演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLKSTK2

STE20 like kinase

SLK(STE20 like kinase)是 STE20 次家族的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,參與細胞凋亡與肌動蛋白壓力纖維的解離。

Homo sapiens10q24.33-q25.1UniProt Q9H2G2
OFFICIAL SYMBOL
SLK
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q9H2G2
PDB / ALPHAFOLD
2J51
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLK 的正式名稱為 STE20 like kinase,是一種蛋白質編碼基因,其產物屬於蛋白激酶超家族中的 STE 絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶家族,並歸入 STE20 次家族。此蛋白質長 1,235 個胺基酸,具有蛋白激酶結構域;另有一個位於蛋白質後段、註解為 UVR 的結構域。其序列也包含多段預測為無序的區域。SLK 所編碼的蛋白質與細胞凋亡及肌動蛋白壓力纖維解離相關,具備絲胺酸與蘇胺酸磷酸化活性。

Official symbol
SLK
Gene name
STE20 like kinase
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11088
UniProt
Q9H2G2
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
STK2se20-9KIAA0204

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q24.33-q25.1
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegSLKpq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr10:103,966,916–104,029,242
Gene span
62,327 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000369755 ★103,967,140–104,029,23319
ENST00000932919103,966,916–104,029,24220
ENST00000946372103,966,916–104,029,24219
ENST00000335753103,967,097–104,029,24218
ENST00000932920103,967,097–104,029,24217
ENST00000932921103,967,097–104,029,24218
ENST00000946373103,967,097–104,029,24217
ENST00000946374103,967,097–104,029,24219
ENST00000946375103,967,097–104,029,24215
ENST00000946376103,967,097–104,029,24218
ENST00000946377103,967,097–104,029,24219
ENST00000946378103,967,097–104,029,24217

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLK 參與細胞凋亡,也與肌動蛋白壓力纖維的解離有關。這些功能指出 SLK 涉及細胞存活狀態與細胞骨架結構變化;現有資料未進一步說明兩者之間的先後關係,也未提供特定細胞情境或調控條件,因此不宜推定其作用順序或適用範圍。

SLK 具有蛋白激酶活性,可使用 ATP 將磷酸基團轉移至蛋白質受質上的絲胺酸或蘇胺酸殘基。反應中,ATP 分別轉化為 ADP 與氫離子,受質則形成磷酸化的絲胺酸或蘇胺酸。這項活性提供了 SLK 參與細胞過程的分子層次依據,但目前資料未指出特定受質,也未說明磷酸化如何連結至凋亡或壓力纖維解離。

因此,依現有註解可將 SLK 描述為與凋亡及肌動蛋白壓力纖維解離相關的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶;資料支持其具有相應的磷酸轉移反應,但不足以界定其下游途徑、作用位置的變化或在上述過程中的具體調控方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 103967140 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLK ENST00000369755 GRCh38 chr10:103966140-103967240 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCGGCGCGGTGGCTCACGCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGA
CCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCGGGGCGTGGTGGCG
GGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCGTGAAGCCGGGAGGCGGAGCTTG
CGGTGAGCCTAGTTCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGATCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAAAAAGAGAAGTGGTCTTAAACAGTTTTTATGTATCTGTGTCT
ATCTTGCCTGCACACTTAAAACAACAAGAGTAAGAACTAAGATTGAGCGTTTACGGGTGCAGGGGCCGCG
CAAAGGGCTTCCATCTATTGTCTCATTCACAACCTTCTGGTAGGGACTATTAGGATCTTCATTTTACGGC
GAGGAAACCGAGGCTCGGAGAGGTCACCTGCCCAAGGTCACAGATCTCTCTCTCCAAAGCTCAAGCTCAC
AACCACCACACAAACTCCCCTCTCACTGTACCTGGGGCCCGTCTGAGAGCGAAAAAGTCCGCTTTCAGGT
CCCAACCCTAACAGGTCCGGCTTTCACTCCACAGTTTTTCCCAGATCCAGAATGGAGACAACATCCGCTA
GCACAATCAACAGGGTCGTCCCACGGGGGCCGCTCCATCAAGGCCGTGGACTGACAGGATTTGGGGCTTG
GAGGGCAAATGAGAAACAATCGTCAGGGACCGAAGAACAAATGCGTCCATCACACCAGCCCCCCGCACCC
CGAGCCCCGTGCTCCGCTCACGCGAACCCTCGGGGGCAGCCAGTCTGAGGGACGTAGCGCGCGTGCGCGG
GGCCAGAGGGGACGCCCCCACGCGAGCGCGCGGTGAGCAGGGCGCGTGACCGGGCGGGCGCGCAGCCGGG
AAAGCGCGCGGGCGCGCTACGGAGTCGGCGTCGGCGCGCGCTCCAGGCCGAGGCTGTGTGGGCTGGGGAG
GGAGACAGGCGGCGGCGGCGGCGCCCCAGACCCGAGGGGACGCGCGGGCCT
SLK 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLK_1 ↗10:103,967,169正股103,967,120–103,967,179

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_CDBJP · enhancer · 103965827–103966914 · regulatory

ENSR10_93J973 · promoter · 103966915–103967211 · regulatory

ENSR10_CDBJS · enhancer · 103967212–103968954 · regulatory

ENSR10_CDBJZ · enhancer · 103969193–103970539 · regulatory

ENSR10_853JGG · enhancer · 103970994–103971166 · regulatory

· motif · 103966184–103966199 · motif

· motif · 103966190–103966202 · motif

· motif · 103966192–103966199 · motif

· motif · 103966192–103966207 · motif

· motif · 103966446–103966459 · motif

· motif · 103966647–103966659 · motif

· motif · 103966661–103966673 · motif

· motif · 103966992–103967005 · motif

· motif · 103967037–103967048 · motif

· motif · 103967037–103967048 · motif

· motif · 103967060–103967073 · motif

· motif · 103967068–103967079 · motif

· motif · 103967068–103967079 · motif

· motif · 103967124–103967135 · motif

· motif · 103967124–103967135 · motif

· motif · 103967195–103967208 · motif

· motif · 103967244–103967257 · motif

· motif · 103967617–103967630 · motif

· motif · 103967642–103967655 · motif

· motif · 103968624–103968637 · motif

· motif · 103968624–103968637 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1235 aa

1 aa1235 aa結構域功能區域
依 Q9H2G2 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLK 蛋白質長 1,235 個胺基酸。其蛋白激酶結構域位於第 34–292 個胺基酸,UVR 結構域位於第 875–910 個胺基酸。另有數段序列被註解為無序區,分布於蛋白質中段及較後段。SLK 歸屬於 STE 蛋白激酶家族的 STE20 次家族。

結構域Protein kinase34–292 aa
結構域UVR875–910 aa
功能區域Disordered309–351 aa
功能區域Disordered363–393 aa
功能區域Disordered421–441 aa
功能區域Disordered519–539 aa
功能區域Disordered613–760 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2J51…

PDB · 2J51

X-ray · 2.10 A · A=12-320

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

SLK 被註解定位於細胞質;現有資料未提供其定位隨條件改變或不同異構型之間有差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
STK2SLK
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLK 與細胞凋亡及肌動蛋白壓力纖維的解離有關。這項註解指出其涉及細胞凋亡與細胞骨架變化,但未說明作用條件、具體機制或兩種作用之間的關係。推論支持
證據與來源

Mediates apoptosis and actin stress fiber dissolution

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)資料庫紀錄
證據與來源

L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)資料庫紀錄
證據與來源

L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLK 的細胞內定位註解為細胞質;此資訊未說明特定細胞條件或定位變化。推論支持
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000369755 · 7,827 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGAGTCGGCGTCGGCGCGCGCTCCAGGCCGAGGCTGTGTG40
41GGCTGGGGAGGGAGACAGGCGGCGGCGGCGGCGCCCCAGA80
81CCCGAGGGGACGCGCGGGCCTTGCGCCGCGGGAGCGGACG120
121GCGGCGGAGGAGACCCTAGGCTCGCGGCCCGAGGCGGGAG160
161GGCTCGGCTTCTCGACTGCCCGCCTCCGAGGCCGCCGGCC200
201GCTTCTCTCTCCCAGAGTGGCCGCCGCCCCTGGAGACTCG240
241CCGTGACACGGGCCTAAGCCGCCGCCGCGGGAGTCCTGAC280
281CGCTCGGACCCGTCGGATCAGGCCGGGTGGGAGCGAGCTT320
321GCGGGCAGGTGCCGCTCCCGGAGGGTGGGCCGGAGGCGAG360
361GCGCCCACCGCGCGGCTCGCGGGCCGGGCTCGGCGGAGGG400
401GCCGCTCGCGCAGCACCCCCACCGCGGGCCGGAGCCCGGG440
441TCGCCGCCCCGCCTTCTCCCGGGACCGCCCGGCCGGAGCT480
481GCGGGGGCCGAGGGACGCCGCGCCCGCCGCCGCCAGCCGG520
521GCTCGCGCGGGAGAGCAGGGAAGAGAAACTTTGCCTTTTA560
561TTGTTTTTAGTCCTTAAGTGCAAGGAACTCTGTGTTGGGA600
601GGAAAAATGTCCTTCTTCAATTTCCGTAAGATCTTCAAGT640
641TGGGGAGCGAGAAGAAGAAGAAGCAGTACGAACACGTGAA680
681GAGGGACCTGAACCCCGAAGACTTTTGGGAGATTATAGGA720
721GAACTGGGCGACGGAGCCTTTGGGAAAGTGTACAAGGCCC760
761AGAATAAAGAGACCAGTGTTTTAGCTGCTGCAAAAGTGAT800
801TGACACTAAATCTGAAGAAGAACTTGAAGATTACATGGTA840
841GAGATTGACATATTAGCATCTTGTGATCACCCAAATATAG880
881TCAAGCTTCTAGATGCCTTCTATTATGAGAACAATCTTTG920
921GATCCTCATTGAATTTTGTGCAGGTGGAGCAGTAGATGCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。