基因總覽
SLIT1（slit guidance ligand 1）是蛋白質編碼基因，產物 Slit homolog 1 protein 長 1534 個胺基酸。其序列包含多個 leucine-rich repeat（LRR）與 EGF-like 區域，並具有 Laminin G-like 和 CTCK 等結構區段，呈現多結構域蛋白的特徵。資料將 SLIT1 描述為分子引導訊號；其在發育中的角色與作用方式仍帶有推測性，相關功能見下文。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000266058 ★ | 96,998,038–97,185,959 | 37 |
| ENST00000371070 | 96,998,038–97,186,121 | 37 |
| ENST00001140172 | 96,998,038–97,186,121 | 37 |
| ENST00001115009 | 97,012,937–97,186,121 | 31 |
| ENST00000314867 | 97,037,698–97,185,623 | 22 |
| ENST00000371041 | 97,057,742–97,186,121 | 12 |
| ENST00001115010 | 97,153,043–97,186,121 | 5 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLIT1 被認為是細胞移動時的分子引導訊號，但這項功能的描述屬推測。其作用似乎由它與 roundabout homolog 受體的交互作用介導；資料未進一步說明此作用的分子細節，因此不宜將此推測擴大解讀為已確立的完整機制。
在神經發育方面，SLIT1 被認為參與神經管腹側中線附近的軸突導航，也與軸突投射至不同區域有關。這些敘述標示為 By similarity，表示功能判斷依據相似性推論，並非此處直接提供的實驗證明。
在前腦中，SLIT1 與 SLIT2 被認為共同參與中線引導。兩者似乎提供排斥性訊號，避免由嗅球投射而來的軸突不適當地跨越中線。來源以「似乎」描述其必要性與作用，故這項功能關係仍保留不確定性；資料支持的重點是 SLIT1 與 SLIT2 的共同作用及其對軸突路徑選擇的關聯。
Promoter 與基因調控
>SLIT1 ENST00000266058 GRCh38 chr10:97185859-97186959 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CGGGGCTGGCCTGTGGGGTTCTCTCCCAAGCAGGCCGCCCAGCGCTATGCCAGCCCTCTCTGTCTCCTTT GATGTCAAGATGGAATATTCATTTTCATCTGTTTCCACCTGTCAGAAATGGAGGAACGCTGGTGTGAGTG GAGGAAGACGTTTGCCAGATTTCCAAGTCCCCTTAATGTCTGTCCCTCTCTTCTACAACGGGGGAAGAAG CCCGTGTAACTGTATGGTACAAATACGCCCTGCTGAGCAAGTGTTCCAATCAGAGCCATTCTCATCCTGG GCATGCGGCTAGCTTGTTCCCCTCTGAGAAGTGGGTGCATTGAGGTAGGAAGGAGACTGTACTCCGCCTA GCGCTTTCGTGGACCCTCCCCCCCGACAAAGCTCCATCCTCAAAGTCCAGGCTAAGTAAGGTTGGTGGCT TGAGGATGCTACCTGGGGCACAGGCACAGGGTTTCCCTTAACCAAGAATTGACACAGCGAGTCGGGTGGG GCCGAGAGGCCGCTGCTGCCGTCGGGGGATGGGGGGAAACGGGTCTGACTCCCCGGGAAGGCGTCCAAGC GGCAAAATAAGATCTCCCTCCCACCCTGGACTAGCAGCTGGGGCCGCGGGTGCCGGGGTGCGTGCGTCTA AATGTGCGCATCCTCGCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACAGCCAG GACTTGGCGGGTCGAGTCACACCCCCTTCCCTCTTCTCCCATCCCCCGCAGCCCCGTGCCCGCTGACGGC GCCTCGGAGGTTCCACCTTTGAAACTGTAGGCGGCTTGCAGCCGCTGAGTGGTCGTCGGGAGAGGGGGGC TGCGGCGGGGGAGGGCGGGGAGGAGCCTGGCCCTGGATGTGTGCTTTTCGATTGATGGATGACTGCCGGG TGGGAGCGAGCGCGCGGGTGTGTGTGTGATCGTGTGTGTGTGTGTGGTGTGTGCGCAGGGTGCGTGCGCG CGCGGGGCCTGCCCATTTTCCTCCTCGCAGCAGTCAGTTGGGAGCTGGAGGGAGGGAGAGGGAGACGCAG GCGGCGAAACGGCAGAGGAGCCGAGCCCCCTCCGCCCAAGGCGCCCTCCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLIT1_4 ↗ | 10:97,185,512 | 負股 | 97,185,502–97,185,561 |
| SLIT1_2 ↗ | 10:97,185,824 | 負股 | 97,185,814–97,185,873 |
| SLIT1_1 ↗ | 10:97,185,944 | 負股 | 97,185,934–97,185,993 |
| SLIT1_3 ↗ | 10:97,186,077 | 負股 | 97,186,067–97,186,126 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_BP9QH · promoter · 97185748–97186449 · regulatory
ENSR10_5ST7D2 · CTCF_binding_site · 97186602–97186623 · regulatory
ENSR10_93FKJN · enhancer · 97188282–97188750 · regulatory
· motif · 97186604–97186620 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1534 aa
Slit homolog 1 protein 長 1534 個胺基酸，序列起始處有訊號序列。蛋白質含多組 LRR 重複與 LRRNT、LRRCT 區域，後段則有多個 EGF-like 區域、Laminin G-like 區域及 CTCK。這些區域依序分布於蛋白質不同位置，構成其多結構域架構。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLIT1 的定位註解為分泌型；資料未提供定位改變的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
- ADAMTSL4Q6UY14-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHRDL2Q6WN34-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FHL5Q5TD97 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOXA1P49639 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KRTAP1-1Q07627 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP13-2Q52LG2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP13-3Q3SY46 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM42Q8IWZ5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF620Q6ZNG0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SLIT1 被註記與 ROBO1 及 GREM1 互相作用。資料未說明這些關係是否代表同一複合體，也未提供其結合方式或功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLIT1 被認為是細胞移動的分子引導訊號，功能似乎由其與 roundabout homolog 受體的交互作用介導。神經發育期間，它被認為參與神經管腹側中線的軸突導航及軸突向不同區域投射；此判斷標示為 By similarity。SLIT1 與 SLIT2 似乎共同參與前腦中線引導，並以排斥訊號避免嗅球投射軸突不適當跨越中線。 | 推論支持 | 證據與來源Thought to act as molecular guidance cue in cellular migration, and function appears to be mediated by interaction with roundabout homolog receptors. During neural development involved in axonal navigation at the ventral midline of the neural tube and projection of axons to different regions (By similarity). SLIT1 and SLIT2 together seem to be essential for midline guidance in the forebrain by acting as repulsive signal preventing inappropriate midline crossing by axons projecting from the olfactory bulb |
| 交互作用 | SLIT1 被註記與 ROBO1 及 GREM1 互相作用；資料未進一步說明交互作用的方式或其功能後果。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
CTCCTCGCAGCAGTCAGTTGGGAGCTGGAGGGAGGGAGAG40GGAGACGCAGGCGGCGAAACGGCAGAGGAGCCGAGCCCCC80TCCGCCCAAGGCGCCCTCCCTCCGTCCGCGCACAGGCGCC120GTCGCTTGGAGGAGCAAGGTGCCTCCCAGCCCGCAGGGGC160GCCGCGCGCAAGCCCGCGGGCTCTTCGGTGGCTCTGCCCC200GGGACTGCACCTGGAGGCGGCCCCGGACGGGGATGGTCAG240CGGCTGCTGCCGTCTGGCTCGCGAGCGGGACGCTGTGAGG280GCACCATGGCGCTGACTCCCGGGTGGGGGTCCTCGGCGGG320GCCGGTCCGGCCGGAGCTCTGGCTGCTGCTGTGGGCAGCC360GCGTGGCGCCTGGGTGCCTCGGCGTGCCCCGCCCTCTGCA400CCTGCACCGGAACCACGGTGGACTGCCACGGCACGGGGCT440GCAGGCCATTCCCAAGAATATACCTCGGAACACCGAGCGC480CTGGAACTCAATGGCAACAACATCACTCGGATCCATAAGA520ATGACTTTGCGGGGCTCAAGCAGCTGCGGGTGCTGCAGCT560GATGGAGAACCAGATTGGAGCAGTGGAACGTGGTGCTTTT600GATGACATGAAGGAGCTGGAGCGGCTGCGACTGAACCGAA640ACCAGCTGCACATGTTACCGGAACTGCTGTTCCAGAACAA680CCAGGCTTTGTCAAGACTGGACTTGAGTGAGAACGCCATC720CAGGCCATCCCCAGGAAAGCTTTTCGGGGAGCTACGGACC760TTAAAAATTTACAGCTGGACAAGAACCAGATCAGCTGCAT800TGAGGAAGGGGCCTTCCGTGCTCTGCGGGGGCTGGAGGTG840CTGACCCTGAACAACAACAATATCACCACCATCCCCGTGT880CCAGCTTCAACCATATGCCCAAGCTACGGACCTTCCGCCT920GCACTCCAACCACCTGTTTTGCGACTGCCACCTGGCCTGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。