演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC7A7y+LAT-1

solute carrier family 7 member 7

SLC7A7 編碼一種多次穿膜的胺基酸運輸蛋白,與 SLC3A2 組成異源二聚體,參與陽離子胺基酸與中性胺基酸的交換。

Homo sapiens14q11.2UniProt Q9UM01
OFFICIAL SYMBOL
SLC7A7
CHROMOSOME
14
UNIPROT
Q9UM01
PDB / ALPHAFOLD
8XXI
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

solute carrier family 7 member 7 是蛋白質編碼基因,所產生的蛋白質屬於 amino acid-polyamine-organocation(APC)超家族中的 L-type amino acid transporter(LAT)家族。這個蛋白質有 511 個胺基酸,含多個穿膜螺旋,是細胞膜上的多次穿膜蛋白。它與 SLC3A2 組成異源二聚體,作為胺基酸運輸系統的一部分;具體的交換方式與生理角色見功能說明。

Official symbol
SLC7A7
Gene name
solute carrier family 7 member 7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11065
UniProt
Q9UM01
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
y+LAT-1Y+LAT1LPI

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q11.2
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegSLC7A7pq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr14:22,773,222–22,829,820
Gene span
56,599 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000674313 ★22,773,222–22,815,43510
ENST0000028585022,773,222–22,819,81111
ENST0000055570222,773,222–22,819,81111
ENST0000039753222,773,222–22,815,88610
ENST0000055591122,773,222–22,815,82610
ENST0000039752922,773,222–22,819,81110
ENST0000039752822,773,222–22,815,89811
ENST0000055451722,773,222–22,819,7219
ENST0000089438722,773,222–22,814,99910
ENST0000094169222,773,222–22,819,81111
ENST0000102349222,773,222–22,815,88610
ENST0000109584522,773,222–22,815,89810

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC7A7 與 SLC3A2 形成異源二聚體,作為胺基酸反向運輸蛋白,將細胞內的陽離子胺基酸輸出,並以中性胺基酸及鈉離子的輸入作交換。來源列出的運輸反應包括細胞內的 L-arginine、L-lysine 或 L-ornithine 與細胞外的 L-leucine 交換,同時伴隨鈉離子移動。這些反應說明其運輸具有方向性,底物交換並非單純將胺基酸由一側搬運至另一側。

此運輸機制被描述為電中性,且依相似性資料推定其化學計量比為 1:1。依相似性資料,在體外,中性胺基酸共運輸也可伴隨 Na(+) 或 Li(+);H(+) 亦可能參與。這些離子伴隨運輸的敘述帶有體外或相似性證據限定,不宜視為所有細胞情境下均已確立的條件。

SLC7A7 也介導非極化細胞(例如單核球)的 arginine 運輸,且對這類細胞的正常功能不可或缺。透過運送 L-arginine,它可能參與 nitric oxide 合成;來源以「可能」描述此關聯,並未將運輸與合成之間的關係表述為唯一或必然的結果。其在不同細胞中的運輸角色,因而涵蓋陽離子胺基酸交換以及特定情境下的 arginine 供應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 22815435 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC7A7 ENST00000674313 GRCh38 chr14:22815335-22816435 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCCCGGGTTCATGCCATTCTCCTCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAATAGCTGGGACTACAGGTGCCCG
CCACCACGCCCGGCTAATTTTTATTTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGG
ATGGTCTTGATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGA
GCCACCGCGTCTGGCCTGATTTCCTCATATTTTTTAGGAAAGTGGAGTCAACTTATATTTGAGGAAGGCG
TTTATAGGAATTTATGCTTATCCCAGAGATCTTGGTATGTTTTGTCAAGAATGAAAAGGCACGTGGGTCT
GGTGGGGATGCAGTCAGATATTTGATCTCTTGACTGTGTTTCTTTTGAAGTAGTCTGAGGCTCAGACTTT
GGGGCAGTGGCCCAGGCTTGGAGGCAACCCCCCAGTCTCTCTTTGCATGGGGAAGTGTGCAGAGTTCTCT
TAGAACACCCAGTCACATGGTGTAGAGACTGCTCTTACACTTCCTGTAATCTCAGCATGGGAACAAGCCT
TTGTGTCACACTGTGCAACCTTCCTCCCTTTCTTAAATGCTTGGGGTGAGAGAGAAGAGAGGCTAGGGTG
GGGCATGGAGGACACAGAGAGAGAGAGTGCTGTGTATTCCTTCCCCGCTACTGTCCTGTCCTCAGCTAAC
TTGCTCTGGGACAGCTTCCCCAGGGCTACAGATACTGCACTCAGCTGACTGTCCTTTCTTCTGGGCCCCT
GGTCCCAGAGCAGAGCTGACAAAGGAGATTCCTGAGAGAGCACCTTCTTATCACAGAAAGTGCTGAGCCA
AGAGCTCCTAGCTGCCCCTTTTGCAGATGTGAAGGGCCAGTGAACCTTGGACCCAGATGGTTGCTTAATA
CTCCTTTCCCCCTCCCTCACTCCTTCCTTTGCGGGCTGCCTCACCTCCTCCACCCTTCTTGCTTAAATCC
ATAGGCATTTGTCTGGCCTTCCCTTTTACTGCTGGCTGGGAAGGAGGAGCATCAGACCACAGATCCTGGA
AGGCACTTCTCTCCCTGACTGCTGCTCACACTGCCGTGAGAACCTGCTTAT
SLC7A7 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC7A7_2 ↗14:22,815,434負股22,815,424–22,815,483
SLC7A7_3 ↗14:22,815,811負股22,815,801–22,815,860
SLC7A7_1 ↗14:22,819,791負股22,819,781–22,819,840

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_9C3GG · enhancer · 22810975–22811403 · regulatory

ENSR14_B6J8R · enhancer · 22814905–22815424 · regulatory

ENSR14_B6J8W · promoter · 22815425–22816168 · regulatory

ENSR14_B6J98 · enhancer · 22817837–22818549 · regulatory

ENSR14_B6J9D · enhancer · 22818941–22819710 · regulatory

ENSR14_B6J9H · promoter · 22819711–22820267 · regulatory

· motif · 22811208–22811222 · motif

· motif · 22811938–22811952 · motif

· motif · 22811942–22811952 · motif

· motif · 22812122–22812135 · motif

· motif · 22812122–22812135 · motif

· motif · 22814739–22814752 · motif

· motif · 22814739–22814752 · motif

· motif · 22815088–22815103 · motif

· motif · 22815599–22815610 · motif

· motif · 22815623–22815637 · motif

· motif · 22815895–22815908 · motif

· motif · 22815897–22815908 · motif

· motif · 22815899–22815908 · motif

· motif · 22816089–22816098 · motif

· motif · 22816089–22816098 · motif

· motif · 22818107–22818120 · motif

· motif · 22818107–22818120 · motif

· motif · 22818302–22818313 · motif

· motif · 22818304–22818313 · motif

· motif · 22818867–22818879 · motif

· motif · 22819623–22819645 · motif

· motif · 22819623–22819645 · motif

· motif · 22819642–22819654 · motif

IFNG(IFN-gamma)可刺激並增強 SLC7A7 的表現。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:511 aa

1 aa511 aa功能區域跨膜區
依 Q9UM01 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC7A7 蛋白質長 511 個胺基酸,屬於 APC 超家族的 LAT 家族。序列註解標示多個 α 螺旋型穿膜區,另有一段位於 N 端、被註記為無序的區域。這些結構特徵與其多次穿膜蛋白的性質相符。

跨膜區Helical37–57 aa
跨膜區Helical69–89 aa
跨膜區Helical107–127 aa
跨膜區Helical133–153 aa
跨膜區Helical160–180 aa
跨膜區Helical186–206 aa
跨膜區Helical222–242 aa
跨膜區Helical259–279 aa
跨膜區Helical304–324 aa
跨膜區Helical383–403 aa
跨膜區Helical416–436 aa
跨膜區Helical441–461 aa
功能區域Disordered1–28 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8XXI…

PDB · 8XXI

EM · 3.04 A · A=2-511

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Basolateral cell membrane

SLC7A7 定位於細胞基底外側膜,並被註記為多次穿膜蛋白。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
y+LAT-1SLC7A7SLC3A2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SLC7A7 與胺基酸運輸蛋白 SLC3A2/4F2hc 以雙硫鍵連結,形成異源二聚體;來源將此複合體描述為胺基酸運輸系統的一部分。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SLC7A7 的變異會造成 lysinuric protein intolerance(LPI)。此代謝疾病的特徵包括腎臟排出陽離子胺基酸增加、腸道吸收減少及 orotic aciduria;患者也可能出現餵食不良、嘔吐、腹瀉、高血氨昏迷發作、生長遲緩、肝脾腫大、骨質疏鬆及肺泡蛋白沉積症。其生化缺陷涉及腎臟與腸道上皮細胞基底外側膜的雙鹼性胺基酸運輸異常。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

8 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 8 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC7A7 與 SLC3A2 組成反向運輸異源二聚體,將細胞內陽離子胺基酸輸出,以中性胺基酸及鈉離子交換;運送 L-arginine 可能參與 nitric oxide 合成。它也介導單核球等非極化細胞的 arginine 運輸,對這些細胞的正常功能不可或缺。其運輸被描述為電中性,化學計量比 1:1 是依相似性推定;體外資料指出 Na(+)、Li(+) 及 H(+) 可與中性胺基酸共運輸。含實驗來源
證據與來源

Heterodimer with SLC3A2, that functions as an antiporter which operates as an efflux route by exporting cationic amino acids from inside the cells in exchange with neutral amino acids plus sodium ions and may participate in nitric oxide synthesis via the transport of L-arginine. Also mediates arginine transport in non-polarized cells, such as monocytes, and is essential for the correct function of these cells. The transport mechanism is electroneutral and operates with a stoichiometry of 1:1 (By similarity). In vitro, Na(+) and Li(+), but also H(+), are cotransported with the neutral amino acids (By similarity)

PMID 10080182 ↗ · PMID 10655553 ↗ · PMID 14603368 ↗ · PMID 15280038 ↗ · PMID 15756301 ↗ · PMID 15776427 ↗ · PMID 17329401 ↗ · PMID 31705628 ↗ · PMID 9829974 ↗ · PMID 9878049 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-leucine(out) + L-arginine(in) + Na(+)(out) = L-leucine(in) + L-arginine(out) + Na(+)(in)推論支持
證據與來源

L-leucine(out) + L-arginine(in) + Na(+)(out) = L-leucine(in) + L-arginine(out) + Na(+)(in)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-lysine(in) + L-leucine(out) + Na(+)(out) = L-lysine(out) + L-leucine(in) + Na(+)(in)推論支持
證據與來源

L-lysine(in) + L-leucine(out) + Na(+)(out) = L-lysine(out) + L-leucine(in) + Na(+)(in)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-ornithine(in) + L-leucine(out) + Na(+)(out) = L-ornithine(out) + L-leucine(in) + Na(+)(in)推論支持
證據與來源

L-ornithine(in) + L-leucine(out) + Na(+)(out) = L-ornithine(out) + L-leucine(in) + Na(+)(in)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SLC7A7 與胺基酸運輸蛋白 SLC3A2/4F2hc 透過雙硫鍵連結,形成異源二聚體。含實驗來源
證據與來源

Disulfide-linked heterodimer with the amino acid transport protein SLC3A2/4F2hc

PMID 23940088 ↗ · PMID 9829974 ↗ · PMID 9878049 ↗

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細胞定位SLC7A7 被註記為多次穿膜蛋白,定位於細胞基底外側膜。含實驗來源
證據與來源

Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 15756301 ↗

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調控IFNG(IFN-gamma)可刺激並增強 SLC7A7 的表現。含實驗來源
證據與來源

Expression is stimulated and enhanced by IFNG/IFN-gamma

PMID 15280038 ↗

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疾病關聯影響 SLC7A7 的基因變異會造成 lysinuric protein intolerance(LPI)。此代謝疾病涉及腎臟陽離子胺基酸排泄增加、腸道吸收減少及 orotic aciduria,並可能伴隨餵食不良、嘔吐、腹瀉、高血氨昏迷發作、生長遲緩、肝脾腫大、骨質疏鬆或危及生命的肺泡蛋白沉積症;生化缺陷為腎臟與腸道上皮細胞基底外側膜的雙鹼性胺基酸運輸異常。含實驗來源
證據與來源

Lysinuric protein intolerance LPI A metabolic disorder characterized by increased renal excretion of cationic amino acid (CAA), reduced CAA absorption from intestine, and orotic aciduria. On a normal diet, LPI patients present poor feeding, vomiting, diarrhea, episodes of hyperammoniaemic coma and growth retardation. Hepatosplenomegaly, osteoporosis and a life-threatening pulmonary involvement (alveolar proteinosis) are also seen. Biochemically LPI is characterized by defective transport of dibasic amino acids at the basolateral membrane of epithelial cells in kidney and intestine. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 222700

PMID 10080182 ↗ · PMID 10631139 ↗ · PMID 10655553 ↗ · PMID 12402335 ↗ · PMID 15756301 ↗ · PMID 15776427 ↗ · PMID 17764084 ↗ · PMID 23940088 ↗ · PMID 9829974 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 8 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000674313 · 2,082 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCCTTTTACTGCTGGCTGGGAAGGAGGAGCATCAGACCAC40
41AGATCCTGGAAGGCACTTCTCTCCCTGACTGCTGCTCACA80
81CTGCCGTGAGAACCTGCTTATATCCAGGACCAAGGAGGCA120
121ATGCCAGGAAGCTGGTGAAGGGTTTCCTCTCCTCCACCAT160
161GGTTGACAGCACTGAGTATGAAGTGGCCTCCCAGCCTGAG200
201GTGGAAACCTCCCCTTTGGGTGATGGGGCCAGCCCAGGGC240
241CGGAGCAGGTGAAGCTGAAGAAGGAGATCTCACTGCTTAA280
281CGGCGTGTGCCTGATTGTGGGGAACATGATCGGCTCGGGC320
321ATCTTTGTTTCCCCCAAGGGTGTGCTCATATACAGTGCCT360
361CCTTTGGTCTCTCTCTGGTCATCTGGGCTGTCGGGGGCCT400
401CTTCTCCGTCTTTGGGGCCCTTTGTTATGCGGAACTGGGC440
441ACCACCATTAAGAAATCTGGGGCCAGCTATGCCTATATCC480
481TGGAGGCCTTTGGAGGATTCCTTGCTTTCATCAGACTCTG520
521GACCTCCCTGCTCATCATTGAGCCCACCAGCCAGGCCATC560
561ATTGCCATCACCTTTGCCAACTACATGGTACAGCCTCTCT600
601TCCCGAGCTGCTTCGCCCCTTATGCTGCCAGCCGCCTGCT640
641GGCTGCTGCCTGCATTTGTCTCTTAACCTTCATTAACTGT680
681GCCTATGTCAAATGGGGAACCCTGGTACAAGATATTTTCA720
721CCTATGCTAAAGTATTGGCACTGATCGCGGTCATCGTTGC760
761AGGCATTGTTAGACTTGGCCAGGGAGCCTCTACTCATTTT800
801GAGAATTCCTTTGAGGGTTCATCATTTGCAGTGGGTGACA840
841TTGCCCTGGCACTGTACTCAGCTCTGTTCTCCTACTCAGG880
881CTGGGACACCCTCAACTATGTCACTGAAGAGATCAAGAAT920
921CCTGAGAGGAACCTGCCCCTCTCCATTGGCATCTCCATGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。