演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC4A8NBC3

solute carrier family 4 member 8

SLC4A8 編碼 anion exchanger 家族的多次穿膜蛋白,參與鈉離子與碳酸氫根依賴的氯離子交換,並與神經元酸鹼調節及腎臟鈉再吸收相關。

Homo sapiens12q13.13UniProt Q2Y0W8
OFFICIAL SYMBOL
SLC4A8
CHROMOSOME
12
UNIPROT
Q2Y0W8
PDB / ALPHAFOLD
5JHO
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC4A8(solute carrier family 4 member 8)是蛋白質編碼基因,產物屬於 anion exchanger(TC 2.A.31)家族。此蛋白質為多次穿膜蛋白,長度為 1,093 個胺基酸;其序列包含多段跨膜螺旋,並交錯排列於細胞外與細胞質側的區域。來源註記的 VTVLP 基序與二聚化有關,且 N 端部分區域被預測為無序。其基本角色是作為膜上的離子交換蛋白;具體運輸方向與生理功能見下方說明。

Official symbol
SLC4A8
Gene name
solute carrier family 4 member 8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11034
UniProt
Q2Y0W8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NBC3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q13.13
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegSLC4A8pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr12:51,391,317–51,515,763
Gene span
124,447 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000453097 ★51,424,831–51,515,76325
ENST0000053522551,391,317–51,474,57515
ENST0000035865751,391,317–51,515,76325
ENST0000087785751,424,735–51,515,76326
ENST0000092242151,424,735–51,515,76324
ENST0000100992951,424,735–51,480,72117
ENST0000100993051,424,735–51,480,60116
ENST0000111635351,424,735–51,474,56815
ENST0000114185451,424,735–51,515,76325
ENST0000051435351,425,117–51,480,61017

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC4A8 產物可介導電中性的鈉離子與碳酸氫根依賴性氯離子交換。所述交換的化學計量比為 Na(+):HCO3(-) = 2:1:兩個細胞外的碳酸氫根與一個細胞內的氯離子,伴隨一個細胞外鈉離子,交換為兩個細胞內碳酸氫根、一個細胞外氯離子及一個細胞內鈉離子。此描述指出交換過程不造成淨電荷轉移。

在神經元中,SLC4A8 被認為對 pH 調節具有主要作用;此項功能註記為依相似性推定。由於運輸反應涉及碳酸氫根與氯離子的跨膜交換,該交換活性與神經元酸鹼平衡調節相關,但來源未提供更細部的分子調控步驟或條件。

在腎臟方面,來源指出 SLC4A8 介導腎皮質集合管中的鈉再吸收,這項功能同樣是依相似性推定。現有資料未進一步說明其在此組織中的運輸調控方式,也未提供不同生理狀態下功能變化的資訊。

因此,來源所支持的功能重點包括特定化學計量的電中性離子交換,以及其與神經元 pH 調節和腎皮質集合管鈉再吸收的關聯。這些功能註記的證據性質不同:交換反應有實驗文獻支持,而兩項生理角色為依相似性推定,不宜視為同等程度的直接驗證。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 51424831 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC4A8 ENST00000453097 GRCh38 chr12:51423831-51424931 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTACAAATACAAAAAAATCAGCCGGGCGTGG
TGGTGGGGACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACTGGATAGGCGGA
GGTTGCAGTGATCCAAGAACACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTTCGTCTCCAAA
AAAAAAAAAAAAACAAAAAAAACAACAAAAAAAAAACAAAAAAAACCCAAAAGGTACCTTTCTTTTTCTT
GAGGAGAGAGGGTTGCTTCGATTTTAGCCAGCCTCTCTTTTCTTATAAATCCAAATCAAATTTAATGCAT
TATTCATGATATTCTAACCTTGTGTTAAGTCAGTAGTTCTGTTGCTAAATAATAGTTTGCCTTAGATCAT
TTCCTGGAAAAGTTCGAAGCCTTTTTGTGGAATTGCTTCAACAGTCATCCTTAGCTCGACCCTGTCCGTG
TGTTTTGCTTCTGACTTGAGACTCAAGAAGAAGACCTAAGTCATAGTGAGACTGTGAGGGAGCCTGACAC
TGCCTGCCTTCTTCAATTTAATGCTCTTTAATCTGGCCATTAGCTCAAGGAAAAACAATTAATTTTAGAA
GGCCCTCTCCCCTCATCCGCAATTACCTCCTCCTGCAATCGCGAAGGATGTTTGCCCGGAATTTAAACAT
CATCTCCCAAGGAATGAAATCAGAATAGGCAAAACCGACACTTTCCCAGTTTTCAAGGGTCAGGTGCAGC
TGCAAATAGAAGCAGAGATTTTCTAGCAAGCAGTTGGAAGGACCTTCACGCCCAGAGGCCCCTGAAGGGA
GGGAGGCGGTTTCCAAGGCAACCGGGCCCGGGAGCGGTTGGCTCCCCGGCTCCTCCCCCTCCCCGCGGTA
GCCCAGGGTACCGCCGGACAGCGTCCTCCCGTGCTCCGCGCCCTGATTGGCTGCGCAGGCCTCTCGCTGA
TTGGTTGCGGCGGATGCCTCGCGGGCCGGTGGCTATGGAGGCGGCGGCGGTTGATGGTTGACCGTTGGCT
CCGGGGTGGGGGTCGCCGTTCGAGTGATCTGCTCAGACCCGACCAGAGGGC
SLC4A8 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC4A8_2 ↗12:51,391,074正股51,391,025–51,391,084
SLC4A8_4 ↗12:51,391,317正股51,391,268–51,391,327
SLC4A8_1 ↗12:51,424,831正股51,424,782–51,424,841
SLC4A8_3 ↗12:51,425,154正股51,425,105–51,425,164

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1093 aa

1 aa1093 aa功能區域基序跨膜區拓樸區域
依 Q2Y0W8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC4A8 蛋白長 1,093 個胺基酸,屬於 anion exchanger(TC 2.A.31)家族。序列註解包含多段跨膜螺旋,以及位於膜兩側的區域;前 25 個胺基酸與 55–95 位胺基酸區段被註記為無序。340–344 位的 VTVLP 基序與二聚化有關。

拓樸區域Extracellular1–478 aa
跨膜區Helical479–499 aa
拓樸區域Cytoplasmic500–523 aa
跨膜區Helical524–544 aa
拓樸區域Extracellular545–565 aa
跨膜區Helical566–586 aa
拓樸區域Cytoplasmic587–595 aa
跨膜區Helical596–616 aa
拓樸區域Extracellular617–687 aa
跨膜區Helical688–708 aa
拓樸區域Cytoplasmic709–731 aa
跨膜區Helical732–752 aa
拓樸區域Extracellular753–778 aa
跨膜區Helical779–799 aa
拓樸區域Cytoplasmic800–824 aa
跨膜區Helical825–845 aa
拓樸區域Extracellular846–881 aa
跨膜區Helical882–902 aa
拓樸區域Cytoplasmic903–904 aa
跨膜區Helical905–925 aa
拓樸區域Extracellular926–962 aa
跨膜區Helical963–983 aa
拓樸區域Cytoplasmic984–1093 aa
功能區域Disordered1–25 aa
功能區域Disordered55–95 aa
基序VTVLP; mediates dimerization340–344 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5JHO…

PDB · 5JHO

X-ray · 2.80 A · A/B=54-397

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Apical cell membrane;Basolateral cell membrane;Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, synaptic vesicle membrane;Cell membrane

SLC4A8 被註記位於細胞膜的頂端或基底外側,也可見於細胞質囊泡、分泌囊泡及突觸囊泡膜。 Isoform 1、3、4 與 5 均被註記為細胞膜上的多次穿膜蛋白;來源未提供這些異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NBC3SLC4A8
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SLC4A8 被註記可形成同源二聚體。資料支持其二聚體狀態,但未指出其他結合夥伴或更大型複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

8 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 8 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC4A8 介導電中性的鈉離子與碳酸氫根依賴性氯離子交換,Na(+):HCO3(-) 化學計量比為 2:1。它依相似性被認為在神經元 pH 調節中具有主要作用,並依相似性介導腎皮質集合管的鈉再吸收。含實驗來源
證據與來源

Mediates electroneutral sodium- and carbonate-dependent chloride-HCO3(-) exchange with a Na(+):HCO3(-) stoichiometry of 2:1. Plays a major role in pH regulation in neurons (By similarity). Mediates sodium reabsorption in the renal cortical collecting ducts (By similarity)

PMID 18577713 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性2 hydrogencarbonate(out) + chloride(in) + Na(+)(out) = 2 hydrogencarbonate(in) + chloride(out) + Na(+)(in)含實驗來源
證據與來源

2 hydrogencarbonate(out) + chloride(in) + Na(+)(out) = 2 hydrogencarbonate(in) + chloride(out) + Na(+)(in)

PMID 18577713 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homodimer推論支持
證據與來源

Homodimer

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC4A8 被註記為多次穿膜蛋白,定位於細胞膜的頂端與基底外側,也位於細胞質囊泡、分泌囊泡及突觸囊泡的膜上。含實驗來源
證據與來源

Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle, synaptic vesicle membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 17715183 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform 1 被註記為位於細胞膜的多次穿膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Isoform 1; Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 18577713 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform 3 被註記為位於細胞膜的多次穿膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Isoform 3; Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 18577713 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform 4 被註記為位於細胞膜的多次穿膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Isoform 4; Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 18577713 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform 5 被註記為位於細胞膜的多次穿膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Isoform 5; Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 18577713 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 8 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000453097 · 11,764 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCGGGCCGGTGGCTATGGAGGCGGCGGCGGTTGATGGTTG40
41ACCGTTGGCTCCGGGGTGGGGGTCGCCGTTCGAGTGATCT80
81GCTCAGACCCGACCAGAGGGCGCGGGCTGCTGATGCTTGG120
121CTTGGAGCCCGTGGGGGAGACCTAGTTCGGCTCCGCCATG160
161CCGGCCGCCGGGAGTAACGAGCCGGACGGCGTCCTCAGCT200
201ATCAGAGACCAGATGAAGAAGCTGTGGTGGATCAGGGTGG240
241GACCAGTACAATTCTCAACATTCACTATGAAAAAGAAGAG280
281CTGGAAGGTCACAGAACTCTGTATGTGGGAGTTCGGATGC320
321CGCTTGGCCGGCAGAGCCATCGGCATCACCGCACTCATGG360
361CCAGAAGCACCGGAGACGAGGGCGGGGCAAAGGAGCCAGC400
401CAGGGGGAGGAAGGCCTGGAAGCCCTGGCCCACGACACAC440
441CATCTCAGCGTGTTCAGTTCATTCTTGGCACCGAGGAAGA480
481TGAAGAGCATGTGCCTCATGAGCTGTTTACAGAGCTGGAT520
521GAGATCTGTATGAAAGAGGGAGAAGATGCTGAGTGGAAGG560
561AAACAGCCAGGTGGCTGAAGTTTGAAGAAGATGTTGAAGA600
601TGGGGGAGAACGCTGGAGCAAGCCTTATGTGGCAACCCTT640
641TCATTGCACAGCCTGTTTGAGCTAAGGAGCTGCCTTATTA680
681ATGGAACAGTCCTCCTGGATATGCATGCAAATAGCATAGA720
721AGAAATTTCAGACCTGATCCTGGATCAGCAAGAACTGTCC760
761AGTGACCTGAATGACAGCATGAGGGTTAAAGTGCGGGAAG800
801CCCTTCTCAAAAAGCATCATCATCAGAATGAAAAGAAGAG840
841AAACAACCTCATTCCCATTGTTCGCTCCTTTGCTGAGGTT880
881GGCAAGAAGCAGTCTGATCCTCATTTGATGGATAAACATG920
921GTCAAACCGTGTCTCCTCAGTCTGTTCCAACTACAAATCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。