基因總覽
SLIT2 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 slit guidance ligand 2。其產物 Slit homolog 2 protein 被認為是細胞移動與神經發育相關的分子引導訊號，功能似乎由其與 roundabout homolog 受體的交互作用介導。來源描述 SLIT2 參與軸突導航，也涉及神經元與白血球移動；這些資料呈現其作為引導配體的基本角色，但未提供更廣泛的家族分類或蛋白質整體結構說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000504154 ★ | 20,251,905–20,620,561 | 37 |
| ENST00000503823 | 20,251,897–20,621,249 | 36 |
| ENST00000273739 | 20,251,897–20,621,249 | 39 |
| ENST00000883938 | 20,251,897–20,621,249 | 36 |
| ENST00001110081 | 20,251,897–20,271,261 | 4 |
| ENST00001110082 | 20,251,897–20,258,410 | 3 |
| ENST00001111907 | 20,251,897–20,492,461 | 9 |
| ENST00001124843 | 20,251,897–20,282,712 | 5 |
| ENST00001124844 | 20,251,897–20,282,712 | 5 |
| ENST00001124845 | 20,251,897–20,282,705 | 5 |
| ENST00001141405 | 20,251,897–20,621,249 | 37 |
| ENST00000622093 | 20,253,564–20,621,249 | 37 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLIT2 被認為可提供細胞移動所需的分子引導訊號，其作用似乎透過與 roundabout homolog 受體交互作用而介導。神經發育期間，SLIT2 參與神經管腹側中線附近的軸突導航，以及軸突投射至不同區域。在前腦，SLIT1 與 SLIT2 似乎是嗅球軸突中線引導的重要因子，可能藉由排斥訊號避免軸突不適當地穿越中線。
在脊髓發育中，SLIT2 可能於連合軸突抵達底板後，透過調節其對 netrin 的反應參與引導；它也可能參與軸突穿越脊髓中線後的排斥作用。體外研究中，只有已穿越中線的連合軸突會對 SLIT2 起反應，顯示此作用與軸突所處的發育階段有關。
在發育中的視覺系統，SLIT2 似乎會排斥視網膜神經節細胞軸突，協助其在通過視交叉之前及之後沿適當路徑前進。體外實驗也觀察到 SLIT2 使這些細胞的生長錐塌陷並產生排斥反應。除此之外，SLIT2 似乎參與中樞神經系統感覺軸突的分支與樹狀化，也涉及神經元細胞移動。
體外結果顯示，Slit homolog 2 protein 的 N 端產物與 C 端產物作用不同：N 端產物可排斥嗅球軸突，但不排斥背根神經節軸突；它也會誘發嗅球軸突生長錐塌陷，並促進背根神經節軸突分支。SLIT2 另被認為可能參與白血球移動的調節。
Promoter 與基因調控
>SLIT2 ENST00000504154 GRCh38 chr4:20250905-20252005 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAGAGAAGGAGCAGAGTCATTTAGATGTCATTTCAAACTTACAGTGACATTGGCTCTTGCTGGGGGGGAA AGGGGGGCGAGAGAGGCAGCCGTTGCCAGACATACGTCACACTAAAGAGACAAGATGAAACAAGGAAATT CTCTTTCAAAACATAGCGGGGAAAAAAATATCCAGAACTGCCCTGAAATAAAGAAAACCTTCTGGTATAA TGTGCGTTGCTAGGGATTTATTTTTTCCCCTCCTTTCTCTCATAAGAGAGTAAAAAATCACACAGATACG TTCAAGCCCTTAAGAGTTTTGTGAGCCTATTGAATATCCAAGACATCAACTGACCACGGTGTGGTTCAGT GTGTGTCTACAAAGGAAGGGTTAAACGGAAGGGGGTGGCTTGGAGATAGAAAGGCAAGCAAGAAGGTTGG AAAATGCTGTTTTCCAACTTGCAAAAACTGAACTTTTCAGCTCCCCAAAATACACGTGTGTGTCTGTAAG CGCAGGCAGATCTATTTCGGTAGGATTTTTCTTAAATTTAAATCATAATTTCTCTGTTTCTGTCTCTCTG TCTCTTGCTGCGCTGCAAAGAGTGAGCAGCCCCCTTAAGGATCGCGTGGCAAAAGCTGCAGGAGAGGCAC TGGCAGGGCTGTTTATTTATGAGCCGCGTTCAAAGCCGACCTCTTCCCATTCTCCCACTGCAAACGACTA TCTCCGAGCCCAGGTCACCTCTGGGGCCAAGGAGTTGGGGGCTGGGGCTCGGGTGGCTCCTTCTTCGGGC CAAGTTTGCCCGCGCGTGGGAGCGAGGGGGCGAGCCAGGGCGCACGGGAACGCGCGCCGCCAGCCGCCGC CTCCGCCCAGCGCTGGCAGCCCCGGCCTCACCTCTCCCCTCTCCCCAGCGAGGTGCGGGCTCCCAGAGCG GAGCCAGGGGGCGGGCCTGGGCCTCGAGGGGCGGGGTCAGGGGGCGGAGGCTCGGGCGGCTATATAAGGC CCGCGCCGGCTCAACTTCGGACTTGGTGTTATTTATTTGGGAAGCGCCCGGACGGCGGAGCTTGGCGGCG GCGGTGGTGGTGGCTGCCGCAGACTGTGGTTAAAAAAAAGAAGGCGGCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLIT2_1 ↗ | 4:20,252,890 | 正股 | 20,252,841–20,252,900 |
