基因總覽
SLCO1B3 是蛋白質編碼基因，產物屬於有機陰離子轉運蛋白家族。其蛋白質具有多次穿膜的結構，並帶有 Kazal-like 結構域。這類膜蛋白的基本角色是轉運有機陰離子；SLCO1B3 的底物範圍廣，涵蓋膽汁酸、結合型類固醇及其他有機分子。其轉運作用與肝臟處理多種有機陰離子有關，也涉及藥物的運送。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000381545 ★ | 20,810,705–20,916,911 | 16 |
| ENST00000978275 | 20,806,645–20,875,625 | 10 |
| ENST00000901222 | 20,810,691–20,918,230 | 16 |
| ENST00000901223 | 20,810,691–20,918,230 | 16 |
| ENST00000901224 | 20,810,691–20,918,230 | 13 |
| ENST00001107067 | 20,810,691–20,880,029 | 11 |
| ENST00001107068 | 20,810,691–20,880,023 | 11 |
| ENST00001107069 | 20,810,691–20,879,815 | 11 |
| ENST00001107070 | 20,810,691–20,879,746 | 9 |
| ENST00001117947 | 20,810,691–20,875,567 | 9 |
| ENST00001117955 | 20,810,691–20,875,366 | 5 |
| ENST00001117958 | 20,810,691–20,868,122 | 8 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLCO1B3 介導不依賴 Na(+) 的有機陰離子攝取，底物包括膽汁酸 taurocholate，以及多種結合型類固醇，例如 17-beta-glucuronosyl estradiol、dehydroepiandrosterone sulfate（DHEAS）和 estrone 3-sulfate。它也可運送 leukotriene C4、prostaglandin E2 與 L-thyroxine（T4），呈現廣泛的底物範圍。
其轉運可能以 HCO3(-) 作為交換用的反向陰離子；對硫酸化類固醇、taurocholate 和 T4 的底物選擇性會受 pH 影響。這種敏感性可能與結合位點的質子化狀態有關，在酸性微環境中可刺激底物轉運。
在肝臟中，SLCO1B3 參與膽汁酸與有機陰離子的清除，並可將血漿中的 bilirubin glucuronides 攝入肝臟，納入有助於解毒的肝臟—血液運輸循環。它也能轉運血基質合成副產物 coproporphyrin I 與 III，可能參與這些分子在肝臟的處置。另有可能協助調節睪丸中有機化合物跨越血睪屏障的運輸。
SLCO1B3 可運送藥物，包括降血脂藥 statin 類中的 pitavastatin；它也可能影響化學治療藥物 methotrexate 和 paclitaxel 在血漿與組織中的分布。此外，來源指出它可能在肝臟運送降血壓藥 enalapril（血管張力素轉換酶抑制劑前驅藥）及 valsartan（選擇性血管張力素 II AT1 受體拮抗劑）。
Promoter 與基因調控
>SLCO1B3 ENST00000381545 GRCh38 chr12:20809705-20810805 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCGTGCCGCTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAACTAGTT TATCAAATAACTGTGATATAGAAATTAAATACATATTGCTGCAACTGTATCAACAACTGTCCTGTCAGTG ATAAGGGGTAACAATGTTTTCATACATGCATTCTCTCTTTGCTATATACATACACACATACACATAAATA CATATATACATACACTCATGCATGTGTGTGTATATATACATGTGAGAGAAGACTCCGTTTATTATTTATA TTTTTATAGTACACTTCTAAAACACAGCCATGTGCCTGAGATATAGTAGGGAGTCAAATATGTTTGAGTT ACTGAATTAATTAATTTGACTTCATCCTTACTCAAGAAAAGTTTCAACTGAGTGAAGGTCTTCCATTCTC TAAAGAGCAAGTCAATAGAAGGAGATCATTCTTCCTTTACACATTGATGTAAGGAATATATCATACAAAC TAGTCTTGATTTTTGTCATTTAGAAGACTAGTCTTGTAATTAATTGGCAATTTAGTATTCCATGTGAGAT ATCCAGTGTCCATGTACGTCATATTAGATCCATACACATGTAACAAGCAAAGAGGGTATGTTTTATTTTT TGAATGCTAATGTAACATGTAGGGACATTTTAAAAAATCGCCTTGACATATTTTCTATTTGGAATAGTTT TAAATACTTTGGATAATGTGTTGTATTTGTATTTCTAAAGAAGAAAATCTTATGCAACCAACTTAATTGA ATAAGAAATAAATCATTCCCAGAAATAATTTATTTTCTAATGTTAACATAATGTGTACATTCTGAGAAAT TATTAATAAAATGTTTAAAAGATAGGCTTCTGGGGTGAACTCCTAGAATTAGCTAGGTATGTTTTTTCTG TTTGCCTAGGACAATGACCTAATAAGATGGTTAATCATCATTGGACTCATAAAAACAAACAAATAAAAAG CCAACTAACCATTTAAAGTGAGACTTTAACATCAGAAAAAGGATGGACTTGTTGCAGTTGCTGTAGCATT CAAAGTCAAGGTAAGAACCGTCGAGGTTGTCTAATTAAAACATTTCTTTTA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 6 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLCO1B3_5 ↗ | 12:20,807,520 | 正股 | 20,807,471–20,807,530 |
| SLCO1B3_6 ↗ | 12:20,807,756 | 正股 | 20,807,707–20,807,766 |
| SLCO1B3_2 ↗ | 12:20,810,705 | 正股 | 20,810,656–20,810,715 |
| SLCO1B3_1 ↗ | 12:20,822,543 | 正股 | 20,822,494–20,822,553 |
| SLCO1B3_4 ↗ | 12:20,875,432 | 正股 | 20,875,383–20,875,442 |
| SLCO1B3_3 ↗ | 12:20,901,380 | 正股 | 20,901,331–20,901,390 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
· motif · 20808063–20808075 · motif
· motif · 20808066–20808073 · motif
· motif · 20808066–20808081 · motif
· motif · 20808209–20808221 · motif
· motif · 20808212–20808219 · motif
· motif · 20808666–20808679 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：702 aa
SLCO1B3 蛋白質長 702 個胺基酸，屬於 organo anion transporter（TC 2.A.60）家族。序列註解標示 12 個螺旋型跨膜區，並含有 Kazal-like 結構域；其細胞質側與細胞外側區段交錯排列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLCO1B3 是多次穿膜蛋白，在肝細胞定位於基底外側膜；在 Sertoli 細胞則定位於基底膜。 來源未指出這些定位會因條件或異構型而改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
SLCO1B3 的變異與 Rotor 型高膽紅素血症相關。此病為常染色體隱性遺傳的原發性結合型高膽紅素血症，患者通常在出生後不久或兒童期出現輕度黃疸，且不伴隨溶血。病例可見未結合陰離子染料 bromsulphthalein 的血漿清除延遲、尿中 coproporphyrin I 明顯增加，而肝臟色素沉著正常。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 13 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLCO1B3 以不依賴 Na(+) 的方式攝取有機陰離子，底物包含 taurocholate、結合型類固醇、leukotriene C4、prostaglandin E2 與 T4。HCO3(-) 可能作為交換的反向陰離子；酸性微環境可能藉由影響結合位點質子化，促進部分底物的轉運。此蛋白參與肝臟清除膽汁酸、有機陰離子及 bilirubin glucuronides，也可運送 coproporphyrins、多種藥物；其睪丸屏障運輸角色與部分藥物分布作用仍屬可能性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mediates the Na(+)-independent uptake of organic anions. Shows broad substrate specificity, can transport both organic anions such as bile acid taurocholate (cholyltaurine) and conjugated steroids (17-beta-glucuronosyl estradiol, dehydroepiandrosterone sulfate (DHEAS), and estrone 3-sulfate), as well as eicosanoid leukotriene C4, prostaglandin E2 and L-thyroxine (T4). Hydrogencarbonate/HCO3(-) acts as the probable counteranion that exchanges for organic anions. Shows a pH-sensitive substrate specificity towards sulfated steroids, taurocholate and T4 which may be ascribed to the protonation state of the binding site and leads to a stimulation of substrate transport in an acidic microenvironment. Involved in the clearance of bile acids and organic anions from the liver. Can take up bilirubin glucuronides from plasma into the liver, contributing to the detoxification-enhancing liver-blood shuttling loop. Transports coproporphyrin I and III, by-products of heme synthesis, and may be involved in their hepatic disposition. May contribute to regulate the transport of organic compounds in testes across the blood-testis-barrier (Probable). Can transport HMG-CoA reductase inhibitors (also known as statins) such as pitavastatin, a clinically important class of hypolipidemic drugs. May play an important role in plasma and tissue distribution of the structurally diverse chemotherapeutic drugs methotrexate and paclitaxel. May also transport antihypertension agents, such as the angiotensin-converting enzyme (ACE) inhibitor prodrug enalapril, and the highly selective angiotensin II AT1-receptor antagonist valsartan, in the liver PMID 10779507 ↗ · PMID 11159893 ↗ · PMID 12568656 ↗ · PMID 15159445 ↗ · PMID 16624871 ↗ · PMID 16627748 ↗ · PMID 17412826 ↗ · PMID 19129463 ↗ · PMID 22232210 ↗ · PMID 23243220 ↗ · PMID 26383540 ↗ · PMID 35307651 ↗ |
| 分子活性 | estrone 3-sulfate(out) + hydrogencarbonate(in) = estrone 3-sulfate(in) + hydrogencarbonate(out) | 含實驗來源 | 證據與來源estrone 3-sulfate(out) + hydrogencarbonate(in) = estrone 3-sulfate(in) + hydrogencarbonate(out) PMID 19129463 ↗ |
| 分子活性 | 17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)(out) = 17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)(in) | 含實驗來源 | 證據與來源17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)(out) = 17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)(in) PMID 10779507 ↗ · PMID 12568656 ↗ · PMID 15159445 ↗ |
| 分子活性 | taurocholate(out) = taurocholate(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | estrone 3-sulfate(out) = estrone 3-sulfate(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | dehydroepiandrosterone 3-sulfate(out) = dehydroepiandrosterone 3-sulfate(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | leukotriene C4(out) = leukotriene C4(in) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | L-thyroxine(out) = L-thyroxine(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | prostaglandin E2(out) = prostaglandin E2(in) | 推論支持 | |
| 分子活性 | (4E,15E)-bilirubin IXalpha C8-beta-D-glucuronoside(out) = (4E,15E)-bilirubin IXalpha C8-beta-D-glucuronoside(in) | 含實驗來源 | 證據與來源(4E,15E)-bilirubin IXalpha C8-beta-D-glucuronoside(out) = (4E,15E)-bilirubin IXalpha C8-beta-D-glucuronoside(in) PMID 22232210 ↗ |
| 分子活性 | bilirubin IXalpha bis-beta-D-glucuronoside(out) = bilirubin IXalpha bis-beta-D-glucuronoside(in) | 含實驗來源 | 證據與來源bilirubin IXalpha bis-beta-D-glucuronoside(out) = bilirubin IXalpha bis-beta-D-glucuronoside(in) PMID 22232210 ↗ |
| 細胞定位 | SLCO1B3 是多次穿膜蛋白，定位於肝細胞的基底外側膜，也定位於 Sertoli 細胞的基底膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basal cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localized to the basolateral membrane of hepatocytes. Localized to the basal membrane of Sertoli cells PMID 10779507 ↗ · PMID 35307651 ↗ |
| 疾病關聯 | SLCO1B3 相關變異可造成 Rotor 型高膽紅素血症，這是一種常染色體隱性遺傳的原發性結合型高膽紅素血症。患者多在出生後不久或兒童期出現不伴溶血的輕度黃疸，並有 bromsulphthalein 血漿清除延遲及尿中 coproporphyrin I 顯著增加；肝臟色素沉著正常。 | 含實驗來源 | 證據與來源Hyperbilirubinemia, Rotor type HBLRR An autosomal recessive form of primary conjugated hyperbilirubinemia. Affected individuals develop mild jaundice not associated with hemolysis shortly after birth or in childhood. They have delayed plasma clearance of the unconjugated anionic dye bromsulphthalein and prominent urinary excretion of coproporphyrin I. Hepatic pigmentation is normal. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 237450 PMID 22232210 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGACTTTAACATCAGAAAAAGGATGGACTTGTTGCAGTTG40CTGTAGCATTCAAAGTCAAGTTGTGCTTTGCGATGCTGAG80TTTACTGTTTTAAATGGACTTCAAGCATAGCCCTGAAGTG120TTGTCCCGTTGTTCCCACCTCCTAGAGGGCCTGACAGAAG160AGGTACATATGCTATGTGATCATTTCAAACCAAGCATCAG200CAACAATTAAAAATATTCACTTGGTATCTGTAGTTTAATA240ATGGACCAACATCAACATTTGAATAAAACAGCAGAGTCAG280CATCTTCAGAGAAAAAGAAAACAAGACGCTGCAATGGATT320CAAGATGTTCTTGGCAGCCCTGTCATTCAGCTATATTGCT360AAAGCACTAGGTGGAATCATTATGAAAATTTCCATCACTC400AAATAGAAAGGAGATTTGACATATCCTCTTCTCTTGCTGG440TTTAATTGATGGAAGCTTTGAAATTGGAAATTTGCTTGTG480ATTGTATTTGTAAGTTACTTTGGATCTAAACTACACAGAC520CGAAGTTAATTGGAATTGGTTGTCTCCTTATGGGAACTGG560AAGTATTTTGACATCTTTACCACATTTCTTCATGGGATAT600TATAGGTATTCTAAAGAAACCCATATTAATCCATCAGAAA640ATTCAACATCAAGTTTATCAACCTGTTTAATTAATCAAAC680CTTATCATTCAATGGAACATCACCTGAGATAGTAGAAAAA720GATTGTGTAAAGGAATCTGGGTCACACATGTGGATCTATG760TCTTCATGGGGAATATGCTTCGTGGCATAGGGGAAACCCC800CATAGTACCATTGGGGATTTCATACATTGATGATTTTGCA840AAAGAAGGACATTCTTCCTTGTATTTAGGTAGTTTGAATG880CAATAGGAATGATTGGTCCAGTCATTGGCTTTGCACTGGG920ATCTCTGTTTGCTAAAATGTACGTGGATATTGGATATGTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。