基因總覽
SLC9A3（solute carrier family 9 member A3）是蛋白質編碼基因，產物屬於 monovalent cation:proton antiporter 1（CPA1）transporter 家族。此蛋白是多次穿膜的細胞膜運輸蛋白，主要位於腎臟與腸道上皮細胞的頂端膜，為這些組織進行鈉吸收的重要成員。其基本作用是交換細胞內外的鈉離子與氫離子，因而連結上皮運輸、體液吸收與細胞內酸鹼平衡。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000264938 ★ | 470,456–524,449 | 17 |
| ENST00000514375 | 470,456–524,450 | 17 |
| ENST00001139209 | 470,456–524,450 | 17 |
| ENST00000644203 | 470,458–524,322 | 16 |
| ENST00001028769 | 480,811–524,450 | 9 |
| ENST00001065756 | 480,815–524,450 | 10 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC9A3 產物是細胞膜上的 Na(+)/H(+) antiporter，利用反向運輸交換鈉離子與氫離子。其交換方向為細胞內 Na(+) 與細胞外 H(+) 互換，化學計量比為 1:1。來源指出，此交換作用對鹽分與液體吸收及 pH 恆定具有重要作用；這項整體功能的描述標示為 By similarity，應保留其相似性推論的證據性質。
在腎臟與腸道，SLC9A3 是主要的頂端膜 Na(+)/H(+) exchanger，參與腎臟及腸道對 Na(+) 的吸收。這使其運輸功能與上皮組織的鈉處理相連，也與體液吸收相關。現有資料將其描述為重要的鈉吸收成員，但未提供更細的組織區段或生理調節機制，因此不宜據此延伸出額外的作用步驟。
SLC9A3 的作用亦與血壓調節相關。來源將腎臟和腸道的鈉吸收，以及血壓調節，並列為此運輸蛋白的重要生理角色；此處描述的是功能關聯，並未將單一運輸事件表述為血壓變化的直接原因。總體而言，SLC9A3 透過 Na(+)/H(+) 交換參與離子與液體吸收，並與 pH 恆定及血壓調節相連；其中 pH 恆定與鹽分、液體吸收的描述帶有 By similarity 的證據限制。
Promoter 與基因調控
>SLC9A3 ENST00000264938 GRCh38 chr5:524349-525449 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTCTGAGCTCCCGGGAGACGTTGAGCCTTTCCTCTGAGAGGGAGGGTCCCAATAGGAGGGACTGAAGGGG CAGGTAGAGGGCCGAGCAGGAGCCTTTGCAGGTGGCTGCAGGCTCCCAGAAGCCGCTGGTTTTGTGCACA TTTTGAAAGTAGAGCAGATATGCTAAGAGCTTGGAAACCTTGTGAGCGAAAGAAGTCCACCTGCGTCCCA GGTCTGGGGCTGGAAGGCTGCAGGGTGGGCTTGGAGGAAAACAGGGGTGTGGTTTGCACAGTGGAGCCTG AGATGCTTAAGAGAGCCAGTGCTGCCGGAGCGGGCTGTGGGCAGAGGCCCCGCATCCGTGTGAAGCCCTG GGGGTATCGAATTGTTTTGGGCGGAGGTCTAAAGGCAGGGGATGGGGCAGGGGAGACCACGGGGGCCCCT GGGCTCCCATCTCAGAGCCTGGGGTGGGGGATGCTGGCTGGCGATGGGAGGGGCAGAGAGACTTACCAGC GCACCACGCAAGGCCTGGGCGCCCCCGAGTTCTGGTAAGTGGCCGGTCCGGCTGTGGAATGCAGGTTCCT GCTGAAGACAATAGCGAGGGGCTGTGTGAAGACACACCTGGGGCCCCTGTGCACCCTTGGGCCGCCCTGT GGGGTCTGCGCAGCCCCAGGCCCTGCGTTTATGAAGGAGGGTTGGGGCGAGCGCACCCACAGCTGCCCGG GCATCCCAGGAGCTGCGCGGAACCGCCTGTCCCGCTGCCCCGCGCTGTGCTCCCCACGCCCCAGGAAGGC GGCCGCGCAGTCCCGGGCTCGCTCTTGCCGCGACCTCCCGGACCTCCAGGCCGCGGGCTCCGGGGGAGGG TGGGCACCAGGGAGCGCGGGGTGGGCGTGCGCGGGCGGGGCGGGCGTGCCGGGAGCTGCGGCGGTGTCTG CGCTCGCGAGTGCGCGGCGGGGGCGGGCAGGCTCCGCCCCGGGGCGGGAGGGGGCCGCGGGATTAAAGGC CACCCCGGCGGGCGGGGATCGGACTGTAGCCGGTACCGGCACCGGAGCGCGCCGGGTCCTCGCCGGGTCC CAGCCCCGCGCGTCGGCCCAGCCCAGCCGGGACCCCCCGCGACATGCGCGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_97LK · promoter · 523619–524119 · regulatory
ENSR5_8FBS · enhancer · 528435–528568 · regulatory
ENSR5_97N5 · enhancer · 529089–529428 · regulatory
· motif · 520694–520707 · motif
· motif · 520694–520707 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：834 aa
SLC9A3 產物長 834 個胺基酸，屬於 CPA1 transporter 家族。蛋白質具有 13 段螺旋型跨膜區，N 端另有訊號胜肽；其 C 端大段區域位於細胞質側。序列註解也標示了與 EZR、NHERF4 及 AHCYL1 互作的區域，以及兩段預測為無序的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC9A3 位於細胞膜，在腸上皮細胞中可定位於迴腸刷狀緣。 它也出現在早期內體與再循環內體膜，呈現細胞膜與胞內運輸區室之間的分布。 SGK1 在 Ser-663 的磷酸化與細胞膜上蛋白質量增加相關；Angiotensin-2 則被描述為可增強頂端膜表現（By similarity）。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 24 個夥伴
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SLC9A3 可形成同源二聚體，也被描述存在於複合體及動態巨分子複合體中。它與 NHERF1、NHERF2、CHP1、CHP2、SHANK2、PDZK1、NHERF4、AHCYL1、SNX27 和 EZR 有互作紀錄；其中 CHP1 與 SLC9A3 在細胞膜的運送及活性增加相關，AHCYL1 互作則是其活性所需。SNX27 參與引導 SLC9A3 從早期內體插入細胞膜，EZR 互作與其定位至頂端膜相關。NHERF4 互作會隨鈣離子濃度升高而減少。
疾病與遺傳關聯
SLC9A3 變異與先天性分泌性鈉腹瀉 8（DIAR8）相關，來源將該疾病歸因於影響此基因的變異。其特徵包括產前起病的水樣分泌性腹瀉、出生後明顯腹脹及腸袢擴張並充滿液體，並可見糞便鈉濃度升高、尿鈉濃度偏低。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC9A3 產物是細胞膜 Na(+)/H(+) 反向運輸蛋白，以 1:1 化學計量比交換細胞內 H(+) 與細胞外 Na(+)。此功能與鹽分及液體吸收、pH 恆定相關，其中相關整體功能標示為 By similarity；它也是腎臟和腸道主要的頂端膜 Na(+)/H(+) exchanger，參與兩處的鈉吸收，並與血壓調節相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plasma membrane Na(+)/H(+) antiporter. Exchanges intracellular H(+) ions for extracellular Na(+) in 1:1 stoichiometry, playing a key role in salt and fluid absorption and pH homeostasis (By similarity). Major apical Na(+)/H(+) exchanger in kidney and intestine playing an important role in renal and intestine Na(+) absorption and blood pressure regulation PMID 18829453 ↗ · PMID 24622516 ↗ · PMID 26358773 ↗ · PMID 35613257 ↗ |
| 分子活性 | Na(+)(in) + H(+)(out) = Na(+)(out) + H(+)(in) | 含實驗來源 | 證據與來源Na(+)(in) + H(+)(out) = Na(+)(out) + H(+)(in) PMID 18829453 ↗ · PMID 26358773 ↗ · PMID 35613257 ↗ |
| 交互作用 | SLC9A3 可形成同源二聚體，也存在於複合體及動態巨分子複合體中。它與多種蛋白質互作：CHP1 與其細胞膜運送及活性增加相關，AHCYL1 互作是其活性所需；SNX27 引導其由早期內體插入細胞膜，EZR 互作則與頂端膜定位相關。另有 NHERF1、NHERF2、CHP2、SHANK2、PDZK1 與 NHERF4 的互作紀錄；NHERF4 互作在鈣離子升高時減少。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Found in the forms of complex and dynamic macromolecular complexes (By similarity). Binds NHERF1 and NHERF2 (By similarity). Interacts with CHP1; increases SLC9A3 trafficking and activity at the plasma membrane. Interacts with CHP2 and SHANK2. Interacts with PDZK1 (via C-terminal PDZ domain) (By similarity). Interacts with NHERF4 and interaction decrease in response to elevated calcium ion levels. Interacts with AHCYL1; the interaction is required for SLC9A3 activity. Interacts with SNX27 (via PDZ domains); directs SLC9A3 membrane insertion from early endosomes to the plasma membrane. Interacts with EZR; interaction targets SLC9A3 to the apical membrane (By similarity) PMID 18829453 ↗ · PMID 19088451 ↗ · PMID 20584908 ↗ · PMID 25851603 ↗ · PMID 35613257 ↗ |
| 細胞定位 | SLC9A3 定位於頂端細胞膜、細胞膜、再循環內體膜及早期內體膜；在腸上皮細胞中位於迴腸刷狀緣。SGK1 對 Ser-663 的磷酸化與細胞膜上 SLC9A3 增加相關；Angiotensin-2 可增強其頂端膜表現，但此項描述標示為 By similarity。 | 含實驗來源 | 證據與來源Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Recycling endosome membrane / Multi-pass membrane protein; Early endosome membrane / Multi-pass membrane protein; In intestinal epithelial cells, localizes to the ileal brush border. Phosphorylation at Ser-663 by SGK1 is associated with increased abundance at the cell membrane. Angiotensin-2 enhances apical expression (By similarity) PMID 19088451 ↗ · PMID 26358773 ↗ · PMID 35613257 ↗ · PMID 25851603 ↗ |
| 疾病關聯 | 先天性分泌性鈉腹瀉 8（DIAR8）與影響 SLC9A3 的變異相關。疾病可在產前起病，表現為水樣分泌性腹瀉；出生後可有明顯腹脹，並見腸袢擴張且充滿液體。相關檢查特徵包括糞便鈉濃度升高及尿鈉濃度偏低。 | 含實驗來源 | 證據與來源Diarrhea 8, secretory sodium, congenital DIAR8 A disease characterized by watery secretory diarrhea with prenatal onset, prominent abdominal distension after birth due to dilated fluid-filled loops of intestine, elevated fecal sodium concentrations and low urinary sodium concentrations. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616868 PMID 26358773 ↗ · PMID 31276831 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGACTGTAGCCGGTACCGGCACCGGAGCGCGCCGGGTCCT40CGCCGGGTCCCAGCCCCGCGCGTCGGCCCAGCCCAGCCGG80GACCCCCCGCGACATGCGCGTCCCAGCCCTGCGCTGAGCA120GGCGGCAATGTGGGGACTCGGGGCCCGGGGCCCCGACCGG160GGGCTGCTGCTGGCGCTGGCGCTGGGCGGGCTGGCGCGGG200CCGGGGGCGTCGAGGTGGAGCCCGGCGGCGCGCACGGCGA240GAGCGGGGGCTTCCAGGTGGTCACCTTCGAGTGGGCCCAC280GTGCAGGATCCCTACGTCATCGCGCTCTGGATCCTCGTGG320CCAGCTTGGCCAAGATCGGGTTCCACCTGTCCCACAAGGT360CACCAGCGTGGTTCCCGAGAGCGCCCTGCTCATCGTGCTG400GGCCTGGTGCTGGGCGGCATCGTCTGGGCGGCCGACCACA440TCGCGTCCTTCACACTGACGCCCACCGTCTTCTTCTTCTA480CCTGCTGCCCCCCATCGTGCTGGACGCCGGCTACTTCATG520CCCAACCGCCTCTTCTTCGGCAACCTGGGGACCATCCTGT560TGTACGCCGTCGTGGGTACCGTGTGGAACGCGGCCACCAC600CGGGCTGTCCCTCTACGGCGTCTTCCTCAGTGGGCTCATG640GGCGACCTGCAGATTGGGCTGCTGGACTTCCTCCTGTTTG680GCAGCCTCATGGCGGCTGTGGACCCGGTGGCCGTCCTGGC720CGTGTTTGAGGAGGTCCATGTCAACGAGGTCCTGTTCATC760ATCGTCTTCGGGGAGTCGCTGCTGAACGACGCAGTCACCG800TGGTTCTGTACAATGTGTTTGAATCTTTCGTGGCGCTGGG840AGGTGACAACGTGACTGGCGTGGACTGCGTGAAGGGCATA880GTGTCCTTCTTCGTGGTGAGCCTGGGGGGCACGCTGGTGG920GGGTGGTCTTCGCCTTCCTGCTGTCGCTGGTGACGCGCTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。