演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC7A10asc-1

solute carrier family 7 member 10

SLC7A10 編碼多次穿膜的胺基酸轉運蛋白,可與 SLC3A2/4F2hc 形成異二聚體,協助小型中性 L-與 D-胺基酸跨越細胞膜。

Homo sapiens19q13.11UniProt Q9NS82
OFFICIAL SYMBOL
SLC7A10
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9NS82
PDB / ALPHAFOLD
8QEY
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC7A10 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 solute carrier family 7 member 10。其產物屬於 amino acid-polyamine-organocation(APC)超家族,是具有多個穿膜區段的膜蛋白。蛋白質全長 523 個胺基酸,序列預測含九段螺旋型穿膜區域,N 端與 C 端各有一段無序區域。SLC7A10 的基本角色是參與胺基酸跨膜轉運,並可與 SLC3A2/4F2hc 組成具功能的異二聚體。

Official symbol
SLC7A10
Gene name
solute carrier family 7 member 10
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11058
UniProt
Q9NS82
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
asc-1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.11
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25SLC7A10pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:33,208,656–33,225,853
Gene span
17,198 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000253188 ★33,208,664–33,225,85011
ENST0000101863733,208,656–33,225,85311
ENST0000093695833,208,657–33,225,85311
ENST0000099818333,208,657–33,225,85310
ENST0000099818433,208,657–33,225,85311
ENST0000114078633,208,657–33,225,85311

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC7A10 與 SLC3A2/4F2hc 結合後形成具功能的異二聚體,將小型中性 L-與 D-胺基酸跨越細胞膜轉運。其主要方式是交換運輸,也可透過促進性擴散運作;這項轉運特性有相似性證據支持,另有文獻資料支持其運輸功能。列出的交換反應顯示,L-alanine 可與 glycine、L-serine、L-threonine、L-cysteine、2-aminoisobutanoate、D-serine、D-alanine、L-valine、L-methionine、beta-alanine、D-cysteine 或 D-threonine 進行方向相反的跨膜交換。另有反應顯示,D-serine 可與 D-isoleucine 交換,並可發生由細胞內向外的轉運。

在中樞神經系統中,SLC7A10 是 glycine、L-serine 與 D-serine 的主要轉運蛋白之一。在脊髓與腦幹,它藉由提供 L-serine 以供 glycine 新生合成,並協助 astrocytes 將 glycine 回收至 glycinergic motor neurons,調節 glycine 代謝及 glycinergic 抑制性神經傳遞。這些作用可連結胺基酸的跨膜移動與神經系統中 glycine 的供應和再利用;相關描述帶有相似性證據限定。

在 Schaffer collateral-CA1 突觸,SLC7A10 介導 D-serine 與 glycine 釋放,進而調節突觸後 NMDA receptors 的活化及興奮性 glutamatergic 傳遞。此處的作用重點在於藉由胺基酸釋放影響受體活化與突觸訊號,來源將此功能標示為相似性推論。

此外,SLC7A10 可能調節發育中皮下脂肪組織內間質前驅細胞釋放 D-serine,並偏向促進白色脂肪細胞,而非具產熱特性的米色脂肪細胞譜系分化。這項可能的作用同樣屬於相似性推論,不能視為已確立的直接因果機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 33225850 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC7A10 ENST00000253188 GRCh38 chr19:33225750-33226850 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCTCGCCCCGCCCGCCGCCCCGGTGGCCCCGACGCGGCCCCCCTGGATCTTTTCCGCCGGCCTCGGCTGC
ACAGTCCGGACGGCTTCCGGGAGGAGGCAGCCTCCCTCGGATCCCCGCACTCCCGACCCTCTCCCGCGAC
CACAGCCTCCTTCTCCGTGTCTCCCGGGCATTCCAGGTCGCCTGGCCTTCTTGAGCCGGGCTGGATCGCG
CGGGACCTGCACCAGAGACCCGAGTTCTAGTCCGCTGAGCCCTCACTCTGACCTGGGACGAGGAGCCTGT
AGTGAAGATCTCAGGCCAGAGGTGGCCCAGAGCCTGGTAGGGTGGGCGAGCCGTGTCCAGGACTCGTCAC
AGGTCTTGGGTCCCCGTGATGAGGATGAGAGCCCCCGGGATCTTCACCTCGACCCTCAGGCCTTTGATCC
AGGGTGCATAGGACACCCAGACCCCTCAGAGGAGTTCCAGACCTCAACCCCCACCCCTCCTGAGGTTGTC
CGCCTGGGAGCCTCAGGAGGCACGAGAAAGGGTTTGGTCTCAGCCCTGCACTTGCTCGGCGATCGCTACT
GATCTCTGGGCTTCAACTTCCACCTGTAGAATGGACTCACCCTGGGAGCTGTCTCCTACACACACACACA
CACACACACACACACACACACACACACACACATCGTGCAGGCATAGAGTACTAAAGGGAGCACACACTGC
ATCCCCACACGCGGCCAGCTGTTATTCTTGCCGTCCCCCTCGGCCTCCCTGAGAGCAGGGATTGTCTTGT
CTCGGAGCTCTGCTCCCCAACCCGGCCCCAAGAATGGATGTAACTCAGGCAACTGGAGGGTCCCTTCCTT
CGCCCAACTGGGAAGTCCTTCCTAGATCTGCCCCAAGTCCTCTCCTTCCTTCCCAGGCCGGGACTGGGGG
AGGGGGCGTTCCCTTTAAGGGAGGTGGGGGAGGGGGCTGTGGGCCGGCCCTCCTTCCGCCCCTCCCGGGC
CCCCGCCGCCCGGGGCCCCCAGTCCCGGGCCCGGAGCCAGCGCATGCGCCCGCCTGTGGGCGCTGTCCCG
GCTGCGAGGGCCGTGAGCTCACGGACCGACGGACCGACGGGCGGCCGGCCG
SLC7A10 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC7A10_1 ↗19:33,225,809負股33,225,799–33,225,858

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_8ZD3J · enhancer · 33221651–33221840 · regulatory

ENSR19_9H742 · promoter · 33225840–33226340 · regulatory

ENSR19_9H74F · enhancer · 33227341–33227690 · regulatory

· motif · 33225821–33225832 · motif

· motif · 33225821–33225832 · motif

· motif · 33227573–33227582 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:523 aa

1 aa523 aa功能區域跨膜區
依 Q9NS82 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC7A10 蛋白質長 523 個胺基酸,屬於 amino acid-polyamine-organocation(APC)超家族。序列註解列出九段螺旋型穿膜區域,位置分別為 40–60、72–92、113–133、268–288、310–330、362–382、388–408、424–444 與 448–468;N 端 1–28 與 C 端 499–523 被註解為無序區域。

跨膜區Helical40–60 aa
跨膜區Helical72–92 aa
跨膜區Helical113–133 aa
跨膜區Helical268–288 aa
跨膜區Helical310–330 aa
跨膜區Helical362–382 aa
跨膜區Helical388–408 aa
跨膜區Helical424–444 aa
跨膜區Helical448–468 aa
功能區域Disordered1–28 aa
功能區域Disordered499–523 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8QEY…

PDB · 8QEY

EM · 4.00 A · A=1-523

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

SLC7A10 是多次穿膜蛋白,位於細胞膜。 在 astrocytic processes 中與 OLIG2 共定位;成熟脂肪細胞中定位於 plasma membrane,而前脂肪細胞中則位於細胞內結構,顯示其定位會隨細胞成熟狀態不同。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
asc-1SLC7A10APPBP2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SLC7A10 與胺基酸轉運蛋白 SLC3A2/4F2hc 形成由二硫鍵連結的異二聚體。此處描述的是實體組成及連結方式;兩者形成的複合體具有胺基酸轉運功能。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

17 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 17 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC7A10 與 SLC3A2/4F2hc 組成異二聚體,轉運小型中性 L-與 D-胺基酸,主要採交換運輸,也能促進性擴散。它在中樞神經系統轉運 glycine 與 L-、D-serine,並參與脊髓、腦幹的 glycine 代謝與抑制性傳遞,以及 Schaffer collateral-CA1 突觸的胺基酸釋放與訊號調節;這些部分功能具相似性證據。它也可能調節發育中皮下脂肪前驅細胞的 D-serine 釋放,偏向白色而非產熱米色脂肪細胞譜系。含實驗來源
證據與來源

Associates with SLC3A2/4F2hc to form a functional heterodimeric complex that translocates small neutral L- and D-amino acids across the plasma membrane. Preferentially mediates exchange transport, but can also operate via facilitated diffusion (By similarity). Acts as a major transporter for glycine, L- and D-serine in the central nervous system. At the spinal cord and brainstem regulates glycine metabolism and glycinergic inhibitory neurotransmission by providing for glycine de novo synthesis from L-serine and glycine recycling from astrocytes to glycinergic motor neurons (By similarity). At Schaffer collateral-CA1 synapses mediates D-serine and glycine release that modulates post-synaptic activation of NMDA receptors and excitatory glutamatergic transmission (By similarity). May regulate D-serine release from mesenchymal progenitors located in developing subcutaneous adipose tissue, favoring white adipocyte over thermogenic beige adipocyte lineage commitment (By similarity)

PMID 10863037 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-alanine(in) + glycine(out) = L-alanine(out) + glycine(in)推論支持
證據與來源

L-alanine(in) + glycine(out) = L-alanine(out) + glycine(in)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-serine(out) + L-alanine(in) = L-serine(in) + L-alanine(out)推論支持
證據與來源

L-serine(out) + L-alanine(in) = L-serine(in) + L-alanine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threonine(out) + L-alanine(in) = L-threonine(in) + L-alanine(out)推論支持
證據與來源

L-threonine(out) + L-alanine(in) = L-threonine(in) + L-alanine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-cysteine(out) + L-alanine(in) = L-cysteine(in) + L-alanine(out)推論支持
證據與來源

L-cysteine(out) + L-alanine(in) = L-cysteine(in) + L-alanine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性2-aminoisobutanoate(out) + L-alanine(in) = 2-aminoisobutanoate(in) + L-alanine(out)推論支持
證據與來源

2-aminoisobutanoate(out) + L-alanine(in) = 2-aminoisobutanoate(in) + L-alanine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性D-serine(out) + L-alanine(in) = D-serine(in) + L-alanine(out)推論支持
證據與來源

D-serine(out) + L-alanine(in) = D-serine(in) + L-alanine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性D-alanine(out) + L-alanine(in) = D-alanine(in) + L-alanine(out)推論支持
證據與來源

D-alanine(out) + L-alanine(in) = D-alanine(in) + L-alanine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-valine(out) + L-alanine(in) = L-valine(in) + L-alanine(out)推論支持
證據與來源

L-valine(out) + L-alanine(in) = L-valine(in) + L-alanine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-methionine(out) + L-alanine(in) = L-methionine(in) + L-alanine(out)推論支持
證據與來源

L-methionine(out) + L-alanine(in) = L-methionine(in) + L-alanine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性beta-alanine(out) + L-alanine(in) = beta-alanine(in) + L-alanine(out)推論支持
證據與來源

beta-alanine(out) + L-alanine(in) = beta-alanine(in) + L-alanine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性D-cysteine(out) + L-alanine(in) = D-cysteine(in) + L-alanine(out)推論支持
證據與來源

D-cysteine(out) + L-alanine(in) = D-cysteine(in) + L-alanine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性D-threonine(out) + L-alanine(in) = D-threonine(in) + L-alanine(out)推論支持
證據與來源

D-threonine(out) + L-alanine(in) = D-threonine(in) + L-alanine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性D-isoleucine(out) + D-serine(in) = D-isoleucine(in) + D-serine(out)推論支持
證據與來源

D-isoleucine(out) + D-serine(in) = D-isoleucine(in) + D-serine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性D-serine(in) = D-serine(out)推論支持
證據與來源

D-serine(in) = D-serine(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SLC7A10 與胺基酸轉運蛋白 SLC3A2/4F2hc 形成由二硫鍵連結的異二聚體。推論支持
證據與來源

Disulfide-linked heterodimer with the amino acid transport protein SLC3A2/4F2hc

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC7A10 是多次穿膜的細胞膜蛋白;在 astrocytic processes 中與 OLIG2 共定位。成熟脂肪細胞中位於 plasma membrane,前脂肪細胞中則位於細胞內結構。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Colocalizes with OLIG2 in astrocytic processes. Localizes to the plasma membrane in mature adipocytes and to intracellular structures in preadipocytes

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 17 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000253188 · 1,946 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCCCGGGCCCGGAGCCAGCGCATGCGCCCGCCTGTGGG40
41CGCTGTCCCGGCTGCGAGGGCCGTGAGCTCACGGACCGAC80
81GGACCGACGGGCGGCCGGCCGGACAGACGGGGCAGCGCAG120
121GGAGCGGGGACGCGGCGGGACAGCGACATGGCCGGCCACA160
161CGCAGCAGCCGAGCGGGCGCGGGAACCCCAGGCCTGCGCC200
201CTCGCCCTCCCCAGTCCCAGGGACCGTCCCCGGCGCCTCG240
241GAGCGGGTGGCGCTCAAGAAGGAGATCGGGCTGCTGAGCG280
281CCTGCACCATCATCATCGGGAACATCATCGGCTCGGGCAT320
321CTTCATCTCGCCCAAGGGGGTCCTGGAGCACTCAGGCTCC360
361GTGGGTCTGGCCCTGTTCGTCTGGGTCCTGGGTGGGGGCG400
401TGACGGCTCTGGGCTCCCTCTGCTATGCAGAGCTGGGAGT440
441CGCCATCCCCAAGTCTGGCGGGGACTACGCCTACGTCACA480
481GAGATCTTCGGGGGCCTGGCTGGCTTTCTGCTGCTCTGGA520
521GCGCCGTCCTCATCATGTACCCCACCAGCCTTGCTGTCAT560
561CTCCATGACCTTCTCCAACTACGTGCTGCAGCCCGTGTTC600
601CCCAACTGCATCCCCCCCACCACAGCCTCCCGGGTGCTGT640
641CCATGGCCTGCCTGATGCTCCTGACATGGGTGAACAGCTC680
681CAGTGTGCGCTGGGCCACGCGCATCCAGGACATGTTCACA720
721GGCGGGAAGCTGCTGGCCTTGTCCCTCATCATCGGCGTGG760
761GCCTTCTCCAGATCTTCCAAGGACACTTCGAGGAGCTGAG800
801GCCCAGCAATGCCTTTGCTTTCTGGATGACGCCCTCCGTG840
841GGACACCTGGCCCTGGCCTTCCTCCAGGGCTCCTTCGCCT880
881TCAGTGGCTGGAACTTCCTCAACTATGTCACCGAGGAGAT920
921GGTTGACGCCCGAAAGAACCTACCTCGCGCCATCTTCATC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。