基因總覽
SLC37A1(solute carrier family 37 member 1)是蛋白質編碼基因,其產物屬於主要促進因子超家族中的 Organophosphate:Pi antiporter(OPA)家族。蛋白質長533個胺基酸,具有多段跨膜螺旋,符合多次穿越膜的膜蛋白特徵。其主要角色與葡萄糖-6-磷酸及無機磷酸的跨膜交換有關;來源描述其可能將細胞質中的葡萄糖-6-磷酸運入內質網腔,並使無機磷酸朝相反方向移動。此運輸作用不依賴腔內葡萄糖-6-磷酸酶。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000352133 ★ | 42,513,852–42,581,426 | 20 |
| ENST00000960757 | 42,495,994–42,581,440 | 20 |
| ENST00000419522 | 42,496,018–42,518,510 | 3 |
| ENST00000398341 | 42,499,632–42,581,440 | 21 |
| ENST00000893151 | 42,513,603–42,581,440 | 20 |
| ENST00000893152 | 42,513,603–42,581,440 | 21 |
| ENST00000893153 | 42,513,603–42,581,440 | 21 |
| ENST00000893154 | 42,513,603–42,581,440 | 20 |
| ENST00000922856 | 42,513,603–42,581,440 | 19 |
| ENST00000922857 | 42,513,603–42,581,440 | 20 |
| ENST00000922858 | 42,513,603–42,581,440 | 17 |
| ENST00000960758 | 42,513,603–42,581,440 | 20 |
顯示 12/41 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SLC37A1 被描述為無機磷酸與葡萄糖-6-磷酸的反向運輸蛋白。來源指出,它可能將細胞質中的葡萄糖-6-磷酸移入內質網腔,同時使無機磷酸朝相反方向轉運;這項功能屬於可能性描述,並非確定性陳述。
其反向交換可用兩種分子的進出方向表示:葡萄糖-6-磷酸由內側移出、磷酸由外側移入,亦即兩者沿相反方向跨膜移動。來源將這種交換描述為不依賴內質網腔內的葡萄糖-6-磷酸酶,因此該轉運作用並非以該酶在腔內的存在為必要條件。
至於血糖恆定調節,來源指出 SLC37A1 可能不參與維持血糖穩定。這一點同樣是審慎的可能性判斷;現有資料不足以將其說成已確立的生理功能,也未提供更詳細的調控機制或生物學情境。
Promoter 與基因調控
>SLC37A1 ENST00000352133 GRCh38 chr21:42512852-42513952 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCCCCAGGGGGAAACTGCGAGGCCTAGCAGGGCAGGGGAGCCAAACACAGGGAAGAATGCCTTCTCCATT CTCCAGAGGGAAGCTCAACGTGCCTGGGGAAGGGTGCGAGGGGCACTGGCCTGTTGGGACATTTACAGCC AGGCCTCGGGTTGGTTTTATCCTTAAACATTGTTTTATCCGGGGGCAGGCTTTTTCCCCGGAAAATTTCC GCTCTGCCTCACTTTGCTCTTCCCCGAGGAGTGGGCTGGGAGCCCCCTCTGCTCTGAAGCCATCCTGGGG GTCCACTGTGGGTGTTCGGCAGTAGCTTCTAGGGGACTGGCCAGGCCCCTCCCTGGGGCTGCCTAAGGAG AAGAGTTGTTTCTGGGGTGACGTGGGAGCCTGTGTGCCAGGGCACTGGCCCGCAAGGGTAAGAACCCGGC GGGCTCCCGCAGCCTAACAGGGAGCTGCCTCTGTCACGTGCCTGCGAGGTGGGACACAAGTTGGCTTACA AGTTGGTTCGACATAGCCAAATCCGCGTGCCGCATTTCCACGCTATGGAGTGCTAGTCTTCATGATTGTG CCCCTTGACATGACACAATAGGAATAGAAGCCGGGAGGCCAAGCAAAGGCCCTCTTTGGGGGTGGGGGCG CGGCGGCATGTGACCCTCGCCGCCTGTGGGGAAGACCTGCCTTGAGGACAGAGCGCCAGGGGTGCAGAGG CCGCCTGGGACTGCCCGGAGGCCGGTGGGGAGCGCGCCAGCGAAAGCCCGTGCGCCCTCGGAGCCGGGGA AGGCGCGGGCCATGACCCGGGTTCGCCCGCAAAGGCCGGGCAGTGCCGCAAGGCGTGGGGGCGCCCCCGC CCGGTGGCCCCGGGGCTGGTGCGACCCTGGGCACGCCGGGGCCGGGGCCGGAGCCGGGGGTCGCGGCGGC CGGGGAGGGGGAGGAGCCGCGCGGCTCCGCCGGCGCCCCGCGGGCCAGGGAAAGTGAAAGGGCGGCGGGG CCTCCCGCGCGCCGCTCCAGGAAGTCGCGAGCAGGAAGCGCCCGCGGCGGCCGGGCCGGGCTGGGCTGCG GAGCGCGGGCCTCGGCGGCGCAGGTGAGGCGCGGGGCCGGGGCCGGACCGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SLC37A1_3 ↗ | 21:42,495,947 | 正股 | 42,495,898–42,495,957 |
| SLC37A1_4 ↗ | 21:42,499,642 | 正股 | 42,499,593–42,499,652 |
| SLC37A1_1 ↗ | 21:42,513,860 | 正股 | 42,513,811–42,513,870 |
| SLC37A1_2 ↗ | 21:42,514,540 | 正股 | 42,514,491–42,514,550 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR21_9LTLD · promoter · 42513362–42513862 · regulatory
ENSR21_5CZZPM · CTCF_binding_site · 42513679–42513700 · regulatory
ENSR21_C67WF · enhancer · 42513863–42515208 · regulatory
ENSR21_838Q8T · enhancer · 42515390–42515600 · regulatory
ENSR21_BBFS4 · enhancer · 42515968–42516608 · regulatory
ENSR21_BBFSD · enhancer · 42518128–42518859 · regulatory
· motif · 42513043–42513054 · motif
· motif · 42513304–42513313 · motif
· motif · 42513304–42513313 · motif
· motif · 42513306–42513322 · motif
· motif · 42513306–42513322 · motif
· motif · 42513410–42513423 · motif
· motif · 42513488–42513500 · motif
· motif · 42513681–42513694 · motif
· motif · 42513681–42513697 · motif
· motif · 42513846–42513857 · motif
· motif · 42513980–42513989 · motif
· motif · 42514022–42514031 · motif
· motif · 42514437–42514450 · motif
· motif · 42514783–42514800 · motif
· motif · 42515251–42515260 · motif
· motif · 42515329–42515340 · motif
· motif · 42517710–42517722 · motif
· motif · 42517859–42517872 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:533 aa
SLC37A1 蛋白質長533個胺基酸,屬於主要促進因子超家族的 Organophosphate:Pi antiporter(OPA)家族。序列註解標示12段螺旋型跨膜區,分布於蛋白質不同區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SLC37A1 位於內質網膜,並被註記為多次穿越膜的蛋白質。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資料。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SLC37A1 被描述為無機磷酸與葡萄糖-6-磷酸的反向運輸蛋白,可能將細胞質中的葡萄糖-6-磷酸送入內質網腔,並使無機磷酸反向移動;此交換不依賴腔內葡萄糖-6-磷酸酶,且可能不參與血糖恆定調節。 | 含實驗來源 | 證據與來源Inorganic phosphate and glucose-6-phosphate antiporter. May transport cytoplasmic glucose-6-phosphate into the lumen of the endoplasmic reticulum and translocate inorganic phosphate into the opposite direction. Independent of a lumenal glucose-6-phosphatase. May not play a role in homeostatic regulation of blood glucose levels PMID 21949678 ↗ |
| 分子活性 | D-glucose 6-phosphate(in) + phosphate(out) = D-glucose 6-phosphate(out) + phosphate(in) | 含實驗來源 | 證據與來源D-glucose 6-phosphate(in) + phosphate(out) = D-glucose 6-phosphate(out) + phosphate(in) PMID 21949678 ↗ |
| 細胞定位 | SLC37A1 被註記為位於內質網膜的多次穿膜蛋白;該定位資料未說明特定條件下的變化或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAAGTCGCGAGCAGGAAGCGCCCGCGGCGGCCGGGCCGGG40CTGGGCTGCGGAGCGCGGGCCTCGGCGGCGCAGGTGAGGC80GCGGGGCCGGGGCCGGACCGGGAGGCGGGGACCCCCCGCC120CCCCCGCCCGCACCTGCGGGGCAGCCGGCGCTCAGGCGCC160GCAGCCGCTCAGCACCTGCGGCGCCCTCAGGGAGCCGGGC200GCGGGGCCCTGCGCACTCGGAGCTCGGCTCCTCTCCTTCC240TTTTCTTTTTTTTCGGGGGGAGGTGGGGGCTGGTTTGGAT280GTTTTCCGAGAGCCGGGGACGGTCTCAAGCTATTTTCGCG320GAGGGAAGTCTTTGAAATACGACATCTAGAAGAGTGGCCC360TCGGCGACAATGCCGGGCGTTCCCGGACCGGGGCAACGCT400GGGATTCCGGGGAAGTGGAGGCAGAGGGAGCGGGCACGGG440GCCGGCAGCCGCTCCACGGAGTCCCCGGCAGGGGCGAGCT480TAGCTGTCCAGCCGGGTCCCCTGCCCACCCCGGCCCGGGC520CGCGGTGACAGCTGAGGGTCCAGAGAGCCGGCAGGAGGGG560ACCCTGCGCATTGTCTGCCGCGATGGGGACGTGGGCGTGC600CCGCGGAATTCACCTCCTCCGGGGACCAGCCGCCCAGGGA640GGAGCCGGCACAGAACGCTGGCTCGGAGCGCCGGCACCCT680GGGCCTTTGCGTTGTTTGTCGGCTGAGCAGCTGGTTCCCG720GAGCCCGTGGGCCTCCTGGCCAATGCGAGTGACAGCGACC760TTCTGGGTTTATAATAAAGGGCTTGACGCGCCGGAAAGTC800CCCTCGCCGCTGGCCACCAGCCTTCCAGCCCTTACGGCCC840ACGCCGTAATCCTGGTGACCGAGAAGAGAGCAGAGCCACT880GCCAGAAGGAAGGGGACAAGACCCAGCAGGACACCTTCTT920TCCACGCTTTCCAGCCTGTGGGAGCGGCAGGGGCAACAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。