演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC34A1NAPI-3

solute carrier family 34 member 1

SLC34A1 編碼 SLC34 transporter family 成員 solute carrier family 34 member 1,參與腎臟近端小管刷狀緣的磷酸鹽運輸。

Homo sapiens5q35.3UniProt Q06495
OFFICIAL SYMBOL
SLC34A1
CHROMOSOME
5
UNIPROT
Q06495
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC34A1 是蛋白質編碼基因,其產物 solute carrier family 34 member 1 屬於 SLC34A transporter family。此蛋白質是多次穿膜的膜蛋白,具有八段螺旋跨膜區;其細胞內與細胞外區段交錯排列。蛋白質定位於腎臟近端小管刷狀緣膜,為了解其在腎臟磷酸鹽運輸中的角色提供基本背景。

Official symbol
SLC34A1
Gene name
solute carrier family 34 member 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11019
UniProt
Q06495
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NAPI-3NPTIIaSLC11NPT2SLC17A2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q35.3
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegSLC34A1pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr5:177,379,235–177,398,848
Gene span
19,614 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000324417 ★177,384,434–177,398,84813
ENST00000504577177,379,235–177,386,2904
ENST00000994218177,379,240–177,397,30412
ENST00000512593177,384,431–177,390,5139
ENST00000872468177,384,431–177,398,84813
ENST00001135307177,384,431–177,398,84813

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC34A1 的產物參與腎臟近端小管刷狀緣膜上的磷酸鹽運輸,將磷酸鹽由細胞外帶入細胞。這項運輸與 Na(+) 同向轉運相連,使磷酸鹽攝取依賴鈉離子共同移動。

來源描述此共轉運的 Na(+):Pi 化學計量比為 3:1;也就是每轉運一個磷酸鹽,伴隨三個 Na(+) 移動。此運輸被描述為具電生性質,但這項性質標示為依相似性推定,應保留其推論性質。

反應方向可表示為細胞外的三個 Na(+) 與一個磷酸鹽進入細胞,同時對應細胞內物質移至細胞外的反向表示。這些資料共同指出,SLC34A1 參與近端小管對磷酸鹽的回收運輸;來源並未提供更進一步的調控機制或其他生理作用細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 177384434 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC34A1 ENST00000324417 GRCh38 chr5:177383434-177384534 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCCCGCTGTGGGGGTGTCAGTTTGCTCATAGGTGGAGACACTCGATGTGACATTAACAGCACCTTCAAG
CCCAAGGACCCAGAGATTCTGACACAAGAACTGAGAACTGATTGCATTTCCGTGACTCAGCGACACCCTC
CTACCTGGGCATGAACCCAGCCCTAGCCAAAGATCCAGAGACCCGACTCCCATCTATTTCCTTTTCCTCT
CTCCCTCCCCGTCACCAATTCTACTGGTCAGATGTCCCTGGGATGCACCTGTCCTCCCCAGCCCCTCCGT
TCCCATCGGAGTTCAGGCCTCATCATCTCCTGCCTGGACCATTAGCCTCTTAACTGGCCCCTCCGCTTCC
AGGCTCCCTTCCATATATCCGGGTTCCACCCCGGGGGCCATTCTAAAAGGCAGATCAGGCCCATCCCAGT
CTGGCCAGCGGCTCCACATTCACTCAGACTCACATCCTGGACCCATGGTCGGGCATTAGAGACCTGCCAC
GATTCAACATTCCACGGCCTTTCCAGCTTAGGTCCTCATCTCACACTCCCTCTCCTCTGAGCTCCCCCTG
GGAGACTTACAGACACCCCGACGCTTGGCAAGGCCATAGGATGTTTTTGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTTC
TGAGACAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGAA
GGCCATAGGATGTTTGGGTCATTCCCTGGGGAGTCCTGTCAGGCCAGGAACGAGGGGACCCTGGGAACAA
GGTGCTGAGTGGCATCAGGGTCTCTGCCTGCAGGCGGGGGATGTGTCTGGGTCGTGGTTGATGGGAAGAA
CCTGACCATAGATTCCCCATGCAGAGCTGACGATTAGCAATTAACTGGGAGGAATCTCAGGGGTGAGGTT
AATTGGGGGACAGAGGGAGGGCAGCTAGGGTTCCAGGGACTTTGCCCTTGACCCAAGAGTATAAAGAGGA
GGGTCTCAGTTCTCCTCAGGGTCCTGGAGGCTTCATTGAGCTGCTGAGCAGAAGCTGAAACACAGAATTC
TAAGGTGAGCCCAGGACCCTCACATCCCAACCCCACCCCCAGCTCTGAGTA
SLC34A1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC34A1_1 ↗5:177,384,434正股177,384,385–177,384,444

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_B3B7GH · enhancer · 177378880–177379750 · regulatory

ENSR5_94LDXL · enhancer · 177381155–177381533 · regulatory

ENSR5_94LDZ3 · enhancer · 177382614–177383100 · regulatory

ENSR5_53JPHFT · CTCF_binding_site · 177382833–177382854 · regulatory

ENSR5_53JPJDZ · CTCF_binding_site · 177388470–177388491 · regulatory

ENSR5_DBRM2 · enhancer · 177388907–177391343 · regulatory

· motif · 177379536–177379550 · motif

· motif · 177379536–177379550 · motif

· motif · 177379642–177379659 · motif

· motif · 177382835–177382851 · motif

· motif · 177388472–177388488 · motif

· motif · 177388707–177388720 · motif

· motif · 177388707–177388720 · motif

· motif · 177389234–177389242 · motif

· motif · 177389234–177389249 · motif

· motif · 177389275–177389290 · motif

· motif · 177389398–177389411 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:639 aa

1 aa639 aa跨膜區拓樸區域
依 Q06495 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC34A1 產物長 639 個胺基酸,屬於 SLC34A transporter family。序列註解標示八段螺旋跨膜區(M1 至 M8),其間分布細胞內及細胞外拓撲區段;N 端與 C 端均為細胞質區域。

拓樸區域Cytoplasmic1–103 aa
跨膜區Helical; Name=M1104–125 aa
拓樸區域Extracellular126–145 aa
跨膜區Helical; Name=M2146–163 aa
拓樸區域Cytoplasmic164–165 aa
跨膜區Helical; Name=M3166–185 aa
拓樸區域Extracellular186–347 aa
跨膜區Helical; Name=M4348–370 aa
拓樸區域Cytoplasmic371–412 aa
跨膜區Helical; Name=M5413–436 aa
拓樸區域Extracellular437–466 aa
跨膜區Helical; Name=M6467–487 aa
拓樸區域Cytoplasmic488–513 aa
跨膜區Helical; Name=M7514–534 aa
拓樸區域Extracellular535–539 aa
跨膜區Helical; Name=M8540–561 aa
拓樸區域Cytoplasmic562–639 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q06495…

AlphaFold · Q06495

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Apical cell membrane;Cell membrane

SLC34A1 位於細胞膜,特別是腎臟近端小管的刷狀緣膜。 受到 PTH 刺激時,蛋白質會由細胞表面內化。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 21 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NAPI-3SLC34A1APBA1APBA2DLG1DLG2DLG3DLG4FRMPD2GRID2IPGRIP1GRIP2IL16LNX1LNX2MAGI2MPDZNHERF4PATJPDZK1SCRIBTJP1WHRN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SLC34A1 的 C 端區域與 NHERF4 互作,此項互作為依相似性推定;另有資料記載其與 NHERF1 互作。SLC34A1 也與 TMEM174 互作,而 TMEM174 與 PTH、FGF23 誘發的 SLC34A1 內化調控相關。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

影響 SLC34A1 的變異與多種疾病相關。Nephrolithiasis/osteoporosis, hypophosphatemic, 1 的特徵包括腎磷酸鹽吸收下降、腎性磷酸鹽流失、低磷血症、高磷酸尿、高鈣尿、腎結石及骨質疏鬆。Fanconi renotubular syndrome 2 為常染色體隱性疾病,可造成近端腎小管廣泛功能異常及溶質、水分再吸收減少,並可能伴隨多尿、磷酸尿、糖尿、胺基酸尿,以及低磷性佝僂病或骨軟化症等表現。Hypercalcemia, infantile, 2 亦為常染色體隱性疾病,特徵包括血鈣過高,可能伴隨生長不良、嘔吐、脫水及腎鈣質沉著。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC34A1 參與腎臟刷狀緣膜上的磷酸鹽攝取,透過 Na(+) 共轉運將磷酸鹽帶入細胞;該運輸的 Na(+):Pi 比為 3:1,且具電生性的描述屬依相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Involved in actively transporting phosphate into cells via Na(+) cotransport in the renal brush border membrane. The cotransport has a Na(+):Pi stoichiometry of 3:1 and is electrogenic (By similarity)

PMID 12324554 ↗ · PMID 20335586 ↗ · PMID 26047794 ↗ · PMID 8327470 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性3 Na(+)(out) + phosphate(out) = 3 Na(+)(in) + phosphate(in)含實驗來源
證據與來源

3 Na(+)(out) + phosphate(out) = 3 Na(+)(in) + phosphate(in)

PMID 12324554 ↗ · PMID 20335586 ↗ · PMID 26047794 ↗ · PMID 8327470 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SLC34A1 透過 C 端區域與 NHERF4 互作,該關係為依相似性推定;另與 NHERF1 互作,也與 TMEM174 互作。TMEM174 與 PTH、FGF23 誘發的 SLC34A1 內化調控相關。含實驗來源
證據與來源

Interacts via its C-terminal region with NHERF4 (By similarity). Interacts with NHERF1. Interacts with TMEM174; regulates SLC34A1 internalization by PTH and FGF23 (By similarity)

PMID 22506049 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC34A1 是多次穿膜蛋白,位於細胞膜及近端腎小管刷狀緣膜;PTH 刺激時,蛋白質會從細胞表面內化。含實驗來源
證據與來源

Apical cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Localized at the brush border membranes of the proximal tubules. Internalized from the cell surface upon PTH stimulation

PMID 26047794 ↗ · PMID 20335586 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 SLC34A1 的變異與 Nephrolithiasis/osteoporosis, hypophosphatemic, 1 相關;其特徵包括腎磷酸鹽吸收下降與磷酸鹽流失、低磷血症、高磷酸尿、高鈣尿、腎結石及骨質疏鬆。含實驗來源
證據與來源

Nephrolithiasis/osteoporosis, hypophosphatemic, 1 NPHLOP1 A disease characterized by decreased renal phosphate absorption, renal phosphate wasting, hypophosphatemia, hyperphosphaturia, hypercalciuria, nephrolithiasis and osteoporosis. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 612286

PMID 12324554 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 SLC34A1 的變異與常染色體隱性 Fanconi renotubular syndrome 2 相關。此病涉及近端腎小管廣泛功能異常及溶質、水分再吸收減少,可有多尿、磷酸尿、糖尿、胺基酸尿,並可能發生低磷性佝僂病或骨軟化症、酸中毒、脫水傾向或腎功能不全。含實驗來源
證據與來源

Fanconi renotubular syndrome 2 FRTS2 A form of Fanconi renotubular syndrome, a disease due to a generalized dysfunction of the proximal kidney tubule resulting in decreased solute and water reabsorption. Patients have polydipsia and polyuria with phosphaturia, glycosuria and aminoaciduria. They may develop hypophosphatemic rickets or osteomalacia, acidosis and a tendency toward dehydration. Some eventually develop renal insufficiency. FRTS2 inheritance is autosomal recessive. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613388

PMID 20335586 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 SLC34A1 的變異與常染色體隱性 Hypercalcemia, infantile, 2 相關。疾病以血鈣異常升高為特徵,可能伴隨生長不良、嘔吐、脫水及腎鈣質沉著。含實驗來源
證據與來源

Hypercalcemia, infantile, 2 HCINF2 An autosomal recessive form of hypercalcemia, a disorder characterized by abnormally high level of calcium in the blood, failure to thrive, vomiting, dehydration, and nephrocalcinosis. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616963

PMID 26047794 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000324417 · 2,583 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTCCTGGAGGCTTCATTGAGCTGCTGAGCAGAAGCTGAAA40
41CACAGAATTCTAAGCGTTGCTGAGACCCACTGACCTGCAG80
81ACCTCATAGTGGGTGCCCAGGATGTTGTCCTACGGAGAGA120
121GGCTGGGGTCCCCTGCTGTCTCCCCACTCCCAGTCCGTGG160
161GGGGCATGTGATGCGAGGGACGGCCTTTGCCTACGTGCCC200
201AGCCCTCAGGTCCTACACAGGATCCCGGGGACCTCTGCCT240
241ATGCCTTCCCCAGCCTGGGCCCTGTGGCCCTTGCTGAGCA280
281CACCTGCCCCTGTGGGGAGGTCCTGGAGCGCCATGAACCA320
321CTGCCTGCCAAGCTGGCCCTGGAGGAGGAGCAGAAGCCAG360
361AGTCCAGGCTGGTCCCCAAGCTGCGCCAGGCTGGCGCCAT400
401GCTGCTCAAGGTGCCACTGATGCTCACCTTCCTCTACCTC440
441TTCGTCTGCTCCCTGGACATGCTCAGCTCGGCCTTCCAGC480
481TGGCTGGAGGGAAGGTGGCTGGTGACATCTTCAAGGATAA520
521CGCCATCCTGTCCAACCCGGTGGCCGGGCTGGTGGTGGGG560
561ATCCTGGTGACCGTGCTGGTGCAGAGCTCCAGCACCTCCA600
601CATCCATCATCGTCAGCATGGTCTCCTCTGGCTTGCTGGA640
641GGTGAGCTCTGCCATCCCCATCATCATGGGCTCCAACATC680
681GGCACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCCTGATGCAGG720
721CGGGGGACAGGACTGACTTCCGGCGGGCCTTCGCGGGGGC760
761CACGGTGCATGACTGCTTTAACTGGCTGTCAGTGCTGGTC800
801CTGCTGCCCCTGGAGGCTGCCACTGGCTACCTGCACCACA840
841TCACTCGACTTGTGGTGGCCTCCTTCAACATCCATGGTGG880
881CCGTGATGCTCCTGACCTGCTCAAGATCATCACAGAGCCC920
921TTCACGAAGCTCATCATCCAGCTGGACGAGTCTGTGATAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。