演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC34A2NAPI-3B

solute carrier family 34 member 2

SLC34A2 編碼 SLC34 transporter family 的膜蛋白,能以 Na(+) 共運方式將 phosphate 主動運入細胞;其蛋白質定位於腸細胞刷狀緣膜。

Homo sapiens4p15.2UniProt O95436
OFFICIAL SYMBOL
SLC34A2
CHROMOSOME
4
UNIPROT
O95436
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC34A2(solute carrier family 34 member 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於 SLC34A transporter family。此蛋白為多次穿膜蛋白,具有多段跨膜螺旋及分布於細胞內、外側的區域;來源註解描述其全長為 690 個胺基酸,N 端前段另標示為無序區。這些基本特徵構成其膜蛋白身分;其具體運輸作用見功能說明。

Official symbol
SLC34A2
Gene name
solute carrier family 34 member 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11020
UniProt
O95436
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NAPI-3BNaPi-2bNPTIIbNaPi2bNAPI-IIb

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44p15.2
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25SLC34A2pq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr4:25,648,011–25,679,132
Gene span
31,122 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000382051 ★25,655,851–25,678,74813
ENST0000064578825,648,011–25,679,13213
ENST0000087227825,654,867–25,679,13213
ENST0000087227925,654,867–25,679,13213
ENST0000087228025,655,129–25,679,13213
ENST0000051320425,655,301–25,666,2405
ENST0000050457025,655,822–25,679,13213
ENST0000087228125,655,822–25,679,13213
ENST0000087228225,655,822–25,679,13214
ENST0000095497625,655,822–25,679,13213
ENST0000095497725,655,822–25,679,13213
ENST0000095497825,655,822–25,679,13214

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC34A2 的主要功能是透過 Na(+) 共運,主動將 phosphate 運入細胞。這表示 phosphate 的跨膜移動與 Na(+) 一同進行,並具有明確的運輸方向:由細胞外移至細胞內。

來源所列的反應式將此運輸描述為每次共運三個細胞外 Na(+) 與一個細胞外 phosphate,進入細胞內;反向則是三個細胞內 Na(+) 與一個細胞內 phosphate 移至細胞外。此化學計量關係指出 Na(+) 與 phosphate 的共運比例為 3 比 1。

因此,SLC34A2 的作用是以 Na(+) 共運方式參與細胞的 phosphate 攝取。現有資料支持其運輸方向與化學計量,但未進一步說明此運輸在特定組織中的生理效應或其他調節機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 25655851 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC34A2 ENST00000382051 GRCh38 chr4:25654851-25655951 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CACTGAGCCTCACTGTGCTCCACTATAAAACCAGGAGAGTGCGCAGCAGAGGAGAGGGTCTGGGTTTCAG
AATAAGAAGCAGGTTTTCTTCCTGCTCAGCAAATCCTGGGTAATTGTATCATATCCCCTAACCCCTTAAA
CCTCAGCTAGAGAGGGCGCCAGTCTTAGCCCCAGGGAAGGCTTTCGTGTGCACATTGGAGACAAAGCCTG
CCCAGCAGTGCCCGGCACAGAACTGGGGAGCTGTTGGGATAAGCATGGGGGTGGACTCTCCCTGGGACAG
ATCCTATCTCACAGCAGTTTGGAGAACTGTTGTATACACACGCAGGTGACACGAGGCAGAGCAGGATGTG
AAACGAGCGCAGTGGTTTGCCAAACCCGCAGCAGGCTTAGGACGGAGTGGTGAGAACAGCCCCCTTCCTT
TTCCTCAGCTTGACGGTCCCAGCCTTTCCCATTGCGGACCTAGAGCCCAGACTCCCAGGGCAGAAAGCGC
CCCACAGACTGATAAAGGTGAACAATCCAGGCTTTGTTTCCAAGGGCTTTATCCCTGACTTTCCAACTGG
CTTTTATCTGTGTCTTCACGTCTCTGACCTCTTGAGCCTCACAGGAGCTAGACTAGAAGGTTCAAGTTCT
TGAGGAGAAGGCAGGGGCGGGAGAGCCCCACTTGCGGGAATCTCGTGCGGACCGAGTCGGGGCGGGAGAG
GGCGCGCACCAGCCAGGCTAGGGCGCGCGGGGCGCCGAGGGGCGCGGGGCCGTTTGGGGCCGTTCGGGCC
AGTTCGCGCGGCGGGGCCCGTCGGAGCTTTTCTCTCGGCAGCCTGGCTGGCCGCGCGTCTTCTCCGCGCA
GCGGGCGAAGTCGCGATGGGTTCATTAAGGCGGCAGGTAGGCAGTGCCCCGGCGGCGGCTGCGGCAGGCG
GTCCTGGAATGTGCGAGGGGCGTGATGACAGCGGCCAGCCTCTTTGCGCAACACCTTCGCCATATATACC
CGGGGCGCTGCGCTCCACCTGGCCGCCGCCTCCAGCCCAGCACCTGCGGAGGGAGCGCTGGTGAGTACCG
CCGCCGGGGCAGGGGCGCTTCCTCGCTCTTTCAAGGACTTTGATTCACTTA
SLC34A2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC34A2_1 ↗4:25,655,852正股25,655,803–25,655,862

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_B74G9 · enhancer · 25652112–25652695 · regulatory

ENSR4_B74GQ · promoter · 25655332–25655861 · regulatory

ENSR4_582X4N · CTCF_binding_site · 25655538–25655559 · regulatory

ENSR4_8QCW6 · enhancer · 25655862–25656010 · regulatory

· motif · 25655511–25655527 · motif

· motif · 25655511–25655527 · motif

· motif · 25655540–25655556 · motif

· motif · 25655764–25655773 · motif

· motif · 25655803–25655812 · motif

· motif · 25655815–25655825 · motif

EGF 會下調 SLC34A2;來源未提供此調控的細胞類型、作用機制或變化幅度。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:690 aa

1 aa690 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 O95436 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC34A2 產物屬於 SLC34A transporter family,來源註解其長度為 690 個胺基酸。蛋白質具有八段跨膜螺旋(M1–M8),並在跨膜區段之間交錯排列細胞質側與細胞外側區域。其第 1–42 個胺基酸另被標註為無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–100 aa
跨膜區Helical; Name=M1101–121 aa
拓樸區域Extracellular122–135 aa
跨膜區Helical; Name=M2136–156 aa
拓樸區域Cytoplasmic157–212 aa
跨膜區Helical; Name=M3213–233 aa
拓樸區域Extracellular234–362 aa
跨膜區Helical; Name=M4363–383 aa
拓樸區域Cytoplasmic384–407 aa
跨膜區Helical; Name=M5408–428 aa
拓樸區域Extracellular429–485 aa
跨膜區Helical; Name=M6486–506 aa
拓樸區域Cytoplasmic507–525 aa
跨膜區Helical; Name=M7526–546 aa
拓樸區域Extracellular547–552 aa
跨膜區Helical; Name=M8553–573 aa
拓樸區域Cytoplasmic574–689 aa
功能區域Disordered1–42 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O95436…

AlphaFold · O95436

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Apical cell membrane

SLC34A2 是多次穿膜蛋白,定位於頂端細胞膜;在腸細胞中,來源特別指出其位於刷狀緣膜。 資料未描述其他定位位置、異構型差異或定位變化條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 18 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NAPI-3BSLC34A2AIG1ERG28GUCA2AJAGN1LHFPL5PLNPNLIPRP1RTP2SLC30A3SLC35A1SLC39A7STRIT1TEX264TMEM128TMEM239TMEM42TSPO2TUSC5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SLC34A2 基因變異可造成肺泡微石症(pulmonary alveolar microlithiasis),這是一種罕見、具完全外顯率的隱性單基因疾病,特徵為磷酸鈣微石沉積於肺部。病程通常長期進展,肺功能可能逐漸惡化,但多數患者多年甚至數十年間沒有症狀;早發或快速進展較少見。另有一項染色體異常報告來自 U-118MG 膠質母細胞瘤細胞株,該異常形成具有持續性 kinase 活性的 SLC34A2-ROS1 嵌合蛋白;此為細胞株中的發現。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC34A2 透過 Na(+) 共運,主動將 phosphate 從細胞外運入細胞內。含實驗來源
證據與來源

Involved in actively transporting phosphate into cells via Na(+) cotransport

PMID 10329428 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性3 Na(+)(out) + phosphate(out) = 3 Na(+)(in) + phosphate(in)含實驗來源
證據與來源

3 Na(+)(out) + phosphate(out) = 3 Na(+)(in) + phosphate(in)

PMID 10329428 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC34A2 是多次穿膜蛋白,定位於頂端細胞膜;在腸細胞中,位於刷狀緣膜。推論支持
證據與來源

Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localized at the brush border membranes of enterocytes

開啟資料庫紀錄 ↗

調控EGF 會下調 SLC34A2;此註解未提供作用機制、細胞背景或下調幅度。含實驗來源
證據與來源

Down-regulated by EGF

PMID 11171583 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯SLC34A2 基因變異可造成肺泡微石症,屬於罕見、具完全外顯率的隱性單基因疾病,患者肺部會沉積磷酸鈣微石。疾病起病年齡可從新生兒期至老年,通常長期進展並使肺功能逐漸惡化;多數患者可多年或數十年無症狀,早發或快速進展較少見。含實驗來源
證據與來源

Pulmonary alveolar microlithiasis PULAM Rare disease characterized by the deposition of calcium phosphate microliths throughout the lungs. Most patients are asymptomatic for several years or even for decades and generally, the diagnosis is incidental to clinical investigations unrelated to the disease. Cases with early-onset or rapid progression are rare. A 'sandstorm-appearing' chest roentgenogram is a typical diagnostic finding. The onset of this potentially lethal disease varies from the neonatal period to old age and the disease follows a long-term, progressive course, resulting in a slow deterioration of lung functions. Pulmonary alveolar microlithiasis is a recessive monogenic disease with full penetrance. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 265100

PMID 16960801 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯在 U-118MG 膠質母細胞瘤細胞株中發現涉及 SLC34A2 的染色體異常,並形成 SLC34A2-ROS1 嵌合蛋白;該嵌合蛋白保有持續性 kinase 活性。這項發現描述的是細胞株中的異常。含實驗來源
證據與來源

A chromosomal aberration involving SLC34A2 is found in a glioblastoma multiforme cell line U-118MG. Results in the formation of a SLC34A2-ROS1 chimeric protein that retains a constitutive kinase activity

PMID 12661006 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000382051 · 4,115 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGCCGCCGCCTCCAGCCCAGCACCTGCGGAGGGAGCGCTG40
41ACCATGGCTCCCTGGCCTGAATTGGGAGATGCCCAGCCCA80
81ACCCCGATAAGTACCTCGAAGGGGCCGCAGGTCAGCAGCC120
121CACTGCCCCTGATAAAAGCAAAGAGACCAACAAAACAGAT160
161AACACTGAGGCACCTGTAACCAAGATTGAACTTCTGCCGT200
201CCTACTCCACGGCTACACTGATAGATGAGCCCACTGAGGT240
241GGATGACCCCTGGAACCTACCCACTCTTCAGGACTCGGGG280
281ATCAAGTGGTCAGAGAGAGACACCAAAGGGAAGATTCTCT320
321GTTTCTTCCAAGGGATTGGGAGATTGATTTTACTTCTCGG360
361ATTTCTCTACTTTTTCGTGTGCTCCCTGGATATTCTTAGT400
401AGCGCCTTCCAGCTGGTTGGAGGAAAAATGGCAGGACAGT440
441TCTTCAGCAACAGCTCTATTATGTCCAACCCTTTGTTGGG480
481GCTGGTGATCGGGGTGCTGGTGACCGTCTTGGTGCAGAGC520
521TCCAGCACCTCAACGTCCATCGTTGTCAGCATGGTGTCCT560
561CTTCATTGCTCACTGTTCGGGCTGCCATCCCCATTATCAT600
601GGGGGCCAACATTGGAACGTCAATCACCAACACTATTGTT640
641GCGCTCATGCAGGTGGGAGATCGGAGTGAGTTCAGAAGAG680
681CTTTTGCAGGAGCCACTGTCCATGACTTCTTCAACTGGCT720
721GTCCGTGTTGGTGCTCTTGCCCGTGGAGGTGGCCACCCAT760
761TACCTCGAGATCATAACCCAGCTTATAGTGGAGAGCTTCC800
801ACTTCAAGAATGGAGAAGATGCCCCAGATCTTCTGAAAGT840
841CATCACTAAGCCCTTCACAAAGCTCATTGTCCAGCTGGAT880
881AAAAAAGTTATCAGCCAAATTGCAATGAACGATGAAAAAG920
921CGAAAAACAAGAGTCTTGTCAAGATTTGGTGCAAAACTTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。