| SLIT2_2 ↗ | 4:20,253,209 | 正股 | 20,253,160–20,253,219 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_B62HG · enhancer · 20248120–20248758 · regulatory
ENSR4_56QKX3 · CTCF_binding_site · 20248277–20248298 · regulatory
ENSR4_56QL35 · CTCF_binding_site · 20248934–20248955 · regulatory
ENSR4_8L42H · enhancer · 20249453–20249683 · regulatory
ENSR4_56QLFX · CTCF_binding_site · 20251275–20251296 · regulatory
ENSR4_9B32T · promoter · 20251415–20251915 · regulatory
ENSR4_B62J2 · enhancer · 20251916–20252482 · regulatory
ENSR4_C4293 · promoter · 20252483–20253826 · regulatory
ENSR4_56QLMW · CTCF_binding_site · 20252560–20252581 · regulatory
ENSR4_56QLN8 · CTCF_binding_site · 20252635–20252656 · regulatory
ENSR4_C4296 · enhancer · 20253827–20255578 · regulatory
ENSR4_56QLTZ · CTCF_binding_site · 20253871–20253892 · regulatory
· motif · 20248279–20248295 · motif
· motif · 20248936–20248952 · motif
· motif · 20251277–20251293 · motif
· motif · 20251871–20251886 · motif
· motif · 20251894–20251908 · motif
· motif · 20252562–20252578 · motif
· motif · 20252637–20252653 · motif
· motif · 20253873–20253889 · motif
· motif · 20255077–20255093 · motif
· motif · 20255077–20255093 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1529 aa
Slit homolog 2 protein 長 1529 個胺基酸，具有訊號胜肽、重複的 LRR 區段，以及多個 LRRNT 與 LRRCT 區域。其後段包含七個 EGF-like 區域，其中兩個註記為 calcium-binding，另有 Laminin G-like 區域；C 端則含 CTCK。這些為序列註解所列的結構特徵。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLIT2 為分泌蛋白。 切割後的 C 端蛋白較容易擴散；相較之下，較大的 N 端蛋白與細胞的關聯較緊密。 來源未提供其他定位改變條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- ROBO1Q9Y6N7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
SLIT2 可形成同源二聚體，並以高親和力結合 ROBO1 與 ROBO2。另有與 GREM1 交互作用的記載，但此項依據標示為 By similarity；來源未進一步說明該關係是否屬於複合體或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLIT2 被認為是細胞移動的分子引導訊號，作用似乎由 roundabout homolog 受體介導。它參與神經發育時軸突導航，可能避免嗅球軸突不當穿越前腦中線，並在脊髓調節連合軸突對 netrin 的反應及中線穿越後的排斥。體外觀察顯示其排斥視網膜神經節軸突，且 N 端與 C 端產物對嗅球及背根神經節軸突的作用不同；此外可能涉及神經軸突分支、神經元及白血球移動。 | 含實驗來源 | 證據與來源Thought to act as molecular guidance cue in cellular migration, and function appears to be mediated by interaction with roundabout homolog receptors. During neural development involved in axonal navigation at the ventral midline of the neural tube and projection of axons to different regions. SLIT1 and SLIT2 seem to be essential for midline guidance in the forebrain by acting as repulsive signal preventing inappropriate midline crossing by axons projecting from the olfactory bulb. In spinal cord development may play a role in guiding commissural axons once they reached the floor plate by modulating the response to netrin. May be implicated in spinal cord midline post-crossing axon repulsion. In vitro, only commissural axons that crossed the midline responded to SLIT2. In the developing visual system appears to function as repellent for retinal ganglion axons by providing a repulsion that directs these axons along their appropriate paths prior to, and after passage through, the optic chiasm. In vitro, collapses and repels retinal ganglion cell growth cones. Seems to play a role in branching and arborization of CNS sensory axons, and in neuronal cell migration. In vitro, Slit homolog 2 protein N-product, but not Slit homolog 2 protein C-product, repels olfactory bulb (OB) but not dorsal root ganglia (DRG) axons, induces OB growth cones collapse and induces branching of DRG axons. Seems to be involved in regulating leukocyte migration PMID 10102268 ↗ · PMID 10864954 ↗ · PMID 10975526 ↗ · PMID 11309622 ↗ · PMID 11404413 ↗ |
| 交互作用 | SLIT2 可形成同源二聚體，並以高親和力結合 ROBO1 與 ROBO2。另有與 GREM1 交互作用的記載，但此項依據為相似性推論，來源沒有進一步說明其互作形式或功能結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with GREM1 (By similarity). Homodimer. Binds ROBO1 and ROBO2 with high affinity PMID 10102268 ↗ · PMID 11404413 ↗ · PMID 17848514 ↗ · PMID 19498462 ↗ |
| 細胞定位 | SLIT2 為分泌蛋白。蛋白質切割後，C 端產物比體積較大的 N 端產物更容易擴散；N 端產物則與細胞關聯較緊密。 | 含實驗來源 | 證據與來源Secreted; The C-terminal cleavage protein is more diffusible than the larger N-terminal protein that is more tightly cell associated PMID 10102268 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTTGGTGTTATTTATTTGGGAAGCGCCCGGACGGCGGAG40CTTGGCGGCGGCGGTGGTGGTGGCTGCCGCAGACTGTGGT80TAAAAAAAAGAAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGCG120GAGGCAGCTGCGAGGCATGGGAGCGCCGAAGCGCCCAGGC160GCAGGCCGAAGCTGCCGCGCTTTCTGGGCACGGCGGGAGT200GCTGAGCAGAAAGGGGAGCGCCGGGGGCCCGCAGCCGGCT240CCGGAGGCGCGGGCCGGGTTTTTGTTTGGCTACGCTGAGC280GCCAGTCAGCCCCAGCGAACAACTCCAGTTACGACAACAA320CCCACCTTCCTTCCAGACAAGCGAGACTTGGGCTGCTGCG360TCCGTCCTATTGTTTAGACACTTGCCAGGGGCTCCGGAGT400CGGCAGAGCCACCGAGTCCCCGCTCTGAGTCGTCGCCCTC440CCTCTCCCCGACCTCGCTCCCTGGAGCGGGAGGCCAGGAA480AGCAGCGGGAGAGGGGAAGGGGCTAGAAGGAGAAGGACTA520CCCGGGACTGCGGCCGCCGCGTCAGGTGCAGCGCCAGGAG560CCGGGCGGCGTCGCCACGCCGGCAGGGGTACCGCCACTGT600GGCCTTGGGGGACGGAATTCAAAGCCTGGGAAAAGTTGCT640GCACTTTGAGAAGGACGAACCACTAGTGGGAGACCGCCGG680GGGCCGGCCGTGGCTCTGCGCCCTCCGGAACCCGGCTCTT720GTTTCTTCTACCTTTGCCATCAGGTGTCTGCCGCGGAGCT760GCGGCTTATCTGGGAGACGAGCGGGGTTGACACGCGCGCA800CACACTACTGCCATTCAGCTGCCGCCTGGCTCTGCCTGGA840GTAGTGGATCCCACCCGCCCACCTGCCACCGAGCCATTCT880CCAGTACGCCCCAGCAGGACGCTGACACCTCCAACCTTGG920CCTTTGCCTTTCCACTCCTTCCGGTCTGCCTGGTTTTTAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。