基因總覽
SLC6A2（solute carrier family 6 member 2）是蛋白質編碼基因，產物為 Sodium-dependent noradrenaline transporter，也稱 Norepinephrine transporter。此蛋白屬於 sodium:neurotransmitter symporter（SNF）家族中的 SLC6A2 subfamily，是多次穿越細胞膜的膜蛋白，長度為617個胺基酸。其跨膜區域由12段螺旋構成，並有細胞質側與細胞外側區段，形成適合執行跨膜運輸的構造。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000568943 ★ | 55,655,988–55,706,192 | 15 |
| ENST00000414754 | 55,655,961–55,703,750 | 14 |
| ENST00001139367 | 55,655,961–55,706,192 | 15 |
| ENST00000574918 | 55,656,059–55,706,240 | 14 |
| ENST00000865255 | 55,656,059–55,702,761 | 15 |
| ENST00000568529 | 55,656,086–55,694,113 | 6 |
| ENST00000219833 | 55,656,254–55,706,192 | 14 |
| ENST00000379906 | 55,656,254–55,703,788 | 14 |
| ENST00000561820 | 55,656,254–55,706,192 | 13 |
| ENST00000566163 | 55,656,655–55,702,346 | 13 |
| ENST00000567238 | 55,671,671–55,703,791 | 12 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Sodium-dependent noradrenaline transporter 的主要角色，是運輸 norepinephrine（亦稱 noradrenaline）。此運輸依賴鈉離子與氯離子，將 norepinephrine由細胞外側帶入細胞內側；相關反應式描述兩種離子與 norepinephrine 同向移動。norepinephrine 是自主神經交感神經系統的主要訊號神經傳遞物質，因此此轉運蛋白所介導的跨膜運輸，直接涉及該訊號分子的回收。
在突觸間隙中，該蛋白負責 norepinephrine 的再攝取與清除。依序列相似性推論，這項作用有助於使 norepinephrine 失活並維持其恆定；此處的失活與恆定功能標註屬於相似性推論，並非在此來源中以直接證據表述。透過從突觸間隙移除 norepinephrine，轉運蛋白參與調節此神經傳遞物質在突觸周圍的可用狀態。
SLC6A2 也能介導 dopamine 的運輸，且同樣依賴鈉離子與氯離子。來源列出兩種 dopamine 運輸化學計量：一種與 norepinephrine 相同，為每個 dopamine 搭配一個氯離子與一個鈉離子；另一種則搭配一個氯離子與兩個鈉離子。因此，不能將 dopamine 的離子比例概括為單一形式。這些資料支持該蛋白可運送不只一種神經傳遞物質，但其主要標註角色仍是 norepinephrine 的運輸與突觸間隙清除。
Promoter 與基因調控
>SLC6A2 ENST00000568943 GRCh38 chr16:55654988-55656088 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCAGCACTGTTCACGCACACAGCAGATGATCAGCATCTGCTAAAGGGATTAATACATTAATCAATAGAT GAGTGAATGAATGAGAAAACGACTCTCAGGTCCAAATGGCTCACTCCTTTACTTGTCTAATTGTTACCTT CTCAAATTCCCTGACCCCGTATGCAAACTGCAGCCCCACTGTCCCCCCATTCCCTCACCCATCATATAAC GTGTGTATTTATTATGTTTCCCGTTTCCTCTGTCTCCGCCAGCAGAATGTAAACTCCATGAGGTCAGGAA TCTCCGAGTTATGTTGCGCCAGTGTAATCCAAGAGCCCGGAACAGTGCCTGGCACACAGCGGGCATATGG AAGAACAAATGTGTGAAGGTGTGAATGAATGAATAATTGAAAGAATAAATAGTAGTTCTCAGCCTCACAG AACACGGGTCACAACCTCAAATGACCTGCTACCCTGCCCATAAATAACAGAGATGCAGGAGTAAGTGCTG GGCTGTGACCTGTCAACATGCTAAGCCGCTCAAACAAAACTGCCCAACAGCCCGCTGGCCGCCTATTTGC AGCACTGGGCCCTGAGCCGCACATTCCCATTTCGTTGATAAAGAAACTGACCAGATAGTTTAAGTGGCCT GCTGCGGAAGACAGAGCTGGTGCTGCACCGGTCGCTGCTTCCCCAGTCCTTTTTTGGCCTCCTTTCTGAC GCGACGCAGACCCCAGTTCTGGAGAGTCTGTCACTCGCTCCCCGTGGTGGGAGATCAGAGGCCTGGTGTC CTTGGGAGCGGCGAGCGGTGCTCGGCGCAGGATAGAAAGGGAGTGCGCGCCCGAGTCCCCCAGATCCCTG GGAACCCGCGCCACCCTCCCGCCCCTGCCCATCCCCGGCCGCGCTGTCAGTCTCCATTAGCGCTAACAGG CTCCAGACGGAGCGGGCCGGGCGCTGGGTTAATGCAATCGGCGCGTTACCTGGGGCGCAGGCTACATTAC CAGCCCGGCCCCCGCCAGGCACGGCCAGAACCAGTCAGCCCGCGCCCTGCCGGCCGCCCCGCGCCTCCAG CTCTTCCCCGGCCCCGCCCGAACGCCACACGGCGGAGCCCAGCCCCAGCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC6A2_1 ↗ | 16:55,655,540 | 正股 | 55,655,491–55,655,550 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_C7J53 · promoter · 55655641–55656665 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：617 aa
Sodium-dependent noradrenaline transporter 長617個胺基酸，屬於 sodium:neurotransmitter symporter（SNF）家族的 SLC6A2 subfamily。序列註解包含12段螺旋型跨膜區；N端與C端及多個區段位於細胞質側，另有區段位於細胞外側。N端第1至23個胺基酸另被註解為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Sodium-dependent noradrenaline transporter 位於細胞膜，並見於軸突的細胞突起及突觸相關樣本。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間的差異資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell projection, axon；Synapse, synaptosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
此蛋白可呈單體形式，也可在細胞膜中形成同源二聚體。二聚化主要由膽固醇與脂質介導，並會調節神經傳遞物質的運輸活性。來源另記載其與 PRKCABP 互作，但未進一步說明此互作是否屬於直接結合或複合體的一部分。
疾病與遺傳關聯
SLC6A2 相關變異被記載與體位性不耐症（orthostatic intolerance）有關。此病症為常染色體顯性疾病，患者由臥姿轉為站立時可出現頭暈、心悸、疲倦、視線模糊與心搏過速，且沒有低血壓；也可能發生昏厥，伴隨短暫認知障礙與呼吸困難。患者血漿 norepinephrine 濃度異常偏高。來源將此疾病歸因於影響該基因的變異，但未在此提供特定變異細節。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC6A2 以鈉離子與氯離子依賴方式運輸 norepinephrine；norepinephrine 是自主神經交感神經系統的主要訊號神經傳遞物質。此蛋白負責其在突觸間隙的再攝取與清除，並依序列相似性推論參與 norepinephrine 失活及恆定；此外也可運輸 dopamine。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mediates sodium- and chloride-dependent transport of norepinephrine (also known as noradrenaline), the primary signaling neurotransmitter in the autonomic sympathetic nervous system. Is responsible for norepinephrine re-uptake and clearance from the synaptic cleft, thus playing a crucial role in norepinephrine inactivation and homeostasis (By similarity). Can also mediate sodium- and chloride-dependent transport of dopamine PMID 11093780 ↗ · PMID 2008212 ↗ · PMID 38750358 ↗ · PMID 39048818 ↗ · PMID 8125921 ↗ |
| 分子活性 | (R)-noradrenaline(out) + chloride(out) + Na(+)(out) = (R)-noradrenaline(in) + chloride(in) + Na(+)(in) | 含實驗來源 | 證據與來源(R)-noradrenaline(out) + chloride(out) + Na(+)(out) = (R)-noradrenaline(in) + chloride(in) + Na(+)(in) PMID 11875370 ↗ · PMID 2008212 ↗ · PMID 39048818 ↗ · PMID 8125921 ↗ |
| 分子活性 | dopamine(out) + chloride(out) + Na(+)(out) = dopamine(in) + chloride(in) + Na(+)(in) | 含實驗來源 | 證據與來源dopamine(out) + chloride(out) + Na(+)(out) = dopamine(in) + chloride(in) + Na(+)(in) PMID 11093780 ↗ · PMID 39048818 ↗ |
| 分子活性 | dopamine(out) + chloride(out) + 2 Na(+)(out) = dopamine(in) + chloride(in) + 2 Na(+)(in) | 含實驗來源 | 證據與來源dopamine(out) + chloride(out) + 2 Na(+)(out) = dopamine(in) + chloride(in) + 2 Na(+)(in) PMID 8125921 ↗ |
| 交互作用 | SLC6A2 可呈單體形式，也能在細胞膜形成同源二聚體。二聚體形成主要由膽固醇與脂質介導，且會調節神經傳遞物質運輸活性。來源另記載 SLC6A2 與 PRKCABP 互作，但未說明其互作性質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer. Can form homodimers in the cell membrane; homodimerization is mostly mediated by cholesterol and lipids, and regulates neurotransmitter transport activity. Interacts with PRKCABP PMID 11343649 ↗ · PMID 38750358 ↗ · PMID 39048818 ↗ |
| 細胞定位 | SLC6A2 定位於細胞膜，並記錄於軸突的細胞突起及突觸相關樣本；此來源未描述定位變化的條件或異構型差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell projection, axon; Synapse, synaptosome PMID 11343649 ↗ |
| 疾病關聯 | 體位性不耐症為常染色體顯性疾病，姿勢由臥轉站時可出現頭暈、心悸、疲倦、視線模糊及心搏過速，且沒有低血壓；也可能有昏厥、短暫認知障礙與呼吸困難，血漿 norepinephrine 濃度異常偏高。來源指出此病由影響 SLC6A2 的變異造成，但未列出特定變異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Orthostatic intolerance ORSTI An autosomal dominant disorder characterized by lightheadedness, palpitations, fatigue, blurred vision and tachycardia following postural change from a supine to an upright position, in the absence of hypotension. A syncope with transient cognitive impairment and dyspnea may also occur. Plasma norepinephrine concentration is abnormally high. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 604715 PMID 10684912 ↗ · PMID 11875370 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACGGCCAGAACCAGTCAGCCCGCGCCCTGCCGGCCGCCCC40GCGCCTCCAGCTCTTCCCCGGCCCCGCCCGAACGCCACAC80GGCGGAGCCCAGCCCCAGCCCGCGCCCTAGAGCCTGCCAA120GGCGCCGCCGGTCGGGGGCCGGCAGGGCGCAAGGCACCAG160GGATCCCCTCGCCGCCGGACACAGCCTCGGCGTGCCCCCA200GGACCGGTAAAGTTCCTCTCGCCAGCCGCATCCATGCTTC240TGGCGCGGATGAACCCGCAGGTGCAGCCCGAGAACAACGG280GGCGGACACGGGTCCAGAGCAGCCCCTTCGGGCGCGCAAA320ACTGCGGAGCTGCTGGTGGTGAAGGAGCGCAACGGCGTCC360AGTGCCTGCTGGCGCCCCGCGACGGCGACGCGCAGCCCCG400GGAGACCTGGGGCAAGAAGATCGACTTCCTGCTGTCCGTA440GTCGGCTTCGCAGTGGACCTGGCCAACGTGTGGCGCTTCC480CCTACCTCTGCTACAAGAACGGCGGCGGTGCCTTCTTGAT520CCCGTACACACTGTTCCTTATCATCGCGGGGATGCCCCTG560TTCTACATGGAGCTGGCTCTGGGACAGTACAACCGGGAGG600GGGCTGCCACCGTTTGGAAAATCTGCCCATTCTTCAAAGG640CGTTGGCTATGCTGTCATCCTGATCGCCCTGTACGTTGGC680TTCTACTACAACGTCATCATCGCCTGGTCACTCTACTACC720TCTTCTCCTCCTTCACCCTCAACCTGCCCTGGACCGACTG760TGGCCACACCTGGAACAGCCCCAACTGTACCGACCCCAAG800CTCCTCAATGGCTCCGTGCTTGGCAACCACACCAAGTACT840CCAAGTACAAGTTCACGCCGGCAGCCGAGTTTTATGAGCG880TGGTGTCCTGCACCTTCACGAGAGCAGCGGGATTCATGAC920ATCGGCCTGCCCCAGTGGCAGCTCTTGCTCTGTCTGATGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。