演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC31A2hCTR2

solute carrier family 31 member 2

SLC31A2 編碼 solute carrier family 31 member 2,屬於銅轉運蛋白 Ctr 家族;體外可低親和力輸送銅離子,並參與調節 SLC31A1。

Homo sapiens9q32UniProt O15432
OFFICIAL SYMBOL
SLC31A2
CHROMOSOME
9
UNIPROT
O15432
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC31A2 是位於第 9 號染色體的蛋白質編碼基因,產物 solute carrier family 31 member 2 屬於銅轉運蛋白 Ctr 家族的 SLC31A 次家族。此蛋白由 143 個胺基酸組成,具有多段跨膜螺旋,胞外與細胞質區段交錯分布,符合多次穿膜蛋白的拓樸特徵。來源資料指出,它與銅離子運輸及另一個家族成員 SLC31A1 的調節相關;其體內與體外作用並不相同,具體功能條件見功能說明。

Official symbol
SLC31A2
Gene name
solute carrier family 31 member 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11017
UniProt
O15432
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
hCTR2CTR2COPT2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q32
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegSLC31A2pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:113,150,951–113,164,140
Gene span
13,190 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000259392 ★113,151,007–113,164,1404
ENST00001094860113,150,951–113,164,1404
ENST00001094861113,150,951–113,164,1404
ENST00001094862113,150,951–113,164,1404
ENST00001094863113,150,951–113,164,1404
ENST00001094864113,150,951–113,164,1383
ENST00001139225113,150,951–113,164,1404

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC31A2 的銅離子輸送能力依實驗條件而異。依相似性推定,它在體內並不作為銅離子(Cu⁺)輸入蛋白;但體外研究顯示,它可低親和力輸送 Cu⁺。因此,體外觀察到的輸送能力不能直接視為其體內主要作用。

除自身的體外輸送活性外,SLC31A2 也被描述為 SLC31A1 的調節因子。依相似性推定,SLC31A2 可能促進 SLC31A1 胞外結構域切割,或使 SLC31A1 的截短形式(Truncated CTR1 form)保持穩定。這兩種可能作用都與截短形式相關的胞內體銅輸出相連;來源並未將其限定為單一作用方式。

透過調節 SLC31A1,SLC31A2 可影響經由 SLC31A1 介導的銅與 cisplatin 累積。資料支持的是對累積量的調節,不足以將此描述為 SLC31A2 直接輸送 cisplatin,也未提供具體方向或效應幅度。其生物學作用因此包括與 SLC31A1 相關的銅處理調節,但其中涉及截短形式的機制屬於依相似性提出的推定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 113151007 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC31A2 ENST00000259392 GRCh38 chr9:113150007-113151107 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCTGTTTCAAAGAAAAGAAAAAAAGCTGTGTGACCCTGAGGATTCTACC
ATTTACTGAACAAGCTCCCACTGCCAGGTTACATGATAATTTAACATGTATGTTTTCATTTAATCCCTAT
GACATAGATTTTATTATTATTTTCATTTTACTGACCAGAAAACTGAGGTTCAGAGATGTAAGCTATTTGC
CTACGGTCCCAAAGCCAATAGTTGATGCGTATGGATGTGAACTGAGGTTAGCTCCAGGCTCAAGGTCTCT
GCTAATACTGTCCTTAGTAAGGTTTCTCTGAAGAGCCTCTTTACTCATAGGCTGATTAGCAAAGGGTTCC
TAAATATGCTTAAGAATCAATAACCATTAAAAATCCCTCACCCTACAAGAAACTCCCCATCAAAAAACTG
GATCAGTGAAATGAACAGGCAATACACAGAAATGGAAGTACCCGTAAGAAAAATAGTTTACTACCCTAGT
AATCAAAGAAAAACAAAATTACACGGGTGTATTCCTTTTGGCTTATCAGATTGGAAAATATTTTTCTAAA
AAGAAAAATGTAATTATCTTGTAATGACTACACTAAAAATCTAGGGCATAATTGACTTAATTTACTCCAA
ATGTGTTGCTATTGCGTCCATAGCACGGACTTGCCCATTTCAACTCAATATATGTTACGCTTGGGGTAGT
TTATTACAATGAGCAATAAACATTCTCATAATCGCCAAGACAAGCCAAGTGCAAAACAGGAAGGGCGAAG
ACAGAGGGCAGCAGGTGGTCCCTCTCGCTCGCGACTCCGGGAACGCCAAGCCTCAGCCCTTGGGAACCTG
GGGCGAGGCGCCTGGGTCTCGGCCAGGGGGCGCGCCCGAGGACGCCGAAGTAGGGCGCGTGTGGGGACCA
CAACTCCCAGGCGCCCGCGCGCCGCCTCGCCCGGACCACGTGATCCGTGCGGCCAGGGTAGCTATCGCGG
CGGCGGCGGCGGCGGCGGTTGAACTGACTCGGAGCGAGGAGACCCGAGCGAGCAGACGCGGCCCTGGCGC
CCGCCCTGCGCACTCACCATGGCGGTAAGGGCCGGGCGCTACGGTGAAGAG
SLC31A2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC31A2_1 ↗9:113,151,012正股113,150,963–113,151,022

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:143 aa

1 aa143 aa跨膜區拓樸區域
依 O15432 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

solute carrier family 31 member 2 長 143 個胺基酸,屬於銅轉運蛋白 Ctr 家族的 SLC31A 次家族。序列註解預測其含三段螺旋跨膜區:胺基酸 23–43、94–114 與 120–140;其間及兩端的拓樸區段分別朝向胞外或細胞質。

拓樸區域Extracellular1–22 aa
跨膜區Helical23–43 aa
拓樸區域Cytoplasmic44–93 aa
跨膜區Helical94–114 aa
拓樸區域Extracellular115–119 aa
跨膜區Helical120–140 aa
拓樸區域Cytoplasmic141–143 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O15432…

AlphaFold · O15432

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane;Cytoplasmic vesicle membrane;Late endosome membrane;Lysosome membrane

SLC31A2 被記錄於細胞膜、細胞質囊泡膜、晚期胞內體膜與溶體膜,均為多次穿膜蛋白;其細胞膜定位僅屬部分定位。 資料未提供定位隨條件或時間改變的描述。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
hCTR2SLC31A2BNIP3GLP1R
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SLC31A2 可形成寡聚體。它也與 SLC31A1 發生互作;此互作會穩定 SLC31A2,並保護其免於泛素化及後續降解。來源描述的是蛋白質互作及其對穩定性的影響,未進一步界定兩者形成特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能依相似性推定,SLC31A2 在體內不作為銅離子(Cu⁺)輸入蛋白;但體外可低親和力輸送 Cu⁺。它也調節 SLC31A1,可能促進其胞外結構域切割,或穩定其截短形式,進而推動與該截短形式相關的胞內體銅輸出,並調節經由 SLC31A1 累積的銅與 cisplatin。含實驗來源
證據與來源

Does not function as a copper(1+) importer in vivo (By similarity). However, in vitro functions as a low-affinity copper(1+) importer. Regulator of SLC31A1 which facilitates the cleavage of the SLC31A1 ecto-domain or which stabilizes the truncated form of SLC31A1 (Truncated CTR1 form), thereby drives the SLC31A1 truncated form-dependent endosomal copper export and modulates the copper and cisplatin accumulation via SLC31A1 (By similarity)

PMID 17617060 ↗ · PMID 17944601 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SLC31A2 可形成寡聚體,並與 SLC31A1 互作。此互作會穩定 SLC31A2,保護它免於泛素化及隨後的降解。含實驗來源
證據與來源

Oligomer. Interacts with SLC31A1; this interaction stabilizes SLC31A2 and protects it from ubiquitination and the subsequent degradation

PMID 17617060 ↗ · PMID 26205368 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC31A2 是多次穿膜蛋白,定位於細胞膜、細胞質囊泡膜、晚期胞內體膜及溶體膜;其細胞膜定位僅為部分定位。含實驗來源
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasmic vesicle membrane / Multi-pass membrane protein; Late endosome membrane / Multi-pass membrane protein; Lysosome membrane / Multi-pass membrane protein; Plasma membrane localization is partial

PMID 17944601 ↗ · PMID 17617060 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000259392 · 1,723 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAACTGACTCGGAGCGAGGAGACCCGAGCGAGCAGACGCG40
41GCCCTGGCGCCCGCCCTGCGCACTCACCATGGCGATGCAT80
81TTCATCTTCTCAGATACAGCGGTGCTTCTGTTTGATTTCT120
121GGAGTGTCCACAGTCCTGCTGGCATGGCCCTTTCGGTGTT160
161GGTGCTCCTGCTTCTGGCTGTACTGTATGAAGGCATCAAG200
201GTTGGCAAAGCCAAGCTGCTCAACCAGGTACTGGTGAACC240
241TGCCAACCTCCATCAGCCAGCAGACCATCGCAGAGACAGA280
281CGGGGACTCTGCAGGCTCAGATTCATTCCCTGTTGGCAGA320
321ACCCACCACAGGTGGTATTTGTGTCACTTTGGCCAGTCTC360
361TAATCCATGTCATCCAGGTGGTCATCGGCTACTTCATCAT400
401GCTGGCCGTAATGTCCTACAACACCTGGATTTTCCTTGGT440
441GTGGTCTTGGGCTCTGCTGTGGGCTACTACCTAGCTTACC480
481CACTTCTCAGCACAGCTTAGCTGGTGAGGAACGTGCAGGC520
521ACTGAGGCTGGAGGGACATGGAGCCCCCTCTTCCAGACAC560
561TATACTTCCAACTGCCCTTTCTTCTGATGGCTATTCCTCC600
601ACCTTATTCCCAGCCCCTGGAAACTTTGAGCTGAAGCCAG640
641CACTTGCTCCCTGGAGTTCGGAAGCCATTGCAGCAACCTT680
681CCTTCTCAGCCAGCCTACGTAGGGCCCAGGCATGGTCTTG720
721TGTCTTAAGACAGCTGCTGTGACCAAAGGGAGAATGGAGA760
761TAACAGGGGTGGCAGGGTTACTGAGCCCATGACAATGCTT800
801CTCTGTGACTCAAACCAGGAATTTCCAAAGATTTCAAGCC840
841AGGGAGAAGGGTTCTTGGTGATGCAGGGCATGGAACCTGG880
881ACACCCTCAGCTCTCCTGCTTTGTGCCTTATCTACAGGAG920
921CATCGCCCATTGGACTTCCTGACCTCTTCTGTCTTTGAGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。