基因總覽
SLC39A11（solute carrier family 39 member 11）是蛋白質編碼基因，產物屬於 ZIP transporter（TC 2.A.5）家族。其蛋白質長 342 個胺基酸，具有多個跨膜螺旋，屬於多次跨膜蛋白。這類蛋白質與金屬離子運輸相關；SLC39A11 的主要角色是協助調節細胞質中的鋅濃度，並可能運輸銅離子。至於它如何完成跨膜運輸，現有資料尚未釐清。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000255559 ★ | 72,645,949–73,092,688 | 10 |
| ENST00000909853 | 72,645,947–73,092,195 | 10 |
| ENST00000909850 | 72,645,949–73,092,693 | 10 |
| ENST00000909852 | 72,645,949–73,092,723 | 9 |
| ENST00000909856 | 72,645,949–73,089,812 | 10 |
| ENST00001140931 | 72,645,949–73,092,723 | 10 |
| ENST00000542342 | 72,645,950–73,092,723 | 10 |
| ENST00000909849 | 72,645,950–73,092,723 | 9 |
| ENST00000952470 | 72,645,950–73,089,812 | 9 |
| ENST00001009645 | 72,645,951–73,092,723 | 10 |
| ENST00000909854 | 72,645,952–73,092,195 | 10 |
| ENST00000952469 | 72,645,952–73,092,723 | 11 |
顯示 12/37 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC39A11 的主要功能與鋅離子運輸有關，可透過不同方向的跨膜運輸調節細胞質鋅濃度。鋅離子可由細胞外區室進入細胞，也可能從高基氏體等細胞內胞器移出；這兩種運輸途徑提供了調整細胞質鋅含量的方式。資料將其描述為鋅輸入蛋白，但運輸方向取決於離子所在區室，並非只限於由細胞外進入細胞。
活性註記指出，Zn²⁺可由膜的一側移至另一側，與其參與鋅離子跨膜運輸的角色相符。不過，現有資料沒有說明運輸所依賴的具體分子機制，因此不宜進一步推定其運輸步驟或調控方式。已知的功能重點是改變鋅在細胞質與其他區室之間的分布，藉此參與細胞質鋅濃度的調節。
SLC39A11 也可能運輸銅離子；活性資料列出 Cu²⁺跨膜運輸，但此項功能帶有可能性，不能視為已確立的主要角色。整體而言，來源支持其參與鋅運輸與細胞質鋅平衡，並提示可能涉及銅運輸；至於運輸機制仍有待釐清。
Promoter 與基因調控
>SLC39A11 ENST00000255559 GRCh38 chr17:73092588-73093688 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACAGCGCCCAGCCCAGGCATCTTGTTTCTATCTATTTATTTATTTTGTTTTGTTTTTGGCTAAATCTAGT CAATCCTATCCTCTGGTCTTTTCACAGAAATCCTGCAGATCAAAGCCTTTGACCTAGGGCAGTGCTTTTC AAAGGGTGGTCCCAGGACAGCAGCATCAGCAACTCCTAGCTCAAAACAAGATCTCAGGCCAGGCGCGGTG GCTCATGCCTATAATCCAGCACTTTGGGAGGCCCACACGAGTGGATCATTTGAGGTCAGGGGTTCGAGGC CAGCCTGGGCAACGTGGTGAAACCCCGTCCCTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAATT AGCGGGGCTTGGCAGCATGCACCTGTGATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAAGCAGGAGAATCGCTTGAAC ATAGGAGGCAGAGGCTGCAATCACCCGAGATTGGGCCACGGCACTCCAGCCTGGGCGAAAGAGCGAGACT CCATCTCAAAAAAACAAAAGCAAAAACAAAAAAATCCCAAAATGTCAGCCCCACCCAGAATGACGGAACC AGAGCCTCTGGGGGTGCTGGCATTTTGTGTTTGACCCCCTCCAGTGATTCTTTTGAGGGTCATTGACTGG AGAATGATGCCGATGCCATCACATTACCCGCCCCCAGCCTCTCCCGCAACACACACACAGCACATCCTGC TCTGCTGCGCACCCAGTGGCATGGACCTGGCTGCCAAAGGTGTAGAAGCATAAGTAACATCAGGGGTGTT ACAAAGGGCTCTTTCCTTGGGTGTTTGTAGCTTCCCTTAGGGCTGCAGTCACTCGCAGACTGCTGGGCTC TTGGCCTCAGGGCTCTGTTCTGCCCGCCCAGATCTGTTCCTGAGCCTGCAGACGGCTGTGAACCAGAGAA TCTATTCTTCAGGCGGGAGTTGCCAGTTGCGGCCAAGGGGGCGGGGCCCGGAGGCGGGAGGGCCACGTGT GCGGGAGGGAAGCAGGAAGTGACTGCGGGAGTGGAGCCGGCGAGAGAGTGGCAGCGGGGGCTGATGGAAG TGCAGTGGGGGCTGGAGAGGGCACCCTAGTGAGTTGGCTTTTCTCTCCTTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC39A11_1 ↗ | 17:73,092,688 | 負股 | 73,092,678–73,092,737 |
| SLC39A11_3 ↗ | 17:73,099,732 | 負股 | 73,099,722–73,099,781 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_C98SC · enhancer · 73091626–73092670 · regulatory
ENSR17_5M76WZ · CTCF_binding_site · 73092008–73092029 · regulatory
ENSR17_9342BK · promoter · 73092671–73093178 · regulatory
ENSR17_8462PP · enhancer · 73097319–73097485 · regulatory
· motif · 73090699–73090714 · motif
· motif · 73092010–73092026 · motif
· motif · 73092420–73092430 · motif
· motif · 73092429–73092439 · motif
· motif · 73092688–73092697 · motif
· motif · 73092688–73092699 · motif
· motif · 73092688–73092699 · motif
· motif · 73092688–73092701 · motif
· motif · 73092708–73092717 · motif
· motif · 73092732–73092742 · motif
· motif · 73093998–73094011 · motif
· motif · 73093998–73094011 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：342 aa
SLC39A11 蛋白質長 342 個胺基酸，屬於 ZIP transporter（TC 2.A.5）家族。序列註解預測其含有七段跨膜螺旋，分布於蛋白質不同區段，支持其為多次跨膜蛋白的特徵。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 SLC39A11 標示於細胞膜、高基氏體、細胞質與細胞核，並註明其為多次跨膜蛋白。 這些資訊未說明不同位置出現的條件或動態變化；所列位置皆指向 SLC39A11 本身。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC39A11 是鋅輸入蛋白，可透過鋅由細胞外區室進入，或由高基氏體等細胞內胞器移出，調節細胞質鋅濃度。它也可能運輸銅離子，但其運輸機制尚未釐清。 | 推論支持 | 證據與來源Zinc importer that regulates cytosolic zinc concentrations either via zinc influx from the extracellular compartment or efflux from intracellular organelles such as Golgi apparatus. May transport copper ions as well. The transport mechanism remains to be elucidated |
| 分子活性 | Zn(2+)(in) = Zn(2+)(out) | 推論支持 | |
| 分子活性 | Cu(2+)(in) = Cu(2+)(out) | 推論支持 | |
| 細胞定位 | SLC39A11 被標示為多次跨膜蛋白，定位於細胞膜、高基氏體、細胞核與細胞質。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GACTGCGGGAGTGGAGCCGGCGAGAGAGTGGCAGCGGGGG40CTGATGGAAGTGCAGTGGGGGCTGGAGAGGGCACCCTACT80GTATCCAGCATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGG120CCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGC160TGGGGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGG200CGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGGTCA240TGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGT280TGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGTGCCTTTGCC320TTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTT360TTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGATGCCTCACTTGGGTGC400AGCAGAAGACCCCCAGACGACCCTGGCACTGAACTTCGGC440TCTACGTTGATGAAGAAGAAGTCTGATCCTGAGGGTCCCG480CGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGA520CAAGAGTGAGAATGGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCG560GCAGCCACTGGCCTTCCAGAGGGTCCTGCTGTCCCTGTGC600CTTCTCGAGGGAATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTG640GAGGAGGATCGCACTGCTCATCTTGGCCATCACTATACAC680AACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGG720CTATAGAAAAGACGGCATCTGCTACCTTTGAGAGTGCCAG760GAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCCCCGAG800GGCCTGGCTGTCAGCCTTCCCTTGCGAGGGGCAGGCTTCT840CCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAGCTGAGCGGCAT880GGTGGAGCCCCTGGCCGGGGTCTTTGGTGCCTTTGCCGTG920GTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTACGCTCTGGCCTTTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。