基因總覽
SLC4A1AP 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 solute carrier family 4 member 1 adaptor protein。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 2p23.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000326019 ★ | 27,663,889–27,694,969 | 14 |
| ENST00000696012 | 27,663,426–27,694,937 | 13 |
| ENST00000696015 | 27,663,426–27,695,756 | 13 |
| ENST00000901631 | 27,663,426–27,695,756 | 14 |
| ENST00000901632 | 27,663,426–27,695,756 | 13 |
| ENST00000912953 | 27,663,426–27,695,756 | 14 |
| ENST00000953679 | 27,663,426–27,695,756 | 14 |
| ENST00001042041 | 27,663,426–27,695,756 | 12 |
| ENST00001042042 | 27,663,426–27,695,636 | 13 |
| ENST00001145325 | 27,663,426–27,695,756 | 14 |
| ENST00000618046 | 27,663,889–27,695,756 | 14 |
| ENST00000613517 | 27,663,889–27,695,756 | 14 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SLC4A1AP ENST00000326019 GRCh38 chr2:27662889-27663989 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCCACCTCAGCCTCTGGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCGCACCATCAAACCTGGATTTTTTCTTTTTTTT TTTTTTTTTTGGCGAGACAGGGTCTCGCCATGTTGCCCAGCCTCCTCTGGAACTCCTGGGCTCAAGCAAT CCTCCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGGTCTGGCTGGCCTTTATTGT TTGATTCAATTCTTCCAACAACCCTATGAGGCTAATAATCTTATCCCCATTTTTCAGAGTGAGGGCTGAG GCCTAGTGTCTTGCCCAATGTCACAAATGGCGAGGTCAAAAATCGACAGTCTCCAGAGTCTGCTCTCTTA ACCACTTAACTATTCTGCCTTAATAATTTCAGAAAAAAAATAAATGAATGAACGAAATAACAAAAAAGTC GCCCTCTTCCCTTACTTTACCGAAAGGAGCACGAAGAACAGGCACGGAGCCCAAGGAATGCCCAAGTCCC TCCAGGGGTTTCCTCGGTCACGGTCCGCCGGCGCAGGCGCCAATCACAGGGTCCTGAGGTCGCCTGACGT TCAGGGCAGCCGGAAGACGGGGAGGTCTGGACCTGAACCGAGACAAGGAGGTACCACACTATTCACTGCT GCGTCGCAGAGCGGGCTGGGCGGCTGTCTGGACCTCGAGAGGCCTGAGGCAAGGATCGCGTCAGACCCCG AAAGCTGGTTTGTTGATTAGTGATCTAAGACCGCCGGAAGCGCTTCTTCTCAATCAAGCTATGCAACAGG AAGTCATTACGATCCCGTTGTAACCTCTAAATATGTCCCCGTTCTGCACAGCATCCCGATAACCGTTTTG TTTTTCTCATATTATGACCTTCTCATGTTAGCACCACTTCGCAACGCTCCAGGTCGTGAAGGAGCAACTT CACCATCGCCGCCTACAGACGCCACTGGGAGCTTGGGAGAGTGGGACGTGGACAGGAACGTAAAGACCGA AGGGTGGGTTTCGAAGGAGCGGATTTCGAAGTTGCACCGGTTGAGGATGGCTGACATTCTCTCTCAGTCA GAGACCCTGGCGTCGCAAGACCTCAGTGGGGACTTCAAGAAGCCAGCTCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC4A1AP_2 ↗ | 2:27,663,471 | 正股 | 27,663,422–27,663,481 |
| SLC4A1AP_1 ↗ | 2:27,663,889 | 正股 | 27,663,840–27,663,899 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_9DZGF · promoter · 27663082–27663436 · regulatory
ENSR2_8RXWZ · enhancer · 27663437–27663603 · regulatory
ENSR2_B7H8B · promoter · 27663604–27664228 · regulatory
ENSR2_58HNG7 · CTCF_binding_site · 27663801–27663822 · regulatory
ENSR2_58HNHX · CTCF_binding_site · 27664176–27664197 · regulatory
· motif · 27659874–27659882 · motif
· motif · 27661187–27661201 · motif
· motif · 27661187–27661201 · motif
· motif · 27661211–27661222 · motif
· motif · 27661569–27661580 · motif
· motif · 27663394–27663410 · motif
· motif · 27663426–27663441 · motif
· motif · 27663616–27663633 · motif
· motif · 27663621–27663630 · motif
· motif · 27663652–27663663 · motif
· motif · 27663654–27663663 · motif
· motif · 27663803–27663819 · motif
· motif · 27664178–27664194 · motif
· motif · 27664669–27664680 · motif
· motif · 27665156–27665165 · motif
· motif · 27665156–27665165 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：742 aa
solute carrier family 4 member 1 adaptor protein 長 742 個胺基酸，含有位於第 135–195 位胺基酸的 FHA 結構域。序列註解另標示三段無序區，分別位於第 1–112、254–282 及 565–742 位胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC4A1AP 主要位於細胞核，少量存在於細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- ILKQ13418 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- TCF4P15884 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | SLC4A1AP 可在細胞核與細胞質中找到，定位以細胞核為主；細胞質中僅有少量分布。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GGATTTCGAAGTTGCACCGGTTGAGGATGGCTGACATTCT40CTCTCAGTCAGAGACCCTGGCGTCGCAAGACCTCAGTGGG80GACTTCAAGAAGCCAGCTCTGCCGGTGTCCCCAGCGGCGC120GGAGTAAGGCCCCGGCCAGCAGTTCTTCAAACCCTGAGGA160GGTACAGAAGGAAGGGCCCACTGCGTTGCAGGACTCCAAT200TCTGGGGAGCCCGACATCCCTCCTCCTCAGCCGGACTGCG240GTGATTTTAGGAGTCTACAGGAGGAGCAGTCGCGCCCCCC280GACAGCGGTTTCTTCCCCTGGCGGTCCAGCCCGGGCTCCC320CCCTACCAAGAGCCTCCATGGGGTGGCCCTGCCACAGCCC360CCTACAGCTTAGAGACCCTGAAGGGCGGCACTATCCTTGG400CACCCGTAGCTTGAAAGGGACGAGTTACTGCCTTTTCGGG440AGGCTGTCTGGCTGCGACGTGTGCCTGGAGCACCCTTCGG480TGTCTCGGTACCACGCAGTGCTGCAGCACAGGGCGTCCGG520CCCTGACGGAGAATGCGACAGCAACGGGCCGGGCTTCTAC560CTCTACGATCTGGGAAGCACCCATGGCACTTTTCTCAACA600AAACTCGCATCCCACCTCGCACCTACTGTCGAGTCCACGT640TGGGCATGTTGTTCGCTTTGGAGGCAGCACCCGGCTCTTT680ATCCTGCAGGGACCAGAGGAAGACCGAGAGGCAGAATCCG720AGTTAACAGTAACACAGTTGAAGGAATTGCGCAAGCAGCA760GCAAATATTGTTGGAGAAGAAGATGCTAGGAGAAGACTCA800GATGAAGAAGAGGAAATGGATACCTCTGAAAGGAAGATAA840ATGCTGGTAGCCAAGATGATGAGATGGGTTGCACCTGGGG880AATGGGAGAAGATGCAGTAGAGGATGATGCTGAAGAGAAC920CCTATTGTCTTAGAGTTTCAGCAGGAAAGGGAGGCCTTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。