基因總覽
SLIT3 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 slit guidance ligand 3。其產物 Slit homolog 3 protein 長 1,523 個胺基酸，屬於含多種重複與結構域的大型蛋白質。蛋白質序列包含多組 leucine-rich repeat（LRR），以及 EGF-like、Laminin G-like 與 CTCK 等區域；N 端另有訊號序列。這些序列註解呈現出其分段且富含重複單元的結構特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000519560 ★ | 168,661,740–169,301,139 | 36 |
| ENST00000332966 | 168,661,740–169,301,173 | 36 |
| ENST00001132770 | 168,661,740–169,301,173 | 36 |
| ENST00001125382 | 169,275,538–169,301,173 | 2 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLIT3 可能在細胞遷移過程中充當分子導引訊號。這表示它可能提供與細胞移動方向或行為相關的引導資訊；不過，現有描述僅指出可能具有此角色，並未限定特定細胞類型、遷移情境或作用方向，因此不宜將此功能延伸為特定組織中的已確立機制。
其功能可能由與 roundabout homolog receptors 的互作介導。依據這項描述，SLIT3 的導引作用可能與受體參與有關，但來源未進一步說明是哪一種 roundabout homolog receptor，也未提供互作方式、下游訊號或細胞反應的細節。因此，這項受體關聯支持一種可能的作用途徑，不能據此補充未提及的分子步驟。
目前可支持的功能重點是「可能參與細胞遷移導引」以及「作用可能由 roundabout homolog receptors 介導」。來源沒有說明該作用的生理條件、是否對遷移具有促進或抑制效果，或其在不同細胞情境中的差異；這些面向仍無法由現有資訊判定。
Promoter 與基因調控
>SLIT3 ENST00000519560 GRCh38 chr5:169301039-169302139 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTCAAACAAACAAACAAAATCATTCCTACAAGTATTTATGGAGCCTCTAACGCACACGCCCCTCCCCACT GGCATCTGGAAAAGCTCAGACCTAGCCAATTTAAAGCGGGCGCTGGAAGAAAGAAGGCGCTGGGGACAGA AGGGATGCCTCGTCTGCGAATGACTTTTGCAAAAACACGTTCTCTTCTGTGATGCTCCAAACAACCCAGG GAGGTGAGGCCAGGTAGGACTGTGGCCCCGGATTTGAGAAAACGAAGGCTCAGAGATGACACGATTGGCC CAGAGTCACCCAGTCAGGAAGCAGAAACCCGAGGATGGAACAAGGCATTGTCAATCCAGGGGTCCAAGTC GCTGCCATCACTACTTTTACCAGTCCACCAAGCGCTGGGTCTGGGCAAAGCAGGGCAAGTTTCCGGGTAA GGTTTGCCAGCAGTGACCTCAACAACATGGACCACGGTGTGTGTGTGTGTGTAGCTGTGGAGTACATTGG TGTCAACCAAGGCTCTTCAGGCAAAATTGTGGATCTCTGCCATGAGTACTAGGTGCGGTAGGGAAGCGGC TTCGTGGGCGACACTGCCATGGTTTGGCGTCCCTAGCAGCTGTGCGACCTCCAGCAAGTCGCTTCACTTC TCTGAGCTGTTTTCAGACGACCCCTTGGAAGATCGTGGACTTAAGTAAAGAATATGAGTAGAGTGCTCAG CTCAGTGCAAAAATTAAAAAAAAAAAAGTGTCAGGAGCCTTATCCGTCCTTGGATCTTAACAGTGAATGA GTTTCAGTGTTTCTTTCCAGGGGCCCTGCTGGCCGAGCCCCTTTCCTTCCCTGGTTCCTTCTCTCTCCCT CCTCTACTGCCTCCTCCCTCCAGGCTCTCGGTCGCTCCAGCAAAGTTCCCAACTTAGTCGACATGACGCG CGGCGCAGCCAATGGGAGGCGGAGTTGGCGTTTCTTGGTCGGGGGGGGGCCGGAGGGGTGGGCCCCGCGT CTCCGGTGTCTGCCGTGCTCACTGAATGGAGAGAGCGAGCGCCGGCCAGCTCACCCGGCCGCCCCGTGCC CCAGCCGCAGCCGCCGCGCTCCCCAGCCCAGCCCCAAGCCGGACCTCCCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLIT3_2 ↗ | 5:169,300,822 | 負股 | 169,300,812–169,300,871 |
