演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC7A2CAT-2

solute carrier family 7 member 2

SLC7A2 編碼的 permease 負責運輸多種陽離子胺基酸;不同異構型對底物的親和力有所差異。

Homo sapiens8p22UniProt P52569
OFFICIAL SYMBOL
SLC7A2
CHROMOSOME
8
UNIPROT
P52569
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

solute carrier family 7 member 2 是蛋白質編碼基因,產物屬於 amino acid-polyamine-organocation(APC)超家族中的 Cationic amino acid transporter(CAT)家族。其蛋白質為多次穿越細胞膜的 permease,與陽離子胺基酸的跨膜運輸相關。SLC7A2 可因替代性剪接形成不同異構型,各異構型對底物的親和力並不相同;來源亦描述了高親和力與低親和力、高容量的運輸特性。這些差異是理解其底物運輸特性的基本線索。

Official symbol
SLC7A2
Gene name
solute carrier family 7 member 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11060
UniProt
P52569
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CAT-2HCAT2SLC7A2ASLC7A2BCAT-2ACAT-2BATRC2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88p22
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegSLC7A2pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:17,496,975–17,570,573
Gene span
73,599 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000494857 ★17,497,088–17,570,56613
ENST0000090854017,496,975–17,570,57313
ENST0000096569217,497,047–17,570,57314
ENST0000090853917,497,085–17,570,57312
ENST0000090854117,497,088–17,570,57313
ENST0000090854217,497,088–17,570,57313
ENST0000091512617,497,088–17,570,57314
ENST0000111091517,497,088–17,548,9635
ENST0000112577017,497,088–17,570,51213
ENST0000113931017,497,088–17,570,57313
ENST0000052265617,497,091–17,570,57312
ENST0000091512717,497,111–17,570,57313

顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC7A2 的產物是參與陽離子胺基酸運輸的 permease,所列底物包括 L-arginine、L-lysine、L-ornithine 與 L-homoarginine。來源所列的活性反應均以底物進出細胞表示,支持其參與這些胺基酸的跨膜運輸;資料未進一步說明運輸的調控方式或所需條件。

不同異構型的底物親和力有所差異。來源指出,某一異構型對 L-arginine 與 L-homoarginine 的親和力明顯高於 isoform 2;另有描述將此運輸特性概括為低親和力、高容量。這些性質反映不同剪接異構型可能具有不同的底物處理特性,但來源未提供各底物或異構型的定量比較數值。

SLC7A2 透過運輸 arginine,可能參與巨噬細胞的 classical 或 alternative activation;此項功能描述標示為依相似性推定,因此應視為可能的生物學角色,而非在此資料中已確立的直接結論。來源沒有進一步交代特定巨噬細胞實驗條件或 arginine 運輸如何影響活化過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 17497088 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC7A2 ENST00000494857 GRCh38 chr8:17496088-17497188 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTACTCCAATACTATGCAAAGTAAAGTGGACCTTTCTGTCAAACAAAAATAGTAATAGGCCGGGCATGG
TGGCTCAAGCCTGTAATTCTCAGCCTGGTGGCTCAAGCCTGTAGTTGTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGC
GGGAGGATAGCTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCACGATTGTGTCACTGCCCTCCAGCCTG
GGCGACAGAGTGAGACCCTGTCTCTAAAGACAAACCACACACACATATACACACACACACTGACACACAC
TTATTGTTCAATTCAGTGCGTGTTTTGCTTCGTTTTGGATGAAAATTAACAGGCTTTCACATTGTGACTT
AATCTTATCAGAGACTCCTAAAGTAAACAATAGCGCAGTAGGAGAAACCCTGATTGTGTAACTTCTGCTC
TTGCTCCCCTGGAAATAATGTCATTTCCTATAAACCCACCCCCAAACAATCGTGACTACGTATTCATACC
ACTGGAGTCTTCCAAAATAGCAACTGCACATTATTTATCAACGTTTAGTTTGCATTTGACAAAGCACATC
CACCTGGGCTTCCATTTATCATTGCTATTATTATATTTTATTATTATTTTCTTATTTCCAAAATCTTTGT
AGAATGGAAAGTAAACGGGGGGACCAAAACCCCACTTAGAACTCTGCTTAGAAGATTCGGAAATGCCCTT
GAGGTTTGGTCCTCCCAGGAGAGCACGAAGTTTATCCTCGCGCGCAGCCTCTCTTCCCCGGCCCGCGCCC
ACCGGCCTAGCCCGGGGCTAGCGCCCGCCCACGTGTGCTCGGCTCCAGGCAAACCCCGCTGAGCAGCGGC
CGCACACCGCCCACCCCGGGGATTGGTCAGCGCGGCCGGGGCCCGGCGGGAGGCGGGCTCGGGGTCGCGT
TCCGGGAGCGCGGAGGAGGCGGTGCCGCCCGGCCCCGCGCCCCGCCCCCGCCCCGGGTGGCTACACAGAG
GGGCGCCCACGTGCCCAGCCCTCCTTCTGCAGCGCGGCCGGCGGGCGCTCCTCTTCGCGGGACCAGCGAG
GCGGCGGCCGCTGCTCCAGCGTCCCCCAGCCGCGGGCCCCCGACGCGCTGC
SLC7A2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC7A2_2 ↗8:17,494,354正股17,494,305–17,494,364
SLC7A2_1 ↗8:17,497,088正股17,497,039–17,497,098
SLC7A2_3 ↗8:17,497,482正股17,497,433–17,497,492

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_8HTXZ · promoter · 17494154–17494328 · regulatory

ENSR8_8HTZ3 · enhancer · 17494329–17494457 · regulatory

ENSR8_732QZ3 · enhancer · 17495110–17495232 · regulatory

ENSR8_98XHB · promoter · 17495233–17495596 · regulatory

ENSR8_B5GQD · promoter · 17496598–17497225 · regulatory

ENSR8_DTFW · enhancer · 17497226–17499537 · regulatory

· motif · 17495373–17495388 · motif

· motif · 17495373–17495388 · motif

· motif · 17496490–17496499 · motif

· motif · 17496540–17496550 · motif

· motif · 17496849–17496859 · motif

· motif · 17496879–17496889 · motif

· motif · 17496931–17496941 · motif

· motif · 17497073–17497082 · motif

· motif · 17497073–17497082 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:658 aa

1 aa658 aa跨膜區拓樸區域
依 P52569 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

蛋白質長 658 個胺基酸,屬於 amino acid-polyamine-organocation(APC)超家族及 Cationic amino acid transporter(CAT)家族。序列註解預測其包含多段螺旋跨膜區,並在細胞質側與細胞外側之間交替排列拓樸區段。

拓樸區域Cytoplasmic1–37 aa
跨膜區Helical38–59 aa
拓樸區域Extracellular60–63 aa
跨膜區Helical64–84 aa
拓樸區域Cytoplasmic85–104 aa
跨膜區Helical105–125 aa
拓樸區域Extracellular126–163 aa
跨膜區Helical164–184 aa
拓樸區域Cytoplasmic185–192 aa
跨膜區Helical193–213 aa
拓樸區域Extracellular214–248 aa
跨膜區Helical249–269 aa
拓樸區域Cytoplasmic270–289 aa
跨膜區Helical290–309 aa
拓樸區域Extracellular310–339 aa
跨膜區Helical340–360 aa
拓樸區域Cytoplasmic361–386 aa
跨膜區Helical387–407 aa
拓樸區域Extracellular408–410 aa
跨膜區Helical411–431 aa
拓樸區域Cytoplasmic432–490 aa
跨膜區Helical491–511 aa
拓樸區域Extracellular512–524 aa
跨膜區Helical525–549 aa
拓樸區域Cytoplasmic550–557 aa
跨膜區Helical558–578 aa
拓樸區域Extracellular579–582 aa
跨膜區Helical583–603 aa
拓樸區域Cytoplasmic604–658 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P52569…

AlphaFold · P52569

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

SLC7A2 被註記為細胞膜上的多次穿膜蛋白。 現有定位資料未描述其定位隨條件改變的情形,也未提供異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CAT-2SLC7A2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

8 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 8 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC7A2 作為 permease,參與運輸 L-arginine、L-lysine、L-ornithine 與 L-homoarginine。替代性剪接形成的異構型對底物親和力不同;依相似性推定,它也可能透過 arginine 運輸參與巨噬細胞的 classical 或 alternative activation。含實驗來源
證據與來源

Functions as a permease involved in the transport of the cationic amino acids (L-arginine, L-lysine, L-ornithine and L-homoarginine); the affinity for its substrates differs between isoforms created by alternative splicing. May play a role in classical or alternative activation of macrophages via its role in arginine transport (By similarity)

PMID 28684763 ↗ · PMID 9174363 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能SLC7A2 作為 permease,介導 L-arginine、L-lysine、L-ornithine 與 L-homoarginine 等陽離子胺基酸的運輸。相較於 isoform 2,該來源所述異構型對 L-arginine 與 L-homoarginine 具有明顯較高的親和力。含實驗來源
證據與來源

Functions as a permease that mediates the transport of the cationic amino acids (L-arginine, L-lysine, L-ornithine and L-homoarginine). Shows a much higher affinity for L-arginine and L-homoarginine than isoform 2

PMID 28684763 ↗ · PMID 9174363 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能SLC7A2 是低親和力、高容量的 permease,參與陽離子胺基酸 L-arginine、L-lysine、L-ornithine 與 L-homoarginine 的運輸。含實驗來源
證據與來源

Functions as a low-affinity, high capacity permease involved in the transport of the cationic amino acids (L-arginine, L-lysine, L-ornithine and L-homoarginine)

PMID 28684763 ↗ · PMID 9174363 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-arginine(in) = L-arginine(out)含實驗來源
證據與來源

L-arginine(in) = L-arginine(out)

PMID 9174363 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-lysine(in) = L-lysine(out)推論支持
證據與來源

L-lysine(in) = L-lysine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-ornithine(in) = L-ornithine(out)推論支持
證據與來源

L-ornithine(in) = L-ornithine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-homoarginine(in) = L-homoarginine(out)含實驗來源
證據與來源

L-homoarginine(in) = L-homoarginine(out)

PMID 28684763 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC7A2 被註記為細胞膜上的多次穿膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 9174363 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 8 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000494857 · 7,615 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTCCTTCTGCAGCGCGGCCGGCGGGCGCTCCTCTTCGCGG40
41GACCAGCGAGGCGGCGGCCGCTGCTCCAGCGTCCCCCAGC80
81CGCGGGCCCCCGACGCGCTGCAGCCGGCAGCCCACCGCCG120
121CCTTCTTGGCGCGACCCCAACCCAGCCCCACAGGAGACTC160
161TCTGAAGACCAGCAGGAAAGCAGTGAGCCCTTACAGGTCG200
201CCTTCGTCAGACGTCAGAATGATTCCTTGCAGAGCCGCGC240
241TGACCTTTGCCCGATGTCTGATCCGGAGAAAAATCGTGAC280
281CCTGGACAGTCTAGAAGACACCAAATTATGCCGCTGCTTA320
321TCCACCATGGACCTCATTGCCCTGGGCGTTGGAAGCACCC360
361TTGGGGCCGGGGTTTATGTCCTCGCTGGGGAGGTGGCCAA400
401GGCAGACTCGGGCCCCAGCATCGTGGTGTCCTTCCTCATT440
441GCTGCCCTGGCTTCAGTGATGGCTGGCCTCTGCTATGCCG480
481AATTTGGGGCCCGTGTTCCCAAGACGGGGTCTGCATATTT520
521GTACACCTACGTGACTGTCGGAGAGCTGTGGGCCTTCATC560
561ACTGGCTGGAATCTCATTTTATCGTATGTGATAGGTACAT600
601CAAGTGTTGCAAGAGCCTGGAGTGGCACCTTTGATGAACT640
641TCTTAGCAAACAGATTGGTCAGTTTTTGAGGACATACTTC680
681AGAATGAATTACACTGGTCTTGCAGAATATCCCGATTTTT720
721TTGCTGTGTGCCTTATATTACTTCTAGCAGGTCTTTTGTC760
761TTTTGGAGTAAAAGAGTCTGCTTGGGTGAATAAAGTCTTC800
801ACAGCTGTTAATATTCTCGTCCTTCTGTTTGTGATGGTTG840
841CTGGGTTTGTGAAAGGAAATGTGGCAAACTGGAAGATTAG880
881TGAAGAGTTTCTCAAAAATATATCAGCAAGTGCCAGAGAG920
921CCACCTTCTGAAAACGGAACAAGTATCTATGGGGCTGGTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。