演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC7A3CAT-3

solute carrier family 7 member 3

SLC7A3 編碼陽離子 L-胺基酸轉運蛋白,參與 L-精胺酸、L-離胺酸與 L-鳥胺酸的攝取。

Homo sapiensXq13.1UniProt Q8WY07
OFFICIAL SYMBOL
SLC7A3
CHROMOSOME
X
UNIPROT
Q8WY07
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

solute carrier family 7 member 3 是一個蛋白質編碼基因,其產物為陽離子胺基酸轉運蛋白。此蛋白可運送 L-精胺酸、L-離胺酸及 L-鳥胺酸;現有資料將其描述為促進這些分子攝取的 uniporter,並指出其運輸不依賴鈉離子或 pH。這些特性概括了 SLC7A3 產物的基本角色。

Official symbol
SLC7A3
Gene name
solute carrier family 7 member 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11061
UniProt
Q8WY07
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CAT-3ATRC3FLJ14541

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXq13.1
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegSLC7A3pq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrX:70,925,556–70,931,149
Gene span
5,594 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000374299 ★70,925,579–70,931,09612
ENST0000029808570,925,556–70,931,14912
ENST0000092100770,925,556–70,931,14913
ENST0000092100870,925,556–70,931,14913
ENST0000092100970,925,556–70,931,14912
ENST0000092101070,925,556–70,931,14912
ENST0000092101170,925,556–70,931,14912
ENST0000092101270,925,556–70,931,14910
ENST0000092101370,925,556–70,931,14911
ENST0000092101470,925,556–70,931,14912
ENST0000092101570,925,556–70,931,14910
ENST0000092101670,925,556–70,931,14912

顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC7A3 產物是陽離子 L-胺基酸的 uniporter,可介導 L-精胺酸、L-離胺酸與 L-鳥胺酸的攝取。這項功能涵蓋三種具體底物;資料將運輸方向描述為攝取,並未提供其他底物或更廣泛生物學作用的資訊。

此轉運過程不依賴鈉離子,也不受 pH 變化所依賴。運輸由被動擴散介導,且會受到中等程度的 trans-stimulation。這些特徵說明其運輸方式不以鈉離子或 pH 條件作為依據;來源未進一步說明 trans-stimulation 的分子機制。

資料分別列出 L-精胺酸、L-離胺酸及 L-鳥胺酸的轉運反應,與上述三種底物的攝取描述一致。現有內容未指出轉運速率、細胞內外濃度條件或其他調節因素,因此功能意義應限於其介導這些陽離子 L-胺基酸攝取的角色。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 70931096 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC7A3 ENST00000374299 GRCh38 chrX:70930996-70932096 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGGTCCTTTTCTGTTTCCTAGTATCTCCTAGCCTAAACGGACCTACCCTGCTGCTGATGCCTCTCCCTGT
TTGTCTTTCCTTGTGGCCACATCCCTCTTCTTGTTCATTTGAATAAGATATGGTGCCTACGGGAGGCAGG
CATTGAAGTCCAACAGGCCAGGTTTTATCAAAGGTGGTCAACAATAATTATGGTGTGGTGTCAAACAAGT
CATGCCTCTGAGCCTCAGCTTACACATCAATAAAATGGAACTAAACAAGCTTCCTCCTCCAAGATGTTGG
TATTGTCAGAATTTCACATTTAATAGTTTAATATTTATAGGCAGCTGGAGACACATTATAGAGAGATTGG
GGCCTATAAATCAATTTAGACTGGATTAATTATCTGTATACAGGTGGCTTGAAATCATCTTCCATTCTCC
TGCTGCCTGCATTAGAAACACCCACAGCTGAGCGTGAGAGCTGAAGGGTCAGGGTCAGATGTGTAGACAA
GAAAGCTAAGGAAGAAAGACTGAGAGTGAGGTGGAGACTCCCCTGCTGTGTTCCGCTTCACTCCTGACAC
ACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACCCAACTCCCCCCCATCACACCCCACCTACC
TTCCCCATTCCTGCCCAGAATCACTGGTCCTAACAGGGCACAGAGGTGGAAAATCTCATGGGTTCTTTGG
CCAGGAAGCCTCTTATTGTCCTGTTCTGACGACCAGCGAGACAAATGGGAAAAGACTGCCCTCCCCCTTT
TCTCGCTCCCCGGCACGCCAGGCTTGCTAGTGAGGATGGGACGCAGTCTCAGGCCCCACGCAATCCTTTT
GCAAAGCCAAGAAGTGTGTGTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGTG
TGTAGCGAGGAGGATTGGGGGTGGGATCCCATGACGTTACCGGCTCCGCCTCCTGGTGTATATAAGGGGC
GCTTGGCGCGCAACGACCCCAAGCCGCAGCTTTGAAGCCTGAGCGGCCGAACTCGGCAGCTCCAACCCAA
CTCGGCTTAACTCCGCCTCACCGAGCCCAGTCCAAGACTCTGTGCTCCCTA
SLC7A3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC7A3_1 ↗X:70,931,096負股70,931,086–70,931,145

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_BJ43Z · enhancer · 70930487–70931085 · regulatory

ENSRX_933664 · promoter · 70931086–70931520 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:619 aa

1 aa619 aa跨膜區拓樸區域
依 Q8WY07 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC7A3 蛋白長 619 個胺基酸,屬於 amino acid-polyamine-organocation(APC)超家族及 Cationic amino acid transporter(CAT)家族。序列註解預測其含有 14 個跨膜螺旋;多段胞質區域與胞外區域交錯分布。

拓樸區域Cytoplasmic1–36 aa
跨膜區Helical; Name=137–57 aa
拓樸區域Extracellular58–61 aa
跨膜區Helical; Name=262–82 aa
拓樸區域Cytoplasmic83–107 aa
跨膜區Helical; Name=3108–128 aa
拓樸區域Extracellular129–162 aa
跨膜區Helical; Name=4163–183 aa
拓樸區域Cytoplasmic184–191 aa
跨膜區Helical; Name=5192–212 aa
拓樸區域Extracellular213–233 aa
跨膜區Helical; Name=6234–254 aa
拓樸區域Cytoplasmic255–285 aa
跨膜區Helical; Name=7286–306 aa
拓樸區域Extracellular307–335 aa
跨膜區Helical; Name=8336–356 aa
拓樸區域Cytoplasmic357–382 aa
跨膜區Helical; Name=9383–403 aa
拓樸區域Extracellular404–406 aa
跨膜區Helical; Name=10407–427 aa
拓樸區域Cytoplasmic428–475 aa
跨膜區Helical; Name=11476–496 aa
拓樸區域Extracellular497–506 aa
跨膜區Helical; Name=12507–527 aa
拓樸區域Cytoplasmic528–540 aa
跨膜區Helical; Name=13541–561 aa
拓樸區域Extracellular562–569 aa
跨膜區Helical; Name=14570–590 aa
拓樸區域Cytoplasmic591–619 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8WY07…

AlphaFold · Q8WY07

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

SLC7A3 是多次跨膜蛋白,定位於細胞膜。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CAT-3SLC7A3SLC10A1TMEM237
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC7A3 產物是 uniporter,可介導 L-精胺酸、L-離胺酸與 L-鳥胺酸的攝取。運輸不依賴鈉離子或 pH,以被動擴散進行,並受到中等程度的 trans-stimulation。含實驗來源
證據與來源

Uniporter that mediates the uptake of cationic L-amino acids such as L-arginine, L-lysine and L-ornithine. The transport is sodium ions- and pH-independent, moderately trans-stimulated and is mediated by passive diffusion

PMID 11591158 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-arginine(in) = L-arginine(out)含實驗來源
證據與來源

L-arginine(in) = L-arginine(out)

PMID 11591158 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-lysine(in) = L-lysine(out)含實驗來源
證據與來源

L-lysine(in) = L-lysine(out)

PMID 11591158 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-ornithine(in) = L-ornithine(out)含實驗來源
證據與來源

L-ornithine(in) = L-ornithine(out)

PMID 11591158 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC7A3 蛋白定位於細胞膜,屬於多次跨膜蛋白。資料庫紀錄
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000374299 · 2,239 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAGCCGCAGCTTTGAAGCCTGAGCGGCCGAACTCGGCAGC40
41TCCAACCCAACTCGGCTTAACTCCGCCTCACCGAGCCCAG80
81TCCAAGACTCTGTGCTCCCTAGGTTTGCAACAGCTCTCTG120
121ATCATCTTCTTCAATTCCTGCTAGGATGCCGTGGCAAGCA160
161TTTCGCAGATTTGGTCAAAAGCTGGTACGCAGACGTACAC200
201TGGAGTCAGGCATGGCTGAGACTCGCCTTGCCAGATGCCT240
241AAGCACCCTGGATTTAGTGGCCCTGGGTGTGGGCAGCACA280
281TTGGGTGCAGGCGTGTATGTCCTAGCTGGCGAGGTGGCCA320
321AAGATAAAGCAGGGCCATCCATTGTGATCTGCTTTTTGGT360
361GGCTGCCCTGTCTTCTGTGTTGGCTGGGCTGTGCTATGCG400
401GAGTTTGGTGCCCGGGTTCCCCGTTCTGGTTCGGCATATC440
441TCTACAGCTATGTCACTGTGGGTGAACTCTGGGCCTTCAC480
481CACTGGCTGGAACCTCATCCTCTCCTATGTCATTGGTACA520
521GCCAGTGTGGCCCGGGCCTGGAGCTCTGCTTTTGACAACC560
561TGATTGGGAACCACATCTCTAAGACTCTGCAGGGGTCCAT600
601TGCACTGCACGTGCCCCATGTCCTTGCAGAATATCCAGAT640
641TTCTTTGCTTTGGGCCTCGTGTTGCTGCTCACTGGATTGT680
681TGGCTCTCGGGGCTAGTGAGTCGGCCCTGGTTACCAAAGT720
721GTTCACAGGCGTGAACCTTTTGGTTCTTGGGTTCGTCATG760
761ATCTCTGGCTTCGTTAAGGGGGACGTGCACAACTGGAAGC800
801TCACAGAAGAGGACTACGAATTGGCCATGGCTGAACTCAA840
841TGACACCTATAGCTTGGGTCCTCTGGGCTCTGGAGGATTT880
881GTGCCTTTCGGCTTCGAGGGAATTCTCCGTGGAGCAGCGA920
921CCTGTTTCTATGCATTTGTTGGTTTCGACTGTATTGCTAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。