基因總覽
SLCO2B1（solute carrier organic anion transporter family member 2B1）是蛋白質編碼基因，產生有機陰離子轉運蛋白家族成員。其蛋白質屬於 organo anion transporter（TC 2.A.60）家族，是多次穿越細胞膜的膜蛋白；整體結構包含多個跨膜區段，並具有 Kazal-like 結構域。這些特徵使其成為細胞膜上的小分子運輸蛋白。該基因產物的底物範圍包括硫酸化類固醇及其他特定有機陰離子；不同細胞環境中的運輸功能與分布，詳見下方功能及定位說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000289575 ★ | 75,151,107–75,206,549 | 14 |
| ENST00000531713 | 75,100,591–75,165,830 | 4 |
| ENST00000525650 | 75,151,036–75,204,736 | 11 |
| ENST00000891031 | 75,151,036–75,206,400 | 13 |
| ENST00000891032 | 75,151,036–75,206,398 | 15 |
| ENST00000891033 | 75,151,036–75,206,251 | 14 |
| ENST00000891034 | 75,151,036–75,206,104 | 12 |
| ENST00000966603 | 75,151,036–75,206,399 | 9 |
| ENST00000966604 | 75,151,036–75,206,110 | 14 |
| ENST00001007978 | 75,151,036–75,206,398 | 14 |
| ENST00001007979 | 75,151,036–75,206,251 | 12 |
| ENST00001027345 | 75,151,036–75,206,400 | 12 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLCO2B1 介導不依賴 Na(+) 的硫酸化類固醇及其他特定有機陰離子運輸。其底物包括 estrone 3-sulfate（E1S）、dehydroepiandrosterone sulfate（DHEA-S）與 pregnenolone sulfate（PregS）；另可運輸 prostaglandins D2、E1、E2、taurocholate、L-thyroxine、leukotriene C4、thromboxane B2，以及神經肽 substance P 和 vasoactive intestinal peptide。它也運輸 heme 副產物 coproporphyrin III。對 heme 本身，SLCO2B1 可能具有轉運作用，並可能透過 heme oxygenase HMOX2、且不依賴 TFRC，促進細胞可利用的鐵；這項作用仍屬可能性描述。
在 syncytiotrophoblast，SLCO2B1 將 E1S 經基底膜運輸，提示其可能參與胎盤吸收胎兒來源的硫酸化類固醇，包括 DHEA-S。它也促進肝細胞攝取硫酸化類固醇，並參與肝臟有機陰離子的清除；在腸道則介導硫酸化類固醇攝取。於血腦障壁內皮細胞，DHEA-S 與 PregS 的攝取是它們進入腦部的第一步。視網膜神經元釋放的 substance P 與 vasoactive intestinal peptide，也可能經由 SLCO2B1 重新攝取。另有推測認為，它可能參與睪丸血睪障壁中的有機化合物運輸調節。
其底物選擇性會受 pH 影響；酸性微環境可刺激底物運輸，可能與結合位點的質子化狀態有關。精確運輸機制尚未釐清，目前推測主要涉及陰離子交換：有機底物進入細胞時，另一種陰離子向外移動。HCO3(-) 被認為可能作為交換的反離子；在胎盤中，細胞質 glutamate 也可能擔任反離子。另有研究提出，向內的質子梯度可能驅動 E1S 攝取，並以 H(+):E1S 為 1:1 的化學計量比；此模型與陰離子交換的解釋均應保留其推測性。
Promoter 與基因調控
>SLCO2B1 ENST00000289575 GRCh38 chr11:75150107-75151207 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTACTGAGACTCCATGCCTCATTTGTAAAATCAGGGAATAAATAACCTGATGTTACAGTGTCAAGGGGAG GACCCAGTGGGGCCTTGTGTGTGAAAGTGCTGTGCAAGCTGGGAAAGGCAAAGTGGATTTGCTTTCCCTT GCTGCCCTGTTCGGAGCCCCACCTCTGCCACTCCCTTCTCTGAGCTCCAGGCCTGCAGGCTTGGCTTCTC TGTCCTTCACCGAACCTTCACAGTGGCTCTGCAAGGGATTACTGTCCCTTCTTTATAGATGAGAGAATGG ACGCTCAGGGAGATGCTGGGACTTGCCTGAGATCACTTGACCAGCAAATAACAACTGAGGTGGGACCCAG ATCTCTCTGGCTCCTGAACCTCCATCCTCAGTCCTCAGTCCAGGAAACTCTGAGAATTTCATATTTTCCA TTCTCTTCCCCTCCTCCTTTGCCTAGATGGCTGAAATTGATGGACCTTCTACCATGAGCTCCACCCAGGC AGGCTGCCACTGGATACTTAGTGGACAGAGCCCCTTCTTGCTGTGGATCCTTGGAGCTCAGGGAGAAGAT GAGGGATTTAGTGAGAGGGCACGTGGGCTTGAGGGGGACAGGGGTTCAGTGAAAGAGGACAACTGCTAGA TGGGGGAACAAGGGCTCTCTATGGGGCCCTCCTATCAAGGGAGGGCAACAAAAGTTCTGTGAAGGGAACA AGAGCTTGGTAGGAGAAGGGCTCAGGTGGGAAATGGGAGTGCAGTGAGGAGACTGGGGGATGAATGTGGA AGGTTGGGGAGCTTGGGGAGACCCATCAGCATCCCCCCTGTGCCCCCACCTCTCTGCTGCTAACAGAGCA GGGGAAAATACCTAAGGGAAATGCTGAGGCAAGAGGCTGGAAAAGGACAGGCTGAGGCTGAGCCTCAGGG AGGCGGGGTGCAGCTTCCTCTTCACAGAGAGGCTGGACTTGAACAAACCCAGCCTTCTATACAACCGTGG AGCCAGGGCAAGGGAGAGACAGAAGGAGCAAGTGACCCAGGGAGACAAACACTTGGAGATACTTGGGGCT GAGTTTGAGCAAGACTCCCTAACCTGTGTCTGGACAAGTCTGATGTCCTGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLCO2B1_2 ↗ | 11:75,100,576 | 正股 | 75,100,527–75,100,586 |
| SLCO2B1_1 ↗ | 11:75,151,107 | 正股 | 75,151,058–75,151,117 |
| SLCO2B1_3 ↗ | 11:75,159,832 | 正股 | 75,159,783–75,159,842 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
SLCO2B1 的表現受 HNF4A 調控。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：709 aa
SLCO2B1 蛋白質長 709 個胺基酸，屬於 organo anion transporter（TC 2.A.60）家族，具有 12 個跨膜螺旋區段及 Kazal-like 結構域。序列註解指出，N 端、部分中段及 C 端有無序區域。第 51–69 位胺基酸區段對 E1S 與 taurocholate 運輸及轉運蛋白穩定性均為必要。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLCO2B1 位於細胞膜，在肝細胞、syncytiotrophoblast 與 Sertoli 細胞的基底膜均有表現。 腸細胞中則見於基底外側膜，也有研究報告其位於頂端膜，顯示腸道細胞內的膜區域分布並非單一位置。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 20 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- WHRNQ9P202 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 14 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLCO2B1 以不依賴 Na(+) 的方式運輸硫酸化類固醇及多種有機陰離子，參與胎盤、肝臟、腸道與血腦障壁的底物攝取，也可能參與視網膜神經肽再攝取、血基質相關運輸及睪丸屏障運輸。其底物選擇性受 pH 影響；精確機制未明，可能涉及陰離子交換，且另有質子梯度驅動 E1S 攝取的提案。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mediates the Na(+)-independent transport of steroid sulfate conjugates and other specific organic anions. Responsible for the transport of estrone 3-sulfate (E1S) through the basal membrane of syncytiotrophoblast, highlighting a potential role in the placental absorption of fetal-derived sulfated steroids including the steroid hormone precursor dehydroepiandrosterone sulfate (DHEA-S). Also facilitates the uptake of sulfated steroids at the basal/sinusoidal membrane of hepatocytes, therefore accounting for the major part of organic anions clearance of liver. Mediates the intestinal uptake of sulfated steroids. Mediates the uptake of the neurosteroids DHEA-S and pregnenolone sulfate (PregS) into the endothelial cells of the blood-brain barrier as the first step to enter the brain. Also plays a role in the reuptake of neuropeptides such as substance P/TAC1 and vasoactive intestinal peptide/VIP released from retinal neurons. May act as a heme transporter that promotes cellular iron availability via heme oxygenase/HMOX2 and independently of TFRC. Also transports heme by-product coproporphyrin III (CPIII), and may be involved in their hepatic disposition. Mediates the uptake of other substrates such as prostaglandins D2 (PGD2), E1 (PGE1) and E2 (PGE2), taurocholate, L-thyroxine, leukotriene C4 and thromboxane B2 (Ref.25). May contribute to regulate the transport of organic compounds in testis across the blood-testis-barrier (Probable). Shows a pH-sensitive substrate specificity which may be ascribed to the protonation state of the binding site and leads to a stimulation of substrate transport in an acidic microenvironment. The exact transport mechanism has not been yet deciphered but most likely involves an anion exchange, coupling the cellular uptake of organic substrate with the efflux of an anionic compound. Hydrogencarbonate/HCO3(-) acts as a probable counteranion that exchanges for organic anions. Cytoplasmic glutamate may also act as counteranion in the placenta. An inwardly directed proton gradient has also been proposed as the driving force of E1S uptake with a (H(+):E1S) stoichiometry of (1:1) PMID 10873595 ↗ · PMID 11159893 ↗ · PMID 11932330 ↗ · PMID 12409283 ↗ · PMID 12724351 ↗ · PMID 14610227 ↗ · PMID 16908597 ↗ · PMID 18501590 ↗ · PMID 19129463 ↗ · PMID 20507927 ↗ · PMID 22201122 ↗ · PMID 23531488 ↗ · PMID 25132355 ↗ · PMID 26277985 ↗ · PMID 26383540 ↗ · PMID 27576593 ↗ · PMID 29871943 ↗ · PMID 34628357 ↗ · PMID 35714613 ↗ · PMID 35307651 ↗ |
| 功能 | SLCO2B1 的異構型 1 具有 estrone 3-sulfate（E1S）運輸活性；此活性與全長異構型相當。 | 含實驗來源 | 證據與來源Has estrone 3-sulfate (E1S) transport activity comparable with the full-length isoform 1 PMID 23531488 ↗ |
| 分子活性 | dehydroepiandrosterone 3-sulfate(out) = dehydroepiandrosterone 3-sulfate(in) | 推論支持 | 證據與來源dehydroepiandrosterone 3-sulfate(out) = dehydroepiandrosterone 3-sulfate(in) PMID 11159893 ↗ · PMID 14610227 ↗ · PMID 16908597 ↗ · PMID 18501590 ↗ · PMID 23531488 ↗ · PMID 26277985 ↗ · PMID 34628357 ↗ |
| 分子活性 | estrone 3-sulfate(out) = estrone 3-sulfate(in) | 含實驗來源 | 證據與來源estrone 3-sulfate(out) = estrone 3-sulfate(in) PMID 28408210 ↗ · PMID 10873595 ↗ · PMID 11159893 ↗ · PMID 11932330 ↗ · PMID 12724351 ↗ · PMID 14610227 ↗ · PMID 16908597 ↗ · PMID 18501590 ↗ · PMID 19129463 ↗ · PMID 20507927 ↗ · PMID 22201122 ↗ · PMID 23531488 ↗ · PMID 26277985 ↗ · PMID 26383540 ↗ · PMID 27576593 ↗ · PMID 29871943 ↗ · PMID 34628357 ↗ |
| 分子活性 | estrone 3-sulfate(out) + hydrogencarbonate(in) = estrone 3-sulfate(in) + hydrogencarbonate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源estrone 3-sulfate(out) + hydrogencarbonate(in) = estrone 3-sulfate(in) + hydrogencarbonate(out) PMID 19129463 ↗ |
| 分子活性 | taurocholate(out) = taurocholate(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | coproporphyrin III(out) = coproporphyrin III(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | substance P(out) = substance P(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | pregnenolone sulfate(out) = pregnenolone sulfate(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | prostaglandin E2(out) = prostaglandin E2(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | prostaglandin D2(out) = prostaglandin D2(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | L-thyroxine(out) = L-thyroxine(in) | 推論支持 | |
| 細胞定位 | SLCO2B1 是多次穿越細胞膜的蛋白質，在肝細胞、syncytiotrophoblast 與 Sertoli 細胞的基底膜有表現。腸細胞中位於基底外側膜，也有資料指出其存在於頂端膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basal cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Expressed at the basal membrane of hepatocytes, syncytiotrophoblast and Sertoli cells. Localized to the basolateral membrane of enterocytes. Also found at the apical membrane of enterocytes PMID 25132355 ↗ · PMID 11159893 ↗ · PMID 11932330 ↗ · PMID 12409283 ↗ · PMID 35307651 ↗ · PMID 28408210 ↗ · PMID 12724351 ↗ |
| 調控 | HNF4A 參與調控 SLCO2B1 的表現。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGAAGGAGCAAGTGACCCAGGGAGACAAACACTTGGAGAT40ACTTGGGGCTGAGTTTGAGCAAGACTCCCTAACCTGTGTC80TGGACAAGTCTGATGTCCTGTGTGGCCCAAGAAGAACTGA120CCCCGTGTCTGGAGCTCCCACCGTTATTGCATCCCTGCTG160TGGCTCACCTGCTGCTGTCTCCAGGAGCCCCTGAGAAGAT200TTGCTTCCTCTCCCCTGCTAAGCTCCAGGTCCTGAGATTA240AATTAGGGGCTGGAGCTCACTGCACTCCAGCAGTCATGGG280ACCCAGGATAGGGCCAGCGGGTGAGGTACCCCAGGTACCA320GACAAGGAAACCAAAGCCACAATGGGCACAGAAAACACAC360CTGGAGGCAAAGCCAGCCCAGACCCTCAGGACGTGCGGCC400AAGTGTGTTCCATAACATCAAGCTGTTCGTTCTGTGCCAC440AGCCTGCTGCAGCTGGCGCAGCTCATGATCTCCGGCTACC480TAAAGAGCTCCATCTCCACAGTGGAGAAGCGCTTCGGCCT520CTCCAGCCAGACGTCGGGGCTGCTGGCCTCCTTCAACGAG560GTGGGGAACACAGCCTTGATTGTGTTTGTGAGCTATTTTG600GCAGCCGGGTGCACCGACCCCGAATGATTGGCTATGGGGC640TATCCTTGTGGCCCTGGCGGGCCTGCTCATGACTCTCCCG680CACTTCATCTCGGAGCCATACCGCTACGACAACACCAGCC720CTGAGGATATGCCACAGGACTTCAAGGCTTCCCTGTGCCT760GCCCACAACCTCGGCCCCAGCCTCGGCCCCCTCCAATGGC800AACTGCTCAAGCTACACAGAAACCCAGCATCTGAGTGTGG840TGGGGATCATGTTCGTGGCACAGACCCTGCTGGGCGTGGG880CGGGGTGCCCATTCAGCCCTTTGGCATCTCCTACATCGAT920GACTTTGCCCACAACAGCAACTCGCCCCTCTACCTCGGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。