演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC9A5NHE5

solute carrier family 9 member A5

SLC9A5 編碼多次穿膜的 Na(+)/H(+) 交換蛋白,參與細胞內酸鹼平衡,也與神經突觸後的調節過程相關。

Homo sapiens16q22.1UniProt Q14940
OFFICIAL SYMBOL
SLC9A5
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q14940
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC9A5(solute carrier family 9 member A5)是蛋白質編碼基因,其產物為 Sodium/hydrogen exchanger 5,屬於 monovalent cation:proton antiporter 1(CPA1)轉運蛋白家族。此蛋白長896個胺基酸,具有多次穿膜的結構;其N端含12段跨膜螺旋,後接延伸的細胞質區域。這些基本特徵構成其位於膜上的離子交換蛋白身分。

Official symbol
SLC9A5
Gene name
solute carrier family 9 member A5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11078
UniProt
Q14940
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NHE5

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616q22.1
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegSLC9A5pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:67,237,683–67,272,191
Gene span
34,509 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000299798 ★67,248,979–67,272,19116
ENST0000056634567,246,915–67,259,9424
ENST0000089749167,248,446–67,272,19116
ENST0000089749267,248,446–67,272,19116
ENST0000089749367,248,446–67,272,1914
ENST0000092827667,248,446–67,272,19115
ENST0000092827767,248,446–67,272,1917
ENST0000092827867,248,446–67,272,1913
ENST0000092827967,248,446–67,272,1916
ENST0000092828067,248,446–67,272,1913
ENST0000111229567,248,446–67,253,3582
ENST0000113422567,248,446–67,272,19116

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC9A5 是位於質膜的 Na(+)/H(+) 反向運輸蛋白,透過電中性的交換作用,將細胞內 H(+) 與細胞外 Na(+) 以1:1比例互換。這種離子運輸有助於調節細胞內 pH;來源特別指出,此作用與神經組織中的細胞內酸鹼平衡有關。其交換方向為細胞內 Na(+)移出、細胞外 H(+)移入,亦即以 Na(+)外流與 H(+)內流相耦合。

除離子交換外,SLC9A5 也參與神經突觸相關的調節。在樹突棘中,它對樹突棘生長具有負向調節作用,並參與突觸後重塑與訊號傳遞。這些描述指出,SLC9A5 的作用不只涉及細胞內 pH,也與突觸後結構及訊號過程相關;來源未進一步界定這些作用的分子細節。

SLC9A5 還可能透過調節胞器內的 pH,影響受體酪胺酸激酶的運輸。這項作用延伸了其對 pH 平衡的影響範圍,但來源並未說明特定胞器或運輸步驟,因此不宜將其描述為單一明確的運輸機制。綜合而言,來源支持的功能涵蓋離子交換、神經組織中的 pH 調節,以及與樹突棘和受體運輸相關的細胞過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 67248979 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC9A5 ENST00000299798 GRCh38 chr16:67247979-67249079 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGGATCAGTTCCCTTTAGTTGTGGGAGGAAGAGGGAAGGATGCCCTTCAGTTTTCTGGGAAAAGATTGG
GAGGAGTCAGTTTGAGGGGGCAGATAGAACACGTTCCCCTCAGTTTTGGAGAAAAAGTGGGATGGGTGCC
CCTCAGCCTGAATGAAAAGTGGAGACGGTCCTCCTCTGTTTGGGGCGCTATGAGCCGAATGCCCCTCAGA
TTTGGAAAAAGTTGGGTGCATCTCGCCTAGTTTGAAGGGAATCAGTAGGCTGGGTTTTCCATAGGTTCCT
GTCAGCTTCATCAAAGAGATGAGACAGTTCTCTGTAGTGTGACTGAAAGGGAGGGCCAGGTGCCCCTTGG
TTTGGGAGATGAAGAACAGCCTCCCTCTTCGCCTGGCACGAGCTGGGCCAGTCTGGGCCTTAGGGTTTCT
GGGACGTTGGGGGCAGCGTTGTCCGTCACTGCTTTGGGGAGCGTCCAGTGCGCGTGCGCAGCTCAGGTCC
GGGTGGGGGCCGGCAGGGGGTCCTGGGCTTGGCAACGTGGGCGGAGGGCGGCCAAGCACGGTCCCCTGCG
TTTTGCACCCGGCCGCGCCTTGGTCCCAGGGGGGTGCTGCTCGCCGCACAGCAGCGCTGGCCGAGGAGGA
GCCGTGCCCCTCCCGTCCTGACCGCGCCCCCCGCAGACCCCCGCCCTTCCCGCTGCGGGCTGCCCCAGGG
GGGCCGTGGCCGCGCACCGCTCTGGATCTGGTGGGGGCGGTTTTGGGGAGGTTTGGGGGCGCGGACTCGA
AGGAGTAGGTTGTGGAACTTGGGGGAGAGCTGCACTGGGGAATTTCCGGAGCTGGGACTGATTTAGGGAG
GAAAGAGGAGAGAGTCCCCGACTACGAGAGTCCGAGGCAGGGTCTCGGAGCCTGGACCTGGCTTGGGGGT
ATCGGAGCCGGGATTGGGGGGAGCGGGCCCCACGTGCCTGTGACGCGGGGGCGCCCGGTAGGTGGCGGCG
GCGACGCGGGGCCGGCGGCCGTGCGGTGCCGGGAGGGCGGCTGGGCAGGCGGCAGGATGCTGCGCGCCGC
CCTGTCCCTGCTCGCGCTGCCCCTGGCGGGGGCGGCCGAAGAGCCCACCCA
SLC9A5 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC9A5_1 ↗16:67,248,979正股67,248,930–67,248,989

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_C8N6C · enhancer · 67243612–67245537 · regulatory

ENSR16_5KS3KN · CTCF_binding_site · 67246335–67246356 · regulatory

ENSR16_9ZNN8 · promoter · 67247471–67247971 · regulatory

ENSR16_9ZNNJ · promoter · 67248489–67248989 · regulatory

ENSR16_5KS42P · CTCF_binding_site · 67248939–67248960 · regulatory

· motif · 67244420–67244433 · motif

· motif · 67244420–67244433 · motif

· motif · 67244577–67244590 · motif

· motif · 67244577–67244590 · motif

· motif · 67244578–67244591 · motif

· motif · 67244578–67244591 · motif

· motif · 67244618–67244631 · motif

· motif · 67244663–67244676 · motif

· motif · 67244663–67244676 · motif

· motif · 67244805–67244818 · motif

· motif · 67245128–67245141 · motif

· motif · 67246079–67246088 · motif

· motif · 67246079–67246088 · motif

· motif · 67246079–67246088 · motif

· motif · 67246079–67246088 · motif

· motif · 67246081–67246097 · motif

· motif · 67246155–67246164 · motif

· motif · 67246181–67246190 · motif

· motif · 67246217–67246226 · motif

· motif · 67246337–67246353 · motif

· motif · 67246357–67246366 · motif

· motif · 67246569–67246582 · motif

· motif · 67246575–67246588 · motif

· motif · 67246627–67246642 · motif

· motif · 67246726–67246733 · motif

· motif · 67246834–67246843 · motif

· motif · 67246959–67246968 · motif

· motif · 67246989–67246999 · motif

· motif · 67247025–67247036 · motif

· motif · 67247126–67247137 · motif

· motif · 67247281–67247290 · motif

· motif · 67247402–67247412 · motif

· motif · 67247524–67247534 · motif

· motif · 67247540–67247550 · motif

· motif · 67247558–67247568 · motif

· motif · 67247611–67247621 · motif

· motif · 67248447–67248458 · motif

· motif · 67248447–67248458 · motif

· motif · 67248560–67248573 · motif

· motif · 67248560–67248573 · motif

· motif · 67248901–67248912 · motif

· motif · 67248919–67248935 · motif

· motif · 67248919–67248935 · motif

· motif · 67248941–67248957 · motif

· motif · 67249388–67249401 · motif

· motif · 67249388–67249401 · motif

· motif · 67249635–67249648 · motif

· motif · 67249635–67249648 · motif

· motif · 67249663–67249676 · motif

· motif · 67249663–67249676 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:896 aa

1 aa896 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q14940 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Sodium/hydrogen exchanger 5 長896個胺基酸,含12段跨膜螺旋,N端至第449位胺基酸包含交替的跨膜與膜內拓樸區段,之後為長段細胞質區域。第576至721位胺基酸的區域被註記為 ARRB2 互作所需;另有數段區域被註記為無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–45 aa
跨膜區Helical; Name=146–66 aa
拓樸區域Extracellular67–73 aa
跨膜區Helical; Name=274–94 aa
拓樸區域Cytoplasmic95–103 aa
跨膜區Helical; Name=3104–124 aa
拓樸區域Extracellular125–134 aa
跨膜區Helical; Name=4135–155 aa
拓樸區域Cytoplasmic156–173 aa
跨膜區Helical; Name=5174–194 aa
拓樸區域Extracellular195–200 aa
跨膜區Helical; Name=6201–221 aa
拓樸區域Cytoplasmic222–246 aa
跨膜區Helical; Name=7247–267 aa
拓樸區域Extracellular268–276 aa
跨膜區Helical; Name=8277–297 aa
拓樸區域Cytoplasmic298–331 aa
跨膜區Helical; Name=9332–352 aa
拓樸區域Extracellular353–360 aa
跨膜區Helical; Name=10361–381 aa
拓樸區域Cytoplasmic382–398 aa
跨膜區Helical; Name=11399–419 aa
拓樸區域Extracellular420–428 aa
跨膜區Helical; Name=12429–449 aa
拓樸區域Cytoplasmic450–896 aa
功能區域Required for interaction with ARRB2576–721 aa
功能區域Disordered658–686 aa
功能區域Disordered701–720 aa
功能區域Disordered818–864 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q14940…

AlphaFold · Q14940

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Recycling endosome membrane;Cell projection, dendritic spine membrane;Synaptic cell membrane;Cell junction, focal adhesion

SLC9A5 位於質膜,也可在回收胞內體膜、樹突棘膜、突觸細胞膜及黏著斑相關位置出現。 它會依不同刺激在回收胞內體與質膜間循環;其內化依賴網格蛋白與 beta-arrestin,而從回收胞內體送至質膜則需要 PIK3CA 與 SCAMP2。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell projection, dendritic spine membrane;Cell junction, focal adhesion。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NHE5SLC9A5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SLC9A5 與 CHP1、CHP2 的互作屬於相似性推定。它與 ARRB2 的互作有助於 SLC9A5 從質膜內化;與 RACK1 的互作會正向調節其活性,並促進其定位至黏著斑。SCAMP2 則與 SLC9A5 的細胞表面定位及活性調節相關。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC9A5 是質膜 Na(+)/H(+) 反向運輸蛋白,以1:1比例進行電中性的離子交換,調節細胞內 pH,尤其與神經組織相關。它也負向調節樹突棘生長,參與突觸後重塑與訊號傳遞,並可藉由影響胞器 pH,進而關聯受體酪胺酸激酶的運輸。含實驗來源
證據與來源

Plasma membrane Na(+)/H(+) antiporter. Mediates the electroneutral exchange of intracellular H(+) ions for extracellular Na(+) in 1:1 stoichiometry, thus regulating intracellular pH homeostasis, in particular in neural tissues. Acts as a negative regulator of dendritic spine growth. Plays a role in postsynaptic remodeling and signaling. Can also contribute to organellar pH regulation, with consequences for receptor tyrosine kinase trafficking

PMID 10692428 ↗ · PMID 19276089 ↗ · PMID 21551074 ↗ · PMID 24006492 ↗ · PMID 24936055 ↗ · PMID 9933641 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性Na(+)(in) + H(+)(out) = Na(+)(out) + H(+)(in)含實驗來源
證據與來源

Na(+)(in) + H(+)(out) = Na(+)(out) + H(+)(in)

PMID 10692428 ↗ · PMID 19276089 ↗ · PMID 9933641 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SLC9A5 與 CHP1、CHP2 的互作為相似性推定。它與 ARRB2 互作並促進自身由質膜內化;與 RACK1 互作可正向調節活性及促進黏著斑定位;與 SCAMP2 互作則涉及細胞表面定位與活性調節。含實驗來源
證據與來源

Interacts with CHP1 and CHP2 (By similarity). Interacts with ARRB2; facilitates the endocytosis of SLC9A5 from the plasma membrane. Interacts with RACK1; this interaction positively regulates SLC9A5 activity and promotes SLC9A5 localization to focal adhesions. Interacts with SCAMP2; this interaction regulates SLC9A5 cell-surface targeting and SLC9A5 activity

PMID 15699339 ↗ · PMID 19276089 ↗ · PMID 21296876 ↗ · PMID 24006492 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC9A5 可在質膜、回收胞內體膜、樹突棘膜、突觸細胞膜及黏著斑相關位置出現,並會依不同刺激在回收胞內體與質膜間循環。其內化依賴網格蛋白與 beta-arrestin;從回收胞內體插入質膜則需要 PIK3CA 與 SCAMP2。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Recycling endosome membrane / Multi-pass membrane protein; Cell projection, dendritic spine membrane / Multi-pass membrane protein; Synaptic cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell junction, focal adhesion; Cycles between recycling endosome and plasma membrane in response to diverse stimuli. Its internalization is clathrin- and beta-arrestin dependent and its plasma membrane insertion from the recycling endosomes requires phosphoinositide 3-kinase (PIK3CA) and SCAMP2

PMID 12205089 ↗ · PMID 15699339 ↗ · PMID 19276089 ↗ · PMID 21296876 ↗ · PMID 21551074 ↗ · PMID 24936055 ↗ · PMID 24006492 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000299798 · 3,708 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTGCGGTGCCGGGAGGGCGGCTGGGCAGGCGGCAGGATGC40
41TGCGCGCCGCCCTGTCCCTGCTCGCGCTGCCCCTGGCGGG80
81GGCGGCCGAAGAGCCCACCCAGAAGCCAGAGTCCCCGGGC120
121GAGCCTCCCCCAGGCTTAGAGCTCTTCCGCTGGCAGTGGC160
161ACGAGGTGGAGGCGCCCTACCTGGTGGCCCTGTGGATCCT200
201GGTGGCCAGTCTGGCCAAAATCGTGTTTCACCTGTCTCGG240
241AAAGTAACATCTCTGGTCCCTGAGAGCTGCCTGCTGATTT280
281TGCTGGGCCTGGTGCTAGGGGGAATTGTTTTGGCTGTGGC320
321CAAGAAAGCTGAGTACCAGCTGGAGCCAGGCACCTTCTTC360
361CTCTTCCTGCTGCCTCCTATTGTGTTGGACTCAGGCTATT400
401TCATGCCTAGCAGGCTGTTCTTTGACAACTTGGGTGCCAT440
441CCTCACCTATGCCGTGGTAGGCACACTCTGGAATGCCTTC480
481ACAACAGGCGCTGCCCTCTGGGGCTTGCAGCAGGCTGGAC520
521TTGTAGCCCCTAGGGTGCAGGCTGGCTTACTGGACTTCCT560
561GCTGTTTGGGAGCCTCATCTCGGCGGTGGACCCCGTGGCC600
601GTGCTAGCTGTCTTTGAGGAGGTGCACGTCAATGAGACTC640
641TCTTTATCATCGTCTTTGGCGAGTCCCTGCTCAACGATGC680
681TGTCACCGTGGTGCTGTACAAGGTCTGCAACTCCTTTGTG720
721GAGATGGGCTCTGCCAATGTGCAGGCCACTGACTACCTGA760
761AGGGAGTCGCCTCCCTGTTTGTGGTCAGTCTGGGCGGGGC800
801AGCCGTGGGCTTAGTCTTTGCCTTCCTCCTGGCCCTGACC840
841ACACGCTTCACCAAGCGGGTCCGCATCATCGAGCCGCTGC880
881TGGTCTTCCTCCTCGCCTACGCAGCCTACCTCACTGCTGA920
921AATGGCCTCGCTCTCCGCCATTCTTGCGGTGACCATGTGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。