01 / GENE OVERVIEW
基因總覽
SLC6A16 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 solute carrier family 6 member 16。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 19q13.33。
Official symbol
SLC6A16
Gene name
solute carrier family 6 member 16
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13622
UniProt
Q9GZN6
02 / NOMENCLATURE
基因異名與舊稱
Alternative gene names & synonyms
NTT5
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
03 / GENOMIC CONTEXT
染色體位置與基因結構
Chromosome 1919q13.33
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:49,289,638–49,325,215
Gene span
35,578 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000335875 ★ | 49,289,638–49,325,191 | 12 |
| ENST00000454748 | 49,289,765–49,325,191 | 11 |
| ENST00000598828 | 49,290,691–49,325,215 | 5 |
| ENST00000594180 | 49,305,757–49,308,952 | 2 |
| ENST00000597969 | 49,305,885–49,310,146 | 4 |
| ENST00000594917 | 49,306,085–49,310,411 | 4 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
04 / BIOLOGICAL FUNCTION
分子功能與生物學過程
目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用；有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION
Promoter 與基因調控
依所選 TSS 來源，取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算；調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC6A16 ENST00000335875 GRCh38 chr19:49325091-49326191 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTTGTCTAGGCTGGAGTGCAGTGGCAAAAT CTCGGCTCATTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCCAACGATTCTCCTGCCTCAGGCTCCCGAGTAGCTGGG ATTACAGGTGTGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTTTTTTTGACTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCA TCATGTTGGCCAAGCTAGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG GATTACAGGCGTCAGCCACCGCGCCCAGCGCCAAAATTTCTTTTGGAGTAGAAATTATAGTTATTTTAAA TAAAAATGTTATTTTGACACATAATGAATTTTTAAACAATGACTATTTTAGAAATTTATTTTAATATTGA TAGATACAACTCACATAAACATACAACCCATATAAATGTAACTCATAAATTATTGGAGTCCTTAATAATT CTTAAGAGACCGGAAAGTATGAGAACGGATGACCTAAGTAAATCTTTGAGTTTTTAATTCTTGTCTGCAG CCCTAGTAGGCTTCTGAGCTCTCTTAAGGCAACGTCCCTGTCTGCCTTGTTGGACGCATATTTAAGGTTT GGTTTCTAGTAGGCGATCTTTAAGTAAATGCGAAAGGTTTGAAGGCTAGAAGGAATGAATGAGACGATTC TCCCACTTCCTACCCTCTTCTTCCTTACATGAAGTGGAAGCAAAGTGCATGTGCCAGAGAAAGGCCTTGT CTTAGAGCCCCGCCTGAAGCGTGGCATCGTGGGTGTCGGGGTGGGGTGCGGTGGGGAAGGGAGTGGCGCG TGAGCAGTCAGAGGATGTGCACACGTGCGTGCGTGTGGGGAGAGAGCAGGGAGTTGGGGAGGGCGAAGTG GTTACAGTGTTTGCTACAGCTGTAGGGAAAGAGTGAGGGGGCGCGGCGGCGCATGCGCAGAGAATCGGCG GGAAAGGCCGCGCGCCAGGCAGATCGAGGGGTGTCGCCCAAACCGATCTGTCGACGCCTGAAGGGGCCTG AGGAGATTGCTAGGCTTCTCAGCTGGGGCTTCTTCACCCTCATTTTTGTCC
SLC6A16 位於負股。上下游依轉錄方向計算，序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示；負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC6A16_2 ↗ | 19:49,318,709 | 負股 | 49,318,699–49,318,758 |
| SLC6A16_4 ↗ | 19:49,325,191 | 負股 | 49,325,181–49,325,240 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算；該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：736 aa
SLC6A16 的蛋白質長 736 個胺基酸，屬於 sodium:neurotransmitter symporter（SNF）家族的 SLC6A16 subfamily。序列註解預測其具有 12 段跨膜螺旋，兩端皆為細胞質區域，並包含胞外區段。
拓樸區域Cytoplasmic1–138 aa
跨膜區Helical; Name=1139–159 aa
跨膜區Helical; Name=2177–197 aa
跨膜區Helical; Name=3199–219 aa
拓樸區域Extracellular220–263 aa
跨膜區Helical; Name=4264–284 aa
跨膜區Helical; Name=5290–310 aa
跨膜區Helical; Name=6338–358 aa
跨膜區Helical; Name=7383–403 aa
拓樸區域Extracellular404–495 aa
跨膜區Helical; Name=8496–516 aa
跨膜區Helical; Name=9534–554 aa
跨膜區Helical; Name=10568–588 aa
跨膜區Helical; Name=11609–629 aa
跨膜區Helical; Name=12659–679 aa
拓樸區域Cytoplasmic680–736 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY
蛋白質三維結構
自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9GZN6…
08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION
細胞內定位
定位：Membrane
SLC6A16 被註解為膜蛋白，並具有多次跨膜的特徵。
UniProtKB
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX
Contextual Functional Evidence Matrix
功能證據與細胞情境矩陣
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
1 筆功能證據／註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預／量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」，空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | SLC6A16 被註解為膜蛋白，具有多次跨越細胞膜的特徵。 | 資料庫紀錄 |
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀，不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識；未逐篇核對原始方法的紀錄，不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER
核酸與蛋白質序列
完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列，保留非編碼區。
1
AGATCGAGGGGTGTCGCCCAAACCGATCTGTCGACGCCTG4041
AAGGGGCCTGAGGAGATTGCTAGGCTTCTCAGCTGGGGCT8081
TCTTCACCCTCATTTTTGTCCGACTGGCTGGACTGAAGAA120121
CCTGGCAGAAGCCTTGGGGCTAGGGTCTCCTCAGGAAGAT160161
GAACCCTCCCTTGCAGAAGCGGGAGCTGCCCCAGAGAGTC200201
TGTGTGAGATGAAGACAGAGGCCCAGCCTTCGACATCCTT240241
GCTGGCAAACACCTCATGGACTGGCACAGTGATTTCTGAC280281
AGTGTCCCAGGAAGTCAAACGTGGGAAGACAAGGGTTCAT320321
TGACCCGGTCTGCAACATCTTGGACCTCAGAGGCCCAAGT360361
TTCAGCAGCCCGGGTTGCAGAGGCTCAGGCCAGGACCAGT400401
CAGCCCAAGCAAATTTCTGTATTGGAGGCGTTAACTGCCT440441
CAGCCCTGAACCAGAAACCCACGCATGAGAAGGTGCAGAT480481
GACAGAGAAGAAAGAGAGTGAGGTCCTCCTTGCCCGTCCG520521
TTCTGGTCCAGCAAAACTGAGTATATTCTGGCTCAGGTGG560561
GCTTCTCTATGAAGCCATCTTGTCTCTGGCGCTTTGCCTA600601
CCTGTGGCTTAACAGTGGAGGCTGCAGTTTCGCTGCCATC640641
TACATCTTCATGCTGTTCCTGGTCGGGGTTCCTCTTCTCT680681
TCCTGGAGATGGCAGCTGGTCAGAGCATGCGTCAGGGTGG720721
CATGGGTGTATGGAAGATCATTGCCCCCTGGATTGGTGGT760761
GTGGGGTATTCTAGCTTCATGGTGTGCTTCATCCTCGGCC800801
TGTACTTCAATGTGGTCAATTCCTGGATCATCTTCTACAT840841
GAGCCAGTCCTTCCAGTTTCCCGTTCCATGGGAGAAATGT880881
CCCTTAACGATGAACTCTAGTGGCTTTGATCCTGAATGTG920921
AACGGACAACACCCTCCATATACTTCTGGTACCAGCAGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。
13 / DATA PROVENANCE