基因總覽
SLCO3A1（solute carrier organic anion transporter family member 3A1）是蛋白質編碼基因，產物屬於有機陰離子轉運蛋白家族。其主要特性是作為多次穿膜的膜蛋白；所提供的序列註解顯示，蛋白質具有多段跨膜螺旋，並含有 Kazal-like 結構域。這些特徵符合其膜轉運蛋白的基本性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000318445 ★ | 91,853,708–92,165,903 | 10 |
| ENST00000424469 | 91,853,708–92,172,435 | 11 |
| ENST00001037150 | 91,853,708–92,165,895 | 10 |
| ENST00001037154 | 91,853,708–92,163,542 | 9 |
| ENST00001107080 | 91,853,708–92,105,287 | 4 |
| ENST00000553304 | 91,854,121–91,916,378 | 2 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLCO3A1 的產物被認為是具有廣泛底物範圍的有機陰離子反向轉運蛋白。來源指出，它可介導多類分子的跨膜轉運，包括甲狀腺素 L-thyroxine、前列腺素 E1、E2 與 F2alpha、膽酸類 taurocholate 和 glycocholate，以及類花生酸 (5Z,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate。底物還包括胜肽荷爾蒙 L-arginine vasopressin（亦稱 argipressin），以及胺基酸 L-tryptophan、L-tyrosine 和 L-phenylalanine。
其轉運底物也涵蓋類固醇荷爾蒙前驅物 dehydroepiandrosterone 3-sulfate 與 estrone 3-sulfate。不同底物的轉運資料分別支持這些分子可經 SLCO3A1 移動，但來源指出其實際作用可能具有組織特異性，因此不宜將底物範圍視為各組織中都相同的固定模式。
目前仍未釐清此蛋白質的轉運機制，包括轉運是否具有電生性，以及不同組織中可能參與轉運的反向離子。故雖然它被描述為有機陰離子反向轉運蛋白，具體的能量與離子耦聯方式仍屬未定。這些限制也意味著，現有資料可指出其能轉運的底物種類，卻不足以完整說明不同底物在各組織內的轉運條件與機制。
Promoter 與基因調控
>SLCO3A1 ENST00000318445 GRCh38 chr15:91852708-91853808 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAGGCATTCAGGTCAAGGCCGAGGATGGTGGCCAGGGCCACAGAGCCAGGGGACGGGTGGGGACCCAGCA GGCCTGCGGCTGGCCGCTTGCTGAGCGCTCCAGCAGCGGGGCCCTGGGCGGATGAAGGGCCGGAGAAGGC CCTCTGCTGGGGCCGCGGCGATCTTGCAGCGCCTGGACACCGAGGCTGGGGCACTAACGGTCCGTGGGGC TCCCGACGTATTCCTCTAACTTCCCCTTTCTGTCCTTTCGGTCTGGGGCCTTTTCAACACCCCCTGTGGC CGGGGACAGCTGGGGCAGAAACCGGCAGGCGGCAGAAGCCTCAAGCAGCTCTGACCTCTGGCACCTCCCC AAGACCCAGAGCACAACATCTGTCCCCAGAAATCCCCGGGCGGAGAAGAGCGCGCGCCAAGCCCTTCCTG GGTACTCAGTATTCTCCCTTCCTGGGAACAGCCTGCCCTCTGAGGCCTGGGCACCCGGGTTCCCGAGCGC CGGGTCCCAGCCCCGCGGGGGCGCCTCCGCACCCCATCTCCGCGCCCGGCGCAGAGCCGCCAGTCTCCGC CGCGGGGCCCCGTGCCCCGCAGCGCCACCTAGGGGCCGGGCGCCGCCTCCCGCCCTCAGGGGCACCCCCC TTACTCCGCAAGGACTCCGGGTCTCCCCAGTTCTCCCGGCAGCCGGACCCTCCCAGCCTCGGCCGCCGGG CCGCCCTCCGCATCCCAAGCCCGCCTCCCGTGCCTCCCCGGGGGCGCACCGGCAGCGAGGAGCGGCTCGG CGAGGGCGCGCAGCGGCGGCCCAGGCCCAGGCCTTGGGGCTGGGGCTGAGGGGGTGAGAGCAGGCGCGGC CGGCGGGCAAGGGGAACCGGGCGATGGCAGCGGCGGGCGGCCGCGGGAGGCGAGGCAGCGGCGGCGGCGG GCGGCGCGACGAGCCCCTGTGATTGGCACAGCCGGAGCCGGAGGAGGAGGCCAGGGGAGGGCGGAGGCGG GGGAGGAGGAGGAGGAAGGGGCGATCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGAGGAGCTGTGCCTTCCACCTCTC CAGCCCCGGCAGGACGGGGGCGGCCGCCGCGAACCCGGGGCGGGGACAGCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLCO3A1_1 ↗ | 15:91,853,710 | 正股 | 91,853,661–91,853,720 |
| SLCO3A1_3 ↗ | 15:91,853,870 | 正股 | 91,853,821–91,853,880 |
| SLCO3A1_2 ↗ | 15:91,854,306 | 正股 | 91,854,257–91,854,316 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_93CGBX · enhancer · 91849753–91850149 · regulatory
ENSR15_5RLB9S · CTCF_binding_site · 91849850–91849871 · regulatory
ENSR15_5RLBSF · CTCF_binding_site · 91853005–91853026 · regulatory
ENSR15_BN86Z · promoter · 91853218–91853866 · regulatory
ENSR15_6DRMXD · CTCF_binding_site · 91853286–91853325 · regulatory
ENSR15_5RLBXH · CTCF_binding_site · 91853664–91853685 · regulatory
ENSR15_93CGD8 · promoter · 91854169–91854669 · regulatory
ENSR15_5RLC5P · CTCF_binding_site · 91854791–91854812 · regulatory