| SLIT3_1 ↗ | 5:169,301,139 | 負股 | 169,301,129–169,301,188 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_B38L66 · enhancer · 169296407–169297197 · regulatory
ENSR5_B38L6R · promoter · 169300772–169301629 · regulatory
ENSR5_53GS6NW · CTCF_binding_site · 169301205–169301226 · regulatory
ENSR5_53GS6SM · CTCF_binding_site · 169302007–169302028 · regulatory
ENSR5_94H7D4 · enhancer · 169302630–169303030 · regulatory
ENSR5_53GS6XR · CTCF_binding_site · 169302688–169302709 · regulatory
ENSR5_53GS77H · CTCF_binding_site · 169304136–169304157 · regulatory
· motif · 169301207–169301223 · motif
· motif · 169302009–169302025 · motif
· motif · 169302690–169302706 · motif
· motif · 169304138–169304154 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1523 aa
Slit homolog 3 protein 長 1,523 個胺基酸，N 端具有訊號序列。蛋白質含多組 LRR 重複及 LRRNT、LRRCT 區域，後段另有多個 EGF-like 結構域、Laminin G-like 區域與 C 端 CTCK 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLIT3 蛋白質被註記為分泌型。 現有資料未提供其定位隨條件改變的資訊，也未描述不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLIT3 可能在細胞遷移中作為分子導引訊號，其功能可能由與 roundabout homolog receptors 的互作介導。來源未指出特定細胞、遷移方向或受體種類，也未說明互作後的分子步驟，因此這些功能與機制仍具推論性。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May act as molecular guidance cue in cellular migration, and function may be mediated by interaction with roundabout homolog receptors |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACTGAATGGAGAGAGCGAGCGCCGGCCAGCTCACCCGGCC40GCCCCGTGCCCCAGCCGCAGCCGCCGCGCTCCCCAGCCCA80GCCCCAAGCCGGACCTCCCCGGGCGCCACGCCCCATTGCG120CTCGCCCCAGGTCCCCAACCCGGCCCGCGGGCCAGCGGGG160CCAGGGGGCGCTCCGCACCTGGGCACTCCCAGCGATGCGC200AGCGGGGCAGCGCCGGCCCCGCCGATGGAGCTGCTGTTGC240TGCCGCCGCCGCCGCCCGGAGCGCCCCGCTCCGCCCGCGC280CCCGTGCGCCTGAGCACCGAGCTCGCCCCTCCTCCGCGCT320AACTCCGCCGCCCGCTCCCCAGGCCGCCCGCGCTCCCCGC360GCGCCTCCTCGGGCTCCACGCGTCTTGCCCCGCAGAGGCA400GCCTCCTCCAGGAGCGGGGCCCTGCACACCATGGCCCCCG440GGTGGGCAGGGGTCGGCGCCGCCGTGCGCGCCCGCCTGGC480GCTGGCCTTGGCGCTGGCGAGCGTCCTGAGTGGGCCTCCA520GCCGTCGCCTGCCCCACCAAGTGTACCTGCTCCGCTGCCA560GCGTGGACTGCCACGGGCTGGGCCTCCGCGCGGTTCCTCG600GGGCATCCCCCGCAACGCTGAGCGCCTTGACCTGGACAGA640AATAATATCACCAGGATCACCAAGATGGACTTCGCTGGGC680TCAAGAACCTCCGAGTCTTGCATCTGGAAGACAACCAGGT720CAGCGTCATCGAGAGAGGCGCCTTCCAGGACCTGAAGCAG760CTAGAGCGACTGCGCCTGAACAAGAATAAGCTGCAAGTCC800TTCCAGAATTGCTTTTCCAGAGCACGCCGAAGCTCACCAG840ACTAGATTTGAGTGAAAACCAGATCCAGGGGATCCCGAGG880AAGGCGTTCCGCGGCATCACCGATGTGAAGAACCTGCAAC920TGGACAACAACCACATCAGCTGCATTGAAGATGGAGCCTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。