249002–34249023 · regulatory
ENSR6_5B3HM7 · CTCF_binding_site · 34249208–34249229 · regulatory
· motif · 34244692–34244700 · motif
· motif · 34244715–34244723 · motif
· motif · 34246388–34246403 · motif
· motif · 34246594–34246611 · motif
· motif · 34246603–34246618 · motif
· motif · 34246704–34246720 · motif
· motif · 34246724–34246740 · motif
· motif · 34246794–34246801 · motif
· motif · 34246802–34246817 · motif
· motif · 34246864–34246873 · motif
· motif · 34246905–34246918 · motif
· motif · 34247122–34247138 · motif
· motif · 34247201–34247210 · motif
· motif · 34248476–34248489 · motif
· motif · 34248476–34248489 · motif
· motif · 34248746–34248758 · motif
· motif · 34248748–34248763 · motif
· motif · 34248853–34248862 · motif
· motif · 34249004–34249020 · motif
· motif · 34249147–34249160 · motif
· motif · 34249152–34249162 · motif
· motif · 34249153–34249166 · motif
· motif · 34249157–34249170 · motif
· motif · 34249158–34249168 · motif
· motif · 34249162–34249172 · motif
· motif · 34249168–34249181 · motif
· motif · 34249210–34249226 · motif
· motif · 34249257–34249270 · motif
· motif · 34252520–34252533 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：102 aa
SMIM29（small integral membrane protein 29）長 102 個胺基酸，具有一段螺旋型跨膜區域，位於第 21 至 41 個胺基酸的位置。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SMIM29 定位於膜上，屬於單次跨膜蛋白。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | SMIM29 被註解為膜蛋白，且屬於單次跨膜蛋白。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GTTCCTGTCGGGGCTGCAGCGGCGGGAGGGAGCCCAGTGG40AGGCGCCCTCCCGAAGCGCCACTGCCCATGCTGACCACCC80AGCCCTCCGGCTGCTGATGTCATGAGTAACACCACTGTGC120CCAATGCCCCCCAGGCCAACAGCGACTCCATGGTGGGCTA160TGTGTTGGGGCCCTTCTTCCTCATCACCCTGGTCGGGGTG200GTGGTGGCTGTGGTAATGTATGTACAGAAGAAAAAGCGGG240TGGACCGGCTGCGCCATCACCTGCTCCCCATGTACAGCTA280TGACCCAGCTGAGGAACTGCATGAGGCTGAGCAGGAGCTG320CTCTCTGACATGGGAGACCCCAAGGTGGTACATGGCTGGC360AGAGTGGCTACCAGCACAAGCGGATGCCACTGCTGGATGT400CAAGACGTGACCTGACCCCCTTGCCCCACCCTTCAGAGCC440TGGGGTCCTGGACTGCCTGGGGCCCTGCCATCTGCTTCCC480CTGCTGTCACCTGGCTCCCCCTGCTGGGTGCTGGGTCTCC520ATTTCTCCCTCCACCCACCCTCAGCAGCATCTGCTTCCCA560TGCCCTCACCATCACCTCACTGCCCCCAGGCCTTCTGCCC600TTTGTGGGTGTTGAGCTCACCGCCCACCCACAGGCACTCA640TGGGAAGAGGCTTTCCTTCTGGGATGGGGGCGGCTGGTAG680ACACCTTTGCTTTCTCTAGCCCTCCTGGGCTGGGCTTGGG720CACAAATCCCCAGGCAGGCTTTGGAGTTGTTTCCATGGTG760ATGGGGCCAGATGTATAGTATTCAGTATATATTTTGTAAA800TAAAATGTTTTGTGGCTA818cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。