基因總覽
SLCO4A1（solute carrier organic anion transporter family member 4A1）是蛋白質編碼基因，產物屬於有機陰離子轉運蛋白家族，為具有多個跨膜區段的膜蛋白。其可辨識的底物範圍廣，涵蓋甲狀腺荷爾蒙、結合型類固醇、膽酸與前列腺素等分子；這些底物類別構成其基本功能概貌。來源指出，SLCO4A1 可能以具組織特異性的方式運作，但其實際運輸機制及不同組織中的差異仍未完全釐清。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000217159 ★ | 62,642,503–62,672,293 | 12 |
| ENST00000851396 | 62,642,440–62,672,622 | 12 |
| ENST00000851397 | 62,642,440–62,672,622 | 12 |
| ENST00000851398 | 62,642,440–62,672,622 | 10 |
| ENST00000851399 | 62,642,440–62,672,622 | 11 |
| ENST00000851400 | 62,642,440–62,672,622 | 12 |
| ENST00000851401 | 62,642,440–62,672,622 | 10 |
| ENST00000851402 | 62,642,440–62,672,622 | 12 |
| ENST00000921991 | 62,642,440–62,672,622 | 12 |
| ENST00000943509 | 62,642,440–62,672,622 | 11 |
| ENST00001107045 | 62,642,440–62,669,704 | 11 |
| ENST00001107046 | 62,642,440–62,663,042 | 5 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLCO4A1 是有機陰離子反向轉運蛋白，底物辨識範圍較廣。已列出的底物包括甲狀腺荷爾蒙 3,3',5-triiodo-L-thyronine（T3）、L-thyroxine（T4）及 3,3',5'-triiodo-L-thyronine（rT3）；也包括結合型類固醇 estrone 3-sulfate 與 estradiol 17-beta glucuronide、膽酸 taurocholate，以及 prostaglandin E2。來源指出，其運作可能具有組織特異性，因此不能假定不同器官中的底物選擇或運輸方式完全相同。
部分反應資料顯示，SLCO4A1 可促進 T3、T4、estrone 3-sulfate 或 taurocholate 進入細胞，同時使 L-glutamate 朝細胞外移動，符合底物與 glutamate 反向交換的描述。另有資料記錄 T3、T4、rT3、estrone 3-sulfate、17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)、taurocholate 及 prostaglandin E2 的由外向內運輸。不過，來源未將所有底物的運輸都描述為與 glutamate 交換，不能將已列出的交換反應一概套用至全部底物。
SLCO4A1 可能參與將代謝物從血液帶入腎臟、肝臟或胎盤等器官。另有可能性是，在胎盤微絨毛膜上，SLCO4A1 配合向外的 glutamate 梯度，選擇性運輸甲狀腺荷爾蒙與雌激素。此胎盤運輸模式仍屬可能的功能描述；其在不同組織中的實際作用方式尚未完全確定。
目前仍待釐清的事項包括運輸機制本身、運輸是否具有電生性，以及各組織可能使用哪些反向運輸離子。因而，現有資料支持 SLCO4A1 能轉運多種有機陰離子並可能參與器官代謝物攝取，但對其組織差異與完整交換機制仍須保留不確定性。
Promoter 與基因調控
>SLCO4A1 ENST00000217159 GRCh38 chr20:62641503-62642603 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCACCAGCCTGGGGCCGTGAGGTGGTCATTTCCCCCCTTACCTGACTTATCTCAGGATTCACACACACA CACTTGACTTTCGGAAACTTCTTTTAAATTAATTTCACTGACACTAAAAGGGAAGCTTTGTGGAGTGTGA TTGTGGTTACCTGTTAATACTTGGCAACAATTATGAGCCCTGATATGAGCCAACTTCTTCCGTCTTATCC CCTTTGAGGACGCTCTGTTATCGCCCCCATTTTGCAAACGAGGAAACTGAGGCTCGGAGGCCTGGAGCAA TGTGTTCCAGGACAGACGGCAGGAAGCCGGGGTAGGAATTCCAACAGGGAGTTCCCTCTGTGGAAGGGAA CGTGGCTGGCACCTCCCTGCCTTCCACCCTCAGAGCTAGTGTGAAAAAGAAGACGGGGTTATGGAAAAGG CAACGGGCTGGAGATTCCCCGGATTCCCAGGCTAGGGCGCCGGTCTCACTGTGCGCGCAGGTGGGGCGCG TGCCAGAACAGGGCCTGGGGGTCAGGCCGAGACCGGCGGGCACCTTCACCAGGGCCGCCCGTGGCGTTCC CCCAGCCCCTCTGCCGCGGGCCCCACGTGGCCCCGACCCTGCGGCAGCCTTTCGGAAGGGCGGAGCTGAA AAACGGCCGCTTGGCTCCACTCGGCCCCACAGCGCCCAGGAGCGAATCCCGAGTCCGTTCGGAACCGCCT CGCCGCGTGGCCTGGGGCGGCGTCGCCACCGCGCGTTCTCGGCCTCCCGGCTGCGGCAGCGATGCCGGTC CTTGGAGCTGGAGCGGGGAGTCCAGGAGGCGGCAGCGCTCCGGAGAGAGACGCCCTGGTCCCCCGCCGCG CGTTCCCGCCTCTGTGCCCTGGGGGGGAGGAGGGGGCGGTCGCCGCTGCCATTGGCCGTGGGGGGTGAGG CGGGCCCCGCGCAGGAAACCCCGCCCCTCCCTCTGCGGCGGGGGCGGCCCCAGCGGATGAATGAAGCGGC GCGTGGCTGCCGGGGAGGCCAGAGCGTGGAGCGCTGCGCGGCGCGGCGGCCGGGCCCTCGAGACGGGGAC GGTGAGTGCGCGGGGAGCGGGGAGCTGGCGCGGGTGCACAGGGCCCGACCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLCO4A1_1 ↗ | 20:62,642,503 | 正股 | 62,642,454–62,642,513 |
| SLCO4A1_2 ↗ | 20:62,656,449 | 正股 | 62,656,400–62,656,459 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_9WTBM · promoter · 62642013–62642513 · regulatory
ENSR20_5JPS5C · CTCF_binding_site · 62642222–62642243 · regulatory
ENSR20_BGFMW · enhancer · 62642514–62643293 · regulatory
ENSR20_9WTC2 · promoter · 62643294–62643794 · regulatory
ENSR20_5JPSH2 · CTCF_binding_site · 62644313–62644334 · regulatory
ENSR20_BGFN8 · enhancer · 62644837–62645426 · regulatory
ENSR20_C87SR · enhancer · 62646843–62648569 · regulatory
· motif · 62638643–62638657 · motif
· motif · 62642010–62642017 · motif
· motif · 62642224–62642240 · motif
· motif · 62642369–62642382 · motif
· motif · 62642447–62642460 · motif
· motif · 62642626–62642636 · motif
· motif · 62642666–62642679 · motif
· motif · 62642713–62642726 · motif
· motif · 62643009–62643018 · motif
· motif · 62644315–62644331 · motif
· motif · 62647081–62647094 · motif
· motif · 62647351–62647373 · motif
· motif · 62647351–62647373 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：722 aa
SLCO4A1 蛋白質長 722 個胺基酸，屬於 organo anion transporter（TC 2.A.60）家族。序列註解預測其具有 12 個跨膜螺旋，並在第 498–555 位胺基酸標示 Kazal-like 結構域。蛋白質兩端另有預測的無序區段，分別位於第 1–52 位與第 703–722 位胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLCO4A1 位於細胞膜，屬多次跨膜蛋白。 此定位資料未提供特定條件或異構型間差異；來源亦未指出可由其他分子的定位推定 SLCO4A1 的細胞內位置。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- GPR25O00155 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 13 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLCO4A1 是底物範圍看似廣泛的有機陰離子反向轉運蛋白，可辨識甲狀腺荷爾蒙 T3、T4、rT3，結合型類固醇 estrone 3-sulfate 與 estradiol 17-beta glucuronide、膽酸 taurocholate，以及 prostaglandin E2，且可能依組織而異。它可能協助代謝物由血液進入腎臟、肝臟或胎盤；在胎盤微絨毛膜上，也可能配合向外的 glutamate 梯度選擇性運輸甲狀腺荷爾蒙與雌激素。其運輸機制、電生性及組織特異性反向離子仍待釐清。 | 含實驗來源 | 證據與來源Organic anion antiporter with apparent broad substrate specificity. Recognizes various substrates including thyroid hormones 3,3',5-triiodo-L-thyronine (T3), L-thyroxine (T4) and 3,3',5'-triiodo-L-thyronine (rT3), conjugated steroids such as estrone 3-sulfate and estradiol 17-beta glucuronide, bile acids such as taurocholate and prostanoids such as prostaglandin E2, likely operating in a tissue-specific manner. May be involved in uptake of metabolites from the circulation into organs such as kidney, liver or placenta. Possibly drives the selective transport of thyroid hormones and estrogens coupled to an outward glutamate gradient across the microvillous membrane of the placenta. The transport mechanism, its electrogenicity and potential tissue-specific counterions remain to be elucidated (Probable) PMID 10873595 ↗ · PMID 19129463 ↗ · PMID 30343886 ↗ |
| 分子活性 | 3,3',5-triiodo-L-thyronine(out) + L-glutamate(in) = 3,3',5-triiodo-L-thyronine(in) + L-glutamate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源3,3',5-triiodo-L-thyronine(out) + L-glutamate(in) = 3,3',5-triiodo-L-thyronine(in) + L-glutamate(out) PMID 30343886 ↗ |
| 分子活性 | L-thyroxine(out) + L-glutamate(in) = L-thyroxine(in) + L-glutamate(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | estrone 3-sulfate(out) + L-glutamate(in) = estrone 3-sulfate(in) + L-glutamate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源estrone 3-sulfate(out) + L-glutamate(in) = estrone 3-sulfate(in) + L-glutamate(out) PMID 30343886 ↗ |
| 分子活性 | taurocholate(out) + L-glutamate(in) = taurocholate(in) + L-glutamate(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | 3,3',5-triiodo-L-thyronine(out) = 3,3',5-triiodo-L-thyronine(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | L-thyroxine(out) = L-thyroxine(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | 3,3',5'-triiodo-L-thyronine(out) = 3,3',5'-triiodo-L-thyronine(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | estrone 3-sulfate(out) = estrone 3-sulfate(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | 17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)(out) = 17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)(in) | 含實驗來源 | 證據與來源17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)(out) = 17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)(in) PMID 19129463 ↗ |
| 分子活性 | taurocholate(out) = taurocholate(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | prostaglandin E2(out) = prostaglandin E2(in) | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SLCO4A1 是位於細胞膜的多次跨膜蛋白。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGAGCGTGGAGCGCTGCGCGGCGCGGCGGCCGGGCCCTCG40AGACGGGGACGGACACACCAGCCCCTCGGATACCACTTGG80CCACTCCCGCTGAGGCCACTCCCACTGCGTGGCTGAAGCC120TCGAGGTCACCAGGCGGAGGCGCGGAGATGCCCCTGCATC160AGCTGGGGGACAAGCCGCTCACCTTCCCCAGCCCCAACTC200AGCCATGGAAAACGGGCTTGACCACACCCCACCCAGCAGG240AGGGCATCCCCGGGCACACCCCTGAGCCCCGGCTCCCTCC280GCTCCGCTGCCCATAGCCCCCTGGACACCAGCAAGCAGCC320CCTCTGCCAGCTCTGGGCCGAGAAGCATGGCGCCCGGGGG360ACCCATGAGGTGCGGTACGTCTCGGCCGGGCAGAGCGTGG400CGTGCGGCTGGTGGGCCTTCGCACCGCCGTGCCTGCAGGT440CCTCAACACGCCCAAGGGCATCCTGTTCTTCCTGTGTGCG480GCCGCATTCCTGCAGGGGATGACTGTGAATGGCTTCATCA520ACACAGTCATCACCTCCCTGGAGCGCCGCTATGACCTGCA560CAGCTACCAGAGCGGGCTCATCGCCAGCTCCTACGACATT600GCCGCCTGCCTCTGCCTCACCTTCGTCAGCTACTTCGGGG640GCTCAGGGCACAAGCCGCGCTGGCTGGGCTGGGGCGTGCT680GCTTATGGGCACGGGGTCGCTGGTGTTCGCGCTGCCCCAC720TTCACGGCTGGCCGCTATGAGGTGGAGTTGGACGCGGGTG760TCAGGACGTGCCCTGCCAACCCCGGCGCGGTGTGTGCGGA800CAGCACCTCGGGCCTGTCCCGCTACCAGCTGGTCTTCATG840CTGGGCCAGTTCCTGCATGGCGTGGGTGCCACACCCCTCT880ACACGCTGGGCGTCACCTACCTGGATGAGAACGTCAAGTC920CAGCTGCTCGCCCGTCTACATTGCCATCTTCTACACAGCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。