演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC6A8CRTR

solute carrier family 6 member 8

SLC6A8 編碼一種鈉與氯離子依賴型肌酸轉運蛋白,負責將肌酸帶入細胞;其功能與肌酸供應至腦部有關。

Homo sapiensXq28UniProt P48029
OFFICIAL SYMBOL
SLC6A8
CHROMOSOME
X
UNIPROT
P48029
PDB / ALPHAFOLD
9KR7
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC6A8(solute carrier family 6 member 8)是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因,產物屬於鈉:神經傳遞物共轉運蛋白(SNF)家族中的 SLC6A8 亞家族。其蛋白質為多次穿膜蛋白,跨膜螺旋與細胞內、外區段交錯排列;全長 635 個胺基酸,N 端前段另有一段被註記為無序區。這些結構特徵構成其膜轉運蛋白的基本架構。

Official symbol
SLC6A8
Gene name
solute carrier family 6 member 8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11055
UniProt
P48029
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CRTRCT1CRTCRT-1CRT1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXq28
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegSLC6A8pq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chrX:153,687,914–153,696,591
Gene span
8,678 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000253122 ★153,687,926–153,696,58813
ENST00000922630153,687,914–153,696,59113
ENST00000922631153,687,914–153,696,59112
ENST00000922632153,687,914–153,696,59113
ENST00000922633153,687,914–153,696,59113
ENST00000955775153,687,914–153,696,59113
ENST00000955776153,687,914–153,696,59112
ENST00001056146153,687,914–153,696,59112
ENST00001122790153,687,914–153,696,59013
ENST00001132405153,687,914–153,696,59113
ENST00000430077153,689,467–153,696,59113
ENST00000429147153,691,461–153,692,2152

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC6A8 的主要功能是作為肌酸:鈉共轉運蛋白,介導肌酸進入細胞。此轉運依賴鈉與氯離子共同參與:來源所列的反應方向為肌酸、氯離子及兩個鈉離子由細胞外側移至細胞內側。因此,SLC6A8 的作用不只是運送肌酸,也與這些離子的協同跨膜移動相連。

肌酸是此蛋白所運送的底物;來源明確描述其介導肌酸攝取,並列出鈉與氯離子同向進入細胞的化學計量關係。這項轉運功能使細胞能從細胞外取得肌酸。來源未進一步說明轉運循環的構形變化或離子如何在分子層級上促成肌酸移動,因此不宜據此推演更細的運作步驟。

SLC6A8 對肌酸進入腦部具有重要作用;這項角色被描述為肌酸經由血腦障壁供應至腦部,證據標示為相似性推論(By similarity)。因此,此蛋白的功能可連結細胞膜上的肌酸攝取與腦部肌酸供應,但腦部供應這項敘述應保留其推論性質,不視為此處來源直接證實的機制細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 153687926 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC6A8 ENST00000253122 GRCh38 chrX:153686926-153688026 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GATGAGCCATCTGGGGACTGCAGTGTCCACGATCAGATCAGGGAGCTTGAAGCTGAGGGGGGCACACTTT
ACCTCCCAGGCCAGGACAATGACCACTTCCTTCCCCACCCCACCCCCAGGCTACTCTTAGCCCTAGAAAA
TTCTAAACAAGCTGCTCAGCTGGCGGCGGAGAGGCAGCCCAACAAGCTGGCTCTTGCTAGGGAGGCCTGG
GGGGTCCTGGGGAGAGGAACACGGGGTGGGTGGGGGGCGGGCAGCCAGGACCTCAGGCCTGAGGCCTTTG
GGGAAGGGTCTGTGCACCTGCCAGGCACCAGGGGGCAGCCTTGCCTTGTTCCCGCTCCAGTCCCCTCAAG
TCCGAAGCCCCTACCCACTCTCACGCCAGGCAGGGGTGGGGGCCGCCGGGGTCATTTACCCGGGCCCCTT
CTCTGCCTTGATGACAAAGTCGAGGCTTGCTCATCAGCCAGGCAGGCTCCCCTCTGCCCACTGTGGAGAC
ACAGAGGCCTGTCACCTGAAGAGCTGGTCCCGGCCTCCAGCTTCCAGGGTAGCCGGGAAGCTGTAGCCCC
CAGTGGGCAGCGGTGGAGAGAGCTCAAGGAAGGAGGGAGCACCGGGAGGAGACGGCTGCAGCCTGCCAGG
AGCGGGGAGAAAGGGAGAGAAGGGGAGGCGGAGGGCTGAGGGGGCCCGGGGGACGTCTTCCCAGGGCTGG
GAGGGGCCGGCCGGGAAGCCTGGGCTGCACTAGGAGCCGGCGACCCTGGGGCGAGGGGCGGCCCGGAGCC
CTGCGGGAGGAGCTGGCGGCCGCCCCAGGTAGCAACCATCCTGCCTCCCGCTGGAGCGGCGTCTCCTCCC
CGGGAGGAGGGCAGGGAGGAGGTGGGCGGAGTGTGACGAGGAGGGCGGGAGGGAGGGATGCGGGAGGGGG
AGGGGGAGGGGGGCCGGCCGGCCGTGGGGGTGGGGCGATAGTGACATCACCCCGGAGTCGGTTTTTAAGC
GGCGGCCGGCCGGGGACGGGGAAGAGAGGGATAGTCGGAGCGAGGTGGCGAGTCGCTGAGCCCGCCGCGG
CCCCGAGAGCGGCTGCAGCCGCCGCCGCCGGGAAGGAGAGGGCGAGGCGCG
SLC6A8 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:635 aa

1 aa635 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 P48029 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC6A8 蛋白全長 635 個胺基酸,屬於鈉:神經傳遞物共轉運蛋白家族的 SLC6A8 亞家族。資料註記其具有多段跨膜螺旋,並在細胞質側與細胞外側區段之間交替;N 端第 1–28 個胺基酸另被標示為無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–60 aa
跨膜區Helical61–81 aa
拓樸區域Extracellular82–87 aa
跨膜區Helical88–108 aa
拓樸區域Cytoplasmic109–138 aa
跨膜區Helical139–159 aa
拓樸區域Extracellular160–230 aa
跨膜區Helical231–251 aa
拓樸區域Cytoplasmic252–269 aa
跨膜區Helical270–290 aa
拓樸區域Extracellular291–304 aa
跨膜區Helical305–325 aa
拓樸區域Cytoplasmic326–341 aa
跨膜區Helical342–362 aa
拓樸區域Extracellular363–394 aa
跨膜區Helical395–415 aa
拓樸區域Cytoplasmic416–444 aa
跨膜區Helical445–465 aa
拓樸區域Extracellular466–479 aa
跨膜區Helical480–500 aa
拓樸區域Cytoplasmic501–520 aa
跨膜區Helical521–541 aa
拓樸區域Extracellular542–560 aa
跨膜區Helical561–581 aa
拓樸區域Cytoplasmic582–635 aa
功能區域Disordered1–28 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9KR7…

PDB · 9KR7

EM · 3.29 A · A=1-635

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Apical cell membrane

SLC6A8 被註記位於細胞膜,也可位於細胞膜的頂端區域;兩處均標示為多次穿膜蛋白。 來源未提供不同定位所對應的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CRTRSLC6A8
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SLC6A8 的變異可造成 X 聯鎖的腦肌酸缺乏症候群 1(CCDS1),屬於肌酸運輸障礙。患者可有智能障礙、嚴重語言遲緩、行為異常及癲癇;帶因女性可能出現輕微神經心理功能受損。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC6A8 是肌酸:鈉共轉運蛋白,能介導肌酸攝取;其重要作用之一,是透過血腦障壁協助將肌酸供應至腦部。腦部供應的描述標示為相似性推論(By similarity),因此保留其推論性質。含實驗來源
證據與來源

Creatine:sodium symporter which mediates the uptake of creatine. Plays an important role in supplying creatine to the brain via the blood-brain barrier (By similarity)

PMID 17465020 ↗ · PMID 22644605 ↗ · PMID 25861866 ↗ · PMID 7945388 ↗ · PMID 7953292 ↗ · PMID 9882430 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性creatine(out) + chloride(out) + 2 Na(+)(out) = creatine(in) + chloride(in) + 2 Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

creatine(out) + chloride(out) + 2 Na(+)(out) = creatine(in) + chloride(in) + 2 Na(+)(in)

PMID 17465020 ↗ · PMID 22644605 ↗ · PMID 25861866 ↗ · PMID 7945388 ↗ · PMID 7953292 ↗ · PMID 9882430 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC6A8 被註記為多次穿膜蛋白,定位於細胞膜;資料亦列出細胞膜的頂端區域作為其定位。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 22644605 ↗ · PMID 12433955 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯腦肌酸缺乏症候群 1 是 X 聯鎖的肌酸運輸障礙,與 SLC6A8 變異有關。其特徵包括智能障礙、嚴重語言遲緩、行為異常及癲癇;帶因女性可能有輕微神經心理功能受損。含實驗來源
證據與來源

Cerebral creatine deficiency syndrome 1 CCDS1 An X-linked disorder of creatine transport characterized by intellectual disability, severe speech delay, behavioral abnormalities, and seizures. Carrier females may show mild neuropsychologic impairment. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 300352

PMID 11898126 ↗ · PMID 12210795 ↗ · PMID 15154114 ↗ · PMID 16738945 ↗ · PMID 17101918 ↗ · PMID 17465020 ↗ · PMID 22644605 ↗ · PMID 23033978 ↗ · PMID 23660394 ↗ · PMID 24123876 ↗ · PMID 25861866 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000253122 · 3,931 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAAGAGAGGGATAGTCGGAGCGAGGTGGCGAGTCGCTGAG40
41CCCGCCGCGGCCCCGAGAGCGGCTGCAGCCGCCGCCGCCG80
81GGAAGGAGAGGGCGAGGCGCGCCCGAGCCGCCGCCGCCGC120
121CGCCACCGCCGCCGCCGCCACCACCGCCACCGGAGTCGCG160
161GGCCAGCCGGGCAGCCTCCGCGGGCCCCGGCCGGGGCGGG200
201GGGCGCGGGCCACAGGCCCCTGCTCCGGCCGCCGCTTGCA240
241GACCGCGGGCGCCGATGTCGCCCGCGCCCCGCTAGGCTGA280
281GCCTCGGGTCGGGCGAGGAGCCGCCGCAGCCGCCGCCGCC320
321CGAGCCGCGGGCAGGAGCCTCGGGAGCCGCCGCCGCCGCC360
361GCCGCCGCCCGGCCGGGCCCCGCCGCCGCCCGCGCGCCCC400
401CGGGCCCCCGACACACATGAGATTCTTCAGGCTCACTTTC440
441AAGTGCTTCGTGGACTGCTTCTGACTGCGCCGCCCGCGCC480
481CCGCACCCCGCCGCCCGCCCGCCGCCCCGTCCCCCGGCCC520
521GGCCGCCCCCCGGCCCCCGGCCGGCCCGCGCCCTCGGGGC560
561CCTCCCCGGTGCCGCCGGTGCCCCCCGCCTGACCGCCGCC600
601CCCCGTGAGGCGCCGCGACCCCGGCCCGGCCGTGCGGCCC640
641GCCGAGGCCATGGCGAAGAAGAGCGCCGAGAACGGCATCT680
681ATAGCGTGTCCGGCGACGAGAAGAAGGGCCCCCTCATCGC720
721GCCCGGGCCCGACGGGGCCCCGGCCAAGGGCGACGGCCCC760
761GTGGGCCTGGGGACACCCGGCGGCCGCCTGGCCGTGCCGC800
801CGCGCGAGACCTGGACGCGCCAGATGGACTTCATCATGTC840
841GTGCGTGGGCTTCGCCGTGGGCTTGGGCAACGTGTGGCGC880
881TTCCCCTACCTGTGCTACAAGAACGGCGGAGGTGTGTTCC920
921TTATTCCCTACGTCCTGATCGCCCTGGTTGGAGGAATCCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。