演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLCO1B1OATP-C

solute carrier organic anion transporter family member 1B1

SLCO1B1 編碼多次穿膜的有機陰離子轉運蛋白,參與多種內源性分子與藥物的攝取,並與肝臟物質清除及 Rotor 型高膽紅素血症相關。

Homo sapiens12p12.1UniProt Q9Y6L6
OFFICIAL SYMBOL
SLCO1B1
CHROMOSOME
12
UNIPROT
Q9Y6L6
PDB / ALPHAFOLD
8HNB
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLCO1B1 是蛋白質編碼基因,產物屬於有機陰離子轉運蛋白家族,正式名稱為 solute carrier organic anion transporter family member 1B1。此蛋白質為多次穿膜蛋白,具有多段跨膜螺旋;其序列註解另標示一個 Kazal-like 結構域。這些基本特徵構成其作為膜轉運蛋白的分子架構。其主要角色是協助多種有機陰離子跨膜移動,底物範圍涵蓋生理性分子及藥物。來源並指出此轉運不依賴 Na⁺;底物種類與相關生理意義詳見功能說明。

Official symbol
SLCO1B1
Gene name
solute carrier organic anion transporter family member 1B1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10959
UniProt
Q9Y6L6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
OATP-CLST-1OATP1B1SLC21A6

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212p12.1
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegSLCO1B1pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr12:21,127,862–21,298,065
Gene span
170,204 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000256958 ★21,131,194–21,239,79615
ENST0000087017821,127,862–21,241,07415
ENST0000087017921,127,862–21,241,07414
ENST0000087018021,127,862–21,241,07415
ENST0000087018121,127,862–21,241,07414
ENST0000087018221,127,862–21,241,07416
ENST0000087018321,127,862–21,241,07413
ENST0000087018421,127,862–21,241,07416
ENST0000087018521,127,862–21,241,07412
ENST0000087018621,127,862–21,241,07414
ENST0000087018721,127,862–21,241,07413
ENST0000087018821,127,862–21,241,07414

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLCO1B1 產物介導不依賴 Na⁺ 的有機陰離子攝取,底物範圍廣,包含膽酸 taurocholate、結合型類固醇、類二十烷酸及甲狀腺激素。結合型類固醇例子包括 dehydroepiandrosterone 3-sulfate、17-beta-glucuronosyl estradiol 與 estrone 3-sulfate;類二十烷酸則包括 prostaglandin E2、thromboxane B2、leukotriene C4 與 leukotriene E4。可轉運的甲狀腺激素包括 T4(L-thyroxine)和 T3(3,3',5'-triiodo-L-thyronine)。

此蛋白質也可將血漿中的 bilirubin glucuronides 攝入肝臟,參與肝臟與血液間的物質往返,並有助於增進解毒;同時涉及肝臟清除內源性與外源性底物。它能轉運 heme 合成副產物 coproporphyrin I 和 III,但其在肝臟處置這些分子中的作用仍以可能性表述。來源亦指出,它可能參與睪丸中有機化合物跨越血睪屏障的運輸調節。

其藥物底物包括 HMG-CoA reductase inhibitors(statins),例如 pravastatin 與 pitavastatin;另可能影響化學性質多樣的化療藥物 methotrexate 在血漿與組織間的分布。在肝臟中,它也可轉運降血壓藥物,包括 angiotensin-converting enzyme(ACE)抑制劑前驅藥 enalapril,以及 angiotensin II AT1-receptor 拮抗劑 valsartan。來源將這些轉運與藥物分布或肝臟處置相連,並未據此指稱特定臨床結果。

對 prostaglandin E2 與 T4 的底物專一性會受 pH 影響;來源提出,這可能與結合位點的質子化狀態有關,且酸性微環境會刺激底物運輸。HCO₃⁻ 被認為可能是與有機陰離子交換的反離子。這些特性指出,底物轉運可能受到局部化學環境影響,但反離子的角色仍屬推測。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 21131194 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLCO1B1 ENST00000256958 GRCh38 chr12:21130194-21131294 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTGTCTCATGATTCCAATACTCTCAATAATTAACCAAGAATAGAACTAATCAATCAGATAACTGTGGCA
CAGACATCAAATACATTTTGCTGCAACCATATCAACAAATGTCCCATGAATGATAAGGGGTAACCATATT
CTCATATATGCATCCTCACATTACCACATATATATATGTGCATATGTGTATACAGGTAAAAGTGTGTATA
TATGTATACATGTATGTTTGTGTGTATATACATACATATATCTTCACACTTTTCTGAAATATATATATTT
ATGTGAGAGAAGGGTCTGTACTTTATTTCAGAAGAGAGCTTAATGTCCAAGGTATAATTGAGAGTCTAAA
ATGTTTGAGTTATTGAATTAATTAAACTTCATCTCTACTCAAGAAAACTTTTAACTGAGTTAAGCTCTTC
CTTTCTCCACAAGTCAAGTCAATAAAAGGAAACTGTGATATTAATAATTCTTTCCTGTTTTGATGTAAAG
AATCTATCGCATAAAGCAGTCTTAATTTTCATCATTCAGAAAAATGGTCTTGCAGTTAATTGGGACTCTC
TTATTCCAGGTGGTATCTCCAGTCTCCATACATACCACGTTAGAACCATACTTATGTACCAAGCAAAGAG
GGTATATTTTAATTTTTAAATGCCAATGTAACCTGTAGGCATATTTTTTATTTGTCTTAAATTATTTCCT
ATTTGGAAGTTTTAAATACCTGGAATAATTTATTGTACTCATATTTTTAAAGAAAAAAATCTTATGCCAC
CAACTTAATTGAATAAACAAGTAAAAGCCATTCCCAAAAGTAAGGTTTACTTGTTAAGATTAACAAAAAA
TAATGTGAGAATTCTGAGAAATATAATCTTTAAATATTGGCAACTGGAGTGAACTCTTAAAACTAACTAG
GTTTTATATGTTTGACTAGAGCAATGACATAATAAGGTGGTTAATCATCACTGGACTTGTTTTCAAAAAG
CCAACTACTTTAAGAGGAATAAAGGGTGGACTTGTTGCAGTTGCTGTAGGATTCTAAATCCAGGTAAGAA
CCATTGAGATTCTCTAATTTTTACATATATTTTATGTAAGAAATTTTCACG
SLCO1B1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLCO1B1_1 ↗12:21,131,194正股21,131,145–21,131,204

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 21129463–21129477 · motif

· motif · 21129463–21129478 · motif

· motif · 21129698–21129713 · motif

· motif · 21129700–21129713 · motif

· motif · 21130088–21130102 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:691 aa

1 aa691 aa結構域跨膜區拓樸區域
依 Q9Y6L6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLCO1B1 蛋白質長 691 個胺基酸,屬於有機陰離子轉運蛋白家族。序列註解預測其含 12 段跨膜螺旋,並具有 Kazal-like 結構域;兩端及多段膜外、膜內區域交錯分布,形成多次穿膜架構。

拓樸區域Cytoplasmic1–28 aa
跨膜區Helical; Name=129–48 aa
拓樸區域Extracellular49–67 aa
跨膜區Helical; Name=268–88 aa
拓樸區域Cytoplasmic89–94 aa
跨膜區Helical; Name=395–119 aa
拓樸區域Extracellular120–168 aa
跨膜區Helical; Name=4169–197 aa
拓樸區域Cytoplasmic198–216 aa
跨膜區Helical; Name=5217–237 aa
拓樸區域Extracellular238–255 aa
跨膜區Helical; Name=6256–280 aa
拓樸區域Cytoplasmic281–331 aa
跨膜區Helical; Name=7332–353 aa
拓樸區域Extracellular354–373 aa
跨膜區Helical; Name=8374–397 aa
拓樸區域Cytoplasmic398–401 aa
跨膜區Helical; Name=9402–425 aa
拓樸區域Extracellular426–537 aa
跨膜區Helical; Name=10538–560 aa
拓樸區域Cytoplasmic561–569 aa
跨膜區Helical; Name=11570–595 aa
拓樸區域Extracellular596–629 aa
跨膜區Helical; Name=12630–647 aa
拓樸區域Cytoplasmic648–691 aa
結構域Kazal-like453–508 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8HNB…

PDB · 8HNB

EM · 3.53 A · A=1-691

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Basolateral cell membrane;Basal cell membrane

SLCO1B1 定位於細胞膜;在肝細胞中檢測於基底外側膜,在 Sertoli 細胞中則定位於基底膜。 來源未提供不同異構型間的定位差異或定位改變條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 21 個夥伴 · 最多顯示 50 個
OATP-CSLCO1B1APBA1APBA2DLG1DLG2DLG3DLG4FRMPD2GRID2IPGRIP1GRIP2IL16LNX1LNX2MAGI1MAGI2MPDZNHERF4PATJPDZK1TJP1WHRN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SLCO1B1 基因變異與 Rotor 型高膽紅素血症相關。此病為常染色體隱性遺傳的原發性結合型高膽紅素血症;患者通常在出生後不久或兒童期出現輕度黃疸,且不伴隨溶血。資料亦描述未結合陰離子染料 bromsulphthalein 的血漿清除延遲、尿中 coproporphyrin I 明顯增加,而肝臟色素沉著正常。此處為疾病與基因變異的關聯描述。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

15 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 15 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLCO1B1 介導不依賴 Na⁺ 的有機陰離子攝取,底物包括膽酸、結合型類固醇、類二十烷酸與甲狀腺激素,也能攝取 bilirubin glucuronides,並參與肝臟清除內外源性分子。它可轉運多種藥物;睪丸屏障運輸作用及 coproporphyrin 的肝臟處置角色仍屬可能。對 prostaglandin E2 和 T4 的運輸受 pH 影響,HCO₃⁻ 可能作為交換反離子。含實驗來源
證據與來源

Mediates the Na(+)-independent uptake of organic anions. Shows broad substrate specificity, can transport both organic anions such as bile acid taurocholate (cholyltaurine) and conjugated steroids (dehydroepiandrosterone 3-sulfate, 17-beta-glucuronosyl estradiol, and estrone 3-sulfate), as well as eicosanoids (prostaglandin E2, thromboxane B2, leukotriene C4, and leukotriene E4), and thyroid hormones (T4/L-thyroxine, and T3/3,3',5'-triiodo-L-thyronine). Can take up bilirubin glucuronides from plasma into the liver, contributing to the detoxification-enhancing liver-blood shuttling loop. Involved in the clearance of endogenous and exogenous substrates from the liver. Transports coproporphyrin I and III, by-products of heme synthesis, and may be involved in their hepatic disposition. May contribute to regulate the transport of organic compounds in testes across the blood-testis-barrier (Probable). Can transport HMG-CoA reductase inhibitors (also known as statins), such as pravastatin and pitavastatin, a clinically important class of hypolipidemic drugs. May play an important role in plasma and tissue distribution of the structurally diverse chemotherapeutic drug methotrexate. May also transport antihypertension agents, such as the angiotensin-converting enzyme (ACE) inhibitor prodrug enalapril, and the highly selective angiotensin II AT1-receptor antagonist valsartan, in the liver. Shows a pH-sensitive substrate specificity towards prostaglandin E2 and T4 which may be ascribed to the protonation state of the binding site and leads to a stimulation of substrate transport in an acidic microenvironment. Hydrogencarbonate/HCO3(-) acts as the probable counteranion that exchanges for organic anions

PMID 10358072 ↗ · PMID 10601278 ↗ · PMID 10873595 ↗ · PMID 11159893 ↗ · PMID 12196548 ↗ · PMID 12568656 ↗ · PMID 15159445 ↗ · PMID 15970799 ↗ · PMID 16624871 ↗ · PMID 16627748 ↗ · PMID 17412826 ↗ · PMID 19129463 ↗ · PMID 22232210 ↗ · PMID 23243220 ↗ · PMID 26383540 ↗ · PMID 26979622 ↗ · PMID 35307651 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性taurocholate(out) = taurocholate(in)含實驗來源
證據與來源

taurocholate(out) = taurocholate(in)

PMID 10358072 ↗ · PMID 10601278 ↗ · PMID 12196548 ↗ · PMID 17412826 ↗ · PMID 19129463 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性dehydroepiandrosterone 3-sulfate(out) = dehydroepiandrosterone 3-sulfate(in)含實驗來源
證據與來源

dehydroepiandrosterone 3-sulfate(out) = dehydroepiandrosterone 3-sulfate(in)

PMID 10358072 ↗ · PMID 10601278 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性estrone 3-sulfate(out) = estrone 3-sulfate(in)含實驗來源
證據與來源

estrone 3-sulfate(out) = estrone 3-sulfate(in)

PMID 10358072 ↗ · PMID 10873595 ↗ · PMID 15159445 ↗ · PMID 15970799 ↗ · PMID 17412826 ↗ · PMID 19129463 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性3,3',5'-triiodo-L-thyronine(out) = 3,3',5'-triiodo-L-thyronine(in)含實驗來源
證據與來源

3,3',5'-triiodo-L-thyronine(out) = 3,3',5'-triiodo-L-thyronine(in)

PMID 10358072 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-thyroxine(out) = L-thyroxine(in)含實驗來源
證據與來源

L-thyroxine(out) = L-thyroxine(in)

PMID 10358072 ↗ · PMID 10601278 ↗ · PMID 19129463 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性prostaglandin E2(out) = prostaglandin E2(in)含實驗來源
證據與來源

prostaglandin E2(out) = prostaglandin E2(in)

PMID 10358072 ↗ · PMID 10873595 ↗ · PMID 19129463 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性thromboxane B2(out) = thromboxane B2(in)含實驗來源
證據與來源

thromboxane B2(out) = thromboxane B2(in)

PMID 10358072 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)(out) = 17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)(in)含實驗來源
證據與來源

17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)(out) = 17beta-estradiol 17-O-(beta-D-glucuronate)(in)

PMID 10358072 ↗ · PMID 10873595 ↗ · PMID 12196548 ↗ · PMID 12568656 ↗ · PMID 15159445 ↗ · PMID 15970799 ↗ · PMID 16627748 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性leukotriene C4(out) = leukotriene C4(in)含實驗來源
證據與來源

leukotriene C4(out) = leukotriene C4(in)

PMID 10358072 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性leukotriene E4(out) = leukotriene E4(in)含實驗來源
證據與來源

leukotriene E4(out) = leukotriene E4(in)

PMID 10358072 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性(4E,15E)-bilirubin IXalpha C8-beta-D-glucuronoside(out) = (4E,15E)-bilirubin IXalpha C8-beta-D-glucuronoside(in)含實驗來源
證據與來源

(4E,15E)-bilirubin IXalpha C8-beta-D-glucuronoside(out) = (4E,15E)-bilirubin IXalpha C8-beta-D-glucuronoside(in)

PMID 22232210 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性bilirubin IXalpha bis-beta-D-glucuronoside(out) = bilirubin IXalpha bis-beta-D-glucuronoside(in)含實驗來源
證據與來源

bilirubin IXalpha bis-beta-D-glucuronoside(out) = bilirubin IXalpha bis-beta-D-glucuronoside(in)

PMID 22232210 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLCO1B1 是多次穿膜蛋白,位於細胞膜;在肝細胞中檢測於基底外側膜,在 Sertoli 細胞中則定位於基底膜。這些定位描述分別對應不同細胞類型,來源未提供異構型差異或定位改變條件。含實驗來源
證據與來源

Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basal cell membrane / Multi-pass membrane protein; Detected in basolateral membranes of hepatocytes. Localized to the basal membrane of Sertoli cells

PMID 12196548 ↗ · PMID 35307651 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯SLCO1B1 基因變異與 Rotor 型高膽紅素血症相關;此病為常染色體隱性遺傳的原發性結合型高膽紅素血症。患者常在出生後不久或兒童期出現不伴溶血的輕度黃疸,並有 bromsulphthalein 血漿清除延遲及尿中 coproporphyrin I 明顯增加;肝臟色素沉著正常。含實驗來源
證據與來源

Hyperbilirubinemia, Rotor type HBLRR An autosomal recessive form of primary conjugated hyperbilirubinemia. Affected individuals develop mild jaundice not associated with hemolysis shortly after birth or in childhood. They have delayed plasma clearance of the unconjugated anionic dye bromsulphthalein and prominent urinary excretion of coproporphyrin I. Hepatic pigmentation is normal. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 237450

PMID 22232210 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 15 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000256958 · 2,787 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AAAGGGTGGACTTGTTGCAGTTGCTGTAGGATTCTAAATC40
41CAGGTGATTGTTTCAAACTGAGCATCAACAACAAAAACAT80
81TTGTATGATATCTATATTTCAATCATGGACCAAAATCAAC120
121ATTTGAATAAAACAGCAGAGGCACAACCTTCAGAGAATAA160
161GAAAACAAGATACTGCAATGGATTGAAGATGTTCTTGGCA200
201GCTCTGTCACTCAGCTTTATTGCTAAGACACTAGGTGCAA240
241TTATTATGAAAAGTTCCATCATTCATATAGAACGGAGATT280
281TGAGATATCCTCTTCTCTTGTTGGTTTTATTGACGGAAGC320
321TTTGAAATTGGAAATTTGCTTGTGATTGTATTTGTGAGTT360
361ACTTTGGATCCAAACTACATAGACCAAAGTTAATTGGAAT400
401CGGTTGTTTCATTATGGGAATTGGAGGTGTTTTGACTGCT440
441TTGCCACATTTCTTCATGGGATATTACAGGTATTCTAAAG480
481AAACTAATATCAATTCATCAGAAAATTCAACATCGACCTT520
521ATCCACTTGTTTAATTAATCAAATTTTATCACTCAATAGA560
561GCATCACCTGAGATAGTGGGAAAAGGTTGTTTAAAGGAAT600
601CTGGGTCATACATGTGGATATATGTGTTCATGGGTAATAT640
641GCTTCGTGGAATAGGGGAGACTCCCATAGTACCATTGGGG680
681CTTTCTTACATTGATGATTTCGCTAAAGAAGGACATTCTT720
721CTTTGTATTTAGGTATATTGAATGCAATAGCAATGATTGG760
761TCCAATCATTGGCTTTACCCTGGGATCTCTGTTTTCTAAA800
801ATGTACGTGGATATTGGATATGTAGATCTAAGCACTATCA840
841GGATAACTCCTACTGATTCTCGATGGGTTGGAGCTTGGTG880
881GCTTAATTTCCTTGTGTCTGGACTATTCTCCATTATTTCT920
921TCCATACCATTCTTTTTCTTGCCCCAAACTCCAAATAAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。