基因總覽
SLPI(secretory leukocyte peptidase inhibitor)是蛋白質編碼基因,產物為酸穩定的蛋白酶抑制劑。其蛋白質由132個胺基酸組成,具有兩個 WAP 結構域,並含有彈性蛋白酶抑制區域。這些結構特徵與其抑制蛋白酶的性質相符。SLPI 的主要角色涵蓋蛋白酶活性調節,以及感染、發炎和免疫反應相關的生物學作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000338380 ★ | 45,252,239–45,254,564 | 4 |
| ENST00001106012 | 45,251,638–45,254,564 | 3 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLPI 是酸穩定的蛋白酶抑制劑,對 trypsin、chymotrypsin、elastase 與 cathepsin G 具有強親和力。透過限制這些蛋白酶的活性,SLPI 可調節蛋白質分解作用;在傷口癒合中,它可能藉由減少蛋白酶造成的組織損傷,支持正常癒合。這項傷口相關功能的描述帶有「可能」的限定,且依據為相似性推論。
在感染情境中,SLPI 參與細菌感染後的發炎與免疫反應調節,也參與細胞內寄生蟲 L.major 感染後的反應。它能下調對細菌脂多醣(LPS)的反應,此項作用是依相似性推論;另有資料指出,SLPI 參與調節 NF-kappa-B 活化及發炎反應。這些描述反映 SLPI 與感染誘發的免疫及發炎反應有關,但不表示所有反應均由同一機制介導。
SLPI 對不同病原體的作用並不相同:它對分枝桿菌具有抗微生物活性,但對沙門氏菌沒有此活性。SLPI 有助於對結核分枝桿菌(M.tuberculosis)感染維持正常抵抗力,且對 L.major 感染的正常抵抗力是必需的。這些結果分別涉及不同病原體與感染情境,不宜概括成對所有微生物皆具抗菌作用。
此外,SLPI 與 ELANE 一同為骨髓髓系細胞正常分化及增殖所必需。此功能將 SLPI 的作用連結至骨髓細胞發育,但來源未提供更細的分子機制。綜合而言,SLPI 涵蓋蛋白酶抑制、感染相關反應調節、傷口癒合及骨髓髓系細胞發育等不同功能;部分角色依相似性推論,應保留其證據限定。
Promoter 與基因調控
>SLPI ENST00000338380 GRCh38 chr20:45254464-45255564 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTATGGGCTGAATTTTAGAGATAATGGTCGCTCTCTTTATAATTAGAAGCAACCTATGCAGACTGGGTAG CAAATAGAATGGGTTTAATTTTTTGCTGTCATGTGAGATCTGTAAGGGATTTTGGGGAATTTTAGGAAGC AATCCTCTAAGATCTCAAATTATCTCACAGCTAAATGTAGATTACAGTGACTGATGAGCTGCTTTCCCCC TTTATCTCAGATTCATTTCAATTCTCTTTAGTGGGAAGGGATACTATTCATTTGTTCTTTTCATTCAGAG TCCCTTCATGCCCTTAATTTCATAACCCTCTGAGAAGGGCTGACTTGTTAGTATCATTTCATTTCACAGC TGAGACAACTGAGCTCCAGAGAGATTTGTGGAGAGCGGAGCTCTTCTTCAGCTTTCATTTGTGAGTGCTT TTCCTGTGTCAGGCACAGAACAGGCACTGGGGATATAACGGTGTAAATATTTCAGGGAACTAAGTATCAG TTGGTTGAACGAGCTGAACTTTTGAGAAAGAAACTGCATTGAGTAATCAGCAGAGTTTCACAATGCCTGA GAGTCCAGTAATGTGAGAATCAGAATTAGCAATGTGAGAATAGAATGTATTGCACAAAGTCTCAGCAGGG AGTCTGTGTCTGGTTTTAGTTCCAGGTCCGGGTAGCACCTTTGCAATTGACCACTTCTTCCCTCTCTCCA CCTATAAGGCTAATGGCCTGGGATCTTGTGATGTTTAGGGCTCAGATGGACACTGAGATGGCCTCTTTAA TCAACCAACTTCCCAGGCCAATCTCTTCCCTTTCTTTTCTGATAGTTGCTGTGTTGGCCTCATAGCCTTA CCTGGCATAGGAAAGATAAACAATCTCCTTGGTGTCAGGATTTCTGGTCTCTGGCTACGTTTCCTGCTTA TGCAATAGTAGCTGGGAGAGGCCGAAAGAATTCTGGTGGGGCCACACCCACTGGTGAAAGAATAAATAGT GAGGTTTGGCATTGGCCATCAGAGTCACTCCTGCCTTCACCATGAAGTCCAGCGGCCTCTTCCCCTTCCT GGTGCTGCTTGCCCTGGGAACTCTGGCACCTTGGGCTGTGGAAGGCTCTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLPI_1 ↗ | 20:45,254,564 | 負股 | 45,254,554–45,254,613 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR20_9MXZK · promoter · 45254554–45255054 · regulatory
· motif · 45250956–45250970 · motif
· motif · 45252075–45252089 · motif
· motif · 45252082–45252093 · motif
· motif · 45254346–45254356 · motif
· motif · 45254604–45254614 · motif
· motif · 45255028–45255037 · motif
骨髓細胞中,ELANE 活性偏低時 SLPI 下調;以 ELANE 處理則會使 SLPI 上調。來源未提供其他調控條件。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:132 aa
SLPI 蛋白質長132個胺基酸,N端第1至25位為訊號序列。蛋白質含兩個 WAP 結構域,分別位於第28至76位及第82至130位;彈性蛋白酶抑制區域標註於第84至132位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLPI 為分泌型蛋白質。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
- CALN1Q9BXU9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CIB3Q96Q77 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFEMP1Q12805 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM9BQ8IZU0 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- HOXA1P49639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LATO43561-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MKRN3Q13064 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NBL1P41271-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NTAQ1Q96HA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIH1D2Q8WWB5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- SGTBQ96EQ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SMIM14Q96QK8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SLPI 與 GRN 互作;此互作可保護 progranulin 免於蛋白質水解。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLPI 是酸穩定的蛋白酶抑制劑,對 trypsin、chymotrypsin、elastase 與 cathepsin G 具有強親和力。它調節細菌感染及細胞內寄生蟲 L.major 感染後的發炎與免疫反應,並依相似性資料下調對細菌脂多醣的反應;也參與 NF-kappa-B 活化及發炎反應調節。SLPI 對分枝桿菌有抗微生物活性,但對沙門氏菌沒有;它有助於抵抗 M.tuberculosis 感染,且是抵抗 L.major 感染所必需。它可能藉限制蛋白酶活性而支持正常傷口癒合,並與 ELANE 一同支持骨髓髓系細胞正常分化及增殖。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acid-stable proteinase inhibitor with strong affinities for trypsin, chymotrypsin, elastase, and cathepsin G. Modulates the inflammatory and immune responses after bacterial infection, and after infection by the intracellular parasite L.major. Down-regulates responses to bacterial lipopolysaccharide (LPS) (By similarity). Plays a role in regulating the activation of NF-kappa-B and inflammatory responses. Has antimicrobial activity against mycobacteria, but not against salmonella. Contributes to normal resistance against infection by M.tuberculosis. Required for normal resistance to infection by L.major. Required for normal wound healing, probably by preventing tissue damage by limiting protease activity (By similarity). Together with ELANE, required for normal differentiation and proliferation of bone marrow myeloid cells PMID 10702419 ↗ · PMID 2039600 ↗ · PMID 2110563 ↗ · PMID 24121345 ↗ · PMID 24352879 ↗ · PMID 3462719 ↗ · PMID 3533531 ↗ |
| 交互作用 | SLPI 與 GRN 互作;此互作可保護 progranulin 免於蛋白質水解。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 | |
| 調控 | ELANE 活性偏低時,SLPI 表現下調;在骨髓細胞中以 ELANE 處理則會使 SLPI 上調。 | 含實驗來源 | 證據與來源Down-regulated in response to low ELANE activity. Up-regulated by ELANE treatment in bone marrow cells PMID 24352879 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAGTCACTCCTGCCTTCACCATGAAGTCCAGCGGCCTCT40TCCCCTTCCTGGTGCTGCTTGCCCTGGGAACTCTGGCACC80TTGGGCTGTGGAAGGCTCTGGAAAGTCCTTCAAAGCTGGA120GTCTGTCCTCCTAAGAAATCTGCCCAGTGCCTTAGATACA160AGAAACCTGAGTGCCAGAGTGACTGGCAGTGTCCAGGGAA200GAAGAGATGTTGTCCTGACACTTGTGGCATCAAATGCCTG240GATCCTGTTGACACCCCAAACCCAACAAGGAGGAAGCCTG280GGAAGTGCCCAGTGACTTATGGCCAATGTTTGATGCTTAA320CCCCCCCAATTTCTGTGAGATGGATGGCCAGTGCAAGCGT360GACTTGAAGTGTTGCATGGGCATGTGTGGGAAATCCTGCG400TTTCCCCTGTGAAAGCTTGATTCCTGCCATATGGAGGAGG440CTCTGGAGTCCTGCTCTGTGTGGTCCAGGTCCTTTCCACC480CTGAGACTTGGCTCCACCACTGATATCCTCCTTTGGGGAA520AGGCTTGGCACACAGCAGGCTTTCAAGAAGTGCCAGTTGA560TCAATGAATAAATAAACGAGCCTATTTCTCTTTGCA596cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。