演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SLC30A4ZNT4

solute carrier family 30 member 4

SLC30A4 編碼多次穿膜的鋅離子轉運蛋白,可能以質子耦聯方式促進鋅離子跨膜運輸,並與乳汁中的鋅沉積調控有關。

Homo sapiens15q21.1UniProt O14863
OFFICIAL SYMBOL
SLC30A4
CHROMOSOME
15
UNIPROT
O14863
PDB / ALPHAFOLD
9JJ3
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SLC30A4(solute carrier family 30 member 4)是蛋白質編碼基因,其產物屬於陽離子擴散促進因子(cation diffusion facilitator, CDF)轉運蛋白家族,並歸於 SLC30A 亞家族。此蛋白長 429 個胺基酸,具有多段穿膜區域,並含有細胞質側的鋅結合區域。來源將其描述為可能參與鋅離子運輸的蛋白質;至於運輸方向與質子耦聯方式,詳見功能說明。

Official symbol
SLC30A4
Gene name
solute carrier family 30 member 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11015
UniProt
O14863
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZNT4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q21.1
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegSLC30A4pq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr15:45,479,606–45,522,834
Gene span
43,229 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000261867 ★45,479,606–45,522,7558
ENST0000113321545,479,606–45,522,8348
ENST0000103364645,479,636–45,522,8348
ENST0000103364745,479,745–45,522,8348
ENST0000085465345,482,590–45,522,7977
ENST0000085465445,482,788–45,522,8347
ENST0000085465545,483,828–45,522,7976
ENST0000111485745,486,891–45,522,8347
ENST0000110802145,520,255–45,522,8342

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SLC30A4 被認為可能是質子耦聯的鋅離子反向運輸蛋白,參與將鋅離子由細胞質輸入胞內體相關區室。這項運輸方向仍以「可能」描述;來源並未將其表述為已確證的機制。其反向運輸反應式為:細胞內的 Zn²⁺與細胞外側的兩個 H⁺交換,形成 Zn²⁺向外、兩個 H⁺向內的移動。這表示鋅離子運輸與質子跨膜移動相互耦聯。

此運輸活動可能影響細胞內鋅離子的分布,尤其是鋅由細胞質移入內吞系統區室的過程。來源未進一步說明其所涉細胞或生理條件,因此不宜將這項推測延伸為特定細胞中的確定功能。蛋白質家族與跨膜特徵支持其作為膜轉運蛋白的分類,但不代表所有作用細節皆已明確。

另有相似性推論指出,SLC30A4 可能調控乳汁中的鋅沉積。這項功能註記屬於 By similarity,證據性質不同於直接確立的作用;來源並未提供其調控步驟或發生條件。因此,較審慎的理解是:SLC30A4 可能參與鋅離子跨膜移動,並可能與乳汁鋅沉積調控相關,而具體生理情境仍應保留不確定性。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 45522755 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SLC30A4 ENST00000261867 GRCh38 chr15:45522655-45523755 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAGCAGTCATGTATTTTATTTACTTGTTTATTTTTAGAGACAAGGTCTCACTCTGTCGCCAGGCAGGGGT
GCGGAGGCACAATCATAGCTCACTGTAATCTCGAACCTCTGGGCTCATGCGACCCTCCTTCCTCAGAGCA
ATTAACAAATGTATATATACTTTTTCCTTCCTCTCTCCCAATATTTTAAATTAAGGTATGCACATTGTTT
TAGACATAACGCTATTACACGCTTAATAGACTACATTATAAACATGATTGTATTTGCACTGGGACATGAA
ACATTTGTGAGACCTCACTTTGTCATATTGCGGTGGTCTGGAACCAAATTCGCAGTATCTCCAAGGTATG
CCTGTACTAGATTTTCTATGCTTGAGTTTAGTCCATATCGTAAATACCTTGGAGGCAAAAGGAACACGGC
AGAGAGCACAAAGAGGACAATACATATTTGCTGAAAAACAGTAGGACACAGAACTGCTGACGACGACAGC
CTTGCCCTCTCCAGTTGACTGCAGCAAATGTTGCCAATTTGCCAGAGACAAGCAATTCGAGGAGAGAAAA
GCTGCTTGCCTTTTCAGTTAGCAAGAAAAGTGCTGGGTTTGTCTTCTGCCGAGCACCCGCAACCCAGATC
CCGACCCGAGATTCCTGAGACACACTTTCGGTGGAGGGAACTCCTAGCAGCAACGCCCAGCCCCCGGCGT
GACCCTCCGACCGCACTTGCCTCCCAGCCTGGGAAGGTGGAAGAGGCCGCCCAAAGTCCCCTCAGTTGGC
CAGTGAGTGACCCCTGGGCGGAGGCGGCGCAGTGGCCCCCAATCCAGCCTCGGGGCGAGAGGCGGGGCGC
GCCGCGCGCCCCCGCCCATCGCGGGCGCCCCAGCCCTGCGCGCCAGGCCTGCGTGTCCTCGCGCCGACCC
CTCCCTCGCGCGCCTCGCCCGGCGCACGCGCGTGGCCTCGCGCAGGGCGGGGAGAGGCGGTGGCTGTGGG
CGTCCGGCCCCGAACCTGTCAGACCTGGGGAGCCGGCCTCCAGCAGCGGGCGCGGCGGGCGCGAGCACGA
CCCCACTCTCCTGCGGCCGCGGGTGGAGCAGCGCGAGCCCGCCTCGCTGAG
SLC30A4 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SLC30A4_1 ↗15:45,522,755負股45,522,745–45,522,804

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_5DP4HQ · CTCF_binding_site · 45521721–45521742 · regulatory

ENSR15_9N3T2 · promoter · 45522198–45522698 · regulatory

ENSR15_5DP4MN · CTCF_binding_site · 45522573–45522594 · regulatory

ENSR15_9N3T6 · promoter · 45522745–45523245 · regulatory

· motif · 45521723–45521739 · motif

· motif · 45522369–45522385 · motif

· motif · 45522575–45522591 · motif

· motif · 45522814–45522825 · motif

· motif · 45522814–45522825 · motif

· motif · 45522970–45522982 · motif

· motif · 45522972–45522979 · motif

· motif · 45523042–45523057 · motif

· motif · 45523275–45523286 · motif

· motif · 45523301–45523312 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:429 aa

1 aa429 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 O14863 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SLC30A4 蛋白長 429 個胺基酸,屬於 CDF 轉運蛋白家族的 SLC30A 亞家族。其序列包含六段螺旋穿膜區域,並有位於細胞質側的鋅結合區域(胺基酸 240–264)。蛋白質的 N 端與 C 端均位於細胞質側;穿膜區段之間則交替出現細胞質側與腔側區域。

拓樸區域Cytoplasmic1–113 aa
跨膜區Helical114–134 aa
拓樸區域Lumenal135–143 aa
跨膜區Helical144–164 aa
拓樸區域Cytoplasmic165–178 aa
跨膜區Helical179–199 aa
拓樸區域Lumenal200–216 aa
跨膜區Helical217–237 aa
拓樸區域Cytoplasmic238–274 aa
跨膜區Helical275–295 aa
拓樸區域Lumenal296–310 aa
跨膜區Helical311–331 aa
拓樸區域Cytoplasmic332–429 aa
功能區域Zinc binding240–264 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9JJ3…

PDB · 9JJ3

EM · 3.03 A · A/B=1-429

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endosome membrane;Late endosome membrane;Lysosome membrane;Cytoplasm

SLC30A4 位於胞內體、晚期胞內體與溶酶體膜,也可見於細胞質。 上皮細胞中,此蛋白在基底區域的囊泡內較為豐富;來源未指出定位改變的條件或不同異構型的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 19 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNT4SLC30A4BTN2A2CLN6CMTM5FZD7IER3IP1LEPROTL1NSG1PEDS1-UBE2V1SERP2SLC30A10SLC30A2SLC30A3TMEM100TMEM163TMEM60TNFTNFRSF10CYIPF6Tfrc
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 19 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SLC30A4 可形成由雙酪胺酸連結的同源二聚體。來源指出,人類蛋白的同源二聚化可能具有物種特異性,且可提升鋅運輸效率;此處的物種特異性仍屬可能性描述。此外,SLC30A4 與 TMEM163 有交互作用,但資料未進一步界定該交互作用是否為直接結合或共同構成複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SLC30A4 可能是質子耦聯的鋅離子反向運輸蛋白,將鋅離子由細胞質輸入內吞區室;另有相似性推論認為它會調控乳汁中的鋅沉積,這項功能仍屬推論。推論支持
證據與來源

Probable proton-coupled zinc ion antiporter mediating zinc import from cytoplasm potentially into the endocytic compartment. Controls zinc deposition in milk (By similarity)

PMID 19521526 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性Zn(2+)(in) + 2 H(+)(out) = Zn(2+)(out) + 2 H(+)(in)推論支持
證據與來源

Zn(2+)(in) + 2 H(+)(out) = Zn(2+)(out) + 2 H(+)(in)

PMID 19521526 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SLC30A4 可形成以雙酪胺酸連結的同源二聚體;此二聚化可能是人類蛋白特有,並能提升鋅運輸效率。此外,SLC30A4 與 TMEM163 有交互作用。含實驗來源
證據與來源

Homodimer; dityrosine-linked. Homodimerization could be specific of the human protein and enhances the zinc transport efficiency. Interacts with TMEM163

PMID 19521526 ↗ · PMID 36204728 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SLC30A4 位於胞內體、晚期胞內體及溶酶體膜,也可見於細胞質;在上皮細胞中,該蛋白於基底區域的囊泡內較為豐富。含實驗來源
證據與來源

Endosome membrane / Multi-pass membrane protein; Late endosome membrane / Multi-pass membrane protein; Lysosome membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasm; Enriched in vesicles within the basal region of epithelial cells

PMID 17349999 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000261867 · 7,110 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGACCTGGGGAGCCGGCCTCCAGCAGCGGGCGCGGCGGGC40
41GCGAGCACGACCCCACTCTCCTGCGGCCGCGGGTGGAGCA80
81GCGCGAGCCCGCCTCGCTGAGCCGGCCGGGGGCGGGGAGA120
121TGAGTTGCGGCCCCGCGGCAGCGCCCCAGGATGGGGAGGG160
161ACGCGCGGCACTGCCCTCGAGAACTGGCGCTCCGGTGAAG200
201TAGGCGCCGCCGGCCGTCCGCCTCCCCCAAGCCGTTCCGC240
241ACCGCGGCCGCTCAGCCTCTGCCATGGCCGGCTCTGGCGC280
281GTGGAAGCGCCTCAAATCTATGCTAAGGAAGGATGATGCG320
321CCGCTGTTTTTAAATGACACCAGCGCCTTTGACTTCTCGG360
361ATGAGGCGGGGGACGAGGGGCTTTCTCGGTTCAACAAACT400
401TCGAGTTGTGGTGGCCGATGACGGTTCCGAAGCCCCGGAA440
441AGGCCTGTTAACGGGGCGCACCCGACCCTCCAGGCCGACG480
481ATGATTCCTTACTGGACCAAGACTTACCTTTGACCAACAG520
521TCAGCTGAGTTTGAAGGTGGACTCCTGTGACAACTGCAGC560
561AAACAGAGAGAGATACTGAAGCAGAGAAAGGTGAAAGCCA600
601GGTTGACCATTGCTGCCGTTCTGTACTTGCTTTTCATGAT640
641TGGAGAACTTGTAGGTGGATACATTGCAAATAGCCTAGCA680
681ATCATGACAGATGCACTTCATATGTTAACTGACCTAAGCG720
721CCATCATACTCACCCTGCTTGCTTTGTGGCTATCATCAAA760
761ATCACCAACCAAAAGATTCACCTTTGGATTTCATCGCTTA800
801GAGGTTTTGTCAGCTATGATTAGTGTGCTGTTGGTGTATA840
841TACTTATGGGATTCCTCTTATATGAAGCTGTGCAAAGAAC880
881TATCCATATGAACTATGAAATAAATGGAGATATAATGCTC920
921ATCACCGCAGCTGTTGGAGTTGCAGTTAATGTAATAATGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。