ENSR15_BN87C · enhancer · 91855715–91856484 · regulatory
ENSR15_5RLCD2 · CTCF_binding_site · 91856157–91856178 · regulatory
ENSR15_CC54Q · enhancer · 91856595–91858179 · regulatory
· motif · 91849852–91849868 · motif
· motif · 91853007–91853023 · motif
· motif · 91853035–91853047 · motif
· motif · 91853038–91853045 · motif
· motif · 91853038–91853053 · motif
· motif · 91853039–91853052 · motif
· motif · 91853288–91853304 · motif
· motif · 91853306–91853322 · motif
· motif · 91853666–91853682 · motif
· motif · 91854193–91854200 · motif
· motif · 91854793–91854809 · motif
· motif · 91854907–91854921 · motif
· motif · 91854907–91854921 · motif
· motif · 91854910–91854918 · motif
· motif · 91854987–91855002 · motif
· motif · 91855771–91855784 · motif
· motif · 91855917–91855932 · motif
· motif · 91855922–91855944 · motif
· motif · 91855922–91855944 · motif
· motif · 91856159–91856175 · motif
· motif · 91856234–91856249 · motif
· motif · 91857435–91857448 · motif
· motif · 91857435–91857448 · motif
· motif · 91857998–91858015 · motif
· motif · 91858030–91858042 · motif
· motif · 91858155–91858168 · motif
· motif · 91858155–91858168 · motif
FGF19 刺激下，SP1 與 RELA 會使 SLCO3A1 的轉錄上調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：710 aa
SLCO3A1 蛋白長 710 個胺基酸，屬於有機陰離子轉運蛋白家族。序列註解標示 12 段跨膜螺旋，並含有位於第 465–513 位胺基酸的 Kazal-like 結構域；N 端第 1–25 位胺基酸則被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLCO3A1 的不同異構型定位有所差異：Isoform 1 位於脈絡叢上皮細胞的基底外側膜；Isoform 2 位於該上皮細胞的頂端膜，也定位於 Sertoli cells 的基底膜；Isoform 5 則註記位於頂端細胞膜。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- AQP6Q13520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARLNQ8WVX3-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLM1Q8NBJ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TUSC5A5PKU2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 19 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLCO3A1 被認為是底物範圍廣泛的有機陰離子反向轉運蛋白，可能依組織而有不同作用。其底物包括甲狀腺素 L-thyroxine、前列腺素 E1 與 E2、膽酸類 taurocholate、glycolate、glycochenodeoxycholate，以及胜肽荷爾蒙 L-arginine vasopressin；也介導 tryptophan、phenylalanine 和 tyrosine 的轉運。其轉運機制、電生性與可能的組織特異性反向離子尚待釐清。 | 含實驗來源 | 證據與來源Putative organic anion antiporter with apparent broad substrate specificity. Recognizes various substrates including thyroid hormone L-thyroxine, prostanoids such as prostaglandin E1 and E2, bile acids such as taurocholate, glycolate and glycochenodeoxycholate and peptide hormones such as L-arginine vasopressin, likely operating in a tissue-specific manner. The transport mechanism, its electrogenicity and potential tissue-specific counterions remain to be elucidated (Probable). Mediates transport of tryptophan, phenyalanine and tyrosine PMID 10873595 ↗ · PMID 14631946 ↗ · PMID 16971491 ↗ · PMID 19129463 ↗ · PMID 30063921 ↗ · PMID 39206635 ↗ |
| 功能 | SLCO3A1 介導類固醇荷爾蒙前驅物 dehydroepiandrosterone 3-sulfate 與 estrone 3-sulfate 的轉運。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mediates transport of steroid hormone precursors dehydroepiandrosterone 3-sulfate and estrone 3-sulfate PMID 36120371 ↗ |
| 分子活性 | L-thyroxine(out) = L-thyroxine(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | prostaglandin E1(out) = prostaglandin E1(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | prostaglandin E2(out) = prostaglandin E2(in) | 含實驗來源 | 證據與來源prostaglandin E2(out) = prostaglandin E2(in) PMID 10873595 ↗ · PMID 14631946 ↗ · PMID 16971491 ↗ |
| 分子活性 | prostaglandin F2alpha(out) = prostaglandin F2alpha(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | (5Z,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate(out) = (5Z,8Z,11Z,14Z)-eicosatetraenoate(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | taurocholate(out) = taurocholate(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | glycocholate(out) = glycocholate(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | estrone 3-sulfate(out) = estrone 3-sulfate(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | argipressin(out) = argipressin(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | L-tryptophan(in) = L-tryptophan(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | L-tyrosine(in) = L-tyrosine(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | L-phenylalanine(in) = L-phenylalanine(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | dehydroepiandrosterone 3-sulfate(out) = dehydroepiandrosterone 3-sulfate(in) | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Isoform 1 是多次穿膜蛋白，定位於脈絡叢上皮細胞的基底外側細胞膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Isoform 1; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localized to the basolateral membrane of choroid plexus epithelium PMID 16971491 ↗ · PMID 36120371 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 2 是多次穿膜蛋白，可位於頂端或基底細胞膜；在 Sertoli cells 中定位於基底膜，在脈絡叢上皮細胞中則定位於頂端膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Isoform 2; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basal cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localized to the basal membrane of Sertoli cells. Localized to the apical membrane of choroid plexus epithelium PMID 16971491 ↗ · PMID 35307651 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 5 是多次穿膜蛋白，定位於頂端細胞膜。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 在 FGF19 刺激下，SP1 與 RELA 會使 SLCO3A1 的轉錄上調。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCGATCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGAGGAGCTGTGCCT40TCCACCTCTCCAGCCCCGGCAGGACGGGGGCGGCCGCCGC80GAACCCGGGGCGGGGACAGCACGCAGCCTCGAGGCGCGCA120CCCCCGCCCGGCAGCGGCCCCGACACCCGGGGCGAGCGGG160AAAGCGGCAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGGAAG200GATGCAGGGGAAGAAGCCGGGCGGTTCGTCGGGCGGCGGC240CGGAGCGGCGAGCTGCAGGGGGACGAGGCGCAGAGGAACA280AGAAAAAGAAAAAGAAGGTGTCCTGCTTTTCCAACATCAA320GATCTTCCTGGTGTCCGAGTGCGCCCTGATGCTGGCGCAG360GGCACGGTGGGCGCCTACCTGGTGAGCGTCCTGACCACCC400TGGAGCGTAGGTTCAACCTGCAGAGCGCTGACGTGGGTGT440GATCGCTAGCAGCTTCGAGATCGGGAACCTGGCGCTCATC480CTCTTCGTGAGCTACTTCGGGGCACGCGGGCACCGGCCGC520GCCTGATCGGCTGCGGCGGCATCGTCATGGCGCTGGGCGC560GCTGCTGTCGGCGCTGCCCGAGTTCCTGACCCACCAGTAC600AAGTACGAGGCGGGCGAGATCCGCTGGGGCGCCGAGGGCC640GCGACGTCTGCGCAGCCAACGGCTCGGGCGGCGACGAGGG680GCCCGACCCCGACCTCATCTGCCGCAACCGGACGGCTACC720AACATGATGTACTTGCTGCTCATTGGGGCCCAGGTGCTCC760TGGGCATCGGTGCTACCCCTGTGCAGCCCCTGGGCGTCTC800CTACATCGACGACCACGTGCGGAGGAAGGACTCCTCGCTC840TATATAGGAATCCTGTTCACGATGCTGGTATTTGGACCAG880CCTGCGGGTTTATCCTGGGCTCTTTCTGTACCAAAATCTA920CGTGGATGCGGTCTTCATTGACACAAGTAACCTGGACATC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。