基因總覽
SLC44A4 是蛋白質編碼基因，產物屬於 CTL（choline transporter-like）家族，蛋白質長 710 個胺基酸，具有多個跨膜螺旋，並分布於細胞質側與細胞外側的區段交替排列。其轉運功能涉及兩類底物：膽鹼，以及硫胺素焦磷酸（thiamine pyrophosphate）。這種雙重底物相關性，使 SLC44A4 同時連結膽鹼－乙醯膽鹼系統與維生素 B1 的吸收及恆定。來源亦指出它在耳蝸傳出神經支配毛細胞的生理功能中具有作用；此項描述標示為依相似性推論。以下功能區將進一步說明其底物運輸及相關生物學作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000229729 ★ | 31,863,192–31,878,997 | 21 |
| ENST00000544672 | 31,863,173–31,877,671 | 21 |
| ENST00000375562 | 31,863,173–31,879,198 | 20 |
| ENST00000882849 | 31,863,173–31,879,198 | 21 |
| ENST00000882850 | 31,863,173–31,879,198 | 21 |
| ENST00000882852 | 31,863,173–31,879,198 | 21 |
| ENST00000925858 | 31,863,173–31,879,198 | 18 |
| ENST00000991246 | 31,863,173–31,879,198 | 21 |
| ENST00001135291 | 31,863,173–31,879,198 | 21 |
| ENST00000882851 | 31,863,192–31,879,198 | 21 |
| ENST00000882853 | 31,863,192–31,879,198 | 21 |
| ENST00000414427 | 31,865,690–31,878,967 | 13 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC44A4 具有膽鹼轉運功能，參與膽鹼－乙醯膽鹼系統。其轉運反應描述為膽鹼由細胞外進入細胞，並伴隨 n 個 H⁺由細胞內向外移動；來源未提供 n 的具體數值，因此不宜進一步指定其化學計量。這項功能使 SLC44A4 可參與膽鹼跨膜運輸，但資料未詳述其在乙醯膽鹼合成或釋放中的直接作用。
在耳蝸中，來源依相似性指出 SLC44A4 對橄欖耳蝸束中毛細胞的傳出神經支配具有作用，並與外毛細胞維持生理功能及抵禦聲音傷害相關。這項耳蝸功能的描述具有依相似性推論的限制；來源並未進一步列出其在耳內的分子步驟。與該功能相關的疾病資料另指出，SLC44A4 變異與 DFNA72 有關，該病以中頻聽力受損為主，並可逐漸進展至全頻聽力喪失。
SLC44A4 也具有硫胺素焦磷酸轉運活性。在結腸中，它被描述為可能運送由微生物生成的硫胺素焦磷酸，並可能協助其吸收，進而參與宿主維持硫胺素（維生素 B1）恆定。相應的反應是硫胺素二磷酸由細胞外移入細胞。來源將此與腸道營養吸收及維生素 B1 恆定相連，但未提供更細的運輸機制或其對整體生理狀態的量化影響。
Promoter 與基因調控
>SLC44A4 ENST00000229729 GRCh38 chr6:31878897-31879997 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGGTGCTGCCATCTTCTCTCCCCACCACCCTTTCACACATTCCTGACCAGAGATCCCAGCCAGGCCCTGG AGGTCTGACAGCCCCTCCCTCCCAGAGCTGGTTCCTCCCTGGGAGGGCAACTTCAGGGCTGGCCACCCCC CGTGTTCCCCATCCTCAGTTGAAGTTTGATGAATTGAAGTCGGGCCTCTATGCCAACTGGTTCCTTTTGT TCTCAATAAATGTTGGGTTTGGTAATAAACTGCGATTTTTGTGTTGGGGTGGGGAGAAAGCATACTTGGC TAGAGGGAATGTGGGTCCAAGGGCCAGAATAGGATGGGAAGCAGGCTGGACAGGTGTGGCTGGTGTGATG GCCGCCCAGTGCGGGGCAGGGAGGTGGGGGGCCACTATGAAGATCCAGTTTCACAGGCACGGTGGCTGAC ACCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGAATCACCTGAGATCAGGAGTTCAAGACCAGCC TGGCCAACTTGGTGAAACCCCATCTTTCAAAATAGAAAAAATTTGCTGGGCGTGGTGGCAGGCACCTGTA ATCCTGGCTACTCCAGAGACTGAGGCAGGAGAACCGCTTGAAGCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCA AGATTGAGTCACTGCACACCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAGGAAAAAACAGGTC CAATTTCCACACTTTAATCTTTGGCGGGAGCGTGTTGGGAGTGTACGGCAGTTAAGGTAGTTGGCGAGAT TATAAAGCGTTTTCTTATCAGAGCATGCCAGGTCGTTCACTGTGGTCCGTAGTGCCCCCAGGAAATAGCC CTGAGCCCCCGTCCCAGGCTCCAGCTCCCCAGCCCGCTGGGCACAAAGTTGAGAAGAAGGAACTAGAGTG TGTCGGGGACCACAGGCGGGGGTGGGGCTGTGACGTGTGGGAGGGCGGGGCGGGCAGCAGGTGAGACGCC AGGTCTCCAGGGCTCCAATCACTCCGGAGACTGAGCCATGGGGGGAAAGCAGCGGGACGAGGATGACGAG GCCTACGGTGAGACTGGGGCGAGGCCCGGGACCCTGTGGAGGGAGGGGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC44A4_1 ↗ | 6:31,878,997 | 負股 | 31,878,987–31,879,046 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_9GML7 · enhancer · 31875151–31875551 · regulatory
ENSR6_9GMLR · enhancer · 31877223–31877660 · regulatory
ENSR6_8XB8Q · promoter · 31877661–31877818 · regulatory
ENSR6_8XB8T · enhancer · 31877819–31878055 · regulatory
ENSR6_9GMM9 · promoter · 31878987–31879252 · regulatory
ENSR6_59HGMN · CTCF_binding_site · 31881519–31881540 · regulatory
ENSR6_8XBCK · enhancer · 31882493–31882693 · regulatory
· motif · 31881521–31881537 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：710 aa
SLC44A4 蛋白質全長 710 個胺基酸，屬於 CTL（choline transporter-like）家族。序列註解預測其具有多段 α 螺旋跨膜區，並由細胞質區段與細胞外區段交錯連接；N 端及 C 端均位於細胞質側。這些拓樸特徵與多重跨膜蛋白的註解相符。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC44A4 被註解為多重跨膜蛋白，位於細胞膜，並見於細胞頂端膜。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資料。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
SLC44A4 變異與常染色體顯性非症候群感音神經性聽損 DFNA72 有關，患者主要先受中頻影響，聽力損失可逐漸擴及全頻。另有兩名唾液酸沉積症患者被檢出 CTL4 第 10 外顯子與 NEU 的 3′ 非轉譯區融合相關的內部缺失；此報告為病例觀察，未據此證明 SLC44A4 造成唾液酸沉積症。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC44A4 是膽鹼轉運蛋白，參與膽鹼－乙醯膽鹼系統；依相似性推論，它對橄欖耳蝸束中毛細胞的傳出神經支配有所作用，關係到外毛細胞維持生理功能及避免聲音傷害。此外，它在結腸可能運送微生物生成的硫胺素焦磷酸，促進其吸收並協助宿主維持維生素 B1 恆定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Choline transporter that plays a role in the choline-acetylcholine system and is required to the efferent innervation of hair cells in the olivocochlear bundle for the maintenance of physiological function of outer hair cells and the protection of hair cells from acoustic injury (By similarity). Also described as a thiamine pyrophosphate transporter in colon, may mediate the absorption of microbiota-generated thiamine pyrophosphate and contribute to host thiamine (vitamin B1) homeostasis PMID 23651124 ↗ · PMID 24379411 ↗ · PMID 26741288 ↗ · PMID 28013291 ↗ |
| 功能 | SLC44A4 另具有硫胺素焦磷酸轉運活性。 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | choline(out) + n H(+)(in) = choline(in) + n H(+)(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | thiamine diphosphate(out) = thiamine diphosphate(in) | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SLC44A4 是多重跨膜蛋白，定位於細胞膜，並見於細胞頂端膜。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 兩名唾液酸沉積症患者被檢出一項內部缺失，該缺失使 CTL4 第 10 外顯子與 NEU 的 3′ 非轉譯區形成融合；這是患者中的觀察結果，來源未指出其為疾病成因。 | 含實驗來源 | 證據與來源An interstitial deletion causing the fusion of exon 10 of CTL4 with the 3'-UTR of NEU has been detected in two patients affected by sialidosis PMID 12067718 ↗ |
| 疾病關聯 | 常染色體顯性耳聾 72（DFNA72）是一種非症候群感音神經性聽力損失，主要影響中頻，並逐漸進展為全頻聽損。其成因為影響 SLC44A4 的基因變異；感音神經性耳聾可涉及內耳神經受器、通往腦部的神經路徑，或接收聲音資訊的腦區受損。 | 含實驗來源 | 證據與來源Deafness, autosomal dominant, 72 DFNA72 A form of non-syndromic sensorineural hearing loss. Sensorineural deafness results from damage to the neural receptors of the inner ear, the nerve pathways to the brain, or the area of the brain that receives sound information. DFNA72 primarily affects the middle frequencies. It gradually progresses to whole-frequency hearing loss. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617606 PMID 28013291 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTCCGGAGACTGAGCCATGGGGGGAAAGCAGCGGGACGA40GGATGACGAGGCCTACGGGAAGCCAGTCAAATACGACCCC80TCCTTTCGAGGCCCCATCAAGAACAGAAGCTGCACAGATG120TCATCTGCTGCGTCCTCTTCCTGCTCTTCATTCTAGGTTA160CATCGTGGTGGGGATTGTGGCCTGGTTGTATGGAGACCCC200CGGCAAGTCCTCTACCCCAGGAACTCTACTGGGGCCTACT240GTGGCATGGGGGAGAACAAAGATAAGCCGTATCTCCTGTA280CTTCAACATCTTCAGCTGCATCCTGTCCAGCAACATCATC320TCAGTTGCTGAGAACGGCCTACAGTGCCCCACACCCCAGG360TGTGTGTGTCCTCCTGCCCGGAGGACCCATGGACTGTGGG400AAAAAACGAGTTCTCACAGACTGTTGGGGAAGTCTTCTAT440ACAAAAAACAGGAACTTTTGTCTGCCAGGGGTACCCTGGA480ATATGACGGTGATCACAAGCCTGCAACAGGAACTCTGCCC520CAGTTTCCTCCTCCCCTCTGCTCCAGCTCTGGGGCGCTGC560TTTCCATGGACCAACGTTACTCCACCGGCGCTCCCAGGGA600TCACCAATGACACCACCATACAGCAGGGGATCAGCGGTCT640TATTGACAGCCTCAATGCCCGAGACATCAGTGTTAAGATC680TTTGAAGATTTTGCCCAGTCCTGGTATTGGATTCTTGTTG720CCCTGGGGGTGGCTCTGGTCTTGAGCCTACTGTTTATCTT760GCTTCTGCGCCTGGTGGCTGGGCCCCTGGTGCTGGTGCTG800ATCCTGGGAGTGCTGGGCGTGCTGGCATACGGCATCTACT840ACTGCTGGGAGGAGTACCGAGTGCTGCGGGACAAGGGCGC880CTCCATCTCCCAGCTGGGTTTCACCACCAACCTCAGTGCC920TACCAGAGCGTGCAGGAGACCTGGCTGGCCGCCCTGATCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。