基因總覽
SLC4A7（solute carrier family 4 member 7）是蛋白質編碼基因，產物屬於 anion exchanger（TC 2.A.31）家族。其蛋白質為多次跨膜膜蛋白，具有大型胞外區段及多段跨膜螺旋，並帶有胞質端區域。蛋白質末端含有與細胞膜定位及運輸活性相關的區域，也具有 PDZ-binding motif。這些序列與拓撲特徵構成其膜運輸蛋白的基本架構；具體運輸作用與生物學角色見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000454389 ★ | 27,372,723–27,484,384 | 26 |
| ENST00000419036 | 27,372,723–27,424,086 | 18 |
| ENST00000295736 | 27,372,723–27,456,754 | 25 |
| ENST00000428386 | 27,372,723–27,456,754 | 24 |
| ENST00000437179 | 27,372,723–27,484,427 | 24 |
| ENST00000440156 | 27,372,723–27,484,451 | 26 |
| ENST00000446700 | 27,372,723–27,484,427 | 25 |
| ENST00000455077 | 27,372,723–27,484,427 | 25 |
| ENST00000445684 | 27,372,723–27,484,451 | 25 |
| ENST00000863047 | 27,372,723–27,484,451 | 25 |
| ENST00000935546 | 27,372,723–27,484,427 | 25 |
| ENST00000935547 | 27,372,723–27,484,427 | 25 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC4A7 的產物是電中性的 Na⁺／HCO₃⁻共同運輸蛋白，運輸化學計量比為 Na⁺：HCO₃⁻＝1：1。其運輸方向可表述為 Na⁺與 HCO₃⁻由細胞外進入細胞內。此運輸可協助細胞在酸負荷後恢復 pH，也參與穩態 pH 的調節；後者在十二指腸與血管平滑肌細胞中的作用是依相似性推定。
在巨噬細胞中，SLC4A7 介導 HCO₃⁻輸入細胞質，對吞噬作用期間的酸化具有重要作用。這項輸入有助於淨酸排出，並維持吞噬期間的細胞質 pH。來源指出其為巨噬細胞酸化的重要因子，但未將此作用概括為所有細胞類型皆相同的機制。
SLC4A7 也為細胞提供 HCO₃⁻，供嘌呤與嘧啶從頭合成使用；在增殖細胞中，它是 mTORC1 訊號下游從頭核苷酸合成的重要介質。因此，SLC4A7 的功能不僅涉及離子與酸鹼平衡，也連結可用的細胞內 HCO₃⁻與核苷酸生成。上述內容分別涵蓋酸負荷後 pH 恢復、特定細胞中的 pH 調控，以及增殖相關的核苷酸合成；來源並未指出各作用間的直接因果關係。
Promoter 與基因調控
>SLC4A7 ENST00000454389 GRCh38 chr3:27484284-27485384 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAAGGGATATTTGAGAGACGGCCTACAGGGTGGACTCAATAATGTGGCAGCTGGCCGGGTGTGGTGGCTC ATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCTGGTGGATCACCTTAGCTCAGGAGTTCGAGACCAG CCTAACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAGTTGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGTC TGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATAGCTTGAACCCAGGCAGCGGAGGTTGCAGTGA GCCGAGATCATGCCATTGCACTCCAACCTGGGCTGGTGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAGTGGCAGCTGTCGTGGTGCTCAGTGGGCGAGCAAGCACAGGAGGACACCTGGTCAAGTGTACC CCATCTTTCACGGTCCCTGAGTTGGGGTTCGTGCCTACTGGATTGACAGAAAAGAAACTTCCAGGAGTCG TGAAGACTCGTTAGTTGCTTCGGAGGGTTATCCTGGGCGTCCTTGACAGAGGTGGCGTCCTCCTTCCCTG CAGCCTCTAAAGAATGTAGTTAGGAGCCAAGGGAGGTGGTGACCCCCCACCCCATTGAGAACGTCAGGGG AGCTTCCGACTTGAAAAACTAGTTAGACGCTCAGCTTCGGTCAATTAAGCTTATACAAAGAGGGGCGGTG CGTCCTGAGGAGGTGGCACGGGGGAGGCGAGCGGAAGTCCGCCAGCCGCCGATTGGCTGGGACAAATGTC CGTCCCGCCTCCCTCCCGCCCCATCTCCCGGTGGCCTAGCGGCGCGGCCCGCGGGCGCGCTGAGGAGGCT GGCGGTGCCAGACTGGCAGGGGGCGTGACCCGAGGAGGCGGGGCGGGGGGGCGTGTCTTGCCTGGCCCCG GCGCCGGGCTCGTCACGGTTTGCGGCTCCGCCCCCGAACCCCTCCTCCTACGCGGCTCTCCTCCTTCCCG CTCGGTCCGCCGGTTCGCTCAGTTCTAGCTTCAGGTTCCACGCCGCGGCCTCGCTCTCCTACTAAAGCCA GCCCAGCAGTCGCAGCGCGCACACGCACGCCCCGCGTCTCCCGCGCCCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC4A7_2 ↗ | 3:27,456,751 | 負股 | 27,456,741–27,456,800 |
| SLC4A7_1 ↗ | 3:27,484,384 | 負股 | 27,484,374–27,484,433 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_9DWHD · enhancer · 27479857–27480206 · regulatory
ENSR3_C4PM4 · enhancer · 27482482–27484336 · regulatory
ENSR3_B7G9C · promoter · 27484337–27484886 · regulatory
ENSR3_58GJP6 · CTCF_binding_site · 27484516–27484537 · regulatory
ENSR3_9DWK5 · promoter · 27485879–27486245 · regulatory
· motif · 27482518–27482540 · motif
· motif · 27482518–27482540 · motif
· motif · 27483207–27483220 · motif
· motif · 27483209–27483220 · motif
· motif · 27483762–27483774 · motif
· motif · 27483764–27483771 · motif
· motif · 27483796–27483812 · motif
· motif · 27484252–27484268 · motif
· motif · 27484252–27484268 · motif
· motif · 27484427–27484437 · motif
· motif · 27484440–27484450 · motif
· motif · 27484447–27484462 · motif
· motif · 27484448–27484464 · motif
· motif · 27484488–27484498 · motif
· motif · 27484496–27484506 · motif
· motif · 27484501–27484511 · motif
· motif · 27484516–27484526 · motif
· motif · 27484518–27484534 · motif
· motif · 27484603–27484613 · motif
· motif · 27484646–27484655 · motif
· motif · 27484684–27484694 · motif
· motif · 27484772–27484785 · motif
· motif · 27484779–27484786 · motif
· motif · 27485014–27485027 · motif
· motif · 27485014–27485027 · motif
生長因子刺激時，mTORC1 活化可透過 RPS6KA1 依賴的 EIF4B 磷酸化，促進 SLC4A7 mRNA 的翻譯，亦即在蛋白質生成層級調節其產物。此外，SLC4A7 會在巨噬細胞分化時受到強烈誘導。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1214 aa
SLC4A7 蛋白質長 1214 個胺基酸，屬於 anion exchanger 家族。其序列註解包含多段跨膜螺旋，並由胞外與胞質區段交替構成膜蛋白拓撲。蛋白質末端區域被註記為細胞膜定位與運輸活性所必需，另有 CA2-binding 區域及 PDZ-binding motif；部分區段則預測為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC4A7 定位於細胞膜，可見於頂端或基底外側膜；依相似性資料，亦位於耳蝸外毛細胞的靜纖毛及內毛細胞的側膜。 Isoform 6 另有細胞膜定位註記。 來源未指出不同膜區定位的條件或變化機制。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell projection, stereocilium。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 22 個夥伴
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CIAO1O76071 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- KRTAP4-5Q9BYR2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAST1Q9Y2H9 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NHERF2Q15599 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNX27Q96L92 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- WHRNQ9P202 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
SLC4A7 可透過 NHERF1/EBP50 與 CFTR 互作，並與 USH1C 互作；來源未將這些關係描述為同一複合體。另有資料指出 SLC4A7 與 ATP6V1B1、NHERF1/EBP50 形成複合體。它也會以 pH 依賴方式與 CA2/carbonic anhydrase 2 互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC4A7 是電中性的 Na⁺與 HCO₃⁻共同運輸蛋白，兩者以 1：1 的比例運送。其依賴 Na⁺的 HCO₃⁻運輸有助於酸負荷後恢復 pH，並依相似性資料參與十二指腸及血管平滑肌細胞的穩態 pH 調節。在巨噬細胞吞噬期間，它將 HCO₃⁻帶入細胞質，協助淨酸排出並維持細胞質 pH；亦提供嘌呤與嘧啶從頭合成所需的 HCO₃⁻，並在增殖細胞中介導 mTORC1 下游的從頭核苷酸合成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Electroneutral sodium- and bicarbonate-dependent cotransporter with a Na(+):HCO3(-) 1:1 stoichiometry. Mediates the sodium-dependent bicarbonate transport important for pH recovery after acid load as well as for regulation of steady-state pH in the duodenum and vascular smooth muscle cells (By similarity). Plays a key role in macrophage acidification, mediating bicarbonate import into the cytoplasm which is crucial for net acid extrusion and maintenance of cytoplasmic pH during phagocytosis. Provides cellular bicarbonate for de novo purine and pyrimidine synthesis and is a key mediator of de novo nucleotide synthesis downstream of mTORC1 signaling in proliferating cells PMID 10347222 ↗ · PMID 12403779 ↗ · PMID 14578046 ↗ · PMID 14736710 ↗ · PMID 29779931 ↗ · PMID 35772404 ↗ |
| 功能 | 在巨噬細胞中，SLC4A7 介導 HCO₃⁻輸入細胞質，對吞噬期間的酸化具有重要作用。這項輸入有助於淨酸排出，並維持吞噬過程中的細胞質 pH。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays a key role in macrophage acidification, mediating bicarbonate import into the cytoplasm which is crucial for net acid extrusion and maintenance of cytoplasmic pH during phagocytosis PMID 29779931 ↗ |
| 分子活性 | hydrogencarbonate(in) + Na(+)(in) = hydrogencarbonate(out) + Na(+)(out) | 含實驗來源 | 證據與來源hydrogencarbonate(in) + Na(+)(in) = hydrogencarbonate(out) + Na(+)(out) PMID 10347222 ↗ · PMID 12403779 ↗ · PMID 14578046 ↗ · PMID 14736710 ↗ · PMID 29779931 ↗ · PMID 35772404 ↗ |
| 交互作用 | SLC4A7 透過 NHERF1/EBP50 與 CFTR 互作，也與 USH1C 互作。它與 ATP6V1B1、NHERF1/EBP50 形成複合體；此外，SLC4A7 與 CA2/carbonic anhydrase 2 的互作具有 pH 依賴性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with CFTR through NHERF1/EBP50. Interacts with USH1C. Forms a complex with ATP6V1B1 and NHERF1/EBP50. Interacts in a pH dependent-manner with CA2/carbonic anhydrase 2 PMID 12403779 ↗ · PMID 12444018 ↗ · PMID 14736710 ↗ · PMID 16301216 ↗ |
| 細胞定位 | SLC4A7 被註記位於基底外側細胞膜、頂端細胞膜及細胞膜，並位於細胞突起中的靜纖毛。依相似性資料，它定位於耳蝸外毛細胞的靜纖毛，以及耳蝸內毛細胞的側膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein; Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell projection, stereocilium; Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localizes to the stereocilia of cochlear outer hair cells and to the lateral membrane of cochlear inner hair cells (By similarity) PMID 14578046 ↗ · PMID 29779931 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 6 被註記為定位於細胞膜，屬多次跨膜蛋白。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 生長因子刺激時，mTORC1 活化可透過 RPS6KA1 依賴的 EIF4B 磷酸化，促進 SLC4A7 mRNA 翻譯，調節蛋白質生成。此外，SLC4A7 在巨噬細胞分化時會受到強烈誘導。 | 含實驗來源 | 證據與來源In response to growth factor stimuli, mTORC1 activation, through the RPS6KA1-dependent EIF4B phosphorylation, stimulates SLC4A7 mRNA translation (at protein level). Strongly induced upon macrophage differentiation PMID 29779931 ↗ · PMID 35772404 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTCTAGCTTCAGGTTCCACGCCGCGGCCTCGCTCTCCT40ACTAAAGCCAGCCCAGCAGTCGCAGCGCGCACACGCACGC80CCCGCGTCTCCCGCGCCCGGCGCCCGGCTCTCCCCACGCG120CGCACACCTCGCGCACGGACGCACCCACGTTTGTCCTCGC160GCGCCGGGGGCTCGGCGGCGGCGGCAGGGGCAGCGGCAGA200AGCAGGCAGACCGCGCGGGGCAGTACCGTAGCGGCCGTCA240CGGGCTGGCCGGCCGGCCATGGAGGCTGATGGGGCCGGCG280AGCAGATGAGACCGCTACTCACCCGGGTAACGAGCAGGGG320TCCTGATGAAGAAGCTGTTGTGGATCTTGGCAAAACTAGC360TCAACTGTGAACACCAAGTTTGAAAAAGAAGAACTAGAAA400GTCATAGAGCTGTATATATTGGTGTTCACGTCCCGTTTAG440TAAAGAGAGTCGTCGGCGTCATAGGCATCGCGGACACAAA480CATCACCACCGGAGAAGAAAAGATAAAGAATCAGATAAAG520AAGATGGACGGGAATCTCCTTCTTATGATACACCATCCCA560GAGAGTTCAGTTTATCCTTGGTACTGAAGATGATGATGAA600GAACATATTCCCCATGATCTCTTCACGGAAATGGATGAAC640TGTGTTACAGAGATGGAGAAGAATATGAATGGAAAGAAAC680TGCTAGATGGCTGAAATTTGAAGAGGATGTTGAAGATGGC720GGTGACCGATGGAGTAAACCTTATGTGGCAACTCTCTCTT760TGCACAGTCTTTTTGAACTAAGGAGTTGCATCCTCAATGG800AACAGTCATGCTGGATATGAGAGCAAGCACTCTAGATGAA840ATAGCAGATATGGTATTAGACAACATGATAGCTTCTGGCC880AATTAGACGAGTCCATACGAGAGAATGTCAGAGAAGCTCT920TCTGAAGAGACATCATCATCAGAATGAGAAAAGATTCACC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。