基因總覽
SLC39A1 是蛋白質編碼基因，產物屬於 ZIP transporter（TC 2.A.5）家族，長 324 個胺基酸。其蛋白質具有多段穿膜螺旋，並由跨膜區段與細胞內、細胞外區域交替構成；這種膜蛋白架構與其作為離子轉運者的角色相符。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000356205 ★ | 153,959,110–153,963,537 | 4 |
| ENST00000621013 | 153,959,099–153,963,492 | 4 |
| ENST00000537590 | 153,959,099–153,964,125 | 3 |
| ENST00000617697 | 153,959,099–153,968,184 | 5 |
| ENST00000368623 | 153,959,099–153,964,125 | 3 |
| ENST00000368621 | 153,959,099–153,963,491 | 4 |
| ENST00000310483 | 153,959,099–153,967,744 | 5 |
| ENST00000885397 | 153,959,099–153,968,667 | 5 |
| ENST00000885398 | 153,959,099–153,968,667 | 6 |
| ENST00000885399 | 153,959,099–153,963,714 | 4 |
| ENST00000885400 | 153,959,099–153,963,491 | 4 |
| ENST00000885401 | 153,959,099–153,963,491 | 4 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC39A1 的蛋白質產物可轉運二價鋅離子（Zn(2+)），促使鋅由細胞外進入細胞。此方向性使細胞能從外部環境攝取鋅；現有資料並指出，在前列腺細胞中，SLC39A1 是將循環血漿中的鋅帶入細胞的主要轉運者。
這項功能把細胞外可利用的鋅與細胞內鋅供應連結起來。來源所述的轉運方向為 Zn(2+) 由細胞外流入細胞，並未提供其他離子底物或相反方向轉運的主張，因此不宜將其功能延伸為廣泛的金屬離子運輸能力。
在前列腺細胞的情境中，SLC39A1 對血漿來源鋅的輸入具有主要轉運者的地位，凸顯其在該細胞鋅攝取上的功能。資料支持其作為鋅輸入蛋白的角色，但沒有進一步交代此轉運如何影響下游細胞過程。
Promoter 與基因調控
>SLC39A1 ENST00000356205 GRCh38 chr1:153963437-153964537 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGAAGCAAGATCCCATCTGTCCCTTCTTTAGGCAATGAAGCTTTTTTCACCTTTGCATAAAAGAACAGC TGAGCCCCCTTTTTAAATTTTCTTTTGTCTTACCGTCCCTTGAGGCTAGAAGAGGATTCTCAAGGCACAG AGTTGTGGGCCACAAGAATCCAGGTTGAGGAAACGGTGAAAGTCCTGAGCTGAAACAACTACCTTGGGGC ATTCAAGGAACAGCAAACAGCAAACCGACCGGCGAGGGTGGCGGGAGCTGGGCTGGAAATCAGGTGGGAG AACCGGCCAGACGCCCGCAGGCGCGGTACGCAGATATCCTGGAATGCGCTGGGGGCTCTTCCCTGGGCGC GGCTTCAGCACCCCGCATTCCGGTCCCACCACGTCCCCACCCACCTGGAGAAGGCGGAGGCTGCACTGAG TGCCATAAGTAGTCGAGAAGGGATGATTTTCAAGACATACCCTCTCTTTGCTTTCCCCCCTTTCCAATTC TGCCTTGTCTTTTTCCTTGTTGTGGGTGCTGGTGAGGGAAAGCAGTCAAGGAAGTTGGTCCCAAGAGGGG AATGCTTTCCCTTGGGCGCCAAGAGGCACTGACGAGGTGTCAGAGCCTTCTGAGGGACAGATGAGACTTT GGCCCAAGGCCAGGAAGATGTTTTCAGATGTGGGCCGGAAGACTTGACAATGCGGGGTCTCCCTCTTTTA AAAATATCCATATAATCAAAGCCTTTGTTGACTGGCCCGCTCCGGCCCCTCAGTCCTCCACAGATGCGCC CCAGGGCCCCAGCCCCGAGGTCCTTTTCCTAATATCCGCTCTTGCTCTCGCTCACTCTCCTCAGGTCGCC TGCTCCGCCCGCTCCCGCTCCCGATCTCTGATTGCTCCTAACTGACGTCACTCCCGGTCTGTCCCCGCCC ACTCGGTGCTGCCATTGGCAGTCGGTCGTGGGTACGCGGCTCCTGTGGGGGAGGGGGGAGCTATGGGAGG GGGCGGGAATTCCCGACTCTAGGCCGGAAGCGCGCGGAGACCATGTAGTGAGACCCTCGCGAGGTGAGTG CGGGCTGTCTGGCAGCGGGGTCCATGTCGGCTGCCCAGGCCTCCCCGGGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC39A1_1 ↗ | 1:153,963,537 | 負股 | 153,963,527–153,963,586 |
| SLC39A1_2 ↗ | 1:153,967,725 | 負股 | 153,967,715–153,967,774 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
SLC39A1 在前列腺癌中呈下調；此資料描述的是表現量變化，未提供其調控機制或變化所造成的功能後果。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：324 aa
SLC39A1 蛋白長 324 個胺基酸，屬於 ZIP transporter（TC 2.A.5）家族。序列註解預測其含有多段螺旋狀跨膜區，並在膜內外分布短區段；這些拓撲區段構成多次穿膜蛋白的架構。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC39A1 定位於細胞膜及內質網膜。 在數種上皮細胞株中，也觀察到與內質網部分對應的囊泡狀定位；資料未指出不同異構型或特定條件下的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- COMTP21964 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CXCL9Q07325 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYB561P49447 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NME2P1O60361 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- OPTNQ96CV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM60Q9H2L4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TUSC5A5PKU2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YIPF6Q96EC8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC39A1 是二價鋅離子轉運蛋白，可介導鋅由細胞外進入細胞；在前列腺細胞中，則是將循環血漿中的鋅輸入細胞的主要轉運者。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transporter for the divalent cation Zn(2+). Mediates the influx of Zn(2+) into cells from extracellular space. Functions as the major importer of zinc from circulating blood plasma into prostate cells PMID 11301334 ↗ · PMID 12888280 ↗ · PMID 16844077 ↗ |
| 分子活性 | Zn(2+)(in) = Zn(2+)(out) | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SLC39A1 是多次穿膜蛋白，位於細胞膜與內質網膜；在數種上皮細胞株中，也呈現部分對應於內質網的囊泡狀定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein; Shows a vesicular localization corresponding partially to the endoplasmic reticulum in several epithelial cell lines PMID 11301334 ↗ · PMID 11696349 ↗ · PMID 16844077 ↗ |
| 調控 | SLC39A1 在前列腺癌中呈下調；此項資料僅描述表現變化，未提供調控方式或其功能後果。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGGCCGGAAGCGCGCGGAGACCATGTAGTGAGACCCTCGC40GAGGTCTGAGAGTCACTGGAGCTACCAGAAGCATCATGGG80GCCCTGGGGAGAGCCAGAGCTCCTGGTGTGGCGCCCCGAG120GCGGTAGCTTCAGAGCCTCCAGTGCCTGTGGGGCTGGAGG160TGAAGTTGGGGGCCCTGGTGCTGCTGCTGGTGCTCACCCT200CCTCTGCAGCCTGGTGCCCATCTGTGTGCTGCGCCGGCCA240GGAGCTAACCATGAAGGCTCAGCTTCCCGCCAGAAAGCCC280TGAGCCTAGTAAGCTGTTTCGCGGGGGGCGTCTTTTTGGC320CACTTGTCTCCTGGACCTGCTGCCTGACTACCTGGCTGCC360ATAGATGAGGCCCTGGCAGCCTTGCACGTGACGCTCCAGT400TCCCACTGCAAGAGTTCATCCTGGCCATGGGCTTCTTCCT440GGTCCTGGTGATGGAGCAGATCACACTGGCTTACAAGGAG480CAGTCAGGGCCGTCACCTCTGGAGGAAACAAGGGCTCTGC520TGGGAACAGTGAATGGTGGGCCGCAGCATTGGCATGATGG560GCCAGGGGTCCCACAGGCGAGTGGAGCCCCAGCAACCCCC600TCAGCCTTGCGTGCCTGTGTACTGGTGTTCTCCCTGGCCC640TCCACTCCGTGTTCGAGGGGCTGGCGGTAGGGCTGCAGCG680AGACCGGGCTCGGGCCATGGAGCTGTGCCTGGCTTTGCTG720CTCCACAAGGGCATCCTGGCTGTCAGCCTGTCCCTGCGGC760TGTTGCAGAGCCACCTTAGGGCACAGGTGGTGGCTGGCTG800TGGGATCCTCTTCTCATGCATGACACCTCTAGGCATCGGG840CTGGGTGCAGCTCTGGCAGAGTCGGCAGGACCTCTGCACC880AGCTGGCCCAGTCTGTGCTAGAGGGCATGGCAGCTGGCAC920CTTTCTCTATATCACCTTTCTGGAAATCCTGCCCCAGGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。