演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC5A5NIS

solute carrier family 5 member 5

SLC5A5 編碼 Sodium/iodide cotransporter,屬於 sodium:solute symporter 家族,主要將碘離子運入甲狀腺,也可運輸數種其他陰離子。

Homo sapiens19p13.11UniProt Q92911
OFFICIAL SYMBOL
SLC5A5
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q92911
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC5A5 是蛋白質編碼基因,其產物為 Sodium/iodide cotransporter,屬於 sodium:solute symporter(SSF)家族。這是一種多次穿膜蛋白,序列長度為 643 個胺基酸;其跨膜區與細胞外、細胞質區段交錯排列,末端另有一段被註記為無序的區域。這些基本特徵構成其膜蛋白身分,並與其作為鈉離子耦聯溶質運輸蛋白的角色相符。

Official symbol
SLC5A5
Gene name
solute carrier family 5 member 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11040
UniProt
Q92911
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NIS

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.11
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25SLC5A5pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:17,871,939–17,895,174
Gene span
23,236 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000222248 ★17,871,945–17,895,17415
ENST0000114067417,871,939–17,895,17415

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Sodium/iodide cotransporter 的主要功能是在甲狀腺中運輸碘離子。它將細胞外的碘離子與兩個鈉離子一同運入細胞;因此,碘離子運輸與鈉離子跨膜移動相耦聯。此作用使甲狀腺能取得碘離子,來源指出其為該組織中的碘離子運輸蛋白。

這種運輸並不限於碘離子。SLC5A5 也可運輸 chlorate、thiocyanate、nitrate 與 selenocyanate;所列反應同樣是各陰離子與兩個鈉離子由細胞外共同移至細胞內。這些資料支持其底物範圍具有一定廣度,但沒有提供不同底物間的運輸效率或偏好比較,因此不能據此推定它們受到同等程度的運輸。

由於該蛋白屬於 sodium:solute symporter 家族,碘離子與鈉離子共同運輸是理解其分子作用的核心。其功能說明聚焦於物質跨膜方向及共同運輸的離子數量;現有來源未進一步描述能量來源、調控運輸的具體分子機制,或各底物在生理狀態下的相對重要性。就生物學角色而言,來源明確支持它介導碘離子進入甲狀腺,並能運輸上述其他陰離子。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 17871945 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC5A5 ENST00000222248 GRCh38 chr19:17870945-17872045 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGTCAAAGTCCTCCTGGGTCCCCCAGAGAAGGGCCCTGAGATGACAGCTCGTTGGTCCTCATGGAAGCG
TGACCCCCCCAGTAGACTTTCTCCCACACCCAACCTTGGTTTCCTCATCTATATGATAGGGACAAGCCAG
ACTCTACCTCCCTGGTGGTCATGGTCTCCGCTTATTCGGGTTCATAACCTTAAAGGCCCCTCGCACCACC
TCAGTGAGCCATTTATGCCTGGCACAGGGCCAACTCTCAGTGCATATCTGCAAAGGAACCAATGAATGAA
TGAATGAAGTGACAAATGAATAAAGGAATAAATGAATGAGGCACTTATCATGTACCAGGCTTTCGTTACC
ACGTCCCATTTATTCCTCTGAGGCAGGGTCTATTTTATCCTTGTTACAGATGGGGAAACTAAGGCCCAGG
GAGGAGCAAAGTCTTCCCCAAGTATGTACCCACTCAGAACTTGAGCTCTGAATGTCTCCCACCCAGCTTA
GCCCAAGAGCGGGGTTCAGTGATGCCCACCCCCTAAGGCTCTAGAGAAAGGGGGTAGGCCCACATGCCAG
TTTGGGGGTGGTAAAGCCAGGTAAGTTTTCTTTATGGGTCCCCTGAAACCCTGAAAGTGAACCCCAGTCC
TGCATGAAAGTGAGCTCCCCATAGCTCAAGGTATTCAAGCACAATACGGCTTTGAGTGCTGAAGCAGGCT
GTGCAGGCTTGGATAGTGACATGCCCTCTCTGAGCCTCAATTTCCCCACCTGTCAACAGCAGACAGTGAC
AGCTGTGATCAGGGGATCACAGTGCATGGGGATGGGTGGGTGCATGGGGATGGAGGGGCATTTGGGAGCC
CTCCCCGATACCACCCCCTGCAGCCACCCAGATAGCCTGTCCTGGCCTGTCTGTCCCAGTCCAGGGCTGA
AAGGGTGCGGGTCCTGCCCGCCCCTAGGTCTGGAGGCGGAGTCGCGGTGACCCGGGAGCCCAATAAATCT
GCAACCCACAATCACGAGCTGCTCCCGTAAGCCCCAAGGCGACCTCCAGCTGTCAGCGCTGAGCACAGCG
CCCAGGGAGAGGGACAGACAGCCGGCTGCATGGGACAGCGGAACCCAGAGT
SLC5A5 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC5A5_1 ↗19:17,871,945正股17,871,896–17,871,955

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

在蛋白質層級,forskolin 與 thyrotropin 均與 SLC5A5 上調相關;來源未進一步說明此反應的細胞或實驗條件。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:643 aa

1 aa643 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q92911 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Sodium/iodide cotransporter 長 643 個胺基酸,屬於 sodium:solute symporter(SSF)家族。序列註解包含 13 個跨膜區,其中第 2 與第 7 段標示為不連續螺旋;跨膜區之間分布細胞外與細胞質區段。C 端另有一段被註記為無序區域。相關拓樸註解部分依據大鼠同源蛋白推定。

拓樸區域Extracellular1–14 aa
跨膜區Helical; Name=115–31 aa
拓樸區域Cytoplasmic32–56 aa
跨膜區Discontinuously helical; Name=257–80 aa
拓樸區域Extracellular81–84 aa
跨膜區Helical; Name=385–105 aa
拓樸區域Cytoplasmic106–130 aa
跨膜區Helical; Name=4131–157 aa
拓樸區域Extracellular158–163 aa
跨膜區Helical; Name=5164–181 aa
拓樸區域Cytoplasmic182–189 aa
跨膜區Helical; Name=6190–208 aa
拓樸區域Extracellular209–243 aa
跨膜區Discontinuously helical; Name=7244–266 aa
拓樸區域Cytoplasmic267–278 aa
跨膜區Helical; Name=8279–301 aa
拓樸區域Extracellular302–335 aa
跨膜區Helical; Name=9336–363 aa
拓樸區域Cytoplasmic364–386 aa
跨膜區Helical; Name=10387–408 aa
拓樸區域Extracellular409–411 aa
跨膜區Helical; Name=11412–437 aa
拓樸區域Cytoplasmic438–441 aa
跨膜區Helical; Name=12442–465 aa
拓樸區域Extracellular466–525 aa
跨膜區Helical; Name=13526–550 aa
拓樸區域Cytoplasmic551–643 aa
功能區域Disordered623–643 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q92911…

AlphaFold · Q92911

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Cytoplasm

Sodium/iodide cotransporter 位於細胞膜,屬多次穿膜蛋白;來源也記錄其位於細胞質。 現有註解未說明不同條件下的定位變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NISSLC5A5CYSRT1NOTCH2NLC
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源將 SLC5A5 蛋白記錄為單體;未提供其與其他蛋白質形成複合體或直接結合的資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SLC5A5 的變異與甲狀腺激素生成障礙 1(TDH1)相關。此疾病的特徵是甲狀腺無法維持血漿與甲狀腺之間可交換碘的濃度差,並可導致先天性甲狀腺功能低下。來源指出疾病由影響 SLC5A5 的變異所致。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

10 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 10 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Sodium/iodide cotransporter 在甲狀腺介導碘離子運輸,也能運輸 chlorate、thiocyanate、nitrate 與 selenocyanate;來源未比較這些底物的運輸效率或偏好。含實驗來源
證據與來源

Sodium:iodide symporter that mediates the transport of iodide into the thyroid gland. Can also mediate the transport of chlorate, thiocynate, nitrate and selenocynate

PMID 12488351 ↗ · PMID 18372236 ↗ · PMID 18708479 ↗ · PMID 20797386 ↗ · PMID 31310151 ↗ · PMID 32084174 ↗ · PMID 8806637 ↗ · PMID 9329364 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性iodide(out) + 2 Na(+)(out) = iodide(in) + 2 Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

iodide(out) + 2 Na(+)(out) = iodide(in) + 2 Na(+)(in)

PMID 12488351 ↗ · PMID 18372236 ↗ · PMID 18708479 ↗ · PMID 20797386 ↗ · PMID 31310151 ↗ · PMID 32084174 ↗ · PMID 8806637 ↗ · PMID 9329364 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性chlorate(out) + 2 Na(+)(out) = chlorate(in) + 2 Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

chlorate(out) + 2 Na(+)(out) = chlorate(in) + 2 Na(+)(in)

PMID 12488351 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性thiocyanate(out) + 2 Na(+)(out) = thiocyanate(in) + 2 Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

thiocyanate(out) + 2 Na(+)(out) = thiocyanate(in) + 2 Na(+)(in)

PMID 12488351 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性nitrate(out) + 2 Na(+)(out) = nitrate(in) + 2 Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

nitrate(out) + 2 Na(+)(out) = nitrate(in) + 2 Na(+)(in)

PMID 12488351 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性selenocyanate(out) + 2 Na(+)(out) = selenocyanate(in) + 2 Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

selenocyanate(out) + 2 Na(+)(out) = selenocyanate(in) + 2 Na(+)(in)

PMID 12488351 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Monomer含實驗來源
證據與來源

Monomer

PMID 18372236 ↗ · PMID 20797386 ↗ · PMID 31310151 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Sodium/iodide cotransporter 被註記位於細胞膜,屬多次穿膜蛋白;另有細胞質定位記錄,來源未說明其條件或動態。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasm

PMID 18372236 ↗ · PMID 18708479 ↗ · PMID 20797386 ↗ · PMID 31310151 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控在蛋白質層級,forskolin 與 thyrotropin 均與 SLC5A5 上調相關;來源沒有提供其他調控條件或機制。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated by forskolin and thyrotropin (at protein level)

PMID 9329364 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 SLC5A5 的變異與甲狀腺激素生成障礙 1(TDH1)相關。此病使甲狀腺無法維持血漿與甲狀腺間可交換碘的濃度差,並可導致先天性甲狀腺功能低下。含實驗來源
證據與來源

Thyroid dyshormonogenesis 1 TDH1 A disorder characterized by the inability of the thyroid to maintain a concentration difference of readily exchangeable iodine between the plasma and the thyroid gland, leading to congenital hypothyroidism. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 274400

PMID 10487695 ↗ · PMID 9171822 ↗ · PMID 9486973 ↗ · PMID 9745458 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 10 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000222248 · 3,604 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTCCCGTAAGCCCCAAGGCGACCTCCAGCTGTCAGCGCT40
41GAGCACAGCGCCCAGGGAGAGGGACAGACAGCCGGCTGCA80
81TGGGACAGCGGAACCCAGAGTGAGAGGGGAGGTGGCAGGA120
121CAGACAGACAGCAGGGGCGGACGCAGAGACAGACAGCGGG160
161GACAGGGAGGCCGACACGGACATCGACAGCCCATAGATTC200
201CTAACCCAGGGAGCCCCGGCCCCTCTCGCCGCTTCCCACC240
241CCAGACGGAGCGGGGACAGGCTGCCGAGCATCCTCCCACC280
281CGCCCTCCCCGTCCTGCCTCCTCGGCCCCTGCCAGCTTCC320
321CCCGCTTGAGCACGCAGGGCGTCCGAGGACGCGCTGGGCC360
361TCCGCACCCGCCCTCATGGAGGCCGTGGAGACCGGGGAAC400
401GGCCCACCTTCGGAGCCTGGGACTACGGGGTCTTTGCCCT440
441CATGCTCCTGGTGTCCACTGGCATCGGGCTGTGGGTCGGG480
481CTGGCTCGGGGCGGGCAGCGCAGCGCTGAGGACTTCTTCA520
521CCGGGGGCCGGCGCCTGGCGGCCCTGCCCGTGGGCCTGTC560
561GCTGTCTGCCAGCTTCATGTCGGCCGTGCAGGTGCTGGGC600
601GTGCCGTCGGAGGCCTATCGCTATGGCCTCAAGTTCCTCT640
641GGATGTGCCTGGGCCAGCTTCTGAACTCGGTCCTCACCGC680
681CCTGCTCTTCATGCCCGTCTTCTACCGCCTGGGCCTCACC720
721AGCACCTACGAGTACCTGGAGATGCGCTTCAGCCGCGCAG760
761TGCGGCTCTGCGGGACTTTGCAGTACATTGTAGCCACGAT800
801GCTGTACACCGGCATCGTAATCTACGCACCGGCCCTCATC840
841CTGAACCAAGTGACCGGGCTGGACATCTGGGCGTCGCTCC880
881TGTCCACCGGAATTATCTGCACCTTCTACACGGCTGTGGG920
921CGGCATGAAGGCTGTGGTCTGGACTGATGTGTTCCAGGTